282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2850 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0208  hypothetical protein  60.65 
 
 		 569 aa  670    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2850  Na+/H+ antiporter family protein  100 
 
 		 571 aa  1122    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2536  Na(+)/H(+) antiporter family protein  99.47 
 
 		 571 aa  1116    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1419  Na(+)/H(+) antiporter family protein  56.08 
 
 		 567 aa  598  1e-169  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000092827  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1375  Na(+)/H(+) antiporter family protein  56.27 
 
 		 557 aa  572  1.0000000000000001e-162  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1405  Na(+)/H(+) antiporter family protein  54.55 
 
 		 567 aa  564  1.0000000000000001e-159  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.165118  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0970  Na+/H+ antiporter family protein  53.96 
 
 		 570 aa  565  1.0000000000000001e-159  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0849  Na+/H+ antiporter family protein  51.98 
 
 		 577 aa  546  1e-154  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.828958  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0919  Na+/H+ antiporter family protein  51.98 
 
 		 577 aa  547  1e-154  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1182  Na+/H+ antiporter family protein  51.8 
 
 		 577 aa  546  1e-154  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0611  hypothetical protein  48.35 
 
 		 587 aa  476  1e-133  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.732521 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19140  Na+/H+ antiporter NhaC  44.44 
 
 		 521 aa  412  1e-113  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000186366  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1647  Na+/H+ antiporter NhaC  43.7 
 
 		 629 aa  373  1e-102  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2649  Na+/H+ antiporter NhaC  39.77 
 
 		 510 aa  367  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0222  Na+/H+ antiporter NhaC  39.58 
 
 		 515 aa  339  7e-92  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1066  Na+/H+ antiporter NhaC  37.74 
 
 		 574 aa  319  7e-86  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000104071  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3287  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  36.84 
 
 		 638 aa  317  3e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.115901  normal  0.227296 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1645  Na+/H+ antiporter NhaC  37.68 
 
 		 520 aa  313  5.999999999999999e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1408  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  36.6 
 
 		 550 aa  304  3.0000000000000004e-81  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3210  Na+/H+ antiporter NhaC  37.5 
 
 		 517 aa  302  1e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004330  Na+/H+ antiporter NhaC  36.72 
 
 		 507 aa  298  2e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2431  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  34.85 
 
 		 556 aa  291  2e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05850  Na+/H+ antiporter  36.1 
 
 		 525 aa  288  2e-76  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0325247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2746  Na+/H+ antiporter NhaC  36.65 
 
 		 518 aa  286  8e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00133012  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1746  Na+/H+ antiporter NhaC  35.65 
 
 		 561 aa  283  6.000000000000001e-75  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.230963 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1703  Na+ antiporter NhaC  37.81 
 
 		 525 aa  281  3e-74  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0208  Na+/H+ antiporter NhaC  36.9 
 
 		 533 aa  280  4e-74  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0921  Na+/H+ antiporter NhaC  35.13 
 
 		 513 aa  280  5e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000452516  hitchhiker  5.2738399999999995e-21 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12680  Na+/H+ antiporter  36.77 
 
 		 532 aa  280  5e-74  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.33176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2537  Na+/H+ antiporter NhaC  37.1 
 
 		 524 aa  280  6e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0181032  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0897  Na+/H+ antiporter NhaC  37.93 
 
 		 525 aa  280  7e-74  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1182  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  33.9 
 
 		 564 aa  278  1e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1071  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  34.77 
 
 		 560 aa  276  1.0000000000000001e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1424  Na+/H+ antiporter NhaC  36.18 
 
 		 504 aa  275  2.0000000000000002e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1377  Na+/H+ antiporter NhaC  34.6 
 
 		 541 aa  274  3e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2853  Na+/H+ antiporter NhaC  36.09 
 
 		 526 aa  272  2e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1419  Na+/H+ antiporter NhaC  34.02 
 
 		 522 aa  270  5.9999999999999995e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.116291  normal  0.49981 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1354  Na+/H+ antiporter NhaC  34.21 
 
 		 522 aa  268  1e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0897307  hitchhiker  0.00505765 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3234  Na+/H+ antiporter NhaC  34.51 
 
 		 524 aa  268  2e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.22979 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1407  Na+/H+ antiporter NhaC  33.9 
 
 		 522 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0192762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2582  Na+/H+ antiporter NhaC  35.14 
 
 		 521 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01828  Na+/H+ antiporter  36.2 
 
 		 533 aa  266  5e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0788  Na(+)/H(+) antiporter  35.02 
 
 		 515 aa  262  1e-68  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2144  putative sodium/proton antiporter  35.03 
 
 		 528 aa  261  2e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.382499  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1171  Na+/H+ antiporter NhaC  36.26 
 
 		 520 aa  259  1e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.299418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1683  Na+/H+ antiporter NhaC  33.96 
 
 		 528 aa  258  2e-67  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00319882  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003851  malate Na(+) symporter  35.53 
 
 		 533 aa  257  4e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00269434  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2509  Na+/H+ antiporter NhaC  34.38 
 
 		 522 aa  256  5e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000317114  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1447  Na+/H+ antiporter NhaC  35.4 
 
