More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0126 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_0126  ISCpe2, transposase orfB  100 
 
 
384 aa  789    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0168  ISCpe2, transposase orfB  98.7 
 
 
384 aa  777    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0245  ISCpe2, transposase orfB  98.7 
 
 
384 aa  780    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0472  ISCpe2, transposase orfB  98.44 
 
 
384 aa  777    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0547  ISCpe2, transposase orfB  99.22 
 
 
384 aa  782    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0626  ISCpe2, transposase orfB  99.22 
 
 
384 aa  783    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.202409  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0679  ISCpe2, transposase orfB  97.66 
 
 
384 aa  769    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0711  ISCpe2, transposase orfB  97.92 
 
 
384 aa  773    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.489014  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0723  ISCpe2, transposase orfB  99.48 
 
 
384 aa  785    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0772  ISCpe2, transposase orfB  98.17 
 
 
383 aa  774    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0889  ISCpe2, transposase orfB  97.92 
 
 
384 aa  769    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.688854  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0989  ISCpe2, transposase orfB  98.96 
 
 
384 aa  778    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1031  ISCpe2, transposase orfB  98.18 
 
 
384 aa  775    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0491139  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1049  ISCpe2, transposase orfB  98.7 
 
 
384 aa  777    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00154487  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1565  ISCpe2, transposase orfB  97.4 
 
 
384 aa  771    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1583  ISCpe2, transposase orfB  97.92 
 
 
384 aa  776    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0166589  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0505  ISCpe2, transposase orfB  97.46 
 
 
236 aa  465  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0180  transposase  53.42 
 
 
373 aa  398  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0390004  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0392  transposase  52.37 
 
 
373 aa  396  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0091  transposase  52.63 
 
 
373 aa  393  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0888224  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0183  transposase  52.66 
 
 
372 aa  391  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.79763  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0334  transposase  52.39 
 
 
372 aa  392  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0401  transposase  52.66 
 
 
372 aa  393  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.23468  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0445  transposase  52.13 
 
 
372 aa  392  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2264  transposase  52.11 
 
 
373 aa  389  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2715  transposase  51.58 
 
 
373 aa  387  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00297087  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2729  transposase  51.58 
 
 
373 aa  387  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000926712  hitchhiker  0.000102458 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2718  transposase  51.58 
 
 
373 aa  387  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00857929  normal  0.0128228 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3357  IS605 family transposase OrfB  52.31 
 
 
383 aa  382  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2446  IS605 family transposase OrfB  52.05 
 
 
383 aa  380  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.327325  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0182  IS605 family transposase OrfB  51.92 
 
 
383 aa  379  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1508  transposase, IS605 OrfB family  48.67 
 
 
370 aa  362  7.0000000000000005e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1722  transposase, IS605 OrfB family  48.4 
 
 
370 aa  359  3e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0407  ISCpe2, transposase orfB  98.77 
 
 
164 aa  324  2e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0008  family transposase  49.85 
 
 
332 aa  319  5e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2663  transposase, IS605 OrfB family  44.7 
 
 
440 aa  310  2e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.149189 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0042  transposase  45.26 
 
 
362 aa  293  3e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.580929  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1650  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  40.62 
 
 
372 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2515  transposase, IS605 OrfB family  48.86 
 
 
326 aa  282  8.000000000000001e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2479  transposase, IS605 OrfB family  41.33 
 
 
388 aa  280  2e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3241  transposase  41.51 
 
 
370 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.14303 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0404  transposase  53.91 
 
 
259 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1973  transposase  41.3 
 
 
370 aa  271  1e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662748  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2694  transposase  42.04 
 
 
370 aa  271  2e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.240385  normal  0.200603 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4512  transposase, IS605 OrfB family  39.2 
 
 
383 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.276618 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3751  transposase  39.95 
 
 
370 aa  269  5e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.947255  normal 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3755  transposase  42.34 
 
 
393 aa  269  5e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1692  transposase, IS605 OrfB family  39.2 
 
 
383 aa  269  5e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373543 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4771  transposase, IS605 OrfB family  39.2 
 
 
383 aa  269  5e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0751  transposase, IS605 OrfB family  39.2 
 
 
383 aa  269  5e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2882  transposase  40.99 
 
 
393 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.201197  normal  0.164603 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3049  transposase  41.25 
 
 
370 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00782519  normal  0.671104 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3701  transposase  40.47 
 
