More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2654 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 369 aa  756    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  98.37 
 
 		 369 aa  743    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1044  ABC transporter related  68.02 
 
 		 374 aa  525  1e-148  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2909  ABC transporter related  67.65 
 
 		 372 aa  523  1e-147  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3611  ABC transporter related  66.85 
 
 		 370 aa  511  1e-144  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1862  ABC transporter related protein  67.67 
 
 		 370 aa  507  9.999999999999999e-143  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  65.85 
 
 		 370 aa  503  1e-141  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2139  ABC transporter related  66.39 
 
 		 384 aa  499  1e-140  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724946  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  64.4 
 
 		 370 aa  491  1e-137  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4067  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  63.04 
 
 		 366 aa  485  1e-136  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.041099  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1424  ABC transporter related protein  64.4 
 
 		 370 aa  486  1e-136  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4141  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  62.77 
 
 		 366 aa  483  1e-135  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000074393  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3925  sugar ABC transporter ATP-binding protein  62.77 
 
 		 366 aa  482  1e-135  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0573898  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3757  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  62.77 
 
 		 366 aa  482  1e-135  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.305831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3773  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  62.77 
 
 		 366 aa  482  1e-135  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4122  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  63.04 
 
 		 366 aa  484  1e-135  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0138965  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4232  sugar ABC transporter ATP-binding protein  62.77 
 
 		 366 aa  482  1e-135  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.253901  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4035  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  62.77 
 
 		 366 aa  482  1e-135  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0287  ABC transporter related protein  62.19 
 
 		 371 aa  484  1e-135  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0901665  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1117  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  63.04 
 
 		 366 aa  483  1e-135  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000190219  normal  0.407597 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3844  ABC transporter related  62.5 
 
 		 366 aa  479  1e-134  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00035196  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2717  ABC transporter-related protein  62.77 
 
 		 366 aa  479  1e-134  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00458164  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1671  ABC transporter related  61.26 
 
 		 373 aa  472  1e-132  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1897  multiple sugar-binding transport ATP-binding protein  61.14 
 
 		 367 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105891  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1632  multiple sugar-binding transport, ATP-binding protein  61.14 
 
 		 367 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0496  ABC transporter related  60.16 
 
 		 371 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0408811 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1671  ABC transporter related  60.82 
 
 		 366 aa  460  9.999999999999999e-129  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2099  sn-glycerol-3-phosphate import ATP-binding protein UgpC  61.25 
 
 		 367 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0157125  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  59.73 
 
 		 369 aa  457  1e-127  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  63.17 
 
 		 372 aa  456  1e-127  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0777  ABC transporter related  60 
 
 		 367 aa  453  1.0000000000000001e-126  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540961  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0525  ABC transporter related  58.38 
 
 		 367 aa  452  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  60 
 
 		 364 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2199  ABC transporter related protein  61.1 
 
 		 380 aa  452  1.0000000000000001e-126  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1278  ABC transporter related  58.11 
 
 		 367 aa  451  1e-125  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.288826  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2157  beta-phosphoglucomutase  61.41 
 
 		 585 aa  450  1e-125  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2366  ABC transporter-like protein  59.84 
 
 		 381 aa  444  1.0000000000000001e-124  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1529  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  60.6 
 
 		 360 aa  444  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1769  ABC transporter related  59.18 
 
 		 366 aa  446  1.0000000000000001e-124  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01295  putative sugar transport protein  60.33 
 
 		 360 aa  442  1e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.215586  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2164  ABC transporter related  58.71 
 
 		 392 aa  443  1e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1804  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  60.6 
 
 		 360 aa  443  1e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.438286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1963  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  60.6 
 
 		 360 aa  442  1e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.70286 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  58.27 
 
 		 368 aa  443  1e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01306  hypothetical protein  60.33 
 
 		 360 aa  442  1e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.157147  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2307  ABC transporter related  60.33 
 
 		 360 aa  442  1e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.384254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0142  ABC transporter related  60.22 
 
 		 363 aa  439  9.999999999999999e-123  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1992  ABC transporter related  54.32 
 
 		 426 aa  441  9.999999999999999e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.394996  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  58.92 
 
 		 367 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  58.92 
 
 		 367 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1161  ABC transporter related  58.86 
 
