More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2852 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_2537  hypothetical protein  97.21 
 
 
537 aa  1058  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2852  hypothetical protein  100 
 
 
537 aa  1081  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1388  hypothetical protein  32.85 
 
 
561 aa  335  1e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  2.98772e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2342  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  34.67 
 
 
563 aa  333  4e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000602733  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2578  2-octaprenylphenol hydroxylase  35.15 
 
 
559 aa  328  1e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152488  normal  0.0679255 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1088  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  31.65 
 
 
561 aa  325  1e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0289446  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1648  2-octaprenylphenol hydroxylase  33.58 
 
 
559 aa  324  3e-87  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0902  ABC-1 domain protein  32.07 
 
 
560 aa  322  1e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1047  protein kinase  35.08 
 
 
525 aa  321  3e-86  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0760  2-octaprenylphenol hydroxylase  31.75 
 
 
561 aa  320  5e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3359  ABC-1 domain protein  31.69 
 
 
560 aa  316  5e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.779537 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0295  ABC-1 domain protein  34.61 
 
 
558 aa  307  3e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1207  ABC transporter  34.12 
 
 
556 aa  306  6e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.694462  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12230  2-octaprenylphenol hydroxylase  32.37 
 
 
559 aa  303  4e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0168037  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1464  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  34.14 
 
 
555 aa  303  4e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00546242  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5305  ABC-1 domain protein  32.93 
 
 
565 aa  300  6e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1693  ABC-1 domain protein  32.93 
 
 
565 aa  300  6e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12515  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1228  unusual protein kinase  32.53 
 
 
606 aa  296  6e-79  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.99408  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1733  hypothetical protein  31.51 
 
 
557 aa  296  9e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00187554  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0647  hypothetical protein  31.15 
 
 
565 aa  295  1e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  1.86884e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10840  predicted unusual protein kinase  31.03 
 
 
550 aa  294  2e-78  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3247  ABC-1 domain protein  33.2 
 
 
558 aa  294  2e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  4.74003e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2068  ABC-1 domain protein  33.96 
 
 
586 aa  294  3e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2561  ABC-1 domain protein  33.03 
 
 
558 aa  291  2e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1172  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  33.1 
 
 
558 aa  290  3e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0233  2-octaprenylphenol hydroxylase  33.15 
 
 
554 aa  289  8e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1005  hypothetical protein  33.51 
 
 
564 aa  285  2e-75  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0249187 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1612  ABC-1 domain protein  33.46 
 
 
557 aa  283  7e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.504596  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1110  ABC-1 domain protein  31.4 
 
 
599 aa  280  7e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2106  hypothetical protein  32.47 
 
 
559 aa  278  2e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766182 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2458  ABC-1 domain protein  31.86 
 
 
551 aa  277  4e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2071  ABC-1 domain protein  30.42 
 
 
581 aa  276  7e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0987216  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0825  ABC-1 domain protein  31.97 
 
 
558 aa  275  2e-72  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1474  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  29.78 
 
 
561 aa  272  9e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.604813 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2664  2-octaprenylphenol hydroxylase  34.27 
 
 
573 aa  272  1e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.948881  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4898  ABC1 family protein  32.28 
 
 
558 aa  271  2e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00151  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  28.83 
 
 
558 aa  270  4e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2681  hypothetical protein  30.71 
 
 
547 aa  269  9e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.259023 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2150  ABC-1 domain protein  32.24 
 
 
557 aa  269  9e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.181383  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1941  ABC-1 domain protein  31.15 
 
 
549 aa  269  9e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1871  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  28.8 
 
 
568 aa  269  1e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0324  ABC-1 domain protein  30.59 
 
 
581 aa  268  2e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2240  ABC-1 domain protein  32.02 
 
 
557 aa  268  2e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.319336  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2852  ubiquinone biosynthesis protein  29.89 
 
 
559 aa  267  4e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1699  2-octaprenylphenol hydroxylase  33.18 
 
 
557 aa  265  1e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2950  ABC-1 domain protein  30.84 
 
 
549 aa  265  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1536  ABC-1 domain protein  31.11 
 
 
556 aa  265  2e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0390  2-octaprenylphenol hydroxylase  33.03 
 
 
559 aa  264  3e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2885  ABC-1 domain protein  29.29 
 
 
582 aa  263  5e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1760  ABC-1 domain-containing protein  31.07 
 
 
547 aa  262  1e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.794373  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0994  2-octaprenylphenol hydroxylase  31.23 
 
