More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2694 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2694  preprotein translocase subunit SecY  100 
 
 		 425 aa  853    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2379  preprotein translocase subunit SecY  99.53 
 
 		 425 aa  851    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2440  preprotein translocase subunit SecY  48.24 
 
 		 420 aa  421  1e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1726  preprotein translocase, SecY subunit  45.43 
 
 		 435 aa  392  1e-108  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000716119  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0886  preprotein translocase subunit SecY  46.62 
 
 		 418 aa  384  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.609907  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0245  preprotein translocase subunit SecY  47.06 
 
 		 424 aa  384  1e-105  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.101058  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0778  preprotein translocase, SecY subunit  49.08 
 
 		 430 aa  379  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000100686  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0442  preprotein translocase subunit SecY  46.51 
 
 		 429 aa  381  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1000  preprotein translocase, SecY subunit  43.79 
 
 		 419 aa  369  1e-101  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00382146  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0306  preprotein translocase subunit SecY  45.18 
 
 		 421 aa  369  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0894763  normal  0.194972 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2313  preprotein translocase subunit SecY  45.77 
 
 		 421 aa  371  1e-101  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0367996  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0214  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  46.62 
 
 		 419 aa  366  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.32801  normal  0.494063 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2923  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  47.33 
 
 		 427 aa  361  1e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000208113  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1504  preprotein translocase subunit SecY  43.76 
 
 		 419 aa  358  9.999999999999999e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01360  preprotein translocase, SecY subunit  44.39 
 
 		 422 aa  353  2.9999999999999997e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000700723  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0235  preprotein translocase subunit SecY  44.24 
 
 		 419 aa  351  1e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00849669  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1575  preprotein translocase subunit SecY  41.84 
 
 		 435 aa  350  2e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0569624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0728  preprotein translocase, SecY subunit  41.51 
 
 		 429 aa  345  1e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00054251  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1164  preprotein translocase, SecY subunit  42.35 
 
 		 431 aa  344  2e-93  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0798437  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0973  preprotein translocase subunit SecY  43.48 
 
 		 428 aa  342  5e-93  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1856  preprotein translocase, SecY subunit  43.67 
 
 		 446 aa  338  9e-92  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0112849  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2158  preprotein translocase, SecY subunit  41.44 
 
 		 426 aa  335  7.999999999999999e-91  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00470545  normal  0.460281 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3647  preprotein translocase, SecY subunit  43.67 
 
 		 442 aa  335  1e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00118801  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0867  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  40.55 
 
 		 442 aa  334  1e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000152006  hitchhiker  0.00837403 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1931  preprotein translocase subunit SecY  39.95 
 
 		 445 aa  334  2e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.776856  normal  0.537809 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29540  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  42.82 
 
 		 429 aa  332  5e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.498773  normal  0.844433 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5175  preprotein translocase subunit SecY  42.37 
 
 		 433 aa  332  6e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000485174  unclonable  4.1263e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0125  preprotein translocase subunit SecY  42.37 
 
 		 433 aa  332  8e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00395698  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0151  preprotein translocase subunit SecY  42.37 
 
 		 433 aa  332  8e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0158065  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0862  preprotein translocase, SecY subunit  40.97 
 
 		 438 aa  332  8e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.148817  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0130  preprotein translocase subunit SecY  42.14 
 
 		 433 aa  331  2e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0066731  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0130  preprotein translocase subunit SecY  42.14 
 
 		 433 aa  331  2e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00164171  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0126  preprotein translocase subunit SecY  42.14 
 
 		 433 aa  331  2e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0265701  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0124  preprotein translocase subunit SecY  42.14 
 
 		 433 aa  331  2e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.64549  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0161  preprotein translocase subunit SecY  42.14 
 
 		 433 aa  331  2e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000198533  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0130  preprotein translocase subunit SecY  42.14 
 
 		 433 aa  331  2e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00952483  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2135  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  40.65 
 
 		 428 aa  329  7e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.233384  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1953  preprotein translocase subunit SecY  39.26 
 
 		 447 aa  329  7e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2691  preprotein translocase, SecY subunit  39.49 
 
 		 430 aa  328  9e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.803147  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2038  preprotein translocase subunit SecY  39.26 
 
 		 447 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3123  preprotein translocase, SecY subunit  41.93 
 
 		 436 aa  327  2.0000000000000001e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1831  preprotein translocase subunit SecY  39.77 
 
 		 443 aa  326  6e-88  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.321149  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0735  preprotein translocase, SecY subunit  38.81 
 
 		 433 aa  325  7e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3985  preprotein translocase, SecY subunit  41.32 
 
 		 448 aa  325  1e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00342615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1926  preprotein translocase subunit SecY  39.26 
 
 		 447 aa  324  2e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.228643  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0131  preprotein translocase subunit SecY  42.99 
 
 		 430 aa  323  3e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.129381  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2837  preprotein translocase subunit SecY  38.39 
 
 		 435 aa  323  5e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0646  preprotein translocase subunit SecY  38.16 
 
 		 435 aa  323  5e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00379524  hitchhiker  0.000000811889 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3308  preprotein translocase subunit SecY  38.16 
 
 		 435 aa  322  6e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000602472 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1384  preprotein translocase subunit SecY  40.47 
 
 		 443 aa  322  9.000000000000001e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0953  preprotein translocase subunit SecY  38.16 
 
