More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2588 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2588  putative cadmium resistance transcriptional regulator CadC  100 
 
 		 119 aa  242  9.999999999999999e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2290  transcription repressor SmtB-like protein  98.32 
 
 		 119 aa  238  2e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0771617  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0769  regulatory protein, ArsR  70.94 
 
 		 121 aa  178  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0245  ArsR family transcriptional regulator  68.38 
 
 		 125 aa  175  2e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1161  regulatory protein, ArsR  66.95 
 
 		 121 aa  169  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.358448  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0432  ArsR family transcriptional regulator  68.1 
 
 		 124 aa  167  4e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.35069  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0802  regulatory protein ArsR  66.37 
 
 		 125 aa  167  6e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1613  regulatory protein ArsR  68.1 
 
 		 124 aa  167  6e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1275  regulatory protein, ArsR  68.1 
 
 		 124 aa  167  6e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0149892  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0925  transcriptional regulator, ArsR family  62.83 
 
 		 122 aa  163  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000939466  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0315  transcriptional regulator, ArsR family  62.39 
 
 		 125 aa  154  5.0000000000000005e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0516242  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0509  ArsR family transcriptional regulator  58.54 
 
 		 125 aa  150  7e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0722  transcriptional regulator, ArsR family  58.54 
 
 		 125 aa  150  7e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0662  ArsR family transcriptional regulator  57.72 
 
 		 125 aa  149  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0563  ArsR family transcriptional regulator  57.72 
 
 		 125 aa  149  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0505  ArsR family transcriptional regulator  57.72 
 
 		 125 aa  149  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0507  ArsR family transcriptional regulator  57.72 
 
 		 125 aa  149  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0651  transcriptional regulator, ArsR family  57.72 
 
 		 125 aa  149  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016978 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4705  transcriptional regulator, ArsR family  57.72 
 
 		 125 aa  149  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.22146 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0594  ArsR family transcriptional regulator  57.72 
 
 		 125 aa  149  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0633  transcriptional regulator, ArsR family  57.72 
 
 		 125 aa  149  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0236  transcriptional regulator, ArsR family  56.9 
 
 		 120 aa  149  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000016781  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0511  regulatory protein ArsR  58.54 
 
 		 125 aa  144  3e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2129  ArsR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 121 aa  142  2e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000391654  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1541  cadmium efflux system accessory protein  53.1 
 
 		 125 aa  132  9.999999999999999e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.558701  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1546  transcriptional regulator, ArsR family  55.93 
 
 		 133 aa  130  5e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0234857  normal  0.041632 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3693  ArsR family transcriptional regulator  52.25 
 
 		 123 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1207  transcriptional regulator, ArsR family  53.33 
 
 		 173 aa  128  3e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112354 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2087  transcriptional regulator  54.05 
 
 		 119 aa  127  4.0000000000000003e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.570352  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2149  ArsR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 124 aa  127  7.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.267681  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05920  transcriptional regulator, ArsR family  63.16 
 
 		 123 aa  126  1.0000000000000001e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.560602 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0928  transcriptional regulator, ArsR family  48.31 
 
 		 125 aa  123  7e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0525  regulatory protein, ArsR  54.29 
 
 		 120 aa  123  7e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.150899 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1382  ArsR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 117 aa  122  1e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0470  transcriptional regulator, ArsR family  49.58 
 
 		 120 aa  122  1e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000466347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2262  transcriptional regulator, ArsR family  47.9 
 
 		 119 aa  122  2e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13760  transcriptional regulator, ArsR family  63.16 
 
 		 125 aa  122  2e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.933244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0747  ArsR family transcriptional regulator  54.29 
 
 		 120 aa  121  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0517  transcriptional regulator, ArsR family  48.74 
 
 		 122 aa  120  5e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1741  transcriptional regulator, ArsR family  49.09 
 
 		 119 aa  120  5e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.953205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0595  ArsR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 125 aa  120  6e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.91052  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22370  regulatory protein ArsR  55.88 
 
 		 123 aa  119  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0758  ArsR family transcriptional regulator  48.74 
 
 		 122 aa  117  7e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0131  transcriptional regulator, ArsR family  47.9 
 
 		 122 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000586793  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4447  ArsR family transcriptional regulator  42.98 
 
 		 139 aa  113  6.9999999999999995e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1516  transcriptional regulator, ArsR family  57.95 
 
 		 111 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000659197  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2461  transcriptional regulator, ArsR family  48.25 
 
 		 118 aa  108  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.813526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1123  transcriptional regulator, ArsR family  49.57 
 
 		 126 aa  107  4.0000000000000004e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000269044  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1628  transcriptional regulator, ArsR family  41.96 
 
