More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2730 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010320  Teth514_0865  elongation factor Tu  78.75 
 
 		 400 aa  638    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000288327  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2017  elongation factor Tu  77.33 
 
 		 396 aa  640    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2367  elongation factor Tu  77.33 
 
 		 396 aa  640    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.709055  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0213  elongation factor Tu  78.5 
 
 		 400 aa  640    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00624803  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2713  translation elongation factor Tu  80.6 
 
 		 395 aa  656    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000152961  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0851  elongation factor Tu  79.25 
 
 		 400 aa  641    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000784672  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01010  elongation factor Tu  79.9 
 
 		 397 aa  640    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000907786  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0199  elongation factor Tu  78.5 
 
 		 400 aa  640    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000189275  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01150  elongation factor Tu  79.9 
 
 		 397 aa  640    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.58645e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0810  elongation factor Tu  76.5 
 
 		 400 aa  634    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000557985  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0420  elongation factor Tu  78.5 
 
 		 400 aa  647    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000158382  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2716  elongation factor Tu  100 
 
 		 397 aa  806    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2730  elongation factor Tu  100 
 
 		 397 aa  806    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000782822  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2402  elongation factor Tu  100 
 
 		 397 aa  806    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.405583  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2416  elongation factor Tu  100 
 
 		 397 aa  806    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000990458  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1932  elongation factor Tu  77.33 
 
 		 396 aa  640    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2279  elongation factor Tu  77.33 
 
 		 396 aa  640    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0318  elongation factor Tu  76.75 
 
 		 400 aa  633  1e-180  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000823048  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2229  elongation factor Tu  76.32 
 
 		 396 aa  629  1e-179  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0152937 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1910  elongation factor Tu  76.32 
 
 		 396 aa  629  1e-179  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.256474 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0284  elongation factor Tu  77.39 
 
 		 400 aa  627  1e-178  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00091062  hitchhiker  0.00368673 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0270  elongation factor Tu  77.25 
 
 		 400 aa  627  1e-178  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000107043  normal  0.0107333 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2462  elongation factor Tu  77.25 
 
 		 400 aa  626  1e-178  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0594726 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3450  elongation factor Tu  75.82 
 
 		 396 aa  624  1e-177  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.939477 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2335  elongation factor Tu  75.75 
 
 		 400 aa  621  1e-177  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00040826  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1906  elongation factor Tu  74.81 
 
 		 396 aa  618  1e-176  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00000000303162  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3021  elongation factor Tu  74.31 
 
 		 396 aa  619  1e-176  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.000000542381  hitchhiker  0.00818484 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3041  elongation factor Tu  74.31 
 
 		 396 aa  619  1e-176  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0080343  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3476  elongation factor Tu  74.81 
 
 		 396 aa  618  1e-176  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000712008  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0325  elongation factor Tu  74.56 
 
 		 396 aa  617  1e-176  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0223104  normal  0.0648127 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3659  elongation factor Tu  75.06 
 
 		 396 aa  619  1e-176  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000150336  hitchhiker  0.00000130036 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2634  elongation factor Tu  74.81 
 
 		 396 aa  618  1e-176  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000354854  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2649  elongation factor Tu  74.81 
 
 		 396 aa  618  1e-176  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.0000546153  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3824  elongation factor Tu  74.81 
 
 		 396 aa  618  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3748  elongation factor Tu  74.81 
 
 		 396 aa  618  1e-176  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000373215  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3186  elongation factor Tu  74.81 
 
 		 396 aa  618  1e-176  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000468547  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0312  elongation factor Tu  74.56 
 
 		 396 aa  617  1e-176  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000814669  normal  0.179373 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1362  elongation factor Tu  75.31 
 
 		 396 aa  620  1e-176  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.641297 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3778  elongation factor Tu  74.81 
 
 		 396 aa  618  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000176887  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3794  elongation factor Tu  74.81 
 
 		 396 aa  618  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000750152  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3171  elongation factor Tu  74.81 
 
 		 396 aa  618  1e-176  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000406645  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2964  elongation factor Tu  75.7 
 
 		 396 aa  618  1e-176  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.155343  normal  0.97702 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3432  elongation factor Tu  74.56 
 
 		 396 aa  617  1e-176  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000234353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3445  elongation factor Tu  74.56 
 
 		 396 aa  617  1e-176  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000180875  normal  0.0858427 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3461  elongation factor Tu  74.81 
 
 		 396 aa  618  1e-176  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000474832  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3806  elongation factor Tu  74.81 
 
 		 396 aa  618  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.222005  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3070  elongation factor Tu  74.81 
 
 		 396 aa  618  1e-176  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000360276  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3084  elongation factor Tu  74.81 
 
 		 396 aa  618  1e-176  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000577807  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1584  elongation factor Tu  77.33 
 
 		 396 aa  619  1e-176  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1947  elongation factor Tu  77.33 
 
 		 396 aa  619  1e-176  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2266  elongation factor Tu  75.06 
 
 		 396 aa  617  1e-176  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2293  elongation factor Tu  75.06 
 
 		 396 aa  617  1e-176  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.404032 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0299  elongation factor Tu  74.81 
 
