More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0084 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_0084  pullulanase  100 
 
 		 606 aa  1223    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0557  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  45.25 
 
 		 1175 aa  563  1.0000000000000001e-159  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.641532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1458  alpha amylase, catalytic region  48.75 
 
 		 651 aa  522  1e-147  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3195  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  42.95 
 
 		 1193 aa  519  1e-146  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0729  amylopullulanase  42.45 
 
 		 600 aa  467  9.999999999999999e-131  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00401162  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1046  4-alpha-glucanotransferase  37.64 
 
 		 1145 aa  395  1e-109  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1781  alpha amylase, catalytic region  35.6 
 
 		 1847 aa  367  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3272  alpha amylase catalytic region  33.43 
 
 		 1643 aa  355  8.999999999999999e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2874  alpha amylase catalytic region  31.89 
 
 		 1299 aa  333  6e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2452  alpha amylase, catalytic region  32.72 
 
 		 1401 aa  333  7.000000000000001e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0187956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2327  alpha amylase catalytic region  31.1 
 
 		 1401 aa  325  2e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.775797  normal  0.294215 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17020  glycosidase  29.68 
 
 		 727 aa  320  6e-86  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2278  alpha amylase catalytic region  30.16 
 
 		 1307 aa  299  9e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.792883  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1856  Alpha amylase, catalytic region  30.33 
 
 		 586 aa  276  1.0000000000000001e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4336  alpha amylase catalytic region  29.32 
 
 		 914 aa  275  2.0000000000000002e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1431  alpha amylase catalytic region  33.27 
 
 		 663 aa  274  3e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.246388  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1187  alpha amylase, catalytic region  35.45 
 
 		 574 aa  258  2e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.649745  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1318  alpha amylase catalytic region  32.83 
 
 		 486 aa  254  4.0000000000000004e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.844059  normal  0.130735 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1510  alpha amylase catalytic region  31.66 
 
 		 588 aa  254  4.0000000000000004e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002973  maltodextrin glucosidase  31.33 
 
 		 608 aa  253  6e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4335  alpha amylase catalytic region  28.38 
 
 		 1753 aa  253  9.000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.167512  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3073  alpha amylase catalytic region  31.75 
 
 		 477 aa  251  2e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0693  alpha amylase catalytic region  31.43 
 
 		 589 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.544256  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3705  alpha amylase catalytic region  27.12 
 
 		 617 aa  245  1.9999999999999999e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00647332  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2092  alpha amylase catalytic subunit  30.89 
 
 		 484 aa  240  5.999999999999999e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0253645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2274  alpha amylase catalytic region  27.92 
 
 		 614 aa  239  1e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0525857 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0871  maltodextrin glucosidase  29.42 
 
 		 605 aa  234  3e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0611  alpha amylase, catalytic region  30.48 
 
 		 496 aa  234  5e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.132901 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1049  maltodextrin glucosidase  26.23 
 
 		 607 aa  231  3e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0895639 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1998  alpha amylase catalytic region  28.96 
 
 		 481 aa  228  3e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.722533  normal  0.515841 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0434  maltodextrin glucosidase  28.92 
 
 		 605 aa  228  3e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0501  maltodextrin glucosidase  29.39 
 
 		 605 aa  227  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.524518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1712  alpha amylase, catalytic region  29.52 
 
 		 481 aa  227  4e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0433  maltodextrin glucosidase  29.76 
 
 		 605 aa  227  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00351  maltodextrin glucosidase  29.76 
 
 		 605 aa  226  6e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16160  alpha amylase catalytic region  30.74 
 
 		 582 aa  227  6e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.135656  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3230  maltodextrin glucosidase  29.76 
 
 		 605 aa  226  6e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000268324 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0473  maltodextrin glucosidase  29.76 
 
 		 605 aa  227  6e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00355  hypothetical protein  29.76 
 
 		 605 aa  226  6e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1119  alpha-amylase  30.83 
 
 		 586 aa  227  6e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0181074  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3842  alpha amylase catalytic region  30.13 
 
 		 586 aa  226  7e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000752132  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0446  maltodextrin glucosidase  29.39 
 
 		 605 aa  226  9e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565903  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3206  alpha amylase catalytic region  26.54 
 
 		 605 aa  225  1e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.608393  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3419  hypothetical protein  28.81 
 
 		 481 aa  226  1e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.488491  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4065  alpha-amylase  30.24 
 
 		 586 aa  224  2e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00857502  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0480  maltodextrin glucosidase  26.54 
 
 		 604 aa  225  2e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0221  alpha amylase catalytic region  33 
 
 		 474 aa  225  2e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0795  alpha amylase, catalytic region  30.62 
 
 		 575 aa  225  2e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4120  alpha-amylase  29.73 
 
 		 586 aa  224  3e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000171258  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0459  maltodextrin glucosidase  28.72 
 
 		 605 aa  224  4.9999999999999996e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3923  alpha-amylase  29.55 
 