 		 367 aa  438  9.999999999999999e-123  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1433  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  59.78 
 
 		 360 aa  437  1e-121  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1059  ABC transporter related  58.45 
 
 		 402 aa  435  1e-121  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649165  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5050  ABC transporter related  59.03 
 
 		 369 aa  431  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  59.57 
 
 		 370 aa  432  1e-120  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5333  ABC transporter related  59.57 
 
 		 369 aa  434  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0409  putative maltose ABC transportor  58.74 
 
 		 365 aa  430  1e-119  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0259  ABC transporter related protein  59.67 
 
 		 366 aa  427  1e-118  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0366  ABC transporter related protein  58.42 
 
 		 364 aa  427  1e-118  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.173433  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0692  ABC transporter related protein  58.04 
 
 		 364 aa  425  1e-118  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4055  ABC transporter related protein  58.31 
 
 		 364 aa  425  1e-118  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0120  ABC transporter related protein  59.67 
 
 		 366 aa  427  1e-118  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7343  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  57.14 
 
 		 369 aa  427  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.88464  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1522  ABC transporter related protein  57.77 
 
 		 364 aa  422  1e-117  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000622253  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0474  ABC-type sugar transport system, ATPase component  55.79 
 
 		 378 aa  416  9.999999999999999e-116  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0218  ABC-type sugar transport system, ATPase component  57.53 
 
 		 367 aa  416  9.999999999999999e-116  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0122274  hitchhiker  0.000000441743 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0198  ABC transporter related  56.1 
 
 		 365 aa  412  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0274814  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0204  ABC transporter related  56.1 
 
 		 365 aa  412  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  52.07 
 
 		 374 aa  409  1e-113  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0242  ABC transporter related  55.85 
 
 		 377 aa  409  1e-113  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2198  ABC transporter-like protein  51.51 
 
 		 405 aa  409  1e-113  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  0.643805 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2796  ABC transporter related  55.83 
 
 		 338 aa  408  1e-113  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.854812  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1143  ABC transporter related  54.35 
 
 		 376 aa  405  1.0000000000000001e-112  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.402141  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0607  ABC transporter related  53.63 
 
 		 397 aa  405  1.0000000000000001e-112  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0567231 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1651  ABC-type sugar transport system, ATPase component  54.05 
 
 		 402 aa  406  1.0000000000000001e-112  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1925  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  55.32 
 
 		 377 aa  403  1e-111  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2427  ABC transporter related  50.8 
 
 		 372 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2765  ABC transporter related  55.01 
 
 		 373 aa  396  1e-109  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2126  maltose ABC transporter, ATP-binding protein, putative  50.8 
 
 		 372 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.210369  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3082  ABC transporter, ATP-binding component  50.53 
 
 		 379 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1556  maltose ABC transporter, ATP-binding protein, putative  50.8 
 
 		 379 aa  397  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.257646  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6516  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 406 aa  397  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.268585 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1202  ABC transporter related protein  51.26 
 
 		 393 aa  397  1e-109  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1869  ABC transporter related protein  50.63 
 
 		 389 aa  396  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0786  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  50.8 
 
 		 372 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.243222  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2618  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  50.8 
 
 		 372 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.654814  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2994  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  50.8 
 
 		 372 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.68586  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3048  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  50.8 
 
 		 372 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.061373  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2935  ABC transporter related protein  48.24 
 
 		 406 aa  395  1e-109  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.311715 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1994  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  50.8 
 
 		 372 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.630648  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4074  ABC sugar transporter, ATPase subunit  50 
 
 		 372 aa  394  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.785195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0631  ABC transporter related  52.14 
 
 		 371 aa  394  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2907  ABC transporter related  53.41 
 
 		 366 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.147416  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0492  ABC transporter related  50.27 
 
 		 372 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.495421  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0971  ABC transporter related  50.27 
 
 		 372 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0932  ABC transporter related  50.27 
 
 		 372 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2549  ABC transporter related  53.41 
 
 		 366 aa  391  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.071435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06399  hypothetical protein  53.49 
 
 		 385 aa  389  1e-107  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1532  ABC transporter related protein  50.62 
 
 		 404 aa  391  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.427318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0377  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.37 
 
 		 361 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>