More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0075 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_0075  putative methyltransferase  100 
 
 		 267 aa  544  1e-154  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01744  hypothetical protein  25.18 
 
 		 265 aa  103  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5288  Methyltransferase type 11  29.96 
 
 		 275 aa  102  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115739  normal  0.313513 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0178  methyltransferase type 11  28.68 
 
 		 265 aa  97.4  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1675  Methyltransferase type 11  29.14 
 
 		 274 aa  95.9  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0832286  hitchhiker  0.00263089 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4585  Methyltransferase type 11  27.24 
 
 		 273 aa  89.4  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1519  Methyltransferase type 11  40.13 
 
 		 274 aa  89  8e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.799591 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3299  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  26.61 
 
 		 280 aa  88.2  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0260  Methyltransferase type 11  31.65 
 
 		 267 aa  75.5  0.0000000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00488037  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00925  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  24.37 
 
 		 261 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00177111  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2722  Methyltransferase type 11  24.37 
 
 		 261 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000229495  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00932  hypothetical protein  24.37 
 
 		 261 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00185326  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2403  putative metallothionein SmtA  24.37 
 
 		 261 aa  72  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000691412  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1082  putative metallothionein SmtA  24.37 
 
 		 261 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00106092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4205  methyltransferase type 11  27.03 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.940234 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2199  putative metallothionein SmtA  24.37 
 
 		 261 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000201966  normal  0.110054 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1028  putative metallothionein SmtA  24.37 
 
 		 261 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000016657  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1020  putative metallothionein SmtA  24.37 
 
 		 261 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000367391  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2675  putative metallothionein SmtA  24.37 
 
 		 261 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000353459  normal  0.415461 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.86 
 
 		 250 aa  67.4  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  26.42 
 
 		 263 aa  68.2  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1407  methyltransferase type 11  30.33 
 
 		 196 aa  66.6  0.0000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4752  putative methionine biosynthesis protein MetW  24.41 
 
 		 541 aa  66.6  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.432574 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.87 
 
 		 243 aa  66.2  0.0000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0458  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.87 
 
 		 234 aa  65.9  0.0000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1959  methyltransferase type 11  31.97 
 
 		 244 aa  65.5  0.0000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4902  putative SAM-dependent methyltransferase  23.94 
 
 		 541 aa  63.5  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0721  hypothetical protein  31.51 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.856031 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0334  Methyltransferase type 11  35.92 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000194414  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2850  methylase  33.33 
 
 		 235 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00782865  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4899  putative SAM-dependent methyltransferase  24.41 
 
 		 541 aa  62.8  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00310573 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1604  Methyltransferase type 12  25.88 
 
 		 276 aa  62.4  0.000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.654755  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4828  methyltransferase domain family  23.94 
 
 		 541 aa  62.4  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1439  methyltransferase  34.48 
 
 		 212 aa  62  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00779237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.93 
 
 		 230 aa  62  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3113  Methyltransferase type 11  24.65 
 
 		 273 aa  61.6  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1888  methyltransferase type 11  26.35 
 
 		 209 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0468  hypothetical protein  30.34 
 
 		 249 aa  61.2  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4852  putative SAM-dependent methyltransferase  23.47 
 
 		 541 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0491612 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30 
 
 		 238 aa  61.2  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2830  methylase  31.97 
 
 		 238 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.036188  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0655  D-alanine--D-alanine ligase  36.11 
 
 		 663 aa  60.5  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.24382  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0592  methyltransferase type 11  29.58 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.499783  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5595  Methyltransferase type 11  33.01 
 
 		 239 aa  60.1  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2283  Methyltransferase type 11  31.3 
 
 		 264 aa  59.7  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000161897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  24.62 
 
 		 243 aa  59.7  0.00000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1068  methyltransferase type 11  31.93 
 
 		 258 aa  59.7  0.00000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.15636  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1664  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.81 
 
 		 230 aa  59.3  0.00000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1024  putative metallothionein SmtA  22.81 
 
