More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2587 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0433  heavy metal translocating P-type ATPase  56.48 
 
 
786 aa  818    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1276  heavy metal translocating P-type ATPase  55.92 
 
 
786 aa  795    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.248068  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0663  heavy metal-transporting ATPase  56.4 
 
 
788 aa  788    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1162  heavy metal translocating P-type ATPase  56.79 
 
 
658 aa  743    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0564  heavy metal-transporting ATPase  56.54 
 
 
788 aa  789    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0770  heavy metal translocating P-type ATPase  52.68 
 
 
699 aa  751    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0506  cation-transporting ATPase, P-type  56.4 
 
 
788 aa  801    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.907696  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0510  cadmium-translocating P-type ATPase  56.54 
 
 
784 aa  796    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0508  cation-transporting ATPase, P-type  56.4 
 
 
788 aa  801    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0723  heavy metal-transporting ATPase  56.68 
 
 
788 aa  793    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0634  heavy metal-transporting ATPase  56.95 
 
 
788 aa  804    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.373732  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0595  heavy metal-transporting ATPase  56.54 
 
 
788 aa  789    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.318271  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0121  heavy metal translocating P-type ATPase  56.35 
 
 
616 aa  683    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000385765  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2203  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  46.59 
 
 
700 aa  687    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.588592 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0234  cadmium-translocating P-type ATPase  59.18 
 
 
618 aa  701    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00321637  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13740  heavy metal-translocating P-type ATPase, Cd/Co/Hg/Pb/Zn-transporting  53.09 
 
 
638 aa  642    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0652  heavy metal-transporting ATPase  56.4 
 
 
788 aa  801    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000329605 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0512  heavy metal translocating P-type ATPase  56.79 
 
 
785 aa  801    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20930  heavy metal translocating P-type ATPase  48.99 
 
 
745 aa  680    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000162182  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2587  cadmium-translocating P-type ATPase  100 
 
 
738 aa  1467    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2289  zinc-transporting atpase  93.77 
 
 
738 aa  1267    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.362912  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1742  cadmium-translocating P-type ATPase  48.52 
 
 
773 aa  665    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.106711  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4704  heavy metal-transporting ATPase  56.95 
 
 
788 aa  805    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0990671 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2557  cadmium-translocating P-type ATPase  62.05 
 
 
629 aa  715    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00040081  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0927  heavy metal translocating P-type ATPase  47.17 
 
 
800 aa  678    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.28162  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05940  heavy metal-translocating P-type ATPase, Cd/Co/Hg/Pb/Zn-transporting  52.07 
 
 
638 aa  637    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.558589 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0801  heavy metal translocating P-type ATPase  57.17 
 
 
682 aa  714    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2462  heavy metal translocating P-type ATPase  47.73 
 
 
724 aa  648    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0244  heavy metal translocating P-type ATPase  54.77 
 
 
707 aa  762    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.787519  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1544  heavy metal translocating P-type ATPase  53.22 
 
 
640 aa  629  1e-179  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0567508  normal  0.0780509 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1065  hypothetical protein  52.56 
 
 
626 aa  629  1e-179  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.770799  normal  0.783776 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0336  heavy metal translocating P-type ATPase  47 
 
 
690 aa  625  1e-177  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1231  heavy metal translocating P-type ATPase  45.49 
 
 
696 aa  597  1e-169  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1384  cadmium-translocating P-type ATPase  51.14 
 
 
643 aa  593  1e-168  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11668  cation-transporting ATPase, P-type, putative zinc-transporting ATPase  46.95 
 
 
654 aa  591  1e-167  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.292435  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0421  heavy metal translocating P-type ATPase  45.05 
 
 
721 aa  586  1e-166  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.403796  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1064  cation-transporting ATPase  50.42 
 
 
667 aa  582  1.0000000000000001e-165  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.632696  normal  0.380581 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1510  cation-transporting ATPase; zinc-transporting ATPase  48.55 
 
 
664 aa  584  1.0000000000000001e-165  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00216994  normal  0.157435 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3344  heavy metal translocating P-type ATPase  47.05 
 
 
663 aa  583  1.0000000000000001e-165  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.601445  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2686  heavy metal translocating P-type ATPase  47.01 
 
 
656 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.682129  normal  0.103785 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2261  heavy metal translocating P-type ATPase  46.3 
 
 
658 aa  568  1e-161  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1966  heavy metal translocating P-type ATPase  49.66 
 
 
682 aa  559  1e-158  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1265  heavy metal translocating P-type ATPase  43.39 
 
 
696 aa  556  1e-157  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.247851  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0290  heavy metal translocating P-type ATPase  46.95 
 
 
631 aa  550  1e-155  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000372175  normal  0.539461 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0552  cadmium-translocating P-type ATPase  46.44 
 
 
645 aa  539  9.999999999999999e-153  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6787  heavy metal translocating P-type ATPase  42.92 
 
 
671 aa  537  1e-151  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.423495  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1187  heavy metal translocating P-type ATPase  42.53 
 
 
671 aa  536  1e-151  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.491713 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6746  heavy metal translocating P-type ATPase  42.23 
 
