296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2763 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2763  Orn/Lys/Arg decarboxylase  100 
 
 
476 aa  952    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.900019  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2448  Orn/Lys/Arg decarboxylase  97.63 
 
 
476 aa  880    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2108  arginine decarboxylase  37.09 
 
 
485 aa  286  5e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.970229  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0052  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  35.36 
 
 
473 aa  280  5e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.853869  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0024  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  35.99 
 
 
472 aa  277  2e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0155  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  33.61 
 
 
485 aa  277  3e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0024  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  35.16 
 
 
473 aa  276  6e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0027  lysine decarboxylase  35.14 
 
 
473 aa  271  1e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0038  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  35.43 
 
 
473 aa  271  2e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5282  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  34.28 
 
 
473 aa  266  7e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0034  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  35.81 
 
 
473 aa  265  2e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.266079  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0034  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  35.14 
 
 
473 aa  264  3e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0025  lysine decarboxylase  35.14 
 
 
473 aa  263  6e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0025  lysine decarboxylase  34.49 
 
 
473 aa  263  6e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0028  lysine decarboxylase  34.92 
 
 
473 aa  262  1e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0026  lysine decarboxylase  34.92 
 
 
473 aa  262  1e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0025  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  33.55 
 
 
478 aa  258  1e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0023  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  31.62 
 
 
477 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2265  arginine decarboxylase  31.32 
 
 
499 aa  246  8e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.211386 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2121  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  27.54 
 
 
474 aa  239  5.999999999999999e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.06026  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1815  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  29.78 
 
 
491 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.747832  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1838  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  28.16 
 
 
490 aa  234  3e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2795  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  31.83 
 
 
485 aa  233  4.0000000000000004e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2050  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  30.98 
 
 
493 aa  234  4.0000000000000004e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0371444  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3976  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  30.12 
 
 
487 aa  231  2e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000244746  unclonable  0.000000000155031 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0099  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  30.06 
 
 
509 aa  230  4e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000131597 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0963  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  28.36 
 
 
490 aa  230  4e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000204147  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0031  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  31.17 
 
 
483 aa  229  6e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.901763 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3722  lysine decarboxylase; arginine decarboxylase  27.18 
 
 
493 aa  229  8e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.159771  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3874  lysine decarboxylase  27.48 
 
 
493 aa  229  9e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0422494  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4172  lysine decarboxylase  27.48 
 
 
493 aa  229  9e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000808464  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3977  arginine decarboxylase  27.48 
 
 
490 aa  229  9e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3429  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  28.1 
 
 
490 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3707  lysine decarboxylase; arginine decarboxylase  27.39 
 
 
493 aa  228  1e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00346407  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2338  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  29.05 
 
 
491 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1175  arginine decarboxylase  27.18 
 
 
536 aa  228  2e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0528  Orn/Lys/Arg decarboxylase  33.47 
 
 
484 aa  228  2e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2389  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  28.84 
 
 
491 aa  228  3e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0514  Orn/Lys/Arg decarboxylase  33.26 
 
 
484 aa  227  3e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4065  arginine decarboxylase  26.97 
 
 
490 aa  227  4e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0303984  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4081  arginine decarboxylase  27.18 
 
 
490 aa  227  4e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000678146  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4009  lysine decarboxylase  26.97 
 
 
493 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00245624  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0058  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  29.46 
 
 
482 aa  226  7e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2664  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  26.76 
 
 
490 aa  226  8e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000612019  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1039  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  27.18 
 
 
484 aa  225  2e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1276  arginine decarboxylase  27.82 
 
 
542 aa  223  4.9999999999999996e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.099521 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3788  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  26.97 
 
 
509 aa  220  5e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0991436  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2157  arginine decarboxylase  27.35 
 
 
488 aa  220  5e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.366245 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1037  hypothetical protein  29.8 
 
 
483 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1006  Arginine decarboxylase  31.28 
 
