117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0149 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_0149  hypothetical protein  100 
 
 
225 aa  438  9.999999999999999e-123  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0150  hypothetical protein  97.78 
 
 
225 aa  390  1e-107  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.113557  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0873  SNARE associated Golgi protein  35.53 
 
 
236 aa  141  6e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000105314  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0481  hypothetical protein  39.58 
 
 
253 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000679806  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2985  SNARE associated Golgi protein  34.1 
 
 
254 aa  121  7e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0716748  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03520  hypothetical protein  32.19 
 
 
272 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.130294 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1002  hypothetical protein  33.19 
 
 
230 aa  108  9.000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1893  hypothetical protein  33.33 
 
 
224 aa  106  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3011  SNARE associated Golgi protein  26.67 
 
 
272 aa  107  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.140642 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2261  SNARE associated Golgi protein  28.87 
 
 
267 aa  103  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000842977  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01370  hypothetical protein  34.9 
 
 
277 aa  102  7e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.867089  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1595  SNARE associated Golgi protein  27.23 
 
 
234 aa  101  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.734861  hitchhiker  0.00926155 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1685  SNARE associated Golgi protein  35.43 
 
 
236 aa  97.4  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2268  hypothetical protein  37.59 
 
 
211 aa  93.6  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2397  hypothetical protein  34.03 
 
 
238 aa  85.1  8e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0429  SNARE associated Golgi protein  28.7 
 
 
229 aa  84  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0559  DedA family protein  29.09 
 
 
231 aa  82  0.000000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0543  DedA family protein  29.09 
 
 
231 aa  82  0.000000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2357  SNARE associated Golgi protein  23.46 
 
 
241 aa  77.4  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.865891  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0914  hypothetical protein  30.77 
 
 
203 aa  75.9  0.0000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0971  hypothetical protein  34.4 
 
 
201 aa  75.5  0.0000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01721  conserved inner membrane protein  27.13 
 
 
235 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1975  hypothetical protein  27.13 
 
 
235 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1880  SNARE associated Golgi protein  27.13 
 
 
235 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124953 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1438  hypothetical protein  27.13 
 
 
235 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.319111  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01709  hypothetical protein  27.13 
 
 
235 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1890  SNARE associated Golgi protein-like protein  27.13 
 
 
235 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.028896  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1836  hypothetical protein  27.13 
 
 
235 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2001  hypothetical protein  26.6 
 
 
235 aa  72.8  0.000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2471  hypothetical protein  26.6 
 
 
235 aa  72  0.000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3865  SNARE associated Golgi protein  25 
 
 
237 aa  72  0.000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1196  SNARE associated Golgi protein  28.36 
 
 
197 aa  70.5  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000186388  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0752  hypothetical protein  26.18 
 
 
229 aa  67.8  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0647  SNARE associated Golgi protein-related protein  25.63 
 
 
251 aa  67  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3139  SNARE associated Golgi protein  25.17 
 
 
234 aa  62  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.653683  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1602  hypothetical protein  22.99 
 
 
231 aa  61.2  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2340  hypothetical protein  25.17 
 
 
226 aa  60.8  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.290858  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1623  hypothetical protein  30.53 
 
 
199 aa  58.5  0.00000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000141356  normal  0.0113653 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1525  hypothetical protein  24.73 
 
 
194 aa  58.2  0.00000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1842  hypothetical protein  24.76 
 
 
249 aa  56.6  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04161  hypothetical protein  32.1 
 
 
202 aa  55.8  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0548142  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0746  hypothetical protein  20.99 
 
 
239 aa  54.3  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.528389 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3291  hypothetical protein  28.45 
 
 
240 aa  53.9  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1585  hypothetical protein  29.2 
 
 
217 aa  52.4  0.000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0628648  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0728  hypothetical protein  28.4 
 
 
182 aa  52  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3675  hypothetical protein  25.58 
 
 
239 aa  51.6  0.000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5412  phospholipase D  18.52 
 
 
735 aa  51.6  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.965585 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0668  hypothetical protein  27.78 
 
 
182 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0510  hypothetical protein  31.06 
 