 		 586 aa  223  6e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.077221  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3771  neopullulanase  29.55 
 
 		 586 aa  223  6e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00823842  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4230  alpha-amylase  29.55 
 
 		 586 aa  223  6e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.300485  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4033  alpha-amylase  29.37 
 
 		 586 aa  223  6e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1852  neopullulanase  35.05 
 
 		 584 aa  223  6e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.496782  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0209  alpha amylase catalytic region  28.48 
 
 		 587 aa  223  6e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.214929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0440  maltodextrin glucosidase  29.18 
 
 		 605 aa  223  7e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2715  alpha amylase catalytic region  27.41 
 
 		 586 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.783965  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4343  alpha amylase catalytic region  29.4 
 
 		 481 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3755  neopullulanase  29.19 
 
 		 586 aa  221  3e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000420185  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0586  alpha amylase catalytic region  30.65 
 
 		 479 aa  221  3.9999999999999997e-56  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.532649  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2916  Alpha-amylase  30.16 
 
 		 472 aa  221  3.9999999999999997e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0987  alpha amylase catalytic region  30.49 
 
 		 473 aa  219  1e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0969  alpha amylase, catalytic region  30.49 
 
 		 473 aa  219  1e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2869  alpha amylase catalytic region  32.12 
 
 		 578 aa  218  2e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4625  alpha amylase catalytic region  29.55 
 
 		 481 aa  218  2.9999999999999998e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4139  alpha-amylase  29.45 
 
 		 586 aa  217  5e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00110847  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1613  alpha amylase, catalytic region  29.79 
 
 		 589 aa  216  5.9999999999999996e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.050548  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0534  alpha amylase catalytic region  28.46 
 
 		 487 aa  215  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.595542  normal  0.941542 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1580  alpha amylase, catalytic region  32.22 
 
 		 475 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0569736  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0369  alpha amylase catalytic region  30.48 
 
 		 659 aa  214  3.9999999999999995e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2579  alpha amylase catalytic region  31.01 
 
 		 576 aa  211  2e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000456037  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4392  alpha amylase, catalytic region  30 
 
 		 493 aa  211  4e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.47907 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3271  maltodextrin glucosidase  29.05 
 
 		 609 aa  210  5e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2017  Alpha amylase, catalytic region  29.79 
 
 		 488 aa  210  7e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00107336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3131  maltodextrin glucosidase  30.15 
 
 		 609 aa  210  7e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1313  alpha amylase, catalytic domain protein  30.47 
 
 		 459 aa  209  1e-52  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1114  alpha amylase catalytic subunit  29.4 
 
 		 580 aa  209  2e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0144434  normal  0.666267 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1971  alpha amylase catalytic region  28.23 
 
 		 486 aa  207  4e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0248141  normal  0.0160527 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1944  alpha amylase catalytic region  28.23 
 
 		 486 aa  207  7e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0215  neopullulanase  29.7 
 
 		 574 aa  204  4e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0425343  hitchhiker  0.000179088 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0802  glycosy hydrolase family protein  31.65 
 
 		 610 aa  204  6e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.124248  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0789  cymH protein  31.65 
 
 		 610 aa  203  8e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1265  alpha amylase catalytic region  31.19 
 
 		 463 aa  196  1e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0475  alpha amylase, catalytic region  27.01 
 
 		 608 aa  194  6e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.350663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1524  alpha amylase catalytic region  25.26 
 
 		 634 aa  192  2e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.383652 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1834  alpha amylase domain-containing protein  28.6 
 
 		 480 aa  191  2.9999999999999997e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.108338  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2350  alpha amylase catalytic region  31.59 
 
 		 583 aa  191  2.9999999999999997e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21691  glycoside hydrolase family protein  30.2 
 
 		 483 aa  191  4e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0470032 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1167  alpha amylase catalytic region  27.79 
 
 		 576 aa  188  2e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.823071  normal  0.49953 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3146  alpha amylase catalytic region  28.76 
 
 		 622 aa  187  5e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.476414 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2907  alpha amylase catalytic subunit  30.23 
 
 		 715 aa  186  9e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.245602 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1414  alpha amylase catalytic region  26.55 
 
 		 703 aa  183  8.000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0623392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3328  maltodextrin glucosidase  23.3 
 
 		 596 aa  182  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.307817 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3180  alpha amylase catalytic region  25.97 
 
 		 635 aa  180  7e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000161809  normal  0.231974 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0747  alpha amylase, catalytic region  24.44 
 
 		 655 aa  180  8e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.29476  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0794  alpha amylase catalytic region  30.51 
 
 		 562 aa  179  1e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13890  glycosidase  22.43 
 
 		 624 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.496833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0501  alpha amylase domain-containing protein  27.33 
 
 		 476 aa  173  7.999999999999999e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.259034  normal  0.140596 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0286  alpha amylase catalytic region  24.83 
 
 		 611 aa  172  1e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.109454  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>