 		 396 aa  618  1e-176  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000130927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0312  elongation factor Tu  74.81 
 
 		 396 aa  618  1e-176  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000663244  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3186  elongation factor Tu  75.06 
 
 		 396 aa  618  1e-176  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3204  elongation factor Tu  75.06 
 
 		 396 aa  619  1e-176  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1543  elongation factor Tu  75.06 
 
 		 396 aa  617  1e-176  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2761  elongation factor Tu  74.56 
 
 		 396 aa  617  1e-176  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.14554  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2774  elongation factor Tu  74.56 
 
 		 396 aa  617  1e-176  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000183999  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0346  elongation factor Tu  74.56 
 
 		 396 aa  617  1e-176  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0260269  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0333  elongation factor Tu  74.56 
 
 		 396 aa  617  1e-176  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000426715  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3762  elongation factor Tu  74.81 
 
 		 396 aa  618  1e-176  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.000000000163409  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1922  elongation factor Tu  74.81 
 
 		 396 aa  618  1e-176  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000951262  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2350  elongation factor Tu  75.75 
 
 		 400 aa  620  1e-176  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00292725  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3703  elongation factor Tu  75.31 
 
 		 396 aa  619  1e-176  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.871346  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3646  elongation factor Tu  75.06 
 
 		 396 aa  619  1e-176  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.000000015318  hitchhiker  0.0000000000310582 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0252  elongation factor Tu  74.56 
 
 		 396 aa  617  1e-176  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000268752  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0265  elongation factor Tu  74.56 
 
 		 396 aa  617  1e-176  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0194583  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3669  elongation factor Tu  75.31 
 
 		 396 aa  619  1e-176  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0247  elongation factor Tu  74.81 
 
 		 396 aa  616  1e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000151927  normal  0.238121 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2974  elongation factor Tu  74.31 
 
 		 396 aa  614  1e-175  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.741149 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0207  elongation factor Tu  75.63 
 
 		 399 aa  615  1e-175  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000266697  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0238  elongation factor Tu  76.07 
 
 		 397 aa  616  1e-175  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000602877  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1948  elongation factor Tu  75.95 
 
 		 395 aa  614  1e-175  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0261  elongation factor Tu  74.56 
 
 		 396 aa  617  1e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000273962  normal  0.384792 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0274  elongation factor Tu  74.56 
 
 		 396 aa  617  1e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00680281  normal  0.135864 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0234  elongation factor Tu  74.81 
 
 		 396 aa  616  1e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000045907  normal  0.0164851 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2952  elongation factor Tu  73.13 
 
 		 402 aa  615  1e-175  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00124181  hitchhiker  0.00000107296 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2788  translation elongation factor Tu  73.87 
 
 		 397 aa  617  1e-175  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.117991  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2842  elongation factor Tu  74.81 
 
 		 396 aa  616  1e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0284377  normal  0.173199 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3321  elongation factor Tu  74.56 
 
 		 396 aa  615  1e-175  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2855  elongation factor Tu  74.81 
 
 		 396 aa  616  1e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0256724  normal  0.29734 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0223  elongation factor Tu  75.63 
 
 		 400 aa  614  1e-175  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.834398  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06090  elongation factor Tu  73.87 
 
 		 397 aa  611  9.999999999999999e-175  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.878067  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0742  elongation factor Tu  73.8 
 
 		 396 aa  613  9.999999999999999e-175  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000028539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3182  elongation factor Tu  74.06 
 
 		 396 aa  611  9.999999999999999e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00127613  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3196  elongation factor Tu  74.06 
 
 		 396 aa  611  9.999999999999999e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0526973  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0754  elongation factor Tu  73.8 
 
 		 396 aa  613  9.999999999999999e-175  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000150197  normal  0.0210812 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0035  elongation factor Tu  73.48 
 
 		 396 aa  612  9.999999999999999e-175  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000775684  hitchhiker  0.000000000148389 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06230  elongation factor Tu  73.87 
 
 		 397 aa  611  9.999999999999999e-175  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.141067  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3324  elongation factor Tu  74.06 
 
 		 396 aa  612  9.999999999999999e-175  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3341  elongation factor Tu  74.06 
 
 		 396 aa  612  9.999999999999999e-175  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3299  elongation factor Tu  73.13 
 
 		 402 aa  613  9.999999999999999e-175  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00521718  hitchhiker  0.000291329 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2374  elongation factor Tu  73.3 
 
 		 396 aa  608  1e-173  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0129  elongation factor Tu  79.09 
 
 		 395 aa  609  1e-173  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000035963  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0108  elongation factor Tu  79.09 
 
 		 395 aa  609  1e-173  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000780653  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0104  elongation factor Tu  79.09 
 
 		 395 aa  609  1e-173  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.21711e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2326  elongation factor Tu  73.8 
 
 		 396 aa  610  1e-173  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000151481  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2338  elongation factor Tu  73.8 
 
 		 396 aa  610  1e-173  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0567224  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0139  elongation factor Tu  78.84 
 
 		 395 aa  608  1e-173  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000328194  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>