More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2878 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2878  glycerol uptake facilitator protein  100 
 
 		 235 aa  465  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2561  glycerol uptake facilitator glpF  97.45 
 
 		 235 aa  456  1e-127  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1170  putative glycerol uptake facilitator protein  67.67 
 
 		 234 aa  319  1.9999999999999998e-86  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.351362  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1001  glycerol uptake facilitator protein  67.67 
 
 		 234 aa  319  1.9999999999999998e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.379218  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2846  MIP family channel protein  54.7 
 
 		 236 aa  252  4.0000000000000004e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324919  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1267  MIP family channel protein  54.7 
 
 		 275 aa  251  5.000000000000001e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000541866  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0947  MIP family channel protein  55.56 
 
 		 273 aa  250  2e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000138868  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1358  MIP family channel protein  53.91 
 
 		 272 aa  247  1e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00322648  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1384  MIP family channel protein  53.91 
 
 		 272 aa  247  1e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000466  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1065  MIP family channel protein  52.7 
 
 		 247 aa  245  4e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.547307  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0866  glycerol uptake facilitator protein  52.81 
 
 		 274 aa  244  9.999999999999999e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.306502  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0637  major intrinsic protein, glycerol uptake channel  52.81 
 
 		 237 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3322  MIP family channel protein  52.81 
 
 		 237 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.218114 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1019  MIP family channel protein  56.28 
 
 		 242 aa  243  3e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2513  MIP family channel protein  50.79 
 
 		 255 aa  242  5e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.341 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3650  MIP family channel protein  51.45 
 
 		 250 aa  239  2e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.348942  normal  0.828638 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2149  MIP family channel protein  53.85 
 
 		 272 aa  239  2e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0806  MIP family channel protein  55.13 
 
 		 273 aa  238  5e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000186398  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1065  glycerol uptake facilitator protein  54.7 
 
 		 273 aa  238  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000246889  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4234  glycerol uptake facilitator protein  54.7 
 
 		 273 aa  238  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000125591  decreased coverage  0.000000000395439 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1194  glycerol uptake facilitator protein  54.7 
 
 		 273 aa  236  2e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000435303  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1124  glycerol uptake facilitator protein  54.7 
 
 		 273 aa  236  2e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312031  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0946  glycerol uptake facilitator protein  54.7 
 
 		 278 aa  236  2e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.82294e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0937  glycerol uptake facilitator protein  54.7 
 
 		 278 aa  236  2e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000181424  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1105  glycerol uptake facilitator protein  54.7 
 
 		 273 aa  236  2e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5867199999999997e-51 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1025  glycerol uptake facilitator protein  54.27 
 
 		 273 aa  235  5.0000000000000005e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000147152  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0598  glycerol uptake facilitator protein  51.08 
 
 		 238 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0275  glycerol uptake facilitator protein  52.23 
 
 		 232 aa  234  6e-61  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0959  glycerol uptake facilitator protein  54.27 
 
 		 278 aa  235  6e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000387378  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2043  MIP family channel protein  52.97 
 
 		 240 aa  234  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0536083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0738  glycerol uptake facilitator protein  50.65 
 
 		 238 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0239  glycerol uptake facilitator protein  50.65 
 
 		 238 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.160483  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0905  glycerol uptake facilitator protein  50.65 
 
 		 238 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0724  glycerol uptake facilitator protein  50.65 
 
 		 238 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.122714  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2451  glycerol uptake facilitator protein  50.65 
 
 		 238 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.287324  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2707  glycerol uptake facilitator protein  50.65 
 
 		 238 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2370  glycerol uptake facilitator protein  50.65 
 
 		 238 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.925384  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0618  MIP family channel protein  51.82 
 
 		 238 aa  229  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2604  MIP family channel protein  52.29 
 
 		 238 aa  228  5e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2732  MIP family channel protein  52.29 
 
 		 238 aa  228  5e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1487  glycerol uptake facilitator  48.92 
 
 		 242 aa  228  7e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00172082  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2068  MIP family channel protein  52.29 
 
 		 238 aa  228  8e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.104324  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2679  MIP family channel protein  52.29 
 
 		 238 aa  228  8e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.824387  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2708  MIP family channel protein  52.29 
 
 		 238 aa  228  8e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.200517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1765  MIP family channel protein  54.95 
 
 		 244 aa  228  9e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.459656 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6007  Aquaporin  52.29 
 
 		 238 aa  228  9e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.264936  normal  0.939787 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1986  major intrinsic protein  52.14 
 
 		 249 aa  226  2e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000584519 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1653  glycerol uptake facilitator protein  48.92 
 
 		 237 aa  225  4e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5300  major intrinsic protein  53.15 
 
 		 249 aa  222  4e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29930  permease, glycerol uptake facilitator  50.21 
 
 		 239 aa  222  4e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4188  MIP family channel protein  50.84 
 
