143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2870 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2870  transcriptional activator TenA  100 
 
 		 221 aa  450  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1156  transcriptional activator, TenA family  39.81 
 
 		 222 aa  161  9e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000598897  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0612  TenA family transcription regulator  36.82 
 
 		 231 aa  156  3e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.741623  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0782  putative transcriptional activator TenA  36.11 
 
 		 231 aa  153  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.403076  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0795  transcriptional activator TenA, putative  36.11 
 
 		 231 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0691  transcriptional activator TenA  36.11 
 
 		 231 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0635  transcriptional regulator of extracellular enzyme  36.11 
 
 		 231 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000639213  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0635  transcriptional regulator of extracellular enzyme  36.11 
 
 		 231 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0725  transcriptional activator TenA  36.11 
 
 		 231 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00338422  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0879  putative transcriptional activator TenA  36.11 
 
 		 231 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00330179  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4549  putative transcriptional activator TenA  36.11 
 
 		 231 aa  152  4e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00503672  normal  0.282706 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0641  TenA family transcription regulator  35.91 
 
 		 231 aa  149  4e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.4312  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0802  putative transcriptional activator TenA  34.72 
 
 		 231 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15416e-46 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0151  transcriptional activator, TenA family  29.85 
 
 		 236 aa  142  6e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2987  transcriptional activator, TenA family  32.87 
 
 		 221 aa  141  7e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2663  TenA family transcription regulator  30.73 
 
 		 219 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.387648  normal  0.982111 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2784  TenA family transcription regulator  30.37 
 
 		 223 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.349831  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0684  transcriptional activator, TenA family  33.33 
 
 		 221 aa  139  3.9999999999999997e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.453288  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2530  TenA family transcription regulator  30.73 
 
 		 221 aa  138  6e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3186  transcriptional activator, TenA family  30.28 
 
 		 219 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1892  TenA family transcription regulator  34.26 
 
 		 227 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0105459  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2677  TenA family transcription regulator  30.73 
 
 		 219 aa  135  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0490  putative thiaminase (transcriptional activator TenA)  29.95 
 
 		 220 aa  135  5e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.610131  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0644  transcriptional activator, TenA family  33.49 
 
 		 230 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1410  transcriptional activator, TenA family  32.87 
 
 		 227 aa  132  3e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2436  transcriptional activator TenA  34.26 
 
 		 229 aa  132  3e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0858  TENA/THI-4 protein  31.6 
 
 		 220 aa  132  3e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.162996 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2611  transcriptional activator TenA  34.26 
 
 		 229 aa  132  3e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.204985  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2391  transcriptional activator  34.26 
 
 		 229 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0176717  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2357  transcriptional activator  34.26 
 
 		 229 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2628  transcriptional activator TenA  34.26 
 
 		 229 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000192949 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2584  transcriptional activator TenA  34.26 
 
 		 229 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2739  transcriptional activator TenA  34.26 
 
 		 229 aa  132  5e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.376117  hitchhiker  0.00000275014 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0606  transcriptional activator, TenA family  33.33 
 
 		 232 aa  131  6.999999999999999e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00086118  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2523  TenA family transcription regulator  33.8 
 
 		 228 aa  131  7.999999999999999e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0025683  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2629  transcriptional activator TenA  33.8 
 
 		 229 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378111  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2668  transcriptional activator TenA  33.8 
 
 		 229 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.358374  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06842  transcriptional regulator  28.78 
 
 		 222 aa  128  9.000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000867  thiaminase II  28.78 
 
 		 220 aa  127  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4829  transcriptional activator, TenA family  34.26 
 
 		 216 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5519  transcriptional activator, TenA family  28.11 
 
 		 231 aa  125  7e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2374  transcriptional activator  27.4 
 
 		 226 aa  123  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1431  TenA family transcription regulator  32.41 
 
 		 217 aa  121  7e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.26969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1028  TenA family transcription regulator  31.94 
 
 		 218 aa  121  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0869  transcriptional activator, TenA family  32.41 
 
 		 219 aa  120  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1074  TenA family transcription regulator  32.26 
 
 		 212 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0564389 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0407  transcriptional activator, TenA family  35.65 
 
 		 224 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3844  putative transcriptional activator, TenA family  30.96 
 
 		 228 aa  119  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.077878  normal  0.0369625 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0279  TenA family transcription regulator  31.28 
 
 		 231 aa  117  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2482  transcriptional activator, TenA family  30.56 
 
 		 222 aa  117  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1974  TenA family transcription regulator  31.8 
 
 		 212 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.547814  hitchhiker  0.000000287748 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4256  transcriptional activator, TenA family  29.63 
 
 		 232 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4521  transcriptional activator, TenA family  29.63 
 
