More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2983 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2983  cysteine desulfurase family protein  100 
 
 
386 aa  784    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2661  cysteine desulfurase family protein  99.22 
 
 
386 aa  779    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.146987  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1912  selenocysteine lyase  45.71 
 
 
382 aa  349  5e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2313  cysteine desulfurase family protein  42.93 
 
 
380 aa  342  9e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1038  cysteine desulfurase family protein  44.5 
 
 
382 aa  332  8e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000028217  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1300  cysteine desulphurase-like protein  39.53 
 
 
381 aa  330  2e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0145428  hitchhiker  0.00325394 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3075  cysteine desulfurase family protein  42.15 
 
 
381 aa  331  2e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000209414 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2402  cysteine desulfurase family protein  42.82 
 
 
380 aa  329  4e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2495  cysteine desulfurase family protein  38.95 
 
 
385 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.123711  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1932  cysteine desulfurase family protein  38.9 
 
 
380 aa  319  5e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0655  cysteine desulfurase family protein  43.8 
 
 
381 aa  319  6e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.696219  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2214  cysteine desulphurase-like protein  40.53 
 
 
383 aa  317  2e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0350826  hitchhiker  0.000530193 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2291  cysteine desulfurase family protein  38.22 
 
 
380 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1692  cysteine desulfurase family protein  41.15 
 
 
385 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0304  selenocysteine lyase  38.58 
 
 
381 aa  311  2e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000158193  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0618  cysteine desulfurase family protein  45.85 
 
 
381 aa  310  2e-83  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1489  cysteine desulfurase family protein  41.95 
 
 
379 aa  308  1.0000000000000001e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.742565  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2316  cysteine desulfurase family protein  39.63 
 
 
383 aa  306  3e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.996652  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2696  cysteine desulfurase family protein  37.5 
 
 
380 aa  306  5.0000000000000004e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0250  cysteine desulfurase family protein  39.58 
 
 
387 aa  306  6e-82  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1868  aminotransferase, class V  37.53 
 
 
380 aa  304  1.0000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0266  cysteine desulfurase family protein  38.26 
 
 
388 aa  301  9e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1403  cysteine desulphurase-like protein  40.53 
 
 
383 aa  300  2e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1219  cysteine desulfurase family protein  40.63 
 
 
384 aa  300  2e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0234  selenocysteine lyase  38.24 
 
 
400 aa  298  1e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1204  cysteine desulfurase family protein  38.52 
 
 
381 aa  290  4e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.515711 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0636  cysteine desulphurase-like protein  37.43 
 
 
398 aa  287  2e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.024881  normal  0.355065 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2460  aminotransferase, class V  39.53 
 
 
388 aa  281  1e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0711666  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1729  cysteine desulfurase family protein  36.13 
 
 
385 aa  280  4e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000242055  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3101  cysteine desulfurase family protein  41.21 
 
 
378 aa  279  7e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1876  cysteine desulfurase family protein  39.89 
 
 
381 aa  277  3e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25440  cysteine desulfurase family protein  35.88 
 
 
380 aa  268  1e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0587445  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0679  aminotransferase, class V  38.48 
 
 
382 aa  266  5e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2209  aminotransferase, class V  38.7 
 
 
390 aa  265  7e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.159851  normal  0.459608 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0640  aminotransferase class V  33.88 
 
 
413 aa  253  3e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3910  Cysteine desulfurase  37.63 
 
 
376 aa  252  7e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1687  cysteine desulfurase family protein  35.5 
 
 
379 aa  252  1e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.682432 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0881  aminotransferase, class V  36.22 
 
 
388 aa  249  6e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0070311  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0249  Cysteine desulfurase  32.99 
 
 
392 aa  249  8e-65  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.246818 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0298  aminotransferase, class V  36.55 
 
 
383 aa  238  2e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0255  aminotransferase, class V  35.86 
 
 
386 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.409  normal  0.112068 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0365  Cysteine desulfurase  34.21 
 
 
378 aa  231  2e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.60313  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0028  aminotransferase class V  31.05 
 