 		 243 aa  221  6e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.394775 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0486  major intrinsic protein  49.38 
 
 		 246 aa  221  9.999999999999999e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.39672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2249  major intrinsic protein  51.71 
 
 		 249 aa  221  9.999999999999999e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0000222007  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23040  MIP family channel protein  50.64 
 
 		 240 aa  219  3e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0294  MIP family channel protein  48.32 
 
 		 239 aa  219  3.9999999999999997e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000803178  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5936  major intrinsic protein  49.58 
 
 		 241 aa  218  6e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0075  major intrinsic protein  52.81 
 
 		 244 aa  218  7.999999999999999e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0379  MIP family channel protein  52.56 
 
 		 242 aa  216  2e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.995202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0726  major intrinsic protein  51.33 
 
 		 247 aa  212  4.9999999999999996e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000820267 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1918  MIP family channel protein  48.57 
 
 		 255 aa  210  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.157288  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3290  major intrinsic protein  49.17 
 
 		 252 aa  209  4e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.881341  normal  0.0169929 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06810  permease, glycerol uptake facilitator  51.56 
 
 		 245 aa  207  9e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0373  major intrinsic protein  49.34 
 
 		 250 aa  206  3e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.421217  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5041  major intrinsic protein  49.15 
 
 		 240 aa  204  8e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3541  major intrinsic protein  49.78 
 
 		 233 aa  204  9e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0390  major intrinsic protein  49.79 
 
 		 244 aa  202  4e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.143775  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0086  glycerol facilitator-aquaporin  43.59 
 
 		 243 aa  196  3e-49  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000385513 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1557  major intrinsic protein  47.62 
 
 		 242 aa  195  5.000000000000001e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2177  major intrinsic protein  46.78 
 
 		 243 aa  192  3e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.416578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6410  major intrinsic protein  45.18 
 
 		 246 aa  190  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1213  glycerol uptake facilitator  46.03 
 
 		 244 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1752  major intrinsic protein  44.02 
 
 		 235 aa  187  9e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0255  glycerol uptake facilitator related permease (major Intrinsic protein family)  44.4 
 
 		 238 aa  186  2e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0349  glycerol uptake facilitator or related permease (major Intrinsic protein family)  42.74 
 
 		 250 aa  184  8e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000402346  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4219  major intrinsic protein  42.08 
 
 		 241 aa  184  8e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.673856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2383  major intrinsic protein  46.9 
 
 		 241 aa  183  3e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0480  glycerol uptake facilitator related permease (major Intrinsic protein family)  44.58 
 
 		 289 aa  181  6e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000000262851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0217  glycerol uptake facilitator protein  48.18 
 
 		 259 aa  181  8.000000000000001e-45  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0878  major intrinsic protein  45.76 
 
 		 244 aa  181  9.000000000000001e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0559  major intrinsic protein  47.81 
 
 		 245 aa  177  1e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000202801 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1632  glycerol uptake facilitator or related permease (major Intrinsic protein family)  36.9 
 
 		 287 aa  167  2e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000451911  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1732  glycerol uptake facilitator protein, putative  36.12 
 
 		 282 aa  163  2.0000000000000002e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0128526  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1246  MIP family channel protein  41.88 
 
 		 246 aa  163  2.0000000000000002e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2986  MIP family channel protein  39.08 
 
 		 268 aa  153  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.862108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2341  glycerol uptake facilitator related permease (major Intrinsic protein family)  33.33 
 
 		 289 aa  151  7e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.395885  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1392  glycerol uptake facilitator related permease (major Intrinsic protein family)  37.45 
 
 		 239 aa  148  7e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.000178707  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2523  MIP family channel protein  40 
 
 		 274 aa  148  8e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1940  MIP family channel protein  41.39 
 
 		 267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4609  MIP family channel protein  36.67 
 
 		 279 aa  145  4.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.344473 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1732  glycerol uptake facilitator related permease (major Intrinsic protein family)  33.68 
 
 		 287 aa  145  8.000000000000001e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000479183  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0495  MIP family channel protein  36.4 
 
 		 279 aa  143  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0409  glycerol uptake facilitator protein  40.59 
 
 		 251 aa  137  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002676  glycerol uptake facilitator protein  40.89 
 
 		 284 aa  135  6.0000000000000005e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5125  MIP family channel protein  36.89 
 
 		 284 aa  134  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4158  glycerol uptake facilitator protein  40.71 
 
 		 281 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03312  hypothetical protein  40.08 
 
 		 284 aa  132  5e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0253  major intrinsic protein  40.85 
 
 		 251 aa  131  7.999999999999999e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.740215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4409  glycerol uptake facilitator protein  40.71 
 
 		 281 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0436905  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0683  glycerol uptake facilitator protein  39.27 
 
 		 284 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.962847  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0810  major intrinsic protein  37.71 
 
 		 252 aa  129  3e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.199879 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>