 
182 aa  50.4  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00856705  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0512  hypothetical protein  31.06 
 
 
182 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000166734  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2090  hypothetical protein  23.2 
 
 
238 aa  50.8  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0515  SNARE associated Golgi protein  31.06 
 
 
182 aa  50.4  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4304  SNARE associated Golgi protein-related protein  25.53 
 
 
217 aa  50.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.299101  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0568  hypothetical protein  31.06 
 
 
182 aa  50.1  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.155537  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0600  hypothetical protein  31.06 
 
 
182 aa  50.1  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1993  hypothetical protein  22.75 
 
 
242 aa  50.1  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0657  hypothetical protein  31.06 
 
 
182 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.85178e-22 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01719  predicted inner membrane protein  23.26 
 
 
236 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12210  hypothetical protein  23.08 
 
 
227 aa  49.3  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.992528  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1882  SNARE associated Golgi protein  23.26 
 
 
236 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1998  hypothetical protein  23.66 
 
 
192 aa  49.3  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.831633  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0639  hypothetical protein  31.51 
 
 
182 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1959  hypothetical protein  25.15 
 
 
320 aa  49.3  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01707  hypothetical protein  23.26 
 
 
236 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2217  SNARE associated Golgi protein-related protein  31.76 
 
 
713 aa  49.7  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107501  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0516  SNARE associated Golgi protein  27.22 
 
 
182 aa  49.3  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.156492  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4699  hypothetical protein  30.53 
 
 
182 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000989349 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22210  hypothetical protein  26.22 
 
 
259 aa  49.3  0.00005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1865  DedA family membrane protein  28.76 
 
 
217 aa  48.9  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0119773  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1973  hypothetical protein  23.26 
 
 
236 aa  48.9  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1892  SNARE associated Golgi protein-like protein  22.67 
 
 
236 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.328931  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2719  putative transmemebrane protein  26.29 
 
 
238 aa  48.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.934003  normal  0.0999716 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2421  hypothetical protein  24.49 
 
 
225 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.275443 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1834  hypothetical protein  22.67 
 
 
236 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5170  dedA protein  28.71 
 
 
204 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3384  hypothetical protein  23.56 
 
 
252 aa  47.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.325322  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1440  hypothetical protein  22.67 
 
 
236 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.212634  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01463  Phospholipase D/Transphosphatidylase  23.72 
 
 
738 aa  47  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2469  hypothetical protein  23.12 
 
 
236 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5185  dedA protein  28.71 
 
 
204 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2237  hypothetical protein  21.36 
 
 
266 aa  46.6  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.497647 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2230  SNARE associated Golgi protein  25.47 
 
 
231 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.571978 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1727  SNARE associated Golgi protein  31.58 
 
 
189 aa  46.6  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0308  SNARE associated Golgi protein  22.76 
 
 
229 aa  46.2  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1119  hypothetical protein  25 
 
 
225 aa  45.8  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3057  SNARE associated Golgi protein  22.54 
 
 
226 aa  45.8  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000000815606  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1185  SNARE associated Golgi protein  23.78 
 
 
258 aa  45.8  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2110  hypothetical protein  22.36 
 
 
234 aa  45.4  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0389  SNARE associated Golgi protein  23.46 
 
 
245 aa  45.4  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892522  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2418  SNARE associated Golgi protein-like protein  26.09 
 
 
283 aa  45.4  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.934082  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4897  dedA protein  27.72 
 
 
204 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4741  dedA protein  27.72 
 
 
204 aa  44.7  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.98218  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4760  DedA family protein  27.72 
 
 
204 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5272  dedA protein  27.72 
 
 
204 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2545  hypothetical protein  26.62 
 
 
193 aa  44.3  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0636099  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0273  hypothetical protein  22.22 
 
 
215 aa  44.7  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.294063  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4669  SNARE associated Golgi protein  27.27 
 
 
240 aa  44.7  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0872  SNARE associated Golgi protein  25.39 
 
 
215 aa  45.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5176  dedA protein  27.23 
 
 
204 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5141  dedA protein  27.72 
 
 
204 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>