More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2734 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2734  RNA methyltransferase  100 
 
 
289 aa  583  1e-166  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2420  RNA methyltransferase  99.65 
 
 
289 aa  582  1.0000000000000001e-165  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00228978  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3320  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  54.17 
 
 
315 aa  279  4e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000334493  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2060  RNA methyltransferase  52.5 
 
 
277 aa  268  8.999999999999999e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0091  RNA methyltransferase  52.97 
 
 
247 aa  262  6e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00797863  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0091  RNA methyltransferase  52.97 
 
 
247 aa  262  6e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.678867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0088  tRNA/rRNA methyltransferase SpoU  52.97 
 
 
247 aa  262  6e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000158072  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0087  TrmH family tRNA methyltransferase  52.97 
 
 
247 aa  262  6e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.528227  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5214  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  52.54 
 
 
247 aa  261  6e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000196945  unclonable  9.19298e-26 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0091  RNA methyltransferase  52.97 
 
 
247 aa  262  6e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000227809  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0102  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  52.97 
 
 
247 aa  262  6e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.238e-61 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0122  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  52.97 
 
 
247 aa  262  6e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000258465  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0112  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  52.54 
 
 
247 aa  260  2e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0011476  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0086  RNA methyltransferase  51.27 
 
 
247 aa  258  8e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0239075  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0086  RNA methyltransferase  51.69 
 
 
247 aa  255  5e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000284808  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0305  RNA methyltransferase  47.3 
 
 
249 aa  254  1.0000000000000001e-66  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127836  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0848  RNA methyltransferase  51.04 
 
 
247 aa  249  3e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000264025  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0401  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  48.13 
 
 
246 aa  248  7e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000436094  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0092  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  50.83 
 
 
245 aa  248  8e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000607271  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1822  rRNA methylase  48.55 
 
 
249 aa  245  6e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3322  RNA methyltransferase  52.12 
 
 
248 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.752431  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0196  RNA methyltransferase  44.58 
 
 
243 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000588208  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0088  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  47.5 
 
 
246 aa  241  9e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00990  RNA methyltransferase  44.96 
 
 
244 aa  233  2.0000000000000002e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000314375  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0267  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  45 
 
 
246 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000223613  normal  0.011395 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4146  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  40 
 
 
310 aa  227  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2043  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  46.44 
 
 
253 aa  225  6e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000129806  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1336  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  41.15 
 
 
249 aa  223  2e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000822091 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1425  rRNA methylase  45.3 
 
 
233 aa  223  3e-57  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000022514  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2730  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  41.25 
 
 
255 aa  221  9.999999999999999e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.751116  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0172  RNA methyltransferase  47.37 
 
 
249 aa  220  3e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0806813  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2889  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  40.74 
 
 
248 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2796  RNA methyltransferase  43.21 
 
 
242 aa  219  5e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.125421  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2285  TrmA family RNA methyltransferase  38.3 
 
 
323 aa  218  1e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.240402  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0568  RNA methyltransferase  46.75 
 
 
248 aa  216  2e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.927994  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0554  RNA methyltransferase  46.75 
 
 
248 aa  216  2e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.850775  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2629  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  38.65 
 
 
387 aa  215  9e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.821515 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2313  RNA methyltransferase  39.22 
 
 
288 aa  214  9.999999999999999e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0718596 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0264  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  41.49 
 
 
292 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4413  RNA methyltransferase TrmH, group 3  41.08 
 
 
327 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0265  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  41.49 
 
 
292 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3773  RNA methyltransferase  39.92 
 
 
246 aa  209  3e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0174  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  40.91 
 
 
247 aa  209  4e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000034032  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1003  RNA methyltransferase TrmH, group 3  44.21 
 
 
261 aa  209  4e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60779  normal  0.0289199 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0340  rRNA methylase  41.15 
 
 
251 aa  208  7e-53  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000065422  hitchhiker  0.000000457527 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1356  RNA methyltransferase TrmH, group 3  40.16 
 
 
250 aa  207  2e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000394989  hitchhiker  8.416419999999999e-20 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0209  RNA methyltransferase  41.9 
 
 
251 aa  206  4e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2119  RNA methyltransferase TrmH, group 3  41.57 
 
 
519 aa  206  4e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.383182 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1677  RNA methyltransferase  39 
 
 
251 aa  204  1e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.756814  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2352  putative tRNA/rRNA methyltransferase YacO  40.5 
 