 		 435 aa  322  9.000000000000001e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0415377  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0099  preprotein translocase subunit SecY  40.83 
 
 		 437 aa  321  9.999999999999999e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0986849 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1366  preprotein translocase subunit SecY  39.64 
 
 		 437 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000833152  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0647  preprotein translocase, SecY subunit  41.82 
 
 		 432 aa  321  9.999999999999999e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5050  preprotein translocase subunit SecY  39.76 
 
 		 444 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.478224  normal  0.981585 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1565  preprotein translocase subunit SecY  40.09 
 
 		 443 aa  321  1.9999999999999998e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.112443  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1118  preprotein translocase subunit SecY  40.96 
 
 		 428 aa  321  1.9999999999999998e-86  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.348488  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2599  preprotein translocase subunit SecY  40.69 
 
 		 440 aa  321  1.9999999999999998e-86  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0785292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3885  preprotein translocase subunit SecY  40.45 
 
 		 437 aa  321  1.9999999999999998e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6029  preprotein translocase subunit SecY  39.55 
 
 		 430 aa  320  3e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0309  preprotein translocase subunit SecY  39.49 
 
 		 443 aa  320  3e-86  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0197098  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3686  preprotein translocase, SecY subunit  39.87 
 
 		 441 aa  319  5e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.000792509  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2545  preprotein translocase subunit SecY  39.91 
 
 		 434 aa  319  5e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000778926 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2459  preprotein translocase, SecY subunit  39.71 
 
 		 447 aa  319  6e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2766  preprotein translocase subunit SecY  40.45 
 
 		 434 aa  319  6e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00224272  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1745  preprotein translocase subunit SecY  39.91 
 
 		 437 aa  319  6e-86  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2181  preprotein translocase, SecY subunit  39.71 
 
 		 447 aa  319  6e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.318083 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2469  preprotein translocase subunit SecY  39.91 
 
 		 434 aa  318  1e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0545369  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2747  preprotein translocase subunit SecY  39.68 
 
 		 434 aa  318  1e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.787541  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4934  preprotein translocase, SecY subunit  40.23 
 
 		 439 aa  318  1e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000290796  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0602  preprotein translocase subunit SecY  40.09 
 
 		 430 aa  318  1e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.637505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0517  preprotein translocase, SecY subunit  38.05 
 
 		 443 aa  317  2e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.120445  unclonable  0.0000000000266535 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2503  preprotein translocase subunit SecY  39.68 
 
 		 434 aa  317  2e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000332806  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0347  preprotein translocase, SecY subunit  38.05 
 
 		 443 aa  317  2e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.742267  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2144  preprotein translocase, SecY subunit  39.71 
 
 		 447 aa  317  2e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04180  preprotein translocase subunit SecY  39.73 
 
 		 435 aa  318  2e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1246  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  39.91 
 
 		 463 aa  317  2e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.031052  hitchhiker  0.00314824 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0607  preprotein translocase, SecY subunit  39.82 
 
 		 429 aa  317  3e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0598508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2742  preprotein translocase subunit SecY  39.68 
 
 		 434 aa  316  4e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.53667e-23 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0441  preprotein translocase subunit SecY  40.95 
 
 		 443 aa  317  4e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2412  preprotein translocase subunit SecY  40 
 
 		 434 aa  316  5e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00625491  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1086  preprotein translocase subunit SecY  37.7 
 
 		 435 aa  316  6e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.135642  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2403  preprotein translocase subunit SecY  39.77 
 
 		 443 aa  315  7e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0193161  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2209  preprotein translocase subunit SecY  39.31 
 
 		 443 aa  315  8e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000211329  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1374  preprotein translocase subunit SecY  38.36 
 
 		 431 aa  315  8e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0289241  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1006  preprotein translocase subunit SecY  39.29 
 
 		 446 aa  315  9e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38875  hitchhiker  0.00669682 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2198  preprotein translocase, SecY subunit  38.76 
 
 		 448 aa  315  9e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0470035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0127  preprotein translocase subunit SecY  42.07 
 
 		 430 aa  315  9e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2315  preprotein translocase subunit SecY  39.86 
 
 		 443 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.775008  normal  0.296135 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3318  preprotein translocase subunit SecY  40.37 
 
 		 441 aa  315  9.999999999999999e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.150394  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0739  preprotein translocase subunit SecY  38.52 
 
 		 440 aa  315  9.999999999999999e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00521081  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1863  preprotein translocase subunit SecY  38.9 
 
 		 446 aa  314  1.9999999999999998e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.271597  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2276  preprotein translocase subunit SecY  39.77 
 
 		 441 aa  314  1.9999999999999998e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000725785  hitchhiker  0.00410487 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0700  preprotein translocase subunit SecY  38.85 
 
 		 435 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.418561  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2547  preprotein translocase subunit SecY  39.46 
 
 		 434 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0673869  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2734  preprotein translocase subunit SecY  39.46 
 
 		 434 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.356112  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4301  preprotein translocase, SecY subunit  39.41 
 
 		 432 aa  313  4.999999999999999e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0201  preprotein translocase subunit SecY  39.54 
 
 		 443 aa  312  6.999999999999999e-84  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.124191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3903  preprotein translocase subunit SecY  39.33 
 
 		 441 aa  312  6.999999999999999e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.340332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0124  preprotein translocase subunit SecY  42.37 
 
 		 433 aa  312  7.999999999999999e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000327784  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>