 		 122 aa  106  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.548833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1689  transcriptional regulator, ArsR family  51.49 
 
 		 141 aa  106  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1126  ArsR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 131 aa  102  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0458599  normal  0.0698866 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4581  ArsR family transcriptional regulator  49.04 
 
 		 132 aa  102  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1827  transcriptional regulator, ArsR family  54.17 
 
 		 93 aa  101  3e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2202  ArsR family transcriptional regulator  57.65 
 
 		 117 aa  100  5e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.975415  normal  0.398004 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1470  transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 		 119 aa  100  5e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.967801  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4984  transcriptional regulator, ArsR family  37.72 
 
 		 135 aa  99.8  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.452478  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2654  ArsR family transcriptional regulator  48 
 
 		 109 aa  99  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1408  transcriptional regulator, ArsR family  51.65 
 
 		 100 aa  99  2e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0100  ArsR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 127 aa  97.8  4e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1232  regulatory protein ArsR  52.13 
 
 		 114 aa  97.4  7e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.802092  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13920  transcriptional regulator, ArsR family  38.98 
 
 		 124 aa  96.7  1e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.836501  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1244  regulatory protein, ArsR  49.45 
 
 		 109 aa  96.3  1e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0553  transcriptional regulator, ArsR family  41.88 
 
 		 122 aa  91.7  3e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0187  transcriptional regulator, ArsR family  42.06 
 
 		 127 aa  91.3  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.6188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2584  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 127 aa  90.9  6e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2559  transcriptional regulator, ArsR family  44.94 
 
 		 106 aa  90.5  8e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103934  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9265  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.05 
 
 		 122 aa  90.1  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0771  regulatory protein ArsR  46.07 
 
 		 98 aa  89.4  1e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00625866  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1965  ArsR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 120 aa  90.1  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0544  transcriptional regulator, ArsR family  50.56 
 
 		 102 aa  89.7  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0581  ArsR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 115 aa  88.6  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2845  transcriptional regulator, ArsR family  38.53 
 
 		 140 aa  89  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4451  ArsR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 133 aa  88.6  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2197  transcriptional regulator, ArsR family  49.44 
 
 		 102 aa  88.2  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0860  transcriptional regulator, ArsR family  47.06 
 
 		 129 aa  86.7  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0886  transcriptional regulator, ArsR family  47.06 
 
 		 129 aa  86.7  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2011  regulatory protein, ArsR  45.65 
 
 		 135 aa  86.7  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184845  normal  0.0811991 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2471  regulatory protein ArsR  41.35 
 
 		 113 aa  86.7  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.411264  normal  0.730529 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1168  transcriptional regulator, ArsR family  44.33 
 
 		 122 aa  86.3  1e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315565  unclonable  0.0000000265454 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1291  ArsR family transcriptional regulator  42.48 
 
 		 122 aa  85.9  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.217446 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1528  regulatory protein, ArsR  48.78 
 
 		 120 aa  84.3  5e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00003097  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2544  transcriptional regulator, ArsR family  44.9 
 
 		 130 aa  84.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0548  transcriptional regulator, ArsR family  37.72 
 
 		 122 aa  83.6  8e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1719  transcriptional regulator, ArsR family  37.72 
 
 		 122 aa  83.6  8e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09790  predicted transcriptional regulator  43.02 
 
 		 145 aa  83.2  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.829992  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1547  transcriptional regulator, ArsR family  37.61 
 
 		 123 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1137  transcriptional regulator, ArsR family  37.72 
 
 		 122 aa  83.2  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3434  regulatory protein ArsR  46.43 
 
 		 118 aa  82.8  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1258  cadmium efflux system accessory protein  37.17 
 
 		 122 aa  81.3  0.000000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2281  ArsR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 116 aa  81.3  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.815157 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3728  regulatory protein, ArsR  44.57 
 
 		 119 aa  80.9  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.369834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0894  transcriptional regulator, ArsR family  44.94 
 
 		 141 aa  80.5  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.360757  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0480  ArsR family transcriptional regulator  43.02 
 
 		 120 aa  80.1  0.000000000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0108431  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4437  ArsR family transcriptional regulator  43.53 
 
 		 120 aa  80.1  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.352064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1839  transcriptional regulator, ArsR family  41.96 
 
 		 146 aa  79.7  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000000260966  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4462  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 174 aa  79.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1821  transcriptional regulator, ArsR family  45.24 
 
 		 121 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.321191  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1211  transcriptional regulator, ArsR family  47.37 
 
 		 117 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3766  cadmium efflux system accessory protein  39.66 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1486  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 138 aa  78.2  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>