 
670 aa  530  1e-149  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1095  heavy metal translocating P-type ATPase  43.21 
 
 
641 aa  510  1e-143  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.0000123465  hitchhiker  0.000000122053 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1410  heavy metal translocating P-type ATPase  44.12 
 
 
613 aa  486  1e-136  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.575689  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1517  heavy metal translocating P-type ATPase  40.58 
 
 
624 aa  478  1e-133  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0910099  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1718  heavy metal translocating P-type ATPase  36.97 
 
 
712 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0314  heavy metal translocating P-type ATPase  39.49 
 
 
695 aa  469  9.999999999999999e-131  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.040905  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  37.08 
 
 
712 aa  468  9.999999999999999e-131  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0549  heavy metal translocating P-type ATPase  36.68 
 
 
712 aa  464  1e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1527  heavy metal translocating P-type ATPase  35.57 
 
 
783 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00585098  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2204  heavy metal translocating P-type ATPase  41.4 
 
 
833 aa  451  1e-125  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.149675  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1690  heavy metal translocating P-type ATPase  32.36 
 
 
767 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0326  heavy metal translocating P-type ATPase  39.3 
 
 
750 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.451186  normal  0.576346 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1257  cation transporter E1-E2 family ATPase  35.51 
 
 
709 aa  437  1e-121  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1548  heavy metal translocating P-type ATPase  38.47 
 
 
707 aa  437  1e-121  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5192  heavy metal translocating P-type ATPase  38.77 
 
 
750 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5012  heavy metal translocating P-type ATPase  38.42 
 
 
750 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.530784  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5139  heavy metal translocating P-type ATPase  38.42 
 
 
750 aa  435  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.921896  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1151  heavy metal translocating P-type ATPase  32.98 
 
 
904 aa  425  1e-117  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0071597  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5279  cadmium-translocating P-type ATPase  38.32 
 
 
752 aa  419  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5371  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  38.28 
 
 
769 aa  421  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0479  heavy metal translocating P-type ATPase  35.57 
 
 
939 aa  422  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0026  heavy metal translocating P-type ATPase  37.61 
 
 
701 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.260901  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18520  heavy metal translocating P-type ATPase  37.98 
 
 
712 aa  418  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1627  heavy metal translocating P-type ATPase  34.14 
 
 
718 aa  417  9.999999999999999e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4451  heavy metal translocating P-type ATPase  34.07 
 
 
673 aa  412  1e-114  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2103  heavy metal translocating P-type ATPase  37.42 
 
 
800 aa  414  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2390  heavy metal translocating P-type ATPase  37.42 
 
 
800 aa  414  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0451824  normal  0.128679 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2084  heavy metal translocating P-type ATPase  31.97 
 
 
812 aa  412  1e-114  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.155382 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2631  ATPase, E1-E2 type:heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  36.38 
 
 
739 aa  412  1e-113  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.873232 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3643  heavy metal translocating P-type ATPase  33.69 
 
 
726 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.545825 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5352  heavy metal translocating P-type ATPase  35.97 
 
 
799 aa  411  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448816  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1677  heavy metal translocating P-type ATPase  35.56 
 
 
726 aa  411  1e-113  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1049  hypothetical protein  37.12 
 
 
713 aa  407  1.0000000000000001e-112  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1125  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  31.46 
 
 
751 aa  408  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.228678  normal  0.104561 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3304  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  38.48 
 
 
866 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0854  heavy metal translocating P-type ATPase  37.39 
 
 
812 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2303  heavy metal translocating P-type ATPase  35.48 
 
 
984 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0230591  hitchhiker  0.00032078 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3233  heavy metal translocating P-type ATPase  31.72 
 
 
785 aa  406  1.0000000000000001e-112  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.27574  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3390  heavy metal translocating P-type ATPase  35.48 
 
 
984 aa  407  1.0000000000000001e-112  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0773629 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3946  cadmium-translocating P-type ATPase  37.44 
 
 
828 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1815  heavy metal translocating P-type ATPase  35.97 
 
 
800 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.451181 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0138  heavy metal translocating P-type ATPase  37.23 
 
 
848 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1643  heavy metal translocating P-type ATPase  35.95 
 
 
800 aa  405  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.960315  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2976  cadmium-translocating P-type ATPase  37.44 
 
 
713 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0150  cadmium-translocating P-type ATPase  37.44 
 
 
713 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.478149  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1347  heavy metal translocating P-type ATPase  32.24 
 
 
738 aa  405  1e-111  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.174649 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4019  cadmium-translocating P-type ATPase  37.44 
 
 
832 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3038  cadmium-translocating P-type ATPase  37.44 
 
 
834 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5284  heavy metal translocating P-type ATPase  35.95 
 
 
800 aa  405  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.225774  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4225  heavy metal translocating P-type ATPase  35.12 
 
 
734 aa  404  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3333  cadmium-translocating P-type ATPase  37.44 
 
 
834 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1563  cadmium-translocating P-type ATPase  37.44 
 
 
832 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2147  cadmium-translocating P-type ATPase  33.15 
 
 
713 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>