182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2909 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0893  hydroxylamine reductase  63.27 
 
 
546 aa  713    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0479  hydroxylamine reductase  62.71 
 
 
540 aa  704    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1125  hydroxylamine reductase  61.61 
 
 
542 aa  676    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000097703  normal  0.234741 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0506  hydroxylamine reductase  60.95 
 
 
542 aa  659    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.775368 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1669  hydroxylamine reductase  62.71 
 
 
540 aa  692    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.100106  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1490  hydroxylamine reductase  60.69 
 
 
540 aa  675    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000660036  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3948  hybrid cluster protein  62.73 
 
 
551 aa  711    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18290  hydroxylamine reductase  60.98 
 
 
555 aa  678    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000343984  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0977  hydroxylamine reductase  61.3 
 
 
555 aa  711    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.349617 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1053  hydroxylamine reductase  57.85 
 
 
539 aa  645    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1660  hydroxylamine reductase  58.08 
 
 
562 aa  646    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2909  hydroxylamine reductase  100 
 
 
547 aa  1132    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1120  hydroxylamine reductase  70.1 
 
 
568 aa  825    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.170872  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2587  hydroxylamine reductase  99.27 
 
 
547 aa  1127    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000431874  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0219  hydroxylamine reductase  61.54 
 
 
538 aa  677    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0149  hydroxylamine reductase  61.06 
 
 
542 aa  681    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00268758  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0512  hydroxylamine reductase  60.47 
 
 
540 aa  657    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.96139  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1978  hydroxylamine reductase  62.16 
 
 
542 aa  682    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.881596  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0036  hydroxylamine reductase  67.77 
 
 
542 aa  778    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1595  hydroxylamine reductase  61.5 
 
 
543 aa  676    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.333402  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0970  hydroxylamine reductase  64.3 
 
 
591 aa  711    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.164641  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1829  hydroxylamine reductase  68.56 
 
 
545 aa  775    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1919  hydroxylamine reductase  62.75 
 
 
553 aa  678    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.877615  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2875  hydroxylamine reductase  62 
 
 
548 aa  664    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0115588  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0164  hydroxylamine reductase  65.57 
 
 
546 aa  734    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.930451  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2846  hydroxylamine reductase  66.91 
 
 
621 aa  758    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0749  hydroxylamine reductase  61.82 
 
 
543 aa  686    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000113817  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4539  hydroxylamine reductase  70.38 
 
 
549 aa  810    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0957  hydroxylamine reductase  69.1 
 
 
547 aa  791    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1599  hybrid cluster protein  64.35 
 
 
549 aa  713    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000102791  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0466  hydroxylamine reductase  59.35 
 
 
542 aa  628  1e-179  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0754  hydroxylamine reductase  55.72 
 
 
552 aa  605  9.999999999999999e-173  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1634  hydroxylamine reductase  56.09 
 
 
538 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.228305  normal  0.622946 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1163  hydroxylamine reductase  51.39 
 
 
543 aa  572  1.0000000000000001e-162  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2189  hydroxylamine reductase  52.94 
 
 
538 aa  571  1e-161  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00125687  normal  0.781035 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2242  hydroxylamine reductase  54.48 
 
 
541 aa  560  1e-158  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.675401  normal  0.897477 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1173  hydroxylamine reductase  49.73 
 
 
549 aa  544  1e-153  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000032867  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3576  hydroxylamine reductase  50.64 
 
 
531 aa  529  1e-149  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1609  hydroxylamine reductase  49.54 
 
 
542 aa  525  1e-148  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.726092  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2941  hydroxylamine reductase  48.25 
 
 
565 aa  527  1e-148  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0596  hydroxylamine reductase  49.09 
 
 
535 aa  527  1e-148  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2872  hydroxylamine reductase  47.59 
 
 
553 aa  522  1e-147  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000295577  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3702  hydroxylamine reductase  50.18 
 
 
533 aa  523  1e-147  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.456407  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1600  hydroxylamine reductase  49.27 
 
 
542 aa  521  1e-146  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0663  hydroxylamine reductase  47.99 
 
 
541 aa  519  1e-146  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.430546  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3228  hydroxylamine reductase  47.81 
 
 
568 aa  520  1e-146  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.892851 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0213  hydroxylamine reductase  49.27 
 
 
533 aa  518  1.0000000000000001e-145  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.8548  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2834  hydroxylamine reductase  47.38 
 
 
547 aa  518  1.0000000000000001e-145  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000787255  hitchhiker  0.00000000000275149 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1201  hydroxylamine reductase  50.09 
 
 
531 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1033  hydroxylamine reductase  47.99 
 
 
568 aa  515  1.0000000000000001e-145  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1364  hydroxylamine reductase  47.28 
 