 		 232 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0629922  normal  0.0295033 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3497  transcriptional activator, TenA family  31.67 
 
 		 216 aa  115  5e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1351  TenA family transcription regulator  31.98 
 
 		 226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000186678  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2169  transcriptional activator, TenA family  33.79 
 
 		 220 aa  113  2.0000000000000002e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0284  conserved hypothetical protein, putative transcriptional regulator, TenA/Thi-4-like protein  34.86 
 
 		 221 aa  113  2.0000000000000002e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1931  transcriptional activator, TenA family  30.56 
 
 		 232 aa  113  3e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1209  TenA family transcription regulator  28.02 
 
 		 238 aa  112  4.0000000000000004e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.964069  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00130  phosphomethylpyrimidine kinase, putative  26.36 
 
 		 561 aa  112  5e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.45662  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2186  TenA family transcription regulator  32.72 
 
 		 212 aa  112  5e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0212  transcriptional regulator TenA, putative  30 
 
 		 232 aa  110  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10762  thiamin biosynthesis protein (Thi-4), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10740)  29.15 
 
 		 510 aa  110  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.116224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3256  TenA family transcription regulator  29.44 
 
 		 243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.33558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0203  putative transcriptional regulator TenA  30 
 
 		 232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.608084  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0480  TenA family transcription regulator  29.3 
 
 		 220 aa  108  4.0000000000000004e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00667061  hitchhiker  0.000776397 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2707  transcriptional activator, TenA family  28.7 
 
 		 219 aa  109  4.0000000000000004e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2025  TenA family transcription regulator  27.72 
 
 		 232 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1497  TenA/Thi-4 family protein  30.05 
 
 		 222 aa  108  7.000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0035  TenA family transcription regulator  30.05 
 
 		 224 aa  107  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2973  TenA family transcription regulator  28.97 
 
 		 232 aa  107  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.320066  normal  0.731254 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2138  putative transcriptional activator, TenA family  27.91 
 
 		 221 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.391996 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0406  transcriptional activator, TenA family  24.53 
 
 		 234 aa  106  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.23459 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3122  TenA family transcription regulator  28.92 
 
 		 226 aa  106  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1316  TenA family transcription regulator  31.05 
 
 		 214 aa  105  4e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.496095 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0466  TenA/Thi-4 family protein  29.81 
 
 		 221 aa  105  6e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0357  TenA family transcription regulator  27.57 
 
 		 229 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0367  TenA family transcription regulator  27.57 
 
 		 229 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0346  TenA family transcription regulator  27.57 
 
 		 229 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0491  TenA/Thi-4 family protein  29.33 
 
 		 221 aa  102  3e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2438  transcriptional activator, TenA family  27.91 
 
 		 231 aa  102  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000793245  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0908  transcriptional activator  27.1 
 
 		 232 aa  102  4e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.156653  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10853  putative transcriptional activator (TenA family)  31.1 
 
 		 217 aa  101  1e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.198587  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2462  transcriptional activator, TenA family  24.07 
 
 		 236 aa  95.1  6e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.67745  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3656  TenA family transcription regulator  27.36 
 
 		 225 aa  94.4  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.754332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1288  multifunctional hydroxymethylpyrimidine phosphokinase/4-amino-5-aminomethyl-2-methylpyrimidine hydrolase  28.02 
 
 		 494 aa  94.4  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0371148  normal  0.427861 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3392  TenA family transcription regulator  25.35 
 
 		 230 aa  92  6e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.880388  normal  0.0978222 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2146  multifunctional hydroxymethylpyrimidine phosphokinase/4-amino-5-aminomethyl-2-methylpyrimidine hydrolase  26.29 
 
 		 518 aa  92  7e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000135123 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0123  putative transcriptional activator, TenA family  27.57 
 
 		 201 aa  90.1  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.155618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0097  transcriptional activator, TenA family  25.25 
 
 		 205 aa  90.1  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.658619  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1546  putative transcription activator  27.4 
 
 		 234 aa  88.2  9e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0260414  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34896  predicted protein  27.57 
 
 		 226 aa  87  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0044  TenA family transcriptional activator  27.57 
 
 		 205 aa  86.3  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4918  transcriptional activator, TenA family  24.65 
 
 		 227 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2953  putative transcriptional regulator  25.12 
 
 		 235 aa  86.3  4e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04021  TENA/THI-4 protein  28.64 
 
 		 207 aa  84  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.484099  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1950  transcriptional regulator  25.45 
 
 		 218 aa  83.2  0.000000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000196372  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2986  transcriptional activator, TenA family  26.85 
 
 		 227 aa  81.3  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1007  transcriptional activator, TenA family  25.93 
 
 		 208 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00691349 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0361  TenA family transcriptional activator  30.09 
 
 		 207 aa  80.1  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>