More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2631 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1373  threonyl-tRNA synthetase  70.61 
 
 		 645 aa  955    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000340223  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0801  threonyl-tRNA synthetase  64.14 
 
 		 647 aa  862    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00121365  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0748  threonyl-tRNA synthetase  66.77 
 
 		 652 aa  902    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05580  Threonyl-tRNA synthetase  63.04 
 
 		 646 aa  867    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000588041  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1228  threonyl-tRNA synthetase  51.78 
 
 		 635 aa  670    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000338672  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2631  threonyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 643 aa  1331    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2317  threonyl-tRNA synthetase  99.84 
 
 		 643 aa  1329    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1372  threonyl-tRNA synthetase  49.84 
 
 		 635 aa  634  1e-180  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000383369  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2661  threonyl-tRNA synthetase  49.3 
 
 		 644 aa  634  1e-180  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000386283  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3262  threonyl-tRNA synthetase  48.21 
 
 		 643 aa  626  1e-178  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00002753  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0797  threonyl-tRNA synthetase  49.68 
 
 		 652 aa  625  1e-178  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1612  threonyl-tRNA synthetase  47.43 
 
 		 635 aa  624  1e-177  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000178172  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0552  threonyl-tRNA synthetase  48.37 
 
 		 645 aa  620  1e-176  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000171694  unclonable  1.90469e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4707  threonyl-tRNA synthetase  48.21 
 
 		 645 aa  619  1e-176  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000334194  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4472  threonyl-tRNA synthetase  48.21 
 
 		 645 aa  620  1e-176  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.419718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4307  threonyl-tRNA synthetase  48.21 
 
 		 645 aa  620  1e-176  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00228432  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4318  threonyl-tRNA synthetase  48.21 
 
 		 645 aa  620  1e-176  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0311311  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2057  threonyl-tRNA synthetase  49.69 
 
 		 634 aa  621  1e-176  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000136416  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4685  threonyl-tRNA synthetase  48.21 
 
 		 645 aa  619  1e-176  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00204863  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4691  threonyl-tRNA synthetase  48.21 
 
 		 645 aa  620  1e-176  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.88699e-59 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4407  threonyl-tRNA synthetase  48.37 
 
 		 645 aa  620  1e-176  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00383919  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4820  threonyl-tRNA synthetase  48.21 
 
 		 645 aa  620  1e-176  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00851939  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4701  threonyl-tRNA synthetase  48.21 
 
 		 645 aa  618  1e-176  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000566692  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2175  threonyl-tRNA synthetase  48.29 
 
 		 648 aa  615  1e-175  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0711  threonyl-tRNA synthetase  47.9 
 
 		 647 aa  603  1.0000000000000001e-171  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2401  threonyl-tRNA synthetase  46.12 
 
 		 634 aa  599  1e-170  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.162517  normal  0.284009 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0613  threonyl-tRNA synthetase  46.12 
 
 		 648 aa  592  1e-168  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1759  threonyl-tRNA synthetase  45.72 
 
 		 633 aa  588  1e-167  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000991077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1089  threonyl-tRNA synthetase  45.96 
 
 		 635 aa  589  1e-167  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00500732  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1774  threonyl-tRNA synthetase  45.47 
 
 		 645 aa  586  1e-166  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1740  threonyl-tRNA synthetase  45.47 
 
 		 645 aa  586  1e-166  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0523763  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1246  threonyl-tRNA synthetase  44.67 
 
 		 645 aa  584  1.0000000000000001e-165  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.1161  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1384  threonyl-tRNA synthetase  44.86 
 
 		 635 aa  579  1e-164  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000717334  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0185  threonyl-tRNA synthetase  44.89 
 
 		 639 aa  575  1.0000000000000001e-163  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000179764  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0623  threonyl-tRNA synthetase  45.17 
 
 		 662 aa  574  1.0000000000000001e-162  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1327  threonyl-tRNA synthetase  44.5 
 
 		 636 aa  562  1.0000000000000001e-159  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0393085  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2181  threonyl-tRNA synthetase  44.63 
 
 		 646 aa  564  1.0000000000000001e-159  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0912  threonyl-tRNA synthetase  42.28 
 
 		 638 aa  556  1e-157  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0123  threonyl-tRNA synthetase  42.48 
 
 		 677 aa  556  1e-157  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0729429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0172  threonyl-tRNA synthetase  42.22 
 
 		 659 aa  555  1e-156  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0363  threonyl-tRNA synthetase  42.55 
 
 		 648 aa  553  1e-156  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0255987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1450  threonyl-tRNA synthetase  43.39 
 
 		 643 aa  555  1e-156  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0121  threonyl-tRNA synthetase  46.58 
 
 		 596 aa  552  1e-156  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0559  threonyl-tRNA synthetase  43.21 
 
 		 644 aa  551  1e-155  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00454252 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0725  threonyl-tRNA synthetase  42.81 
 
 		 638 aa  551  1e-155  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2628  threonyl-tRNA synthetase  43.75 
 
 		 645 aa  546  1e-154  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000255721  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3742  threonyl-tRNA synthetase  43.1 
 
 		 646 aa  546  1e-154  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.190527  hitchhiker  0.00137888 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00815  threonyl-tRNA synthetase  45.02 
 
 		 648 aa  545  1e-154  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.270847  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1664  threonyl-tRNA synthetase  42.08 
 
 		 640 aa  548  1e-154  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000605435  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2308  threonyl-tRNA synthetase  43.99 
 
