More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2693 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2693  adenylate kinase  100 
 
 
216 aa  447  1e-125  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2378  adenylate kinase  100 
 
 
216 aa  447  1e-125  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2439  adenylate kinase  59.07 
 
 
217 aa  286  1e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3646  adenylate kinase  61.5 
 
 
217 aa  276  1e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000547337  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1725  adenylate kinase  59.62 
 
 
215 aa  275  5e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000477664  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0132  adenylate kinase  57.94 
 
 
216 aa  268  4e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00113447  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0887  adenylate kinase  58.69 
 
 
217 aa  268  5.9999999999999995e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.037956  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1576  adenylate kinases  56.34 
 
 
213 aa  266  2e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00457177  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1237  adenylate kinase  56.6 
 
 
214 aa  260  8.999999999999999e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000920741  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0128  adenylate kinase  55.61 
 
 
217 aa  260  1e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01370  Adenylate kinase  54.67 
 
 
216 aa  260  1e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000615524  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0779  adenylate kinase  56.81 
 
 
214 aa  258  5.0000000000000005e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000192318  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0443  adenylate kinase  56.25 
 
 
217 aa  257  8e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0086  adenylate kinase  56.13 
 
 
215 aa  252  3e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00306231  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2297  adenylate kinase  54.72 
 
 
215 aa  251  5.000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2256  adenylate kinase  54.72 
 
 
215 aa  251  5.000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0268599  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1111  adenylate kinase  54.46 
 
 
214 aa  249  2e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000158184  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0215  Adenylate kinase  54.72 
 
 
214 aa  248  5e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0583  adenylate kinase  53.3 
 
 
217 aa  246  1e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0025  adenylate kinase  54.72 
 
 
215 aa  247  1e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000610793  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2924  adenylate kinase  53.7 
 
 
217 aa  246  2e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1338  adenylate kinase  55.77 
 
 
213 aa  246  2e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.389991  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1810  adenylate kinase  53.3 
 
 
215 aa  246  3e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0152  adenylate kinase  52.8 
 
 
216 aa  245  3e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00506864  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0125  adenylate kinase  52.8 
 
 
216 aa  246  3e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000166818  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1504  adenylate kinases  53.77 
 
 
215 aa  245  3e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0327  adenylate kinase  54.41 
 
 
217 aa  245  3e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000417947 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0131  adenylate kinase  52.34 
 
 
216 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000890423  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0126  adenylate kinase  52.8 
 
 
216 aa  243  9.999999999999999e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000253561  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0162  adenylate kinase  52.34 
 
 
216 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000036841  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1087  adenylate kinase  51.42 
 
 
217 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.171059  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5174  adenylate kinase  52.34 
 
 
216 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000620291  unclonable  1.1738e-25 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1718  adenylate kinase  54.81 
 
 
213 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0131  adenylate kinase  51.87 
 
 
216 aa  241  6e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000156427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0127  adenylate kinase  51.87 
 
 
216 aa  241  6e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000429626  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0125  adenylate kinase  51.87 
 
 
216 aa  241  6e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0141617  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0144  adenylate kinase  51.87 
 
 
216 aa  241  6e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.24496e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0131  adenylate kinase  51.87 
 
 
216 aa  241  6e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000118062  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1163  adenylate kinase  50.96 
 
 
211 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0529729  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2690  adenylate kinase  50.46 
 
 
216 aa  237  9e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0131862  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1001  Nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  50 
 
 
215 aa  236  2e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000583079  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3307  adenylate kinase  52.94 
 
 
214 aa  236  2e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000165316 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4294  adenylate kinase  50 
 
 
217 aa  234  8e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487166 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2312  adenylate kinase  50 
 
 
215 aa  234  9e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00140159  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3902  adenylate kinase  49.51 
 
 
217 aa  233  1.0000000000000001e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1553  adenylate kinase  53 
 
 
218 aa  233  1.0000000000000001e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.216762  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0954  adenylate kinase  51.92 
 
 
214 aa  233  1.0000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.338741  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0722  adenylate kinase  48.83 
 
 
216 aa  231  5e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.940289  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2277  adenylate kinase  53.5 
 
 
220 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00000360285  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0572  adenylate kinase  53.5 
 
 
220 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000148537  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1080  adenylate kinase  53.5 
 
