More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2782 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2782  transcription elongation factor GreA  100 
 
 		 158 aa  310  3.9999999999999997e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2468  transcription elongation factor GreA  100 
 
 		 158 aa  310  3.9999999999999997e-84  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2897  transcription elongation factor GreA  66.24 
 
 		 159 aa  217  5e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0809  transcription elongation factor GreA  68.39 
 
 		 157 aa  212  1.9999999999999998e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000158219  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0395  transcription elongation factor GreA  60.76 
 
 		 158 aa  202  1e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0208  transcription elongation factor GreA  60.76 
 
 		 158 aa  194  5.000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000182043  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0162  transcription elongation factor GreA  59.87 
 
 		 156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  7.34558e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0151  GreA/GreB family elongation factor  54.43 
 
 		 160 aa  181  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000044733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00740  transcription elongation factor GreA  55.26 
 
 		 161 aa  181  3e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000778945  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0174  transcription elongation factor GreA  55.06 
 
 		 158 aa  180  8.000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000153177  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0658  transcription elongation factor GreA  57.59 
 
 		 162 aa  179  2e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211465  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0130  transcription elongation factor GreA  52.9 
 
 		 163 aa  176  1e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000129551  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0250  transcription elongation factor GreA  55.13 
 
 		 158 aa  173  6e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000127535  normal  0.353375 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0972  transcription elongation factor GreA  53.85 
 
 		 158 aa  173  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0737  transcription elongation factor GreA  54.14 
 
 		 175 aa  170  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.718576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4499  transcription elongation factor GreA  54.14 
 
 		 175 aa  170  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4461  transcription elongation factor GreA  52.56 
 
 		 158 aa  169  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.310238  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2481  transcription elongation factor GreA  53.21 
 
 		 159 aa  169  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4275  transcription elongation factor GreA  52.56 
 
 		 158 aa  169  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.282937  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4112  transcription elongation factor GreA  52.56 
 
 		 158 aa  169  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4123  transcription elongation factor GreA  52.56 
 
 		 158 aa  169  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4512  transcription elongation factor GreA  52.56 
 
 		 158 aa  169  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000192957  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4607  transcription elongation factor GreA  52.56 
 
 		 158 aa  169  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3092  transcription elongation factor GreA  51.92 
 
 		 158 aa  169  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4459  transcription elongation factor GreA  52.56 
 
 		 175 aa  169  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0719149 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4226  transcription elongation factor GreA  51.28 
 
 		 175 aa  166  9e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3557  transcription elongation factor GreA  53.8 
 
 		 160 aa  160  7e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000103558  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1648  transcription elongation factor GreA  55.06 
 
 		 159 aa  159  1e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0115  GreA/GreB family elongation factor  48.08 
 
 		 159 aa  155  2e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000137367  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0116  transcription elongation factor GreA  58.17 
 
 		 164 aa  153  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000184686  hitchhiker  0.00194606 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0627  transcription elongation factor GreA  53.8 
 
 		 157 aa  152  1e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1389  transcription elongation factor  52.7 
 
 		 160 aa  150  5.9999999999999996e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  3.76815e-17  hitchhiker  8.922560000000001e-24 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1680  transcription elongation factor GreA  48.61 
 
 		 161 aa  146  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0660  transcription elongation factor GreA  53.1 
 
 		 156 aa  144  6e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.143981  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0289  transcription elongation factor GreA  48.1 
 
 		 160 aa  144  6e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1214  transcription elongation factor GreA  51.3 
 
 		 158 aa  143  8.000000000000001e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000531032  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0472  transcription elongation factor GreA  50.34 
 
 		 160 aa  143  1e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.384084  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2353  transcription elongation factor GreA  46.5 
 
 		 157 aa  140  5e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000000957781  decreased coverage  0.00150302 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1246  transcription elongation factor GreA  47.13 
 
 		 162 aa  140  7e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0270341  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3017  transcription elongation factor GreA  47.65 
 
 		 157 aa  136  8.999999999999999e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2887  transcription elongation factor GreA  46 
 
 		 157 aa  134  7.000000000000001e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2312  transcription elongation factor GreA  46.31 
 
 		 152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.693473  hitchhiker  0.00295599 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1590  transcription elongation factor GreA  48 
 
 		 158 aa  131  3.9999999999999996e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0008  transcription elongation factor GreA  46.2 
 
 		 157 aa  130  6.999999999999999e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000636821  hitchhiker  0.00000229317 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0304  transcription elongation factor GreA  46.67 
 
 		 157 aa  130  9e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2181  transcription elongation factor GreA  43.33 
 
 		 154 aa  130  9e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.015275  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3355  transcription elongation factor GreA  46.75 
 
 		 158 aa  130  9e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00153993  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0910  transcription elongation factor GreA  44.16 
 
