30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2486 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2486  putative spore coat protein  100 
 
 		 335 aa  685    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000540962  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2196  spore coat protein, putative  95.82 
 
 		 335 aa  661    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0443073  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2482  spore coat protein CotS  28.93 
 
 		 334 aa  168  1e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.915972  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2192  spore coat protein CotS  28.93 
 
 		 333 aa  168  1e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00336173  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0543  spore coat protein, CotS family  28.44 
 
 		 330 aa  149  7e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2398  putative spore coat protein  28.08 
 
 		 329 aa  146  5e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0541  spore coat protein, CotS family  32.11 
 
 		 337 aa  144  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0017  spore coat protein, CotS family  26.02 
 
 		 327 aa  135  8e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1978  hypothetical protein  27.79 
 
 		 359 aa  115  7.999999999999999e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1083  putative homoserine kinase type II (protein kinase fold)-like protein  27.4 
 
 		 349 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2267  putative spore coat protein  27.79 
 
 		 359 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2484  putative spore coat protein  24.69 
 
 		 342 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0028881  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2194  spore coat protein, putative  24.38 
 
 		 342 aa  106  6e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00168617  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1084  spore coat protein  25.33 
 
 		 345 aa  97.1  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1090  spore coat protein, CotS family  23.94 
 
 		 331 aa  94.7  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.26177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0449  aminoglycoside phosphotransferase  21.77 
 
 		 