 		 267 aa  59.3  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.144274  normal  0.551504 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1056  putative metallothionein SmtA  22.81 
 
 		 267 aa  58.9  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0602785 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0997  putative metallothionein SmtA  22.81 
 
 		 267 aa  58.9  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.266496  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0712  Methyltransferase type 11  28.95 
 
 		 246 aa  58.9  0.00000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1989  methyltransferase type 11  32.11 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512707  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1105  putative metallothionein SmtA  22.81 
 
 		 267 aa  58.9  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.113863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1089  putative metallothionein SmtA  22.81 
 
 		 267 aa  58.9  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0480774  normal  0.198133 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0358  methyltransferase type 11  37.04 
 
 		 637 aa  58.9  0.00000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290663  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01586  putative metallothionein SmtA  26.07 
 
 		 263 aa  58.9  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3563  methyltransferase type 11  32.35 
 
 		 249 aa  58.9  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1658  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.81 
 
 		 230 aa  58.5  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  29.38 
 
 		 238 aa  58.2  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2809  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  30.41 
 
 		 235 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3824  Methyltransferase type 11  30.92 
 
 		 328 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3876  Methyltransferase type 11  34.82 
 
 		 241 aa  58.5  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0646  hypothetical protein  33.85 
 
 		 280 aa  58.2  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0680  hypothetical protein  33.85 
 
 		 280 aa  58.2  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1091  methyltransferase type 11  32.71 
 
 		 273 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.117678 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2594  Methyltransferase type 11  30.2 
 
 		 262 aa  57.8  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0925  Methyltransferase type 11  34.21 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0162  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.17 
 
 		 277 aa  57.4  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.466565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0237  methyltransferase type 11  26.35 
 
 		 259 aa  57.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635147  decreased coverage  0.000545483 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1411  Methyltransferase type 11  34.48 
 
 		 246 aa  58.2  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.110905 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.97 
 
 		 236 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0947  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.06 
 
 		 252 aa  57.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  28.67 
 
 		 258 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1763  hypothetical protein  39.39 
 
 		 109 aa  57.4  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.013046  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003937  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase functionally coupled to the MukBEF chromosome partitioning mechanism  25.22 
 
 		 263 aa  57.4  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000294838  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0274  Methyltransferase type 11  32.74 
 
 		 250 aa  57  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000124528  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7304  hypothetical protein  30.97 
 
 		 296 aa  57  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  27.27 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5754  Methyltransferase type 12  31.19 
 
 		 272 aa  56.6  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.60689 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1515  methyltransferase domain-containing protein  31.43 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2259  methyltransferase type 11  34 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1776  putative metallothionein SmtA  23.28 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.529612  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02124  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.79 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.369264  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0699  methyltransferase type 11  25 
 
 		 251 aa  56.6  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.29 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08556  methyltransferase, putative  33.04 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1722  methyltransferase type 12  30.34 
 
 		 575 aa  55.8  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0792321 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2260  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.97 
 
 		 254 aa  56.2  0.0000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0516247  normal  0.429891 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4620  methyltransferase type 11  28.21 
 
 		 235 aa  55.5  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0418721  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2546  Methyltransferase type 11  30.23 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0272722 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2775  Methyltransferase type 11  33.98 
 
 		 277 aa  55.5  0.0000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2899  hypothetical protein  32.67 
 
 		 236 aa  55.5  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000010502  normal  0.0506013 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1264  Methyltransferase type 11  27.32 
 
 		 262 aa  55.5  0.0000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4739  Methyltransferase type 11  33.67 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1453  SAM-dependent methyltransferase  33.33 
 
 		 252 aa  55.5  0.0000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.938233  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17011  glycine-sarcosine methyltransferase  25.11 
 
 		 283 aa  55.5  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.650309 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1026  methyltransferase type 11  27.1 
 
 		 207 aa  54.7  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.735672  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2460  hypothetical protein  35.96 
 
 		 281 aa  55.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.171848  normal  0.0255916 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1880  Methyltransferase type 11  27.67 
 
 		 240 aa  55.1  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>