62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2848 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2848  hypothetical protein  100 
 
 
193 aa  384  1e-106  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2534  hypothetical protein  98.96 
 
 
193 aa  380  1e-105  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2535  hypothetical protein  54.04 
 
 
169 aa  155  4e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2849  hypothetical protein  54.04 
 
 
169 aa  155  4e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0310  hypothetical protein  39.35 
 
 
165 aa  89  4e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1771  hypothetical protein  36.49 
 
 
160 aa  73.2  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1753  hypothetical protein  29.75 
 
 
167 aa  69.7  0.00000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00376249  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1378  protein of unknown function DUF939  32.75 
 
 
369 aa  68.6  0.00000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000180772  normal  0.221416 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3675  protein of unknown function DUF939  28.06 
 
 
708 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0436  hypothetical protein  29.94 
 
 
362 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0468809  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0512  putative lipoprotein  29.94 
 
 
362 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0585  putative lipoprotein  29.94 
 
 
362 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0529  putative lipoprotein  29.94 
 
 
362 aa  59.7  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0440  hypothetical protein  29.94 
 
 
362 aa  59.7  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0381254  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0497  putative lipoprotein  29.94 
 
 
362 aa  59.7  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1355  protein of unknown function DUF939  29.63 
 
 
359 aa  60.5  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0584  putative lipoprotein  29.94 
 
 
381 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12921  hypothetical protein  26.81 
 
 
151 aa  56.6  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0893341 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0445  hypothetical protein  29.34 
 
 
381 aa  55.8  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0451  hypothetical protein  29.63 
 
 
394 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1021  protein of unknown function DUF939  29.57 
 
 
368 aa  54.7  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1953  hypothetical protein  25.64 
 
 
364 aa  53.9  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1919  hypothetical protein  25.64 
 
 
364 aa  53.9  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.259115  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1765  hypothetical protein  28.57 
 
 
179 aa  53.5  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.136775  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4792  putative lipoprotein  28.74 
 
 
362 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.591787  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0533  putative lipoprotein  28.74 
 
 
362 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0945445  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2884  hypothetical protein  23.71 
 
 
360 aa  51.6  0.000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1527  hypothetical protein  25.88 
 
 
316 aa  49.7  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.210442  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0482  protein of unknown function DUF939  28.06 
 
 
353 aa  48.9  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00150379  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1808  hypothetical protein  25.29 
 
 
316 aa  48.9  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0309492  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0015  hypothetical protein  23.93 
 
 
380 aa  47.4  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2736  hypothetical protein  22.58 
 
 
363 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.30564  normal  0.0867479 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4389  hypothetical protein  21.02 
 
 
361 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0097  hypothetical protein  24.31 
 
 
347 aa  45.8  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0146368  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0247  YccS/YhfK family integral membrane protein  28.99 
 
 
706 aa  45.8  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3946  YccS/YhfK family integral membrane protein  28.99 
 
 
706 aa  45.8  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1977  hypothetical protein  24.26 
 
 
328 aa  45.4  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1074  hypothetical protein  25.29 
 
 
325 aa  45.4  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1943  membrane protein-like protein  24.26 
 
 
328 aa  45.4  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0311  hypothetical protein  30.19 
 
 
180 aa  45.1  0.0006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1914  protein of unknown function DUF939  20.73 
 
 
395 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1464  membrane protein-like  25 
 
 
151 aa  43.5  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.121948  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4171  hypothetical protein  27.47 
 
 
322 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.781105 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0005  hypothetical protein  26.61 
 
 
377 aa  43.9  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00809476  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6076  membrane protein  28.46 
 
 
600 aa  43.1  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4373  hypothetical protein  27.47 
 
 
322 aa  43.9  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0189837  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3703  YccS/YhfK family integral membrane protein  27.54 
 
 
706 aa  43.9  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4056  hypothetical protein  27.47 
 
 
322 aa  43.9  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00110861  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0164  hypothetical protein  21.33 
 
 
359 aa  43.1  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1114  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  22.56 
 
 
699 aa  43.1  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3399  hypothetical protein  23.17 
 
 
700 aa  42.7  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.709327  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1604  hypothetical protein  25.41 
 
 
326 aa  42.4  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.966783  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1572  hypothetical protein  25.41 
 
 
326 aa  42.4  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0974  hypothetical protein  26.92 
 
 
322 aa  42  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00289539  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4261  hypothetical protein  26.92 
 
 
322 aa  42  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0114239  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3990  hypothetical protein  26.63 
 
 
322 aa  42  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4222  hypothetical protein  26.92 
 
 
322 aa  42  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0112713  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3902  hypothetical protein  27.47 
 
 
322 aa  42  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00608095  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3895  hypothetical protein  24.75 
 
 
322 aa  41.6  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000792929  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1421  hypothetical membrane spanning protein  27.1 
 
 
377 aa  42  0.006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.230954  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1484  hypothetical protein  26.45 
 
 
377 aa  41.6  0.007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.356024  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001146  hypothetical protein  20.71 
 
 
724 aa  41.6  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.913629  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>