34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2841 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2841  primase-like protein  100 
 
 		 182 aa  352  2e-96  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2527  primase-like protein  98.9 
 
 		 182 aa  350  5e-96  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1510  primase/topoisomerase like protein  51.12 
 
 		 176 aa  174  7e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000457105  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0035  primase/topoisomerase like protein  46.33 
 
 		 185 aa  165  4e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0045  primase-related protein  46.89 
 
 		 185 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0035  primase/topoisomerase like protein  46.89 
 
 		 185 aa  162  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5271  primase-related protein  46.89 
 
 		 185 aa  160  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0038  primase-related protein  46.33 
 
 		 185 aa  159  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0039  primase-related protein  46.33 
 
 		 185 aa  159  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0820381  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0036  ribonuclease M5  46.33 
 
 		 185 aa  159  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0045  primase-related protein  46.33 
 
 		 185 aa  159  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0036  ribonuclease M5  46.33 
 
 		 185 aa  159  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000747887  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0038  primase-related protein  46.33 
 
 		 185 aa  159  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0049  primase-related protein  46.33 
 
 		 185 aa  159  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2965  primase/topoisomerase like protein  46.74 
 
 		 192 aa  157  5e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000014203  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0036  primase/topoisomerase like protein  47.46 
 
 		 187 aa  154  5.0000000000000005e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.278687  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0034  primase/topoisomerase like protein  47.43 
 
 		 182 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0212  ribonuclease M5  42.22 
 
 		 188 aa  146  2.0000000000000003e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0513  hypothetical protein  45.71 
 
 		 178 aa  142  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.029642  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0526  hypothetical protein  45.71 
 
 		 178 aa  142  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0178284  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0130  primase-related protein  44.25 
 
 		 181 aa  140  7e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.503861  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0073  primase/topoisomerase like protein  44.62 
 
 		 205 aa  136  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000589128  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0717  hypothetical protein  42.31 
 
 		 186 aa  135  3.0000000000000003e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.740448  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0130  primase/topoisomerase like protein  38.92 
 
 		 191 aa  129  3e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.504524  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1781  primase-related protein  40.33 
 
 		 186 aa  128  5.0000000000000004e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1614  ribonuclease M5  37.93 
 
 		 189 aa  123  2e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1773  ribonuclease M5  38.89 
 
 		 186 aa  120  8e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0517  primase/topoisomerase like protein  39.58 
 
 		 371 aa  118  3.9999999999999996e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0207  ribonuclease M5  39.2 
 
 		 187 aa  118  4.9999999999999996e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000177928  normal  0.0149756 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1550  ribonuclease M5  32.79 
 
 		 184 aa  97.8  8e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0184  primase homolog  35.75 
 
 		 179 aa  91.7  6e-18  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0003  primase-related protein  40 
 
 		 180 aa  70.5  0.00000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.458899  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl004  nucleotidyltransferase, primase  32.1 
 
 		 175 aa  63.5  0.000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0960  DNA primase  37.5 
 
 		 405 aa  41.6  0.007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.916463 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>