 
445 aa  215  9.999999999999999e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3916  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  30.8 
 
 
479 aa  212  1e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0039  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  29.84 
 
 
500 aa  212  1e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0425  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  27.12 
 
 
488 aa  211  3e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3801  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  29.42 
 
 
488 aa  211  3e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0041  arginine decarboxylase  28.82 
 
 
469 aa  207  4e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000185697 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0502  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  30.04 
 
 
445 aa  204  3e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0515  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  30.04 
 
 
445 aa  204  3e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0947631  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5242  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  27.05 
 
 
486 aa  202  8e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1357  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  26.78 
 
 
508 aa  202  9e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0119  Orn/Lys/Arg decarboxylase  30.32 
 
 
445 aa  202  9.999999999999999e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0707  arginine decarboxylase  27.1 
 
 
489 aa  202  1.9999999999999998e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0230  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  26.34 
 
 
484 aa  201  3e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205707  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0220  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  26.34 
 
 
484 aa  201  3e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.746138 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0240  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  26.34 
 
 
484 aa  201  3e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.688738 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3055  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  29.67 
 
 
485 aa  199  7e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1437  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  26.56 
 
 
495 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1918  arginine decarboxylase  29.23 
 
 
486 aa  199  1.0000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000463631  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0060  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  30.26 
 
 
472 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.845817  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0181  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  29.17 
 
 
483 aa  189  8e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000293135  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2916  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  25 
 
 
484 aa  189  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25385  normal  0.0806797 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0035  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  26 
 
 
495 aa  179  1e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.730375  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2805  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  25.42 
 
 
494 aa  174  2.9999999999999996e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100172  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3362  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  23.01 
 
 
473 aa  172  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44775  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0120  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  25.42 
 
 
466 aa  171  2e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1040  arginine decarboxylase  26.32 
 
 
524 aa  168  2e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4595  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  26.11 
 
 
501 aa  167  2.9999999999999998e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.922416  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0160  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  24.09 
 
 
486 aa  160  4e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.356314 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2291  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  23.62 
 
 
498 aa  157  5.0000000000000005e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.945238  normal  0.0438493 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0117  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  29.91 
 
 
487 aa  144  4e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0511  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  26.37 
 
 
464 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11741  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  28.78 
 
 
465 aa  132  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1621  arginine decarboxylase  22.05 
 
 
468 aa  127  5e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.460464 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1369  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  25.63 
 
 
440 aa  126  9e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.572499  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1380  arginine decarboxylase  24.1 
 
 
471 aa  125  2e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.104521  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09861  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  21.72 
 
 
466 aa  123  6e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1095  arginine decarboxylase  26.77 
 
 
463 aa  113  7.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11901  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  26.65 
 
 
465 aa  107  5e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11911  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  25.23 
 
 
465 aa  104  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.83143  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11021  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  24.56 
 
 
465 aa  101  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.260253 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2182  lysine decarboxylase  25.21 
 
 
460 aa  100  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.198287  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2134  lysine decarboxylase  25.21 
 
 
460 aa  99.8  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1007  L-lysine decarboxylase  23.96 
 
 
708 aa  92  2e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0720093  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1269  lysine decarboxylase  24.1 
 
 
767 aa  91.3  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2760  lysine decarboxylase, constitutive  22.89 
 
 
714 aa  90.5  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2822  lysine decarboxylase, constitutive  22.89 
 
 
714 aa  90.5  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2801  lysine decarboxylase, constitutive  22.89 
 
 
714 aa  90.5  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2718  lysine decarboxylase, constitutive  22.89 
 
 
714 aa  90.5  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2935  lysine decarboxylase, constitutive  22.89 
 
 
714 aa  90.5  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3773  lysine decarboxylase  22.5 
 
 
714 aa  89.7  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.231295  normal  0.03112 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1009  lysine decarboxylase  26.56 
 
 
626 aa  89.4  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.187258 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>