 		 157 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1564  transcription elongation factor GreA  47.02 
 
 		 160 aa  130  1.0000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000290434  hitchhiker  0.000735134 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0566  transcription elongation factor GreA  41.4 
 
 		 179 aa  127  8.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0510993  normal  0.103581 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4815  transcription elongation factor GreA  49.33 
 
 		 160 aa  127  8.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0909183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1611  transcription elongation factor GreA  45.64 
 
 		 158 aa  127  9.000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.69568e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0394  transcription elongation factor GreA  44 
 
 		 158 aa  126  9.000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.715679  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3810  transcription elongation factor GreA  45.33 
 
 		 157 aa  127  9.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.138968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2239  transcription elongation factor GreA  51.7 
 
 		 156 aa  126  1.0000000000000001e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000000131275  normal  0.39945 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1701  transcription elongation factor GreA  51.37 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1667  transcription elongation factor GreA  51.37 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1612  transcription elongation factor GreA  46.2 
 
 		 160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.986319  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0453  transcription elongation factor GreA  44 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3400  transcription elongation factor GreA  42.67 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0549133  normal  0.0891208 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1781  transcription elongation factor GreA  46.67 
 
 		 159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.695085  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1676  transcription elongation factor GreA  45.86 
 
 		 155 aa  125  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000127836  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1174  transcription elongation factor GreA  50.68 
 
 		 158 aa  124  3e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01495  putative transcription elongation factor  44.67 
 
 		 158 aa  125  3e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0798  transcription elongation factor GreA  45.16 
 
 		 159 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000258876  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1854  transcription elongation factor GreA  46.67 
 
 		 159 aa  124  5e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.866249  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1117  transcription elongation factor GreA  43.71 
 
 		 159 aa  124  5e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.789381  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1002  transcription elongation factor GreA  45.1 
 
 		 156 aa  124  5e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000716767  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0077  transcription elongation factor GreA  44.59 
 
 		 157 aa  124  5e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00207801  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3030  transcription elongation factor GreA  40.94 
 
 		 152 aa  124  6e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.953757  decreased coverage  0.00490744 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3615  transcription elongation factor GreA  46.67 
 
 		 158 aa  124  6e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000143014  normal  0.24531 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2976  transcription elongation factor GreA  43.62 
 
 		 158 aa  124  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.174839  normal  0.133661 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3474  transcription elongation factor GreA  44.16 
 
 		 158 aa  124  6e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000137819  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1277  transcription elongation factor GreA  46 
 
 		 158 aa  124  7e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000293441  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4606  transcription elongation factor GreA  44.52 
 
 		 158 aa  124  7e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.127343  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1660  transcription elongation factor GreA  41.83 
 
 		 157 aa  124  7e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.985567  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2523  transcription elongation factor GreA  45.33 
 
 		 158 aa  123  8.000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182345  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0480  transcription elongation factor GreA  47.33 
 
 		 158 aa  123  8.000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000270875  normal  0.813705 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0788  transcription elongation factor GreA  45.45 
 
 		 158 aa  123  9e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0638  transcription elongation factor GreA  45.45 
 
 		 158 aa  123  9e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1129  GreA/GreB family elongation factor  42.48 
 
 		 158 aa  123  9e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4421  transcription elongation factor GreA  42.28 
 
 		 158 aa  123  9e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1466  transcription elongation factor GreA  45.86 
 
 		 176 aa  123  1e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0366416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1128  transcription elongation factor GreA  44.44 
 
 		 156 aa  123  1e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000607304  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1218  transcription elongation factor GreA  41.03 
 
 		 160 aa  122  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1089  transcription elongation factor GreA  41.03 
 
 		 160 aa  122  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.799328 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1733  transcription elongation factor GreA  42.21 
 
 		 158 aa  123  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.669906  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2213  transcription elongation factor GreA  42.38 
 
 		 158 aa  122  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2118  transcription elongation factor GreA  42.67 
 
 		 157 aa  123  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3595  transcription elongation factor GreA  45.33 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.303006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1672  transcription elongation factor GreA  47.33 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.112053  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3489  transcription elongation factor GreA  45.33 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0192346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2450  transcription elongation factor GreA  43.84 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.596907 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1023  transcription elongation factor GreA  41.03 
 
 		 160 aa  122  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.299103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3657  transcription elongation factor GreA  45.33 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00121074  normal  0.243551 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3558  transcription elongation factor GreA  45.33 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0635889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3488  transcription elongation factor GreA  45.33 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000067905  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1254  transcription elongation factor GreA  42 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.378894  normal  0.504509 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0526  transcription elongation factor GreA  45.33 
 
 		 158 aa  121  3e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000858072  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3589  transcription elongation factor GreA  45.33 
 
 		 158 aa  121  3e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000874781  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>