More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2969 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2969  pyrroline-5-carboxylate reductase  100 
 
 
266 aa  538  9.999999999999999e-153  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2647  pyrroline-5-carboxylate reductase  99.62 
 
 
266 aa  538  9.999999999999999e-153  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2995  pyrroline-5-carboxylate reductase  54.75 
 
 
272 aa  308  6.999999999999999e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0808412  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3029  pyrroline-5-carboxylate reductase  55.26 
 
 
272 aa  307  9e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0010709  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2713  pyrroline-5-carboxylate reductase  55.89 
 
 
272 aa  307  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2850  pyrroline-5-carboxylate reductase  56.02 
 
 
272 aa  306  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2250  pyrroline-5-carboxylate reductase  54.75 
 
 
272 aa  306  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00152908  normal  0.0119667 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3031  pyrroline-5-carboxylate reductase  55.51 
 
 
272 aa  305  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.029709  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2791  pyrroline-5-carboxylate reductase  54.37 
 
 
272 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2732  pyrroline-5-carboxylate reductase  54.75 
 
 
272 aa  302  4.0000000000000003e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00058851  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2783  pyrroline-5-carboxylate reductase  54.75 
 
 
272 aa  301  5.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2995  pyrroline-5-carboxylate reductase  54.75 
 
 
272 aa  301  5.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00170119  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2899  pyrroline-5-carboxylate reductase  54.51 
 
 
272 aa  299  3e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00203272  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3151  pyrroline-5-carboxylate reductase  55.13 
 
 
265 aa  295  5e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.232227  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2921  pyrroline-5-carboxylate reductase  53.33 
 
 
276 aa  294  1e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3143  pyrroline-5-carboxylate reductase  53.33 
 
 
276 aa  294  1e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3164  pyrroline-5-carboxylate reductase  54.72 
 
 
260 aa  284  9e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3132  pyrroline-5-carboxylate reductase  54.33 
 
 
260 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0416  pyrroline-5-carboxylate reductase  51.13 
 
 
269 aa  280  2e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00333  pyrroline-5-carboxylate reductase  50.75 
 
 
269 aa  279  4e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3222  pyrroline-5-carboxylate reductase  50.75 
 
 
269 aa  279  4e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3246  pyrroline-5-carboxylate reductase  50.75 
 
 
269 aa  279  4e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0855673 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00337  hypothetical protein  50.75 
 
 
269 aa  279  4e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0413  pyrroline-5-carboxylate reductase  50.75 
 
 
269 aa  279  4e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0454  pyrroline-5-carboxylate reductase  50.75 
 
 
269 aa  279  4e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0460  pyrroline-5-carboxylate reductase  50.75 
 
 
269 aa  278  6e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0303  pyrroline-5-carboxylate reductase  50.38 
 
 
269 aa  276  2e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0441  pyrroline-5-carboxylate reductase  49.25 
 
 
269 aa  274  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0428  pyrroline-5-carboxylate reductase  49.25 
 
 
269 aa  274  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0422  pyrroline-5-carboxylate reductase  49.25 
 
 
269 aa  274  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0483  pyrroline-5-carboxylate reductase  49.25 
 
 
269 aa  274  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0423  pyrroline-5-carboxylate reductase  49.25 
 
 
269 aa  274  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.244975 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0857  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.87 
 
 
269 aa  273  3e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.236011 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0672  pyrroline-5-carboxylate reductase  50.19 
 
 
271 aa  258  5.0000000000000005e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000211861  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1755  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.86 
 
 
270 aa  256  3e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0480  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.77 
 
 
272 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.904578 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16300  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.87 
 
 
263 aa  226  3e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000034622  hitchhiker  0.000154585 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2788  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.97 
 
 
267 aa  224  1e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.510272  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1474  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.1 
 
 
274 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2480  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.47 
 
 
274 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1378  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.1 
 
 
274 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2111  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.8 
 
