More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2684 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2684  50S ribosomal protein L17  100 
 
 		 113 aa  229  9e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2369  50S ribosomal protein L17  100 
 
 		 113 aa  229  9e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0521735  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0896  50S ribosomal protein L17  74.77 
 
 		 112 aa  178  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000178462  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2430  50S ribosomal protein L17  68.18 
 
 		 112 aa  156  8e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0451  50S ribosomal protein L17  65.77 
 
 		 112 aa  150  4e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000198381  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0244  50S ribosomal protein L17  64.86 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0315  ribosomal protein L17  66.67 
 
 		 112 aa  149  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.123635  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0138  50S ribosomal protein L17  59.66 
 
 		 120 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000943635  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5167  50S ribosomal protein L17  59.66 
 
 		 120 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000165629  hitchhiker  3.84135e-19 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0138  50S ribosomal protein L17  59.66 
 
 		 120 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0133  50S ribosomal protein L17  59.66 
 
 		 120 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000322802  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0131  50S ribosomal protein L17  59.66 
 
 		 120 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.124408  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0159  50S ribosomal protein L17  59.66 
 
 		 120 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000799248  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0138  50S ribosomal protein L17  59.66 
 
 		 120 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000121438  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0132  50S ribosomal protein L17  59.66 
 
 		 120 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000831433  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1546  ribosomal protein L17  62.83 
 
 		 113 aa  145  2.0000000000000003e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0169  50S ribosomal protein L17  59.66 
 
 		 120 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000157984  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0133  50S ribosomal protein L17  59.66 
 
 		 120 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000340653  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0151  50S ribosomal protein L17  59.66 
 
 		 120 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.34385e-50 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0224  LSU ribosomal protein L17P  62.16 
 
 		 113 aa  144  4.0000000000000006e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.65294 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0135  50S ribosomal protein L17  60.17 
 
 		 120 aa  144  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0254  ribosomal protein L17  63.96 
 
 		 112 aa  144  5e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000174355  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2303  ribosomal protein L17  62.16 
 
 		 113 aa  143  9e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0265603  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0139  50S ribosomal protein L17  59.32 
 
 		 120 aa  143  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000316871  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1495  ribosomal protein L17  60.18 
 
 		 113 aa  142  1e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.882002  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01460  ribosomal protein L17  63.3 
 
 		 114 aa  141  4e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000310561  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3300  ribosomal protein L17  62.39 
 
 		 168 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0299881 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1716  50S ribosomal protein L17  58.41 
 
 		 113 aa  138  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000574886  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0654  50S ribosomal protein L17  58.72 
 
 		 178 aa  136  7.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.686686  hitchhiker  0.0000313712 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0707  50S ribosomal protein L17  60.55 
 
 		 127 aa  135  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000951753  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0085  50S ribosomal protein L17  56.69 
 
 		 128 aa  135  2e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0996581  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1456  50S ribosomal protein L17  55.2 
 
 		 127 aa  135  2e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000714244  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0222  50S ribosomal protein L17  55.2 
 
 		 127 aa  135  2e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1374  50S ribosomal protein L17  58.72 
 
 		 124 aa  134  3.0000000000000003e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00863011  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1804  50S ribosomal protein L17  57.02 
 
 		 122 aa  134  5e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4285  50S ribosomal protein L17  59.46 
 
 		 190 aa  134  5e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106968  hitchhiker  0.00521298 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2291  50S ribosomal protein L17  57.02 
 
 		 122 aa  132  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2250  50S ribosomal protein L17  57.02 
 
 		 122 aa  132  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0379029  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1093  50S ribosomal protein L17  57.8 
 
 		 184 aa  131  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3966  ribosomal protein L17  56.76 
 
 		 116 aa  131  3e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2830  50S ribosomal protein L17  56.88 
 
 		 175 aa  130  6e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215711  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2682  ribosomal protein L17  54.17 
 
 		 121 aa  129  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0293066  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1880  50S ribosomal protein L17  53.54 
 
 		 128 aa  128  2.0000000000000002e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0729  50S ribosomal protein L17  56.88 
 
 		 155 aa  128  3e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3894  50S ribosomal protein L17  56.76 
 
 		 190 aa  127  4.0000000000000003e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0734  50S ribosomal protein L17  58.33 
 
 		 208 aa  127  5.0000000000000004e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4478  ribosomal protein L17  54.95 
 
 		 229 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0807204  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0961  ribosomal protein L17  62.89 
 
 		 144 aa  126  8.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.463077  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0621  50S ribosomal protein L17P  50.39 
 
 		 131 aa  126  8.000000000000001e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0503  50S ribosomal protein L17  57.8 
 
 		 117 aa  126  9.000000000000001e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000331122  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0480  50S ribosomal protein L17  55.96 
 
 		 117 aa  125  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000309842  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0317  50S ribosomal protein L17  53.17 
 
 		 127 aa  125  1.0000000000000001e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.09582e-21 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_445  ribosomal protein L17  56.88 
 
 		 117 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238299  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1583  ribosomal protein L17  54.13 
 
 		 151 aa  123  9e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.296544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1009  50S ribosomal protein L17  52.25 
 
 		 116 aa  123  9e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000240801  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23271  50S ribosomal protein L17  52.78 
 
 		 116 aa  122  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1653  50S ribosomal protein L17P  52.29 
 
 		 143 aa  123  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0594  50S ribosomal protein L17  54.95 
 
 		 190 aa  123  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.30992 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1218  50S ribosomal protein L17  53.15 
 
 		 170 aa  122  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0264415 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5153  ribosomal protein L17  53.7 
 
 		 179 aa  122  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.186095 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1317  50S ribosomal protein L17  51.85 
 
 		 116 aa  120  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.362692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8720  predicted protein  50.45 
 
 		 116 aa  120  6e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.702196  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2617  50S ribosomal protein L17  54.05 
 
 		 172 aa  120  9e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3874  50S ribosomal protein L17P  53.15 
 
 		 202 aa  120  9e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1979  50S ribosomal protein L17  51.85 
 
 		 116 aa  119  9.999999999999999e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.205513  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0352  50S ribosomal protein L17  50.93 
 
 		 116 aa  119  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.84994 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2625  ribosomal protein L17  54.05 
 
 		 168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0716  50S ribosomal protein L17  50.46 
 
 		 116 aa  118  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000127542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2987  50S ribosomal protein L17  50.93 
 
 		 116 aa  118  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.128677 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1367  ribosomal protein L17  54.13 
 
 		 117 aa  117  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1208  50S ribosomal protein L17  49.55 
 
 		 142 aa  117  4.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178196  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0618  50S ribosomal protein L17  51.35 
 
 		 138 aa  117  4.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1171  50S ribosomal protein L17  49.55 
 
 		 142 aa  117  4.9999999999999996e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.198804  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0655  ribosomal protein L17  54.95 
 
 		 178 aa  117  6e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.929452  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1921  50S ribosomal protein L17  52.29 
 
 		 146 aa  116  9e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.195833  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3728  50S ribosomal protein L17  55.56 
 
 		 116 aa  116  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2933  50S ribosomal protein L17  39.66 
 
 		 174 aa  116  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1455  50S ribosomal protein L17  50.46 
 
 		 140 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.026202  normal  0.30678 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1869  50S ribosomal protein L17  48.62 
 
 		 141 aa  115  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16541  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 116 aa  115  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.173204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2201  50S ribosomal protein L17  50.46 
 
 		 151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0373281  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1357  50S ribosomal protein L17  50.46 
 
 		 140 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139721  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0204  50S ribosomal protein L17  49.55 
 
 		 118 aa  115  1.9999999999999998e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3668  ribosomal protein L17  51.85 
 
 		 203 aa  115  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2127  50S ribosomal protein L17P  49.54 
 
 		 121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0812324  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0310  50S ribosomal protein L17  50.45 
 
 		 138 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.43624 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0342  ribosomal protein L17  50 
 
 		 125 aa  115  1.9999999999999998e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3112  50S ribosomal protein L17  54.05 
 
 		 197 aa  114  3e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.785173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0280  50S ribosomal protein L17  50.45 
 
 		 141 aa  115  3e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.39249 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4289  ribosomal protein L17  50.45 
 
 		 169 aa  114  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0096  50S ribosomal protein L17  50.45 
 
 		 117 aa  114  3.9999999999999997e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000142816  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0427  ribosomal protein L17  48.15 
 
 		 118 aa  114  3.9999999999999997e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.75518  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0386  50S ribosomal protein L17  51.35 
 
 		 139 aa  114  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.592753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1740  50S ribosomal protein L17  51.35 
 
 		 139 aa  114  5e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.219561  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1011  50S ribosomal protein L17  50.46 
 
 		 141 aa  114  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.264601 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1981  50S ribosomal protein L17  48.65 
 
 		 142 aa  114  5e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0335  50S ribosomal protein L17P  51.35 
 
 		 222 aa  114  5e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.194907  decreased coverage  0.000408041 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1738  50S ribosomal protein L17  52.29 
 
 		 133 aa  114  5e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.108984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2208  50S ribosomal protein L17  50.47 
 
 		 116 aa  114  6e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1119  50S ribosomal protein L17  52.25 
 
 		 176 aa  114  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.808416  normal  0.809899 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>