More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2683 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2683  cobalt transporter ATP-binding subunit  100 
 
 
281 aa  574  1.0000000000000001e-163  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.904555  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0897  cobalt transporter ATP-binding subunit  61.73 
 
 
277 aa  379  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000015399  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3637  ABC transporter related  62.28 
 
 
303 aa  375  1e-103  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000771297  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0789  ABC transporter related  58.01 
 
 
281 aa  341  1e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0847492  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2934  ABC transporter related protein  55.16 
 
 
299 aa  328  5.0000000000000004e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.786781  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02420  ABC transporter related  57.95 
 
 
273 aa  315  4e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01470  ABC transporter related  57.95 
 
 
273 aa  315  4e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000364129  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1419  ABC transporter related  53.33 
 
 
273 aa  315  7e-85  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0225  ABC transporter related  52.35 
 
 
282 aa  305  7e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.758643 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0316  ABC transporter related  49.1 
 
 
277 aa  299  3e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0293906  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1688  ABC transporter related  51.26 
 
 
278 aa  293  2e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1010  ABC transporter related  51.67 
 
 
272 aa  281  6.000000000000001e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000205509  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24060  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  50 
 
 
278 aa  274  1.0000000000000001e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.569983  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0140  cobalt transporter ATP-binding subunit  48.23 
 
 
280 aa  270  1e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000287993  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2429  ABC transporter related  49.41 
 
 
276 aa  263  3e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928129  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12560  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  46.74 
 
 
283 aa  263  3e-69  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2151  cobalt transporter ATP-binding subunit  46.57 
 
 
279 aa  260  2e-68  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0331117  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2302  putative ABC transporter  45.65 
 
 
273 aa  259  2e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0179898  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0288  cobalt transporter ATP-binding subunit  46.72 
 
 
277 aa  258  9e-68  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00337056  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0898  cobalt transporter ATP-binding subunit  48.89 
 
 
286 aa  256  4e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0245  ABC transporter related  46.04 
 
 
277 aa  255  5e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.878335  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0136  cobalt transporter ATP-binding subunit  45 
 
 
279 aa  255  5e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0999  ABC transporter related  46.64 
 
 
273 aa  255  7e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0187687  normal  0.71455 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2682  cobalt transporter ATP-binding subunit  45.16 
 
 
285 aa  252  5.000000000000001e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.150341  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0134  cobalt transporter ATP-binding subunit  42.86 
 
 
280 aa  251  6e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00576105  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0139  cobalt transporter ATP-binding subunit  42.86 
 
 
280 aa  251  1e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.685034  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0170  cobalt transporter ATP-binding subunit  42.86 
 
 
280 aa  251  1e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000574409  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0133  cobalt transporter ATP-binding subunit  43.93 
 
 
280 aa  250  2e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000421792  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1949  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  46.46 
 
 
276 aa  250  2e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.238648  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0132  cobalt transporter ATP-binding subunit  42.91 
 
 
300 aa  248  6e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0152  cobalt transporter ATP-binding subunit  42.5 
 
 
280 aa  248  7e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.00748e-47 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0139  cobalt transporter ATP-binding subunit  42.5 
 
 
280 aa  248  7e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000064479  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0139  cobalt transporter ATP-binding subunit  42.91 
 
 
300 aa  248  9e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0134  cobalt transporter ATP-binding subunit  42.91 
 
 
300 aa  248  9e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000103896  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1153  ABC transporter related protein  50 
 
 
277 aa  247  1e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00125653  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0160  cobalt transporter ATP-binding subunit  42.86 
 
 
280 aa  247  2e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00729869  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5166  cobalt transporter ATP-binding subunit  43.54 
 
 
280 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000109304  hitchhiker  6.33423e-17 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1985  cobalt transporter ATP-binding subunit  44.36 
 
 
276 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0226  ABC transporter related  41.07 
 
 
290 aa  241  1e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00993646  normal  0.660997 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0318  cobalt transporter ATP-binding subunit  43.46 
 
 
285 aa  239  2.9999999999999997e-62  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  2.84205e-21 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01480  ABC transporter related  43.75 
 
 
283 aa  236  3e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000123426  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02430  ABC transporter related  43.75 
 
 
283 aa  236  3e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.296301  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2472  ABC transporter related  43.88 
 
 
284 aa  233  3e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.324345  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0225  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  43.97 
 
 
272 aa  231  9e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0585  cobalt transporter ATP-binding subunit  45.04 
 
 
274 aa  231  1e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1700  ABC transporter related  45.85 
 
 
272 aa  229  4e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1190  cobalt transporter ATP-binding subunit  44.33 
 
 
281 aa  226  3e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0093  cobalt transporter ATP-binding subunit  47.08 
 
 
278 aa  224  2e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1478  cobalt transporter ATP-binding subunit  42.53 
 
