More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0096 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_1045  translation elongation factor G  46.63 
 
 		 696 aa  684    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0010  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  47.84 
 
 		 692 aa  702    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1831  elongation factor G  51.81 
 
 		 694 aa  752    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000276436  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0828  elongation factor G  53.14 
 
 		 679 aa  760    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2537  small GTP-binding protein  46.7 
 
 		 697 aa  652    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0128296  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0832  translation elongation factor G  48.92 
 
 		 695 aa  680    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2318  elongation factor G  44.56 
 
 		 701 aa  636    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.866261  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2879  elongation factor G  51.3 
 
 		 694 aa  706    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.450791  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1229  translation elongation factor G  43.95 
 
 		 673 aa  644    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0505633  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1142  elongation factor G  46.91 
 
 		 680 aa  657    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.283647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2972  translation elongation factor G  46.81 
 
 		 673 aa  643    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1367  translation elongation factor G  47.83 
 
 		 670 aa  668    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00560984 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1762  translation elongation factor G  47.41 
 
 		 667 aa  671    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.352706  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1794  elongation factor G  52.58 
 
 		 695 aa  736    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0074  elongation factor G  98.28 
 
 		 696 aa  1380    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0096  elongation factor G  100 
 
 		 696 aa  1404    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1152  elongation factor G  47.45 
 
 		 682 aa  654    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000572853  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0204  small GTP-binding protein  48.83 
 
 		 682 aa  657    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0153237  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0068  elongation factor G  46.01 
 
 		 691 aa  635    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.480211  normal  0.213325 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1022  elongation factor G  44.98 
 
 		 683 aa  633  1e-180  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2815  elongation factor G  44.41 
 
 		 697 aa  631  1e-179  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1212  elongation factor G  45.71 
 
 		 686 aa  625  1e-178  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1319  elongation factor G  44.03 
 
 		 694 aa  625  1e-178  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0378966  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  43.73 
 
 		 691 aa  625  1e-178  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000920124  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_995  translation elongation factor, GTPase  45.56 
 
 		 683 aa  622  1e-177  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0656  elongation factor G  43.82 
 
 		 694 aa  622  1e-177  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1905  elongation factor G  44.27 
 
 		 701 aa  619  1e-176  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.129196 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0944  small GTP-binding protein  43.47 
 
 		 703 aa  616  1e-175  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.303462  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0101  elongation factor G  43.54 
 
 		 692 aa  609  1e-173  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151971  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2463  elongation factor G  43.36 
 
 		 692 aa  609  1e-173  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691904  normal  0.0191825 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0138  elongation factor G  43.54 
 
 		 692 aa  609  1e-173  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000590247  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0107  elongation factor G  43.4 
 
 		 692 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0107  elongation factor G  43.4 
 
 		 692 aa  608  9.999999999999999e-173  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000647757  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0103  elongation factor G  43.4 
 
 		 692 aa  608  9.999999999999999e-173  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000410071  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1985  elongation factor G  44.09 
 
 		 697 aa  608  9.999999999999999e-173  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.786263  normal  0.270154 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0107  elongation factor G  43.4 
 
 		 692 aa  608  9.999999999999999e-173  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000392838  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4540  translation elongation factor G  42.78 
 
 		 701 aa  607  9.999999999999999e-173  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889814 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0128  elongation factor G  43.25 
 
 		 692 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000285485  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0102  elongation factor G  43.4 
 
 		 692 aa  606  9.999999999999999e-173  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000176822  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0119  elongation factor G  43.25 
 
 		 692 aa  605  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.92544e-59 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5198  elongation factor G  43.11 
 
 		 692 aa  605  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000109677  unclonable  1.5030900000000001e-24 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0086  translation elongation factor G  42.63 
 
 		 701 aa  603  1.0000000000000001e-171  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0459554 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0189  translation elongation factor G  43.21 
 
 		 691 aa  602  1.0000000000000001e-171  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01140  translation elongation factor G  42.42 
 
 		 689 aa  602  1.0000000000000001e-171  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000711404  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0101  elongation factor G  42.67 
 
 		 692 aa  599  1e-170  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000583321  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1933  elongation factor G  44.44 
 
 		 697 aa  601  1e-170  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0407442  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1969  elongation factor G  42.36 
 
 		 692 aa  601  1e-170  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.704236  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2729  elongation factor G  42.55 
 
 		 697 aa  597  1e-169  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.255792  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2860  elongation factor G  41.74 
 
 		 692 aa  597  1e-169  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0281835  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1113  translation elongation factor G  42.79 
 
 		 696 aa  597  1e-169  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.862086  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0108  elongation factor G  42.24 
 
 		 692 aa  598  1e-169  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000924117  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1188  elongation factor G  41.09 
 
 		 701 aa  596  1e-169  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122084  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0188  elongation factor G  41.59 
 