 
549 aa  512  1e-144  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.453221  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0585  hydroxylamine reductase  48.82 
 
 
533 aa  509  1e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000760383  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2647  hydroxylamine reductase  48.82 
 
 
533 aa  509  1e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.654819  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3446  hydroxylamine reductase  47.91 
 
 
542 aa  508  9.999999999999999e-143  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000118604 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0674  hydroxylamine reductase  46.39 
 
 
548 aa  503  1e-141  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.09718  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0988  hydroxylamine reductase  47.91 
 
 
539 aa  504  1e-141  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.160693 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1523  hydroxylamine reductase  51.94 
 
 
526 aa  499  1e-140  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.53511  normal  0.352571 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0837  hydroxylamine reductase  46.09 
 
 
550 aa  493  9.999999999999999e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00540032  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0974  hydroxylamine reductase  46.99 
 
 
546 aa  493  9.999999999999999e-139  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00100558  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2386  hydroxylamine reductase  46.91 
 
 
566 aa  490  1e-137  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00790044  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0704  hydroxylamine reductase  46.84 
 
 
537 aa  491  1e-137  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.308475 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3038  hydroxylamine reductase  46.29 
 
 
549 aa  483  1e-135  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2190  hydroxylamine reductase  45.49 
 
 
526 aa  483  1e-135  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.317395  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1750  hybrid cluster protein  46.4 
 
 
532 aa  482  1e-135  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.531638  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0742  hydroxylamine reductase  46.65 
 
 
531 aa  483  1e-135  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.483638  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1239  hydroxylamine reductase  46.11 
 
 
549 aa  481  1e-134  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000262121  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1055  hydroxylamine reductase  45.04 
 
 
554 aa  479  1e-134  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0816  hydroxylamine reductase  43.48 
 
 
545 aa  477  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28240  hydroxylamine reductase  46.13 
 
 
525 aa  478  1e-133  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.230727 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1326  hydroxylamine reductase  50.18 
 
 
545 aa  478  1e-133  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.611962  normal  0.884501 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2641  hydroxylamine reductase  45.82 
 
 
537 aa  473  1e-132  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.897837  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1069  hydroxylamine reductase  44.82 
 
 
554 aa  473  1e-132  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0845  hydroxylamine reductase  43.3 
 
 
545 aa  473  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.633582  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1174  hydroxylamine reductase  45.42 
 
 
554 aa  472  1e-132  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0529148  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3097  hydroxylamine reductase  45.24 
 
 
554 aa  472  1e-132  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0213297  normal  0.133055 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3125  hydroxylamine reductase  43.66 
 
 
551 aa  472  1e-132  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1165  hydroxylamine reductase  44.88 
 
 
552 aa  474  1e-132  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0406  hybrid cluster protein  46.63 
 
 
554 aa  475  1e-132  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1293  hydroxylamine reductase  45.52 
 
 
554 aa  474  1e-132  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.86267  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2759  hydroxylamine reductase  44.93 
 
 
549 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2832  hydroxylamine reductase  44.52 
 
 
554 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.310206  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1260  hydroxylamine reductase  45.34 
 
 
554 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1363  hydroxylamine reductase  44.52 
 
 
554 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4165  hydroxylamine reductase  42.6 
 
 
549 aa  466  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2914  hydroxylamine reductase  44.17 
 
 
554 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3011  hydroxylamine reductase  44.17 
 
 
554 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0895  hydroxylamine reductase  43.99 
 
 
554 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.62617 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1216  hydroxylamine reductase  44.88 
 
 
554 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.453579  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1168  hydroxylamine reductase  43.5 
 
 
552 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3609  hydroxylamine reductase  44.17 
 
 
552 aa  465  1e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.918432  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1424  hydroxylamine reductase  45.85 
 
 
522 aa  464  1e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.013462  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1260  hydroxylamine reductase  43.83 
 
 
552 aa  462  9.999999999999999e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.181543  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3188  hydroxylamine reductase  42.91 
 
 
544 aa  453  1.0000000000000001e-126  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0212462 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6194  hydroxylamine reductase  44.96 
 
 
553 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.994183  normal  0.0395415 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1798  hydroxylamine reductase  44.44 
 
 
557 aa  450  1e-125  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0981  hydroxylamine reductase  41.81 
 
 
557 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00091795 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2371  hydroxylamine reductase  42.16 
 
 
550 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003799  hydroxylamine reductase  42.58 
 
 
553 aa  447  1.0000000000000001e-124  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2617  hydroxylamine reductase  42.14 
 
 
550 aa  446  1.0000000000000001e-124  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1591  hydroxylamine reductase  42.14 
 
 
550 aa  446  1.0000000000000001e-124  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>