 
248 aa  203  2e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.177652  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1462  RNA methyltransferase  38.52 
 
 
245 aa  201  9e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0405731  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2481  RNA methyltransferase TrmH, group 3  42.26 
 
 
246 aa  199  3e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000314444  hitchhiker  0.00338936 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0122  tRNA/rRNA methyltransferase  41.91 
 
 
247 aa  196  3e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1867  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  38.78 
 
 
246 aa  195  7e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2067  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  34.62 
 
 
326 aa  193  2e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2065  rRNA methylase  41.49 
 
 
242 aa  194  2e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2022  RNA methyltransferase TrmH, group 3  38.08 
 
 
246 aa  192  5e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19440  rRNA methylase, putative, group 3  39.51 
 
 
256 aa  192  7e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000129696 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2230  RNA methyltransferase  37.34 
 
 
245 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.329348  normal  0.0204347 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1583  RNA methyltransferase TrmH, group 3  38.27 
 
 
256 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.780301  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2172  RNA methyltransferase TrmH, group 3  36.93 
 
 
237 aa  191  1e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0146478  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12700  rRNA methylase, putative, group 3  38.91 
 
 
320 aa  190  2e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2280  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  37.76 
 
 
256 aa  189  4e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2952  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  35.46 
 
 
327 aa  189  5e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.844398  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2368  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  37.34 
 
 
256 aa  189  7e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.900248  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0912  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  37.04 
 
 
321 aa  186  4e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0472746 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1616  RNA methyltransferase TrmH, group 3  37.45 
 
 
248 aa  185  8e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.439996 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1474  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  39.83 
 
 
239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0162513  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03770  rRNA methylase, putative, group 3  34.77 
 
 
323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.1456 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0416  RNA methyltransferase  37.66 
 
 
246 aa  184  2.0000000000000003e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.896719  normal  0.93402 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1346  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  32.27 
 
 
331 aa  182  5.0000000000000004e-45  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00762958 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0190  RNA methyltransferase  36.36 
 
 
251 aa  181  9.000000000000001e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.153268  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1644  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  41.32 
 
 
234 aa  181  9.000000000000001e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000329546  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4313  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  35.59 
 
 
320 aa  181  1e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3458  RNA methyltransferase  37.04 
 
 
252 aa  181  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0971  rRNA methylase-like protein  35.71 
 
 
322 aa  181  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4020  RNA methyltransferase  32.38 
 
 
314 aa  181  1e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.980605  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10311  RNA methyltransferase TrmH, group 3  36.43 
 
 
349 aa  181  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.988579  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0507  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  34.9 
 
 
322 aa  180  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.533536  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1055  tyrosyl-tRNA synthetase, class Ib  36.89 
 
 
248 aa  181  2e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.932424 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0572  RNA methyltransferase  37.2 
 
 
252 aa  180  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09311  RNA methyltransferase TrmH, group 3  33.11 
 
 
442 aa  179  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0566162 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2692  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  38.78 
 
 
252 aa  179  4e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.107399  normal  0.310165 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0672  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  34.46 
 
 
333 aa  179  4e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.927716  hitchhiker  0.000812989 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03790  rRNA methylase, putative, group 3  36.25 
 
 
300 aa  179  4e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000601463  normal  0.201311 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4216  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  38.21 
 
 
245 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000341805 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0003  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  41.25 
 
 
250 aa  179  4.999999999999999e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1909  RNA methyltransferase  37.78 
 
 
256 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000520024  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35140  rRNA methylase, putative, group 3  35.15 
 
 
312 aa  179  5.999999999999999e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.939533 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4616  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  38.31 
 
 
251 aa  179  7e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4246  RNA methyltransferase TrmH, group 3  36.95 
 
 
363 aa  178  9e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4879  RNA methyltransferase  35.83 
 
 
248 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1447  RNA methyltransferase  34.44 
 
 
314 aa  177  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.812422 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4221  RNA methyltransferase  37.55 
 
 
373 aa  177  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.601015 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0262  RNA methyltransferase TrmH, group 3  32.76 
 
 
416 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4935  RNA methyltransferase  36.29 
 
 
248 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000134443 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0606  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  35.8 
 
 
324 aa  177  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.158472  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5337  RNA methyltransferase  34.85 
 
 
314 aa  176  3e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3589  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  35.66 
 
 
246 aa  177  3e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0124331  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0213  RNA methyltransferase TrmH, group 3  35.52 
 
 
324 aa  176  4e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>