 
220 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0446063  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0927  adenylate kinase  53.5 
 
 
220 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2154  adenylate kinase  53.5 
 
 
220 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.181354  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0924  adenylate kinase  53.5 
 
 
220 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.123931  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1049  adenylate kinase  53.5 
 
 
220 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000082609  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1462  adenylate kinase  51.64 
 
 
219 aa  231  9e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000718997  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1273  adenylate kinase  48.36 
 
 
217 aa  230  1e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2713  Adenylate kinase  47.22 
 
 
423 aa  230  1e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.690631  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0739  adenylate kinase  54 
 
 
220 aa  229  2e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.139033  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1207  adenylate kinase  49.53 
 
 
217 aa  229  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00730136 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2533  adenylate kinase  58.6 
 
 
222 aa  229  3e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.154116 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5145  adenylate kinase  50.49 
 
 
219 aa  229  3e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.498584 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0535  adenylate kinase  56.54 
 
 
221 aa  228  4e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.180208  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0748  adenylate kinase  53.5 
 
 
220 aa  227  8e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.552209  normal  0.468478 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5879  adenylate kinase  53.5 
 
 
220 aa  227  8e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.276122  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1936  adenylate kinase  53.5 
 
 
220 aa  227  9e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0745182  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2572  adenylate kinase  53.5 
 
 
220 aa  227  9e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.601307 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2548  adenylate kinase  53.5 
 
 
220 aa  227  9e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2810  adenylate kinase  57.53 
 
 
222 aa  226  1e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0112016  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2836  adenylate kinase  47.66 
 
 
217 aa  227  1e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2404  adenylate kinase  57.53 
 
 
222 aa  226  1e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.239772  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1430  adenylate kinase  50.92 
 
 
214 aa  227  1e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000051006  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0419  adenylate kinase  49.77 
 
 
225 aa  226  2e-58  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1367  adenylate kinase  48.11 
 
 
214 aa  226  3e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00134255  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1925  adenylate kinase  49.76 
 
 
224 aa  226  3e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2893  adenylate kinase  50 
 
 
214 aa  226  3e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1753  adenylate kinase  47.89 
 
 
213 aa  226  3e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000121762  normal  0.119807 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2596  adenylate kinase  53 
 
 
220 aa  225  4e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.69324  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1429  adenylate kinase  50 
 
 
218 aa  224  6e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1315  adenylate kinase  50.69 
 
 
214 aa  224  7e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0119239  normal  0.109595 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0647  adenylate kinase  48.6 
 
 
222 aa  224  8e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00892777  hitchhiker  0.00000105788 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2466  adenylate kinase  52.5 
 
 
220 aa  224  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041386 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0603  adenylate kinase  50.49 
 
 
217 aa  224  1e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0763  adenylate kinase  56.38 
 
 
221 aa  224  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.758811  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3205  adenylate kinase  56.45 
 
 
217 aa  223  2e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.129481  normal  0.282312 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3212  adenylate kinase  54.84 
 
 
217 aa  223  2e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2230  adenylate kinase  49.54 
 
 
214 aa  223  2e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000387262  hitchhiker  0.000214204 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0167  adenylate kinases  47.64 
 
 
228 aa  223  2e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0999685  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0701  adenylate kinase  48.11 
 
 
220 aa  222  3e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0297411  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1024  adenylate kinase  49.08 
 
 
214 aa  222  4e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0354  adenylate kinase  47.75 
 
 
222 aa  222  4e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2018  adenylate kinase  49.31 
 
 
214 aa  221  7e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0532  adenylate kinase  56.38 
 
 
221 aa  221  7e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00589344  hitchhiker  0.0000489496 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3567  adenylate kinase  54.01 
 
 
218 aa  221  8e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00563334  normal  0.0126858 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1976  adenylate kinase  48.36 
 
 
215 aa  220  9.999999999999999e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2297  adenylate kinase  48.85 
 
 
214 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000662759  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1798  adenylate kinase  50.23 
 
 
214 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000131299  hitchhiker  0.000000153174 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2661  adenylate kinase  48.85 
 
 
214 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00427284  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0590  adenylate kinase  54.79 
 
 
221 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.012564  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1313  adenylate kinase  50.46 
 
 
220 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000294373  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>