 
269 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.778537  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0397  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.83 
 
 
270 aa  217  1e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1387  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.35 
 
 
276 aa  216  2e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1570  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.23 
 
 
281 aa  215  5e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0218  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.73 
 
 
274 aa  215  5.9999999999999996e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0979  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.13 
 
 
270 aa  211  7e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000628805  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1084  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.11 
 
 
272 aa  211  1e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000115496  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2105  pyrroline-5-carboxylate reductase  66.22 
 
 
154 aa  210  2e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3154  pyrroline-5-carboxylate reductase  65.54 
 
 
154 aa  206  4e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.369849 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0899  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.1 
 
 
270 aa  205  5e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000196708 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4718  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.64 
 
 
272 aa  204  1e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.533737  normal  0.734088 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0752  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.34 
 
 
303 aa  203  2e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.212702  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1615  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.87 
 
 
264 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133748  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1412  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.5 
 
 
275 aa  201  9.999999999999999e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00064101  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1478  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.45 
 
 
280 aa  197  1.0000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3093  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.71 
 
 
273 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0431736  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2901  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.17 
 
 
270 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000081741  unclonable  0.000000152537 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0863  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.72 
 
 
267 aa  196  3e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3383  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.72 
 
 
267 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01940  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.78 
 
 
266 aa  196  5.000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1017  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.4 
 
 
282 aa  193  2e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2828  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.1 
 
 
270 aa  192  3e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.137875  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0247  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.79 
 
 
276 aa  191  8e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0642346  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2991  pyrroline-5-carboxylate reductase  64.93 
 
 
143 aa  190  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000344161 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0860  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.59 
 
 
264 aa  190  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.012848  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2835  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.13 
 
 
279 aa  189  5e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.159244  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0968  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.83 
 
 
271 aa  188  7e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2285  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.55 
 
 
266 aa  188  9e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0459  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.38 
 
 
263 aa  188  1e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000279105  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2080  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.36 
 
 
263 aa  187  1e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_13156  predicted protein  40.38 
 
 
276 aa  187  2e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.37833  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25379  predicted protein  39.92 
 
 
289 aa  186  3e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0173  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.88 
 
 
256 aa  185  6e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0563052  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4421  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.43 
 
 
271 aa  184  1.0000000000000001e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000164624  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4908  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.06 
 
 
275 aa  184  1.0000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0661401  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1439  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.47 
 
 
262 aa  181  8.000000000000001e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2058  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.21 
 
 
264 aa  181  8.000000000000001e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.736428  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0548  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.07 
 
 
269 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2889  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.23 
 
 
263 aa  181  2e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.792584  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2541  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.09 
 
 
270 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23950  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.43 
 
 
275 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.264409  normal  0.813225 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1828  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.02 
 
 
256 aa  178  8e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.217574  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2914  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.02 
 
 
265 aa  178  1e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0197  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.72 
 
 
271 aa  176  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0249  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.73 
 
 
264 aa  176  3e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.236328  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4459  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.46 
 
 
267 aa  176  5e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0390  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.33 
 
 
272 aa  175  6e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2708  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.26 
 
 
264 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.702325  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0546  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.08 
 
 
275 aa  174  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0150  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  34.09 
 
 
266 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000260384  normal  0.627515 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1696  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.61 
 
 
272 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1715  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.23 
 
 
271 aa  172  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000826167  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3055  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.58 
 
 
274 aa  172  3.9999999999999995e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.145614  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1136  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.19 
 
 
272 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0273851  normal  0.368215 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4207  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.57 
 
 
279 aa  171  9e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0533  Pyrroline-5-carboxylate reductase  34.35 
 
 
264 aa  171  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0535  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.09 
 
 
277 aa  171  1e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3656  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.71 
 
 
270 aa  169  3e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.443187  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0542  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.58 
 
 
272 aa  169  4e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0647728  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>