206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2801 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2801  S4 domain-containing protein  100 
 
 
86 aa  169  1e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000000568506  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2487  S4 domain-containing protein  97.67 
 
 
86 aa  164  4e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000000325164  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0649  RNA-binding S4 domain protein  62.5 
 
 
80 aa  112  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000916676  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2658  RNA-binding S4  67.95 
 
 
79 aa  106  9.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000195193  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0134  RNA-binding S4 domain-containing protein  59.49 
 
 
79 aa  100  5e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000111292  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3084  RNA-binding S4 domain protein  63.16 
 
 
79 aa  100  5e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000350444  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0688  RNA-binding S4 domain-containing protein  58.75 
 
 
81 aa  100  7e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0948167  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0400  ribosome-associated heat shock protein implicated in the recycling of the 50S subunit S4-like protein  56.96 
 
 
93 aa  98.6  2e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0012  ribosome-associated heat shock protein implicated in the recycling of the 50S subunit S4-like protein  58.23 
 
 
89 aa  95.5  2e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0008  S4 domain-containing protein  56.96 
 
 
91 aa  94.7  4e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.340534  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0620  RNA-binding S4 domain protein  55 
 
 
81 aa  92.8  1e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.215008  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0272  ribosome-associated heat shock protein implicated in the recycling of the 50S subunit S4-like protein  53.75 
 
 
91 aa  93.2  1e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0144  S4 domain-containing protein  53.66 
 
 
87 aa  92.8  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0184  ribosome-associated heat shock protein implicated in the recycling of the 50S subunit S4-like protein  50 
 
 
86 aa  92.4  2e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0010  S4 domain-containing protein  56.96 
 
 
90 aa  90.9  5e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0084  hypothetical protein  55 
 
 
80 aa  90.5  7e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0054  RNA-binding S4 domain protein  50.6 
 
 
90 aa  90.1  8e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0449701  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0541  RNA-binding S4 domain-containing protein  55.26 
 
 
87 aa  89.7  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000262722  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0528  RNA-binding S4 domain-containing protein  55.26 
 
 
87 aa  89.7  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000233006  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0052  RNA-binding S4 domain protein  52.44 
 
 
93 aa  88.6  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0220  RNA-binding S4 domain protein  51.25 
 
 
86 aa  88.6  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.126994  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0263  RNA-binding S4 domain-containing protein  51.25 
 
 
90 aa  87  8e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0187  RNA-binding S4 domain protein  47.56 
 
 
100 aa  84.7  4e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0055  S4 domain-containing protein  48.24 
 
 
91 aa  84.3  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.28078  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0056  S4 domain-containing protein  48.24 
 
 
91 aa  84.3  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0052  heat shock protein 15  48.24 
 
 
91 aa  84.3  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000120975  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0052  heat shock protein 15  48.24 
 
 
91 aa  84.3  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.69267  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0062  S4 domain protein  48.24 
 
 
91 aa  84.3  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.244767  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0056  s4 domain-containing protein  48.24 
 
 
91 aa  84.3  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00178771  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0063  S4 domain protein  48.24 
 
 
91 aa  84.3  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5254  S4 domain protein  48.24 
 
 
91 aa  84.3  5e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00238131  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0066  S4 domain protein  48.24 
 
 
91 aa  84.3  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0453623  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0116  RNA-binding S4 domain-containing protein  50 
 
 
80 aa  84  7e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0052  RNA-binding S4 domain-containing protein  50 
 
 
91 aa  83.6  9e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0086  RNA-binding S4  47.06 
 
 
89 aa  83.6  9e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0510355  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0076  RNA-binding S4 domain-containing protein  46.25 
 
 
88 aa  83.2  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0136  RNA-binding S4 domain protein  46.34 
 
 
90 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.170322  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0052  RNA-binding S4 domain-containing protein  47.06 
 
 
91 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.052055  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1221  RNA-binding S4 domain protein  46.25 
 
 
89 aa  75.9  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000180321  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1380  RNA-binding S4 domain-containing protein  51.52 
 
 
77 aa  73.6  0.0000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.278565  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0093  RNA-binding S4 domain protein  45.12 
 
 
82 aa  71.6  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000415805  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1262  RNA-binding S4 domain protein  43.21 
 
 
83 aa  69.3  0.00000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2068  RNA-binding S4 domain protein  42.68 
 
 
81 aa  66.2  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0164  S4 domain protein  41.46 
 
 
87 aa  65.5  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0343  RNA-binding S4 domain protein  41.46 
 
 
87 aa  65.5  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.343465  normal  0.703045 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0965  RNA-binding S4 domain-containing protein  50 
 
 
79 aa  64.7  0.0000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0165  heat shock protein 15  33.33 
 
 
145 aa  58.9  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1980  S4 domain-containing protein  40.74 
 
 
81 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1066  S4 domain-containing protein  43.75 
 