 		 693 aa  593  1e-168  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000059659  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2375  elongation factor G  41.86 
 
 		 698 aa  594  1e-168  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.092172  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0104  elongation factor G  41.69 
 
 		 689 aa  595  1e-168  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2327  elongation factor G  41.91 
 
 		 697 aa  594  1e-168  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000000853268  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0294  elongation factor G  42.04 
 
 		 693 aa  593  1e-168  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0864  elongation factor G  42.71 
 
 		 689 aa  593  1e-168  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000306199  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0181  elongation factor G  42.17 
 
 		 698 aa  592  1e-168  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000344622  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4029  elongation factor G  41.24 
 
 		 701 aa  590  1e-167  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00578031  decreased coverage  0.000000445234 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0193  elongation factor G  41.45 
 
 		 698 aa  587  1e-166  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000238252  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4059  elongation factor G  41.45 
 
 		 698 aa  587  1e-166  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00239546  hitchhiker  0.000000505947 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0334  elongation factor G  40.17 
 
 		 699 aa  588  1e-166  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  0.0000000000000603691  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0222  translation elongation factor G  42.65 
 
 		 689 aa  587  1e-166  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0488172  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4753  translation elongation factor G  42.49 
 
 		 701 aa  587  1e-166  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0974046 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0197  elongation factor G  41.45 
 
 		 698 aa  587  1e-166  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0142343  unclonable  0.0000182182 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3762  elongation factor G  41.01 
 
 		 698 aa  587  1e-166  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000464555  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1857  elongation factor G  40.17 
 
 		 699 aa  588  1e-166  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00459949  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2714  translation elongation factor G  41.57 
 
 		 691 aa  587  1e-166  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00080335  n/a   
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4467  elongation factor G  41.45 
 
 		 698 aa  587  1e-166  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3998  translation elongation factor G  42.46 
 
 		 691 aa  588  1e-166  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0770762  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0210  elongation factor G  41.59 
 
 		 698 aa  585  1e-166  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000406039  unclonable  0.0000140529 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0155  elongation factor G  42.61 
 
 		 698 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0129651  decreased coverage  0.0000592155 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002299  translation elongation factor G  41.65 
 
 		 699 aa  583  1.0000000000000001e-165  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000315857  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0228  elongation factor G  41.3 
 
 		 698 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1562  elongation factor G  42.5 
 
 		 691 aa  582  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00909597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1537  elongation factor G  42.5 
 
 		 691 aa  582  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0698  elongation factor G  39.86 
 
 		 692 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000205392  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0321  elongation factor G  40.94 
 
 		 691 aa  583  1.0000000000000001e-165  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0832332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0623  elongation factor G  41.4 
 
 		 692 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0450617  hitchhiker  1.2333199999999998e-20 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1527  translation elongation factor G  42.73 
 
 		 690 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000816454  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0978  translation elongation factor G  42.79 
 
 		 691 aa  582  1.0000000000000001e-165  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00678136  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0196  elongation factor G  41.16 
 
 		 698 aa  585  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00867813  hitchhiker  0.0000000723027 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0839  translation elongation factor G  39.77 
 
 		 706 aa  579  1e-164  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0212  elongation factor G  42.61 
 
 		 692 aa  578  1e-164  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00232583  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3663  translation elongation factor G  39.97 
 
 		 690 aa  581  1e-164  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.132269 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1343  elongation factor G  41.02 
 
 		 692 aa  582  1e-164  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141135  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0289  small GTP-binding protein  40.66 
 
 		 703 aa  580  1e-164  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000574662  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1486  elongation factor G  41.17 
 
 		 695 aa  578  1e-164  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000303107  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2185  elongation factor G  40.9 
 
 		 708 aa  579  1e-164  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00027976  normal  0.0114318 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0475  elongation factor G  41.94 
 
 		 691 aa  582  1e-164  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0196  elongation factor G  40.87 
 
 		 698 aa  582  1e-164  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000160004  hitchhiker  0.000000014201 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0191  elongation factor G  40.87 
 
 		 698 aa  582  1e-164  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0652513  decreased coverage  0.000543209 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0145  elongation factor G  40.72 
 
 		 698 aa  580  1e-164  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000355615  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0716  translation elongation factor G  42.8 
 
 		 701 aa  580  1e-164  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000130254  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0453  elongation factor G  42.23 
 
 		 691 aa  580  1e-164  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0542  elongation factor G  42.23 
 
 		 691 aa  575  1.0000000000000001e-163  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1895  elongation factor G  40.9 
 
 		 708 aa  577  1.0000000000000001e-163  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365208  normal  0.667418 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1075  elongation factor G  41.96 
 
 		 691 aa  575  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1660  translation elongation factor G  43.36 
 
 		 691 aa  575  1.0000000000000001e-163  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00040628  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>