 		 636 aa  546  1e-154  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304156  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0167  threonyl-tRNA synthetase  41.68 
 
 		 657 aa  546  1e-154  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2219  threonyl-tRNA synthetase  42.9 
 
 		 647 aa  544  1e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0771332 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2222  threonyl-tRNA synthetase  42.08 
 
 		 639 aa  542  1e-153  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1715  threonyl-tRNA synthetase  41.2 
 
 		 657 aa  542  1e-153  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2388  threonyl-tRNA synthetase  42.08 
 
 		 639 aa  542  1e-153  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1643  threonyl-tRNA synthetase  42.55 
 
 		 645 aa  542  1e-153  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.193799  normal  0.0776011 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0156  threonyl-tRNA synthetase  41.73 
 
 		 657 aa  544  1e-153  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1515  threonyl-tRNA synthetase  44.3 
 
 		 636 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00436769  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2419  threonyl-tRNA synthetase  42.55 
 
 		 640 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2161  threonyl-tRNA synthetase  42.02 
 
 		 639 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.820955  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2405  threonyl-tRNA synthetase  42.02 
 
 		 639 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2003  threonyl-tRNA synthetase  41.99 
 
 		 635 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00562927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1300  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  42.55 
 
 		 639 aa  539  9.999999999999999e-153  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2354  threonyl-tRNA synthetase  42.5 
 
 		 640 aa  539  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2973  threonyl-tRNA synthetase  42.5 
 
 		 640 aa  538  1e-151  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.617243 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2145  threonyl-tRNA synthetase  42.08 
 
 		 639 aa  536  1e-151  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1990  threonyl-tRNA synthetase  44.13 
 
 		 636 aa  537  1e-151  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0457996  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1411  threonyl-tRNA synthetase  43.99 
 
 		 645 aa  537  1e-151  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000074774  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1824  threonyl-tRNA synthetase  43.93 
 
 		 636 aa  535  1e-151  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000392835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0768  threonyl-tRNA synthetase  41.81 
 
 		 641 aa  536  1e-151  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.67512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2501  threonyl-tRNA synthetase  41.05 
 
 		 675 aa  536  1e-151  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2489  threonyl-tRNA synthetase  42.11 
 
 		 639 aa  534  1e-150  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.952507  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2230  threonyl-tRNA synthetase  43.66 
 
 		 636 aa  533  1e-150  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00712554 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2665  threonyl-tRNA synthetase  44.8 
 
 		 584 aa  533  1e-150  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000220787  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0176  threonyl-tRNA synthetase  40.9 
 
 		 657 aa  533  1e-150  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1025  threonyl-tRNA synthetase  44.64 
 
 		 638 aa  534  1e-150  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.572663  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0829  threonyl-tRNA synthetase  41.99 
 
 		 640 aa  535  1e-150  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.127421  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1221  threonyl-tRNA synthetase  43.13 
 
 		 647 aa  531  1e-149  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.001104  hitchhiker  0.00620187 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1906  threonyl-tRNA synthetase  42.06 
 
 		 641 aa  529  1e-149  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1767  threonyl-tRNA synthetase  41.95 
 
 		 640 aa  529  1e-149  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.143728  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4736  threonyl-tRNA synthetase  42.35 
 
 		 659 aa  529  1e-149  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.556159 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0392  threonyl-tRNA synthetase  42.9 
 
 		 633 aa  531  1e-149  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0992  threonyl-tRNA synthetase  45.64 
 
 		 647 aa  529  1e-149  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2193  threonyl-tRNA synthetase  41.18 
 
 		 639 aa  526  1e-148  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1418  threonyl-tRNA synthetase  43.69 
 
 		 638 aa  526  1e-148  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000102997  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2639  threonyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 644 aa  526  1e-148  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.3159  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0189  threonyl-tRNA synthetase  41.3 
 
 		 640 aa  526  1e-148  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114049  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1010  threonyl-tRNA synthetase  41.37 
 
 		 640 aa  523  1e-147  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0187  threonyl-tRNA synthetase  41.15 
 
 		 640 aa  524  1e-147  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00194489  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2854  threonyl-tRNA synthetase  41.52 
 
 		 635 aa  523  1e-147  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0336987 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2850  threonyl-tRNA synthetase  45.36 
 
 		 604 aa  525  1e-147  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0185982  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0608  threonyl-tRNA synthetase  41.92 
 
 		 634 aa  521  1e-146  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.769524  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1669  threonyl-tRNA synthetase  41.88 
 
 		 637 aa  520  1e-146  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000137846  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2614  threonyl-tRNA synthetase  40.76 
 
 		 644 aa  520  1e-146  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1160  threonyl-tRNA synthetase  39.97 
 
 		 635 aa  519  1e-146  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.139321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2243  threonyl-tRNA synthetase  40.76 
 
 		 644 aa  520  1e-146  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00594301  hitchhiker  0.00373508 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0460  threonyl-tRNA synthetase / Ser-tRNA(Thr) hydrolase  41.94 
 
 		 663 aa  520  1e-146  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0696284  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2643  threonyl-tRNA synthetase  40.75 
 
 		 637 aa  516  1.0000000000000001e-145  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2483  threonyl-tRNA synthetase  43.98 
 
 		 637 aa  515  1.0000000000000001e-145  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0764303  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0662  threonyl-tRNA synthetase  41.4 
 
 		 652 aa  518  1.0000000000000001e-145  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>