 
370 aa  266  4e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000275581  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0506  ISCpe2, transposase orfB  97.67 
 
 
129 aa  266  5e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1018  transposase  40.99 
 
 
370 aa  265  7e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2043  transposase  39.95 
 
 
370 aa  264  2e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.087211  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2738  transposase  40.31 
 
 
370 aa  264  2e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0501233  hitchhiker  0.000170929 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2948  transposase, IS605 OrfB family  40.27 
 
 
383 aa  263  3e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4154  transposase, IS605 OrfB family  38.4 
 
 
383 aa  263  3e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3217  transposase  39.95 
 
 
394 aa  263  4e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0165855 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0153  transposase, IS605 OrfB family  39.2 
 
 
383 aa  263  4.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0149  transposase, IS605 OrfB family  39.2 
 
 
383 aa  263  6e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00433303  hitchhiker  0.000390892 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4194  transposase, IS605 OrfB family  38.13 
 
 
383 aa  262  8.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1819  transposase, IS605 OrfB family  37.53 
 
 
410 aa  258  9e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.538618 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0703  transposase, IS605 OrfB  38.8 
 
 
368 aa  258  1e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2965  transposase, IS605 OrfB family  40.67 
 
 
405 aa  256  4e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3063  transposase, IS605 OrfB family protein  37.53 
 
 
377 aa  255  9e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.311168  normal  0.0274228 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2895  transposase, IS605 OrfB family  36.34 
 
 
405 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.56532  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1391  transposase, IS605 OrfB family  41.49 
 
 
403 aa  250  3e-65  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000173221  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4226  IS605 family transposase OrfB  37.63 
 
 
408 aa  248  1e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1623  IS605 family transposase OrfB  37.75 
 
 
391 aa  247  2e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2736  transposase, IS605 OrfB family  35.75 
 
 
391 aa  246  4e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.312474 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1629  IS605 family transposase OrfB  38.05 
 
 
402 aa  246  4e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5594  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  35.4 
 
 
381 aa  246  4e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0815398  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1764  IS605 family transposase OrfB  38.05 
 
 
402 aa  246  4e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1563  IS605 family transposase OrfB  38.05 
 
 
402 aa  246  4e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0111  transposase, IS605 OrfB family  35.73 
 
 
410 aa  245  8e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.976081  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2946  transposase, IS605 OrfB family  38.73 
 
 
384 aa  245  8e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.420176 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0880  transposase, IS605 OrfB family  36.88 
 
 
391 aa  245  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1093  transposase  35.34 
 
 
397 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.946066  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1501  transposase  35.58 
 
 
397 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.915709  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1924  transposase, IS605 OrfB family  36.2 
 
 
405 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0227  IS605 family transposase OrfB  37.5 
 
 
391 aa  244  1.9999999999999999e-63  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0173812  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0319  transposase  45.18 
 
 
304 aa  243  3e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.484329  normal  0.853888 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2805  peyer'S patch-specific virulence factor GipA  36.51 
 
 
416 aa  243  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.537832 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4435  transposase, IS605 OrfB family  38.05 
 
 
403 aa  242  7e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1127  transposase, IS605 OrfB family  38.05 
 
 
403 aa  242  7e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.319632 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4240  transposase, IS605 OrfB family  38.05 
 
 
403 aa  242  7e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142269 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3168  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  35.34 
 
 
381 aa  242  7e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1098  transposase, IS605 OrfB family  38.05 
 
 
403 aa  242  7e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5163  transposase, IS608 family  37.83 
 
 
399 aa  241  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000648868 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3044  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  36.64 
 
 
376 aa  241  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396348  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2165  IS605 family transposase OrfB  37.56 
 
 
377 aa  240  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.896467  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3220  transposase, IS605 OrfB family  36.03 
 
 
404 aa  239  5.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2900  transposase, IS605 OrfB family  36.03 
 
 
404 aa  239  5.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.355417  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4201  transposase, IS605 OrfB family  37.53 
 
 
403 aa  238  9e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2689  transposase, IS605 OrfB family  35.81 
 
 
373 aa  238  1e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104678  normal  0.242406 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4609  transposase, IS605 OrfB family  38.06 
 
 
396 aa  238  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.483897 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1784  IS605 family transposase OrfB  37.11 
 
 
375 aa  238  2e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.125878  normal  0.304536 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4039  IS605 family transposase OrfB  36.76 
 
 
377 aa  237  3e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0972683 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>