 		 521 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0476747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1513  Na+ antiporter NhaC  36.99 
 
 		 534 aa  251  3e-65  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.483859  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2993  Na+/H+ antiporter NhaC  34.31 
 
 		 522 aa  246  6e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0701  hypothetical protein  34.14 
 
 		 533 aa  246  6.999999999999999e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2845  Na+/H+ antiporter NhaC  34.12 
 
 		 522 aa  246  9e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.246166  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1513  Na+/H+ antiporter NhaC  34.12 
 
 		 522 aa  246  9e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.235821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2864  Na+/H+ antiporter NhaC  34.12 
 
 		 522 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.105057  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49064  predicted protein  31.91 
 
 		 779 aa  245  1.9999999999999999e-63  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1016  hypothetical protein  33.79 
 
 		 529 aa  243  7.999999999999999e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3259  Na+/H+ antiporter NhaC  33.14 
 
 		 527 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4063  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  32.63 
 
 		 594 aa  239  8e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1007  Na(+)/H(+) antiporter  34.12 
 
 		 526 aa  238  2e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0070  Na+/H+ antiporter NhaC  33.71 
 
 		 552 aa  236  7e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.837679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1009  Na+/H+ antiporter NhaC  35.24 
 
 		 521 aa  235  2.0000000000000002e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07900  Na+/H+ antiporter  34.62 
 
 		 546 aa  217  5.9999999999999996e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2134  Na+/H+ antiporter NhaC  30.86 
 
 		 451 aa  213  1e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1817  Na+/H+ antiporter NhaC  31.69 
 
 		 476 aa  209  1e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1884  Na+/H+ antiporter NhaC  30.18 
 
 		 457 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4723  Na+/H+ antiporter family protein  29.67 
 
 		 493 aa  197  6e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.448886  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1873  Na+/H+ antiporter NhaC  30.26 
 
 		 460 aa  193  6e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0663554  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2234  Na+/H+ antiporter NhaC  30.2 
 
 		 460 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000146324  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2247  Na+/H+ antiporter NhaC  30.2 
 
 		 460 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000466881  decreased coverage  0.0000000000662614 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4520  hypothetical protein  30.2 
 
 		 460 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2187  Na+/H+ antiporter NhaC  30.2 
 
 		 460 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000561486  unclonable  0.00000648727 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2137  Na+/H+ antiporter NhaC  30.2 
 
 		 460 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000622786  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2481  hypothetical protein  29.59 
 
 		 460 aa  189  9e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2144  Na+/H+ antiporter NhaC  29.39 
 
 		 460 aa  187  6e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0101498  hitchhiker  0.00125145 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0699  Na+/H+ antiporter NhaC  30.6 
 
 		 460 aa  186  8e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000725469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3604  hypothetical protein  30.26 
 
 		 466 aa  186  8e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2039  Na+/H+ antiporter NhaC  29.2 
 
 		 460 aa  184  3e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000344468  hitchhiker  0.00385461 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1936  Na+/H+ antiporter NhaC  29.2 
 
 		 460 aa  184  3e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000100121  hitchhiker  0.00835869 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00591  Na+/H+ antiporter family protein  30.43 
 
 		 448 aa  185  3e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0779  Na+/H+ antiporter NhaC  29.22 
 
 		 454 aa  183  8.000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.129292  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0698  Na+/H+ antiporter NhaC  29.44 
 
 		 460 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3255  Na+/H+ antiporter NhaC  30.08 
 
 		 574 aa  178  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.208883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1184  Na+/H+ antiporter NhaC  28.97 
 
 		 448 aa  179  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0529318  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3425  Na+/H+ antiporter NhaC  30.16 
 
 		 460 aa  177  5e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000177895  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3882  Na+/H+ antiporter NhaC  27.81 
 
 		 459 aa  176  9e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1698  hypothetical protein  28.91 
 
 		 460 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000332347  normal  0.0298403 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1791  Na+/H+ antiporter NhaC  27.33 
 
 		 393 aa  174  3.9999999999999995e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2662  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  27.22 
 
 		 501 aa  173  6.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4190  Na+/H+ antiporter NhaC  27.52 
 
 		 497 aa  170  5e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0239157  normal  0.371674 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01080  Na+/H+ antiporter  49.19 
 
 		 201 aa  169  1e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0336  Na(+)/H(+) antiporter  27.71 
 
 		 507 aa  163  9e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3653  Na+/H+ antiporter NhaC  27.85 
 
 		 509 aa  156  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01078  Na+/H+ antiporter  35.48 
 
 		 318 aa  154  2.9999999999999998e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3955  Na+/H+ antiporter NhaC  26.88 
 
 		 497 aa  153  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4150  Na+/H+ antiporter NhaC  26.88 
 
 		 497 aa  152  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4057  Na+/H+ antiporter NhaC  26.88 
 
 		 497 aa  152  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4032  Na+/H+ antiporter NhaC  26.84 
 
 		 497 aa  150  4e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1623  Na+/H+ antiporter NhaC  25.1 
 
 		 470 aa  144  5e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3639  Na+/H+ antiporter NhaC  27.44 
 
 		 501 aa  144  6e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>