219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0068 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0065  major facilitator family transporter  99.74 
 
 		 388 aa  765    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0068  transporter, putative  100 
 
 		 391 aa  773    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0130  major facilitator transporter  32.39 
 
 		 398 aa  172  9e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.453953  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0962  major facilitator transporter  23.16 
 
 		 415 aa  84.7  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3989  major facilitator transporter  23.75 
 
 		 406 aa  77  0.0000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0137476  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1480  major facilitator transporter  20.82 
 
 		 395 aa  76.6  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0063  major facilitator transporter  23.89 
 
 		 406 aa  73.6  0.000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0580428  unclonable  0.0000312687 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0067  major facilitator transporter  23.89 
 
 		 406 aa  73.6  0.000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.700351  unclonable  0.0000000000855622 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0065  major facilitator transporter  23.57 
 
 		 406 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.596651  decreased coverage  0.0000000729069 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2076  major facilitator superfamily MFS_1  21.27 
 
 		 419 aa  72.4  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0062  major facilitator transporter  23.99 
 
 		 406 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.7183  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_11209  hypothetical protein  20.11 
 
 		 440 aa  70.1  0.00000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.873381  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08768  conserved hypothetical protein  22.19 
 
 		 433 aa  68.9  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0863373  normal  0.186532 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0067  major facilitator transporter  23.99 
 
 		 406 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.37883  hitchhiker  0.00294151 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4287  major facilitator transporter  24.01 
 
 		 406 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000504378  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0694  transporter, major facilitator family protein  23.92 
 
 		 393 aa  68.2  0.0000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3819  major facilitator transporter  24.57 
 
 		 425 aa  67.8  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000056973  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0066  major facilitator superfamily MFS_1  23.99 
 
 		 406 aa  67  0.0000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.574631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1261  major facilitator transporter  21.33 
 
 		 406 aa  66.6  0.0000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1068  major facilitator transporter  23.37 
 
 		 395 aa  65.9  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.355091 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0563  major facilitator transporter  23.16 
 
 		 425 aa  64.3  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3689  major facilitator transporter  22.02 
 
 		 395 aa  64.3  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.890108  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4128  L-fucose transporter  24.5 
 
 		 431 aa  63.2  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2750  L-fucose transporter  23.99 
 
 		 431 aa  63.2  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1293  major facilitator superfamily MFS_1  22.13 
 
 		 407 aa  62.8  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.180985  normal  0.234354 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4021  L-fucose transporter  23.75 
 
 		 417 aa  62.8  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13440  major facilitator superfamily MFS_1  21.94 
 
 		 425 aa  61.2  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1304  major facilitator transporter  26.9 
 
 		 390 aa  60.5  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4329  major facilitator superfamily MFS_1  21.16 
 
 		 420 aa  60.5  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.699497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2967  major facilitator transporter  25.35 
 
 		 392 aa  60.1  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1994  L-fucose transporter  20.7 
 
 		 432 aa  58.9  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.486095 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2963  major facilitator superfamily MFS_1  22.12 
 
 		 421 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000121972  normal  0.284618 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3671  glucose/galactose transporter  25.29 
 
 		 435 aa  58.9  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2533  hypothetical protein  29.17 
 
 		 398 aa  58.2  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0651893  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1163  hypothetical protein  19.95 
 
 		 391 aa  57.8  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.38877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0309  major facilitator superfamily MFS_1  23.81 
 
 		 394 aa  57.8  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal  0.0116051 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1174  major facilitator transporter  22.31 
 
 		 379 aa  57.8  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.394628  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2103  major facilitator transporter  20.05 
 
 		 449 aa  57  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.552492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00677  transporter, putative  23 
 
 		 405 aa  57  0.0000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00179637  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1662  major facilitator superfamily MFS_1  20.83 
 
 		 388 aa  57  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2822  major facilitator superfamily MFS_1  20.97 
 
 		 415 aa  56.2  0.0000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1115  major facilitator superfamily MFS_1  21.61 
 
 		 393 aa  56.6  0.0000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.948444  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3964  transporter, putative  25 
 
 		 407 aa  55.8  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000523123  normal  0.125467 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2123  major facilitator superfamily MFS_1  21.58 
 
 		 395 aa  55.1  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.226237  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0275  major facilitator superfamily MFS_1  24 
 
 		 371 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1433  transporter, MFS superfamily  19.17 
 
 		 420 aa  55.5  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.811642  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2115  major facilitator transporter  19.66 
 
 		 386 aa  54.3  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1232  major facilitator transporter  23.15 
 
