271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0054 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_0054  dihydrofolate reductase  100 
 
 		 161 aa  320  5e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.892369  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0051  dihydrofolate reductase  92.45 
 
 		 161 aa  295  2e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1310  dihydrofolate reductase region  44.72 
 
 		 161 aa  142  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000886123  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2571  dihydrofolate reductase  42.36 
 
 		 195 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115778  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3741  dihydrofolate reductase  43.12 
 
 		 169 aa  135  3.0000000000000003e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.674026  hitchhiker  0.000322893 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0914  dihydrofolate reductase  40.13 
 
 		 167 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1058  dihydrofolate reductase  40.13 
 
 		 167 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2569  dihydrofolate reductase  37.89 
 
 		 166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.858438  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1398  dihydrofolate reductase  38.41 
 
 		 172 aa  130  6.999999999999999e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6452  Dihydrofolate reductase  42.86 
 
 		 164 aa  130  7.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.816768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0189  dihydrofolate reductase  39.24 
 
 		 161 aa  130  7.999999999999999e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0664  Dihydrofolate reductase  42.77 
 
 		 163 aa  129  1.0000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.618324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1354  dihydrofolate reductase  38.41 
 
 		 172 aa  129  1.0000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.340933  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0914  dihydrofolate reductase  36.65 
 
 		 166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1963  dihydrofolate reductase  36.36 
 
 		 183 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0932  dihydrofolate reductase  38.36 
 
 		 163 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2824  dihydrofolate reductase  41.26 
 
 		 160 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1041  dihydrofolate reductase  38.96 
 
 		 160 aa  128  3e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0691593  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1074  dihydrofolate reductase  38.96 
 
 		 160 aa  128  3e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0303057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0782  dihydrofolate reductase  37.04 
 
 		 166 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.039834 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0972  dihydrofolate reductase  38.31 
 
 		 160 aa  127  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.415398  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2842  dihydrofolate reductase  36.88 
 
 		 167 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.551792  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2902  dihydrofolate reductase  36.25 
 
 		 167 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.95504  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0244  dihydrofolate reductase  36.25 
 
 		 167 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0387  dihydrofolate reductase  36.25 
 
 		 167 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2530  dihydrofolate reductase  36.25 
 
 		 167 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0903  dihydrofolate reductase  36.25 
 
 		 167 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2729  dihydrofolate reductase  43.7 
 
 		 172 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0802679  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3318  Dihydrofolate reductase  37.66 
 
 		 160 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2952  dihydrofolate reductase  36.88 
 
 		 167 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.700087  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3214  dihydrofolate reductase  39.22 
 
 		 160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1793  dihydrofolate reductase  37.35 
 
 		 174 aa  125  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.928797  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2431  dihydrofolate reductase  37.42 
 
 		 171 aa  125  3e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2350  dihydrofolate reductase region  40.12 
 
 		 178 aa  124  5e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3120  dihydrofolate reductase  39.22 
 
 		 160 aa  124  5e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3735  dihydrofolate reductase  36.36 
 
 		 171 aa  124  8.000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0124901  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1674  dihydrofolate reductase  36.25 
 
 		 219 aa  123  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.69831  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0900  dihydrofolate reductase  35.71 
 
 		 160 aa  123  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.131279  normal  0.732147 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1582  Dihydrofolate reductase  37.89 
 
 		 162 aa  123  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274022  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2748  Dihydrofolate reductase  38.99 
 
 		 162 aa  122  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0597  dihydrofolate reductase  37.27 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.235828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0423  dihydrofolate reductase  36.88 
 
 		 166 aa  122  2e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200309 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1468  dihydrofolate reductase  43.07 
 
 		 160 aa  122  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0959  dihydrofolate reductase  41.91 
 
 		 160 aa  122  3e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1009  dihydrofolate reductase  36.77 
 
 		 160 aa  122  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415728  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2039  dihydrofolate reductase  37.74 
 
 		 167 aa  122  3e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.570547  normal  0.482414 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2886  Dihydrofolate reductase  40.99 
 
 		 166 aa  121  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0984  dihydrofolate reductase  36.13 
 
 		 160 aa  122  3e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.69665  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4196  dihydrofolate reductase  37.5 
 
 		 166 aa  121  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1750  dihydrofolate reductase  37.65 
 