 
559 aa  261  2e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.380493  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0342  ABC1 family protein  33.47 
 
 
551 aa  260  4e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0240  ABC-1 domain protein  33.47 
 
 
544 aa  260  5e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2586  ABC-1 domain protein  33.26 
 
 
562 aa  259  8e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1337  2-octaprenylphenol hydroxylase  29.54 
 
 
549 aa  258  1e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2205  hypothetical protein  28.33 
 
 
552 aa  258  2e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1807  hypothetical protein  30.73 
 
 
560 aa  255  1e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5555  2-octaprenylphenol hydroxylase  28.2 
 
 
584 aa  254  2e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3377  ABC-1 domain protein  31.89 
 
 
557 aa  254  2e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.118171 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0017  2-octaprenylphenol hydroxylase  30.77 
 
 
592 aa  253  4e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.300768 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0950  2-octaprenylphenol hydroxylase  30.65 
 
 
578 aa  252  1e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.467498  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1973  ABC-1 domain protein  29.98 
 
 
547 aa  252  1e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.921372  normal  0.103811 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07760  predicted unusual protein kinase  27.54 
 
 
614 aa  251  2e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.228217 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0243  hypothetical protein  28.68 
 
 
565 aa  251  3e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.469557  normal  0.547936 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3020  ABC-1 domain protein  28.42 
 
 
574 aa  248  1e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0856  hypothetical protein  31.14 
 
 
555 aa  246  7e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1617  ABC-1 domain protein  31.27 
 
 
547 aa  246  1e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02281  putative kinase  29.36 
 
 
560 aa  246  1e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3885  2-octaprenylphenol hydroxylase  29.58 
 
 
532 aa  244  2e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3956  ABC-1 domain protein  29.86 
 
 
552 aa  244  3e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.186201 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0211  putative kinase  31.62 
 
 
555 aa  243  6e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4048  hypothetical protein  28.77 
 
 
556 aa  243  8e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15860  predicted unusual protein kinase  32.26 
 
 
550 aa  242  1e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0868  hypothetical protein  28.93 
 
 
582 aa  241  2e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  9.24249e-08  normal  0.0678292 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3425  hypothetical protein  29.32 
 
 
563 aa  241  2e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.416231  normal  0.872879 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1843  hypothetical protein  28.81 
 
 
549 aa  241  2e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.295975  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1817  hypothetical protein  27.22 
 
 
571 aa  240  4e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.457399  normal  0.0626146 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2767  ABC-1 domain protein  28.05 
 
 
549 aa  240  5e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02271  putative kinase  31.48 
 
 
555 aa  240  6e-62  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3335  ABC-1 domain protein  28.05 
 
 
549 aa  239  7e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0521538  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02291  putative kinase  31.29 
 
 
555 aa  238  1e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4176  hypothetical protein  29.34 
 
 
582 aa  238  2e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.118279  normal  0.965064 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2162  kinase  27.69 
 
 
559 aa  236  6e-61  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2519  hypothetical protein  28.82 
 
 
582 aa  236  1e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.416254 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0626  ABC-1 domain protein  28.2 
 
 
585 aa  234  2e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1598  hypothetical protein  28.79 
 
 
591 aa  233  7e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.429743  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1310  ABC-1 domain protein  28.27 
 
 
562 aa  231  3e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1338  ABC-1 domain protein  28.27 
 
 
562 aa  231  3e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000328718 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02381  putative kinase  30.64 
 
 
555 aa  231  4e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.802769  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0222  ABC-1 domain protein  28.51 
 
 
571 aa  229  7e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.164391  normal  0.703829 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5113  ABC-1 domain protein  29.1 
 
 
544 aa  229  1e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2415  hypothetical protein  29.63 
 
 
545 aa  228  3e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0766121  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3020  hypothetical protein  29.28 
 
 
544 aa  228  3e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.087256 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0176  2-octaprenylphenol hydroxylase  27.87 
 
 
547 aa  227  5e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0769  ABC-1 domain protein  29.85 
 
 
543 aa  226  6e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.477502 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1021  hypothetical protein  29.85 
 
 
556 aa  226  7e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.396117  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1333  ABC-1 domain protein  29.72 
 
 
543 aa  226  1e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.333757 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4049  hypothetical protein  27.86 
 
 
556 aa  224  2e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.240057  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19231  hypothetical protein  31.89 
 
 
618 aa  224  3e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.494256  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0159  ABC-1 domain protein  28.69 
 
 
561 aa  224  3e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>