 		 421 aa  54.7  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1403  glucose/galactose transporter  23.3 
 
 		 415 aa  54.3  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000325262  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1656  glucose/galactose transporter  26.03 
 
 		 458 aa  54.3  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1663  glucose/galactose transporter  23.53 
 
 		 415 aa  53.9  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1336  major facilitator transporter  21.82 
 
 		 404 aa  53.5  0.000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0364  glucose/galactose transporter family protein  25.32 
 
 		 408 aa  53.1  0.000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000442276  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28819  predicted protein  23.08 
 
 		 505 aa  53.1  0.000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00143526 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  20.16 
 
 		 413 aa  53.1  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1827  glucose/galactose transporter  25.32 
 
 		 408 aa  53.1  0.000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1627  membrane transport protein  22.76 
 
 		 428 aa  52.8  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1714  membrane transport protein  22.76 
 
 		 428 aa  52.8  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1793  membrane transport protein  22.76 
 
 		 428 aa  52.8  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.626262  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  20.56 
 
 		 413 aa  52.4  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1853  putative transporter  20.51 
 
 		 417 aa  52.4  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117056  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1147  major facilitator superfamily drug efflux transporter  24.26 
 
 		 516 aa  52.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.777739  normal  0.947879 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0005  major facilitator transporter  21.52 
 
 		 421 aa  52.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0753564  normal  0.228788 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0419  major facilitator transporter  24.56 
 
 		 394 aa  52.8  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.664236  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0981  hypothetical protein  19.58 
 
 		 415 aa  52  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08080  arabinose efflux permease family protein  26.59 
 
 		 398 aa  52  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1438  major facilitator transporter  20.51 
 
 		 415 aa  51.6  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0738  major facilitator superfamily transporter  23.2 
 
 		 488 aa  52  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04660  Major Facilitator Superfamily transporter  22.26 
 
 		 393 aa  51.6  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1655  membrane transport protein  23.06 
 
 		 428 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1647  membrane transport protein  22.52 
 
 		 428 aa  51.6  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2609  major facilitator transporter  24.84 
 
 		 516 aa  50.8  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.151615 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05760  fucose permease  20.64 
 
 		 414 aa  50.4  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0598938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2622  major facilitator superfamily MFS_1  23.88 
 
 		 790 aa  50.1  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03795  glucose/galactose transporter family protein  21.73 
 
 		 420 aa  50.1  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.268682  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2374  major facilitator superfamily MFS_1  25.5 
 
 		 401 aa  50.1  0.00008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1955  major facilitator superfamily MFS_1  26.36 
 
 		 393 aa  49.7  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.135687  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6958  major facilitator superfamily MFS_1  18.97 
 
 		 427 aa  49.7  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6417  major facilitator transporter  18.77 
 
 		 439 aa  49.7  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1017  glucose/galactose transporter  21.12 
 
 		 428 aa  48.9  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4817  nitrate transporter  30 
 
 		 437 aa  48.9  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.438649  normal  0.974789 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0119  glucose/galactose transporter  22.81 
 
 		 425 aa  49.3  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18660  hypothetical protein  19.25 
 
 		 383 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.166024 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3774  major facilitator transporter  22.73 
 
 		 428 aa  49.3  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.108427 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4199  major facilitator transporter  20.88 
 
 		 433 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.153637  normal  0.361901 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2986  glucose/galactose transporter  23.18 
 
 		 412 aa  48.9  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1615  hypothetical protein  19.62 
 
 		 383 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00812  predicted transporter  22.08 
 
 		 402 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.490752  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2797  major facilitator superfamily MFS_1  22.08 
 
 		 402 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.354207  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0067  major facilitator superfamily MFS_1  21.54 
 
 		 449 aa  48.5  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5462  major facilitator superfamily MFS_1  23.49 
 
 		 528 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1459  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.84 
 
 		 483 aa  48.9  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.257317  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1824  major facilitator transporter  19.27 
 
 		 415 aa  48.5  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.582867  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3505  major facilitator transporter  20.3 
 
 		 412 aa  48.5  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0439  major facilitator transporter  22.93 
 
 		 394 aa  48.9  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.116076  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0998  transporter, major facilitator family  22.08 
 
 		 402 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.207413 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0292  glucose/galactose transporter  23.84 
 
 		 389 aa  48.1  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4044  L-fucose transporter  21.66 
 
 		 420 aa  48.9  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0917  major facilitator transporter  22.08 
 
 		 402 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04650  arabinose efflux permease family protein  38.57 
 
 		 405 aa  48.9  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>