 		 167 aa  121  4e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.175283  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1051  Dihydrofolate reductase  41.88 
 
 		 163 aa  121  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0874  dihydrofolate reductase  35.48 
 
 		 160 aa  121  5e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0789491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2037  dihydrofolate reductase  38.04 
 
 		 179 aa  120  5e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.750289  normal  0.473794 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2964  Dihydrofolate reductase  36.13 
 
 		 166 aa  120  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159706  normal  0.451516 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1420  dihydrofolate reductase  40.43 
 
 		 178 aa  120  6e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2659  dihydrofolate reductase  39.75 
 
 		 166 aa  120  8e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.691401 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4209  dihydrofolate reductase  35.98 
 
 		 176 aa  120  8e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4505  dihydrofolate reductase  39.16 
 
 		 170 aa  119  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13858  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3646  dihydrofolate reductase  34.42 
 
 		 160 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2781  Dihydrofolate reductase  40.99 
 
 		 166 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.258533 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2811  Dihydrofolate reductase  37.82 
 
 		 292 aa  120  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000627481  hitchhiker  0.0000305943 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00052  dihydrofolate reductase  36.65 
 
 		 159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0098  dihydrofolate reductase  36.65 
 
 		 159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.653551 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3607  dihydrofolate reductase  36.65 
 
 		 159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332333 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0092  dihydrofolate reductase  36.65 
 
 		 159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.197159 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0042  dihydrofolate reductase  36.65 
 
 		 159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2221  dihydrofolate reductase  37.11 
 
 		 209 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0093  dihydrofolate reductase  36.65 
 
 		 159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1822  dihydrofolate reductase  35 
 
 		 164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11244  hitchhiker  0.00306792 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2729  dihydrofolate reductase  38.18 
 
 		 178 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0096  dihydrofolate reductase  36.65 
 
 		 159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0720  dihydrofolate reductase  35.4 
 
 		 160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.919586 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00051  hypothetical protein  36.65 
 
 		 159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0052  dihydrofolate reductase  36.65 
 
 		 159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.264396  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13348  dihydrofolate reductase  38.85 
 
 		 160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.704546  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0091  dihydrofolate reductase  36.65 
 
 		 159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.895795 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0054  dihydrofolate reductase  36.65 
 
 		 159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3551  Dihydrofolate reductase  36.65 
 
 		 196 aa  118  3e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0050  dihydrofolate reductase  36.65 
 
 		 196 aa  118  3e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.450338 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1020  dihydrofolate reductase  36.54 
 
 		 166 aa  118  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.831665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6098  dihydrofolate reductase  36.59 
 
 		 170 aa  118  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00805  hypothetical protein  38.27 
 
 		 159 aa  118  3.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3353  dihydrofolate reductase  35.8 
 
 		 179 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0397175 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0946  dihydrofolate reductase oxidoreductase protein  34.57 
 
 		 167 aa  117  4.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0266319 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4526  dihydrofolate reductase  37.42 
 
 		 166 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.85477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0300  hypothetical protein  39.86 
 
 		 164 aa  117  4.9999999999999996e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.201622 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1569  dihydrofolate reductase  38.51 
 
 		 161 aa  117  6e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210391  normal  0.206079 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1045  dihydrofolate reductase  45.31 
 
 		 163 aa  117  6e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.46602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0052  dihydrofolate reductase  36.65 
 
 		 196 aa  117  7e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2922  dihydrofolate reductase  33.99 
 
 		 160 aa  117  7e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000038363  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2773  dihydrofolate reductase  34.38 
 
 		 166 aa  117  7e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0219199 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0443  dihydrofolate reductase  36.69 
 
 		 168 aa  117  7e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0437  dihydrofolate reductase  34.36 
 
 		 170 aa  117  9e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0958  dihydrofolate reductase  37.65 
 
 		 195 aa  117  9e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0925  dihydrofolate reductase  36.42 
 
 		 169 aa  117  9e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1729  dihydrofolate reductase  34.15 
 
 		 198 aa  117  9e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000733059 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04648  dihydrofolate reductase  38.51 
 
 		 164 aa  116  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.20271  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0579  dihydrofolate reductase  35.44 
 
 		 163 aa  116  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0962  dihydrofolate reductase  36.48 
 
 		 166 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.505116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2542  Dihydrofolate reductase  32.93 
 
 		 172 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.929799 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>