 
380 aa  218  2e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.354528  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2068  aminotransferase, class V  33.16 
 
 
392 aa  217  4e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1751  aminotransferase, class V  31.32 
 
 
376 aa  208  1e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0949  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.06 
 
 
412 aa  206  7e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286124  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2203  aminotransferase, class V  32.29 
 
 
393 aa  196  6e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1696  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.63 
 
 
417 aa  191  1e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  31.43 
 
 
408 aa  190  2.9999999999999997e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2329  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.47 
 
 
409 aa  189  7e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.29 
 
 
406 aa  189  8e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1512  aminotransferase class V  29.09 
 
 
896 aa  187  2e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0374099 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2248  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.91 
 
 
425 aa  186  5e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0748033  normal  0.0430442 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2006  cysteine desulphurases, SufS  30.21 
 
 
395 aa  185  9e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0893  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.24 
 
 
412 aa  185  1.0000000000000001e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.918138  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0289  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.25 
 
 
415 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.63 
 
 
406 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4340  aminotransferase class V  29.9 
 
 
403 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.390649  normal  0.485462 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.73 
 
 
406 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1941  aminotransferase class V  29.69 
 
 
394 aa  182  8.000000000000001e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0312599  normal  0.253942 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1215  aminotransferase class V  29.46 
 
 
393 aa  182  8.000000000000001e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1968  cysteine desulfurase  30.23 
 
 
421 aa  182  8.000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0729  NifS protein  31.43 
 
 
393 aa  182  1e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1838  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.25 
 
 
406 aa  182  1e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0112034  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.47 
 
 
416 aa  182  1e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1122  hypothetical protein  31.25 
 
 
879 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  32.11 
 
 
406 aa  180  4e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5118  aminotransferase, class V  32.37 
 
 
406 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4849  aminotransferase, class V  32.37 
 
 
406 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4705  aminotransferase, class V, cysteine desulfhydrase  32.37 
 
 
406 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  32.11 
 
 
406 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  32.11 
 
 
406 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.27 
 
 
418 aa  179  7e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4690  aminotransferase, class V; cysteine desulfhydrase  32.11 
 
 
406 aa  179  8e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5086  cysteine desulfurase SufS  32.11 
 
 
406 aa  179  8e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1972  hypothetical protein  32.55 
 
 
405 aa  179  9e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.128198  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5215  aminotransferase, class V  32.37 
 
 
406 aa  178  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1984  aminotransferase, class V  28.97 
 
 
394 aa  178  1e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.278859  normal  0.836735 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0427  cysteine desulphurases, SufS  30.85 
 
 
420 aa  177  3e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.21345  normal  0.0671623 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1112  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  30.08 
 
 
417 aa  176  5e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.966588  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1762  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.48 
 
 
572 aa  176  6e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2054  aminotransferase, class V  29.35 
 
 
880 aa  176  6e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.754406 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0799  cysteine desulfurase  29.92 
 
 
423 aa  176  7e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.635677  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4655  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.7 
 
 
644 aa  175  9.999999999999999e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00370812  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.15 
 
 
406 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1840  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.41 
 
 
414 aa  175  9.999999999999999e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00877809  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.57 
 
 
885 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0084  aminotransferase, class V superfamily protein  33 
 
 
422 aa  173  3.9999999999999995e-42  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.153468  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1041  aminotransferase, class V  27.98 
 
 
878 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31514  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2554  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.06 
 
 
428 aa  173  5e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0418  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.62 
 
 
419 aa  172  9e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0429  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.62 
 
 
419 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3352  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.77 
 
 
415 aa  171  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.143815 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  30.31 
 
 
420 aa  171  3e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2661  cysteine desulfurase  29.87 
 
 
626 aa  171  3e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0591977  normal  0.463261 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0224  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.15 
 
 
414 aa  169  5e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4732  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.03 
 
 
420 aa  169  6e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1552  cysteine desulphurases, SufS  28.5 
 
 
682 aa  169  8e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  27.72 
 
 
414 aa  169  9e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16680  cysteine desulfurase  27.32 
 
 
425 aa  168  1e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.815163  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>