 
81 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0725  RNA-binding S4 domain-containing protein  41.94 
 
 
77 aa  59.3  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.149399  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0701  RNA-binding S4 domain-containing protein  41.94 
 
 
77 aa  59.3  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00584893  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0693  S4 domain-containing protein  44.62 
 
 
81 aa  58.2  0.00000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0768  S4 domain-containing protein  43.08 
 
 
81 aa  57.4  0.00000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.515789  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1332  S4 domain-containing protein  43.08 
 
 
81 aa  57.4  0.00000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1237  uroporphyrinogen decarboxylase  47.62 
 
 
81 aa  56.6  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0850  S4 domain-containing protein  43.75 
 
 
81 aa  56.6  0.0000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00127812  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0753  S4 RNA-binding domain protein  42.86 
 
 
82 aa  55.8  0.0000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4348  hypothetical protein  41.03 
 
 
133 aa  56.2  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0874214  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1468  RNA-binding S4  50.91 
 
 
146 aa  54.3  0.0000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.369867  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0791  RNA-binding S4 domain protein  45.16 
 
 
133 aa  54.3  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1559  RNA-binding S4 domain-containing protein  38.1 
 
 
100 aa  53.9  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.200208  normal  0.3644 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3114  RNA-binding S4 domain-containing protein  39.51 
 
 
137 aa  53.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00552893  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0859  RNA-binding S4 domain protein  44.9 
 
 
132 aa  52.4  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00617037 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2419  RNA-binding S4 domain-containing protein  36.71 
 
 
139 aa  52.4  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.676645  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0016  RNA-binding S4  36.71 
 
 
125 aa  52  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.10348  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1408  RNA-binding S4 domain protein  37.21 
 
 
141 aa  52  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2104  RNA-binding S4 domain protein  38.46 
 
 
128 aa  51.2  0.000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2501  RNA-binding S4 domain-containing protein  42.86 
 
 
149 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.157216  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2640  RNA-binding S4  38.46 
 
 
141 aa  51.2  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.414836  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0206  RNA-binding S4  44 
 
 
122 aa  50.8  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1304  heat shock protein 15  42.86 
 
 
135 aa  50.8  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2048  RNA-binding S4 domain protein  33.77 
 
 
141 aa  50.4  0.000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0734  RNA-binding S4 domain protein  42.86 
 
 
135 aa  50.4  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.20304  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1038  RNA-binding S4  44.68 
 
 
131 aa  50.1  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2876  RNA-binding S4 domain protein  35.38 
 
 
132 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0783  RNA-binding S4 domain protein  36.23 
 
 
117 aa  50.1  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1002  RNA-binding S4  44.68 
 
 
131 aa  50.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.320344 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0574  RNA-binding S4  32.22 
 
 
124 aa  49.7  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000000475662  unclonable  0.0000000209736 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2470  RNA-binding S4 domain protein  35.38 
 
 
132 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.264328  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3766  RNA-binding S4 domain protein  39.62 
 
 
122 aa  50.1  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0330  RNA-binding S4 domain protein  43.4 
 
 
135 aa  49.7  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0496107 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2642  putative heat shock protein 15  35.38 
 
 
131 aa  49.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.351064  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3964  putative heat shock protein 15  42.86 
 
 
135 aa  49.7  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0551076 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0263  RNA-binding S4  33.85 
 
 
135 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.935864  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0228  RNA-binding S4  37.18 
 
 
138 aa  49.3  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0717  RNA-binding S4 domain-containing protein  42.86 
 
 
135 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0747  RNA-binding S4 domain-containing protein  33.85 
 
 
135 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.503491  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1231  RNA-binding S4 domain-containing protein  37.97 
 
 
138 aa  49.3  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.984155  normal  0.301013 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0051  RNA-binding S4 domain-containing protein  34.44 
 
 
131 aa  48.9  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0950  heat shock RNA-binding protein  45.45 
 
 
146 aa  48.1  0.00004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0665  RNA-binding S4 domain-containing protein  33.85 
 
 
135 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2663  RNA-binding S4  39.62 
 
 
120 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.173796  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0641  RNA-binding S4 domain-containing protein  40.82 
 
 
157 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2708  RNA-binding S4 domain-containing protein  39.62 
 
 
120 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0322974 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1639  RNA-binding S4 domain-containing protein  37.5 
 
 
141 aa  48.1  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.290258 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2693  RNA-binding S4 domain-containing protein  39.62 
 
 
120 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.375467  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0884  RNA-binding S4 domain protein  29.87 
 
 
125 aa  47.8  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2006  RNA-binding S4  40.62 
 
 
142 aa  47.8  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.654471  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2659  RNA-binding S4  33.77 
 
 
130 aa  47.8  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.793293  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1026  RNA-binding S4 domain protein  43.08 
 
 
82 aa  47.8  0.00005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.319411  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>