More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2903 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2903  gamma-glutamyl phosphate reductase  100 
 
 
415 aa  835    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2582  gamma-glutamyl phosphate reductase  98.31 
 
 
415 aa  826    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1644  gamma-glutamyl phosphate reductase  66.19 
 
 
419 aa  569  1e-161  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01930  gamma-glutamyl phosphate reductase  60.96 
 
 
418 aa  541  1e-153  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0563  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.14 
 
 
418 aa  538  9.999999999999999e-153  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1303  gamma-glutamyl phosphate reductase  59.61 
 
 
415 aa  512  1e-144  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0188  gamma-glutamyl phosphate reductase  61.71 
 
 
419 aa  511  1e-144  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.240991  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2789  gamma-glutamyl phosphate reductase  59.08 
 
 
415 aa  501  1e-141  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0619  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.38 
 
 
415 aa  498  1e-140  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00446157  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2730  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.11 
 
 
415 aa  498  1e-140  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2988  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.11 
 
 
415 aa  498  1e-140  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000012162 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0644  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.38 
 
 
415 aa  499  1e-140  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0349753  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3027  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.11 
 
 
415 aa  499  1e-140  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.297708  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1520  gamma-glutamyl phosphate reductase  60.36 
 
 
414 aa  496  1e-139  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1607  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  57.35 
 
 
419 aa  497  1e-139  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3028  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.38 
 
 
415 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00693675  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2711  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.87 
 
 
415 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0725314  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2600  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.25 
 
 
415 aa  493  9.999999999999999e-139  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0823147  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2502  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.64 
 
 
417 aa  488  1e-137  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1870  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.63 
 
 
419 aa  489  1e-137  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0481707  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2017  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.72 
 
 
413 aa  486  1e-136  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.969749  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2781  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.38 
 
 
414 aa  483  1e-135  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.268278  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2992  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.38 
 
 
414 aa  483  1e-135  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.440021  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2873  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.05 
 
 
413 aa  481  1e-134  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2252  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.6 
 
 
415 aa  477  1e-133  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.628785  normal  0.156933 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2993  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.87 
 
 
415 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.471186  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0217  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.6 
 
 
416 aa  468  1.0000000000000001e-131  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0345  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.94 
 
 
414 aa  466  9.999999999999999e-131  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2804  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.65 
 
 
420 aa  464  1e-129  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2456  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.04 
 
 
418 aa  457  1e-127  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.690341  normal  0.130366 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1169  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.69 
 
 
415 aa  455  1e-127  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0289018  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2579  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.08 
 
 
418 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000246583  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1552  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.7 
 
 
418 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.554956  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3211  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.18 
 
 
418 aa  449  1e-125  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000676761  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3598  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.33 
 
 
418 aa  450  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3508  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.35 
 
 
418 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876636  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3862  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.35 
 
 
418 aa  445  1.0000000000000001e-124  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.332079 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4131  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.49 
 
 
418 aa  443  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000457014  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3778  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.1 
 
 
418 aa  443  1e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0020576  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1716  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.23 
 
 
413 aa  444  1e-123  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3644  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.36 
 
 
416 aa  444  1e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0817389  normal  0.521871 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0953  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.25 
 
 
446 aa  442  1e-123  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000135756  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2175  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.44 
 
 
418 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.202609  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3199  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.28 
 
 
418 aa  434  1e-120  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000241705  unclonable  2.3922e-23 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0761  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.97 
 
 
445 aa  434  1e-120  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0336329  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1288  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.57 
 
 
424 aa  430  1e-119  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2884  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.2 
 
 
428 aa  431  1e-119  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0090  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.79 
 
 
418 aa  427  1e-118  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1268  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  52.91 
 
 
409 aa  428  1e-118  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3364  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.66 
 
 
424 aa  426  1e-118  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1071  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.85 
 
 
425 aa  424  1e-117  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.183747  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1018  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  50.85 
 
 
425 aa  423  1e-117  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2254  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.34 
 
 
430 aa  422  1e-117  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0385  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.59 
 
 
413 aa  423  1e-117  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.427307  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1099  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.09 
 
 
424 aa  423  1e-117  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1675  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.94 
 
 
416 aa  422  1e-117  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1645  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.83 
 
 
431 aa  421  1e-116  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.212287  hitchhiker  0.00108459 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0781  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.4 
 
 
456 aa  419  1e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7267  Glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  52.7 
 
 
429 aa  421  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0694677  normal  0.109566 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2129  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.64 
 
 
434 aa  420  1e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0315956 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2417  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.63 
 
 
418 aa  418  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00400511  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0284  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.34 
 
 
417 aa  416  9.999999999999999e-116  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00342  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.21 
 
 
414 aa  416  9.999999999999999e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0175641  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0769  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.61 
 
 
417 aa  416  9.999999999999999e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0826655 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0482  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.84 
 
 
429 aa  416  9.999999999999999e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.13569  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0514  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.39 
 
 
421 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0403  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.65 
 
 
420 aa  415  9.999999999999999e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0540  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.61 
 
 
418 aa  413  1e-114  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0454  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.95 
 
 
418 aa  412  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2499  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.37 
 
 
418 aa  414  1e-114  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.549579  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0615  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.95 
 
 
418 aa  412  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.663423  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2276  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.23 
 
 
427 aa  412  1e-114  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.616003  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1880  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.49 
 
 
430 aa  409  1e-113  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0364  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.98 
 
 
416 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000332423 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0363  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.85 
 
 
416 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1312  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.54 
 
 
411 aa  410  1e-113  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0695125  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0354  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.86 
 
 
415 aa  411  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.156512  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2662  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.14 
 
 
418 aa  410  1e-113  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00209734  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2852  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.12 
 
 
419 aa  409  1e-113  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.204057  hitchhiker  0.000000132471 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0456  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.65 
 
 
413 aa  411  1e-113  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000120489 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7264  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.54 
 
 
419 aa  410  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3598  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.86 
 
 
424 aa  409  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0372  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.22 
 
 
416 aa  411  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.559785  normal  0.568115 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0357  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.85 
 
 
416 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1818  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.25 
 
 
429 aa  410  1e-113  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0299965  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00240  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.88 
 
 
417 aa  408  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11440  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  50.86 
 
 
446 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00180187 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00243  hypothetical protein  49.88 
 
 
417 aa  408  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3348  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  47.93 
 
 
423 aa  406  1.0000000000000001e-112  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243599  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3364  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.04 
 
 
417 aa  402  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1194  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.87 
 
 
420 aa  402  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4829  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.39 
 
 
421 aa  404  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369756  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1741  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.51 
 
 
425 aa  402  1e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.542201  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3338  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.04 
 
 
417 aa  402  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.787396 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3345  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.21 
 
 
435 aa  404  1e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000234228  normal  0.0212307 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0288  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.64 
 
 
417 aa  404  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.619087  normal  0.592818 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0297  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.28 
 
 
417 aa  404  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000952781 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0784  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.58 
 
 
423 aa  402  1e-111  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2079  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.32 
 
 
432 aa  404  1e-111  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0240  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.04 
 
 
417 aa  400  9.999999999999999e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>