 
277 aa  221  8e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1794  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  42.54 
 
 
284 aa  221  8e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000176304  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0793  cobalt transporter ATP-binding subunit  45.53 
 
 
278 aa  220  3e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1455  ABC transporter related  41.24 
 
 
275 aa  219  3.9999999999999997e-56  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000125166  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3636  ABC transporter related  42.69 
 
 
286 aa  218  6e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000375654  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0728  cobalt transporter ATP-binding subunit  43.26 
 
 
281 aa  218  8.999999999999998e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.216376  normal  0.366989 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1962  ABC transporter, ATPase subunit  41.64 
 
 
269 aa  217  2e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0998  ABC transporter related  41.02 
 
 
325 aa  216  4e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.241901  normal  0.595675 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1984  cobalt transporter ATP-binding subunit  43.18 
 
 
280 aa  214  9.999999999999999e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.210104  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf376  cobalt transporter ATP-binding subunit  41.16 
 
 
267 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0109258  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1086  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  39.27 
 
 
277 aa  214  1.9999999999999998e-54  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1454  ABC transporter related  40 
 
 
288 aa  213  2.9999999999999995e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000218483  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl152  cobalt transporter ATP-binding subunit  42.34 
 
 
406 aa  211  1e-53  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0246  ABC transporter related  45.68 
 
 
283 aa  209  5e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.708185  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2249  cobalt transporter ATP-binding subunit  44.63 
 
 
269 aa  207  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.284628  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2290  cobalt transporter ATP-binding subunit  44.63 
 
 
269 aa  207  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1391  cobalt transporter ATP-binding subunit  39.16 
 
 
310 aa  207  2e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0500494  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1803  cobalt transporter ATP-binding subunit  45.27 
 
 
269 aa  206  4e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1404  cobalt transporter ATP-binding subunit  40.61 
 
 
277 aa  206  4e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0631  cobalt transporter ATP-binding subunit  40.43 
 
 
294 aa  206  4e-52  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.103866  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1045  cobalt transporter ATP-binding subunit  38.17 
 
 
277 aa  205  6e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.891717 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0143  cobalt transporter ATP-binding subunit  45.04 
 
 
281 aa  205  8e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.13815  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0830  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  42.34 
 
 
280 aa  204  2e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0668  cobalt transporter ATP-binding subunit  43.31 
 
 
408 aa  202  3e-51  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0791  ABC transporter related  38.32 
 
 
280 aa  201  9e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0233186  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1769  ABC transporter, ATP-binding protein  41.47 
 
 
630 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0143868  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0317  ABC transporter related  39.85 
 
 
283 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000872921  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0135  cobalt transporter ATP-binding subunit  39.02 
 
 
293 aa  199  5e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0137  cobalt transporter ATP-binding subunit  39.01 
 
 
290 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0161  cobalt transporter ATP-binding subunit  39.02 
 
 
293 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00175996  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0141  cobalt transporter ATP-binding subunit  38.79 
 
 
291 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000352159  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1074  hypothetical protein  41.44 
 
 
380 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0289  cobalt transporter ATP-binding subunit  40.85 
 
 
288 aa  197  2.0000000000000003e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0412656  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1687  ABC transporter related  39.42 
 
 
288 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0171  cobalt transporter ATP-binding subunit  38.26 
 
 
293 aa  196  3e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000671668  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2150  cobalt transporter ATP-binding subunit  40 
 
 
280 aa  196  4.0000000000000005e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0185  cobalt transporter ATP-binding subunit  40.46 
 
 
285 aa  196  4.0000000000000005e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3208  cobalt transport protein ATP-binding subunit  39.85 
 
 
398 aa  195  5.000000000000001e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0188  cobalt transporter ATP-binding subunit  40.46 
 
 
285 aa  196  5.000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.790607  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0140  cobalt transporter ATP-binding subunit  38.26 
 
 
293 aa  195  6e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0875323  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1880  ABC transporter related  39.49 
 
 
574 aa  195  7e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5165  cobalt transporter ATP-binding subunit  38.26 
 
 
293 aa  195  7e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000192836  hitchhiker  0.000000000000102962 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1296  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.78 
 
 
403 aa  194  1e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.800126  normal  0.0150506 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0140  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.88 
 
 
293 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0135  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.88 
 
 
293 aa  194  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.168047  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0140  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.88 
 
 
293 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000645208  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2936  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.68 
 
 
281 aa  192  5e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12570  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  36.4 
 
 
344 aa  192  7e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0528  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.77 
 
 
402 aa  191  9e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0829  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  41.56 
 
 
292 aa  191  1e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.773526  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1418  ABC transporter related  37.41 
 
 
287 aa  190  2e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0225  ABC transporter related  39.06 
 
 
571 aa  191  2e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>