More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2837 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2837  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  100 
 
 
256 aa  506  9.999999999999999e-143  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2523  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  99.22 
 
 
256 aa  502  1e-141  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0062  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.68 
 
 
295 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2869  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.4 
 
 
267 aa  145  6e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0374  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.7 
 
 
263 aa  128  7.000000000000001e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000370596  hitchhiker  0.000000000404856 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1116  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.24 
 
 
249 aa  126  3e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.427677  normal  0.116 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0857  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.06 
 
 
260 aa  125  7e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000653455  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1209  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.36 
 
 
266 aa  124  1e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0966  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.15 
 
 
260 aa  123  3e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00202083  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0030  prolipoprotein diacylglyceryl transferase, putative  38.16 
 
 
259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000620053  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1509  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.38 
 
 
260 aa  115  5e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1865  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  35.14 
 
 
253 aa  115  5e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.827419  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4345  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.05 
 
 
285 aa  115  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_839  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.28 
 
 
260 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00921901  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0486  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.6 
 
 
261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1554  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.09 
 
 
271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000775379  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1235  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.3 
 
 
269 aa  112  4.0000000000000004e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2253  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  28.94 
 
 
357 aa  111  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.411442  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1165  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.62 
 
 
279 aa  108  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1192  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.62 
 
 
279 aa  108  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4840  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.11 
 
 
270 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01870  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.32 
 
 
257 aa  107  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0951  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  28.63 
 
 
276 aa  107  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5281  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.67 
 
 
270 aa  108  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1189  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  26.17 
 
 
258 aa  108  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5247  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.11 
 
 
270 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5266  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.11 
 
 
270 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5011  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.11 
 
 
270 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4855  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.11 
 
 
270 aa  107  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5391  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.11 
 
 
270 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4955  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.36 
 
 
270 aa  107  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5323  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.67 
 
 
270 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0195  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.92 
 
 
297 aa  106  4e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.337573  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0984  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  28.03 
 
 
320 aa  106  4e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5676  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.22 
 
 
270 aa  105  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1279  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.4 
 
 
250 aa  105  5e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2374  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  26.03 
 
 
257 aa  105  7e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0905  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  27.46 
 
 
267 aa  105  8e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000213906  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2944  Prolipoprotein diacylglyceryltransferase-like protein  28.12 
 
 
372 aa  104  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0870252  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0909  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.96 
 
 
292 aa  103  3e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.173456  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1408  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.99 
 
 
289 aa  103  4e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.997076  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0923  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.96 
 
 
249 aa  102  5e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.532012  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12920  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  26.42 
 
 
290 aa  101  1e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.870796  normal  0.137466 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0370  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  28.17 
 
 
275 aa  100  2e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3170  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  25 
 
 
270 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0785  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  28.57 
 
 
279 aa  100  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.577083  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3705  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.78 
 
 
270 aa  100  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2864  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.3 
 
 
305 aa  100  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0720  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.53 
 
 
263 aa  100  2e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0760049  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0802  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  28.57 
 
 
279 aa  100  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0473  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  28.33 
 
 
357 aa  99  6e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0590188  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1890  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.47 
 
 
252 aa  99  6e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00906876  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28080  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  23.88 
 
 
354 aa  98.6  8e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.640026  normal  0.438535 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1967  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.25 
 
 
282 aa  98.2  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.394112  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0014  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  27.01 
 
 
301 aa  97.8  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3048  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  25.94 
 
 
954 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.814492  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3064  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  25.94 
 
 
865 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.333242  normal  0.223199 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3107  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  25.94 
 
 
954 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.851617  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4475  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  27.48 
 
 
345 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00262186  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2986  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  28.57 
 
 
269 aa  97.1  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0528161  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0868  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  27.55 
 
 
291 aa  97.8  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.514857  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2819  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  24.81 
 
 
820 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.200403  normal  0.775609 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2569  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  25.38 
 
 
295 aa  95.9  5e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000200473  hitchhiker  0.00320491 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0767  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.6 
 
 
267 aa  95.5  7e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0323676  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2870  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  28.29 
 
 
498 aa  95.1  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00175644  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1455  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  27.43 
 
 
322 aa  94.4  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0639  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  28.51 
 
 
261 aa  93.6  2e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.875971  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0465  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  26.37 
 
 
299 aa  93.6  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0974  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.3 
 
 
281 aa  93.6  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0181566  normal  0.0698787 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0014  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  27.63 
 
 
301 aa  93.2  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5142  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  28.74 
 
 
268 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0470002  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0014  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  27.44 
 
 
301 aa  92  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20720  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  27.67 
 
 
325 aa  92  8e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.14446  normal  0.252754 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1880  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  28.2 
 
 
271 aa  92  9e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0668134  normal  0.877518 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0323  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  27.95 
 
 
269 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.337894  normal  0.658901 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0904  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  27.31 
 
 
293 aa  90.5  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1139  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.72 
 
 
282 aa  90.5  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3214  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  24.79 
 
 
323 aa  90.9  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1327  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  26.25 
 
 
278 aa  90.5  2e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000868448  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5705  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  26.89 
 
 
388 aa  90.1  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0015  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  25.28 
 
 
360 aa  90.5  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.891974  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0737  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  25.97 
 
 
257 aa  88.6  9e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1230  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  28.4 
 
 
289 aa  88.6  9e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0607531 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3073  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  25 
 
 
347 aa  87.8  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000171179  hitchhiker  0.000454743 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5699  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  24.24 
 
 
371 aa  88.2  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116082  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0417  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  28.94 
 
 
276 aa  88.2  1e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1218  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  27.53 
 
 
285 aa  87.8  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0627  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  25.27 
 
 
290 aa  87.4  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.616827  normal  0.157864 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1450  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  24.16 
 
 
301 aa  87.4  2e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4306  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  26.79 
 
 
290 aa  87.8  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3170  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  28.18 
 
 
372 aa  87.4  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.129029  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14920  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  25.57 
 
 
307 aa  87  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13542  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0349  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.25 
 
 
274 aa  87  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.932967  normal  0.231861 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3339  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  28.63 
 
 
276 aa  87.8  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0440  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  26 
 
 
261 aa  86.7  3e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.541789  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1954  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  26.1 
 
 
273 aa  87  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1690  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  27.2 
 
 
409 aa  87  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.268506  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5374  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  28.75 
 
 
271 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.4033 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2481  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  27.37 
 
 
305 aa  86.7  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.148056  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1505  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  24.16 
 
 
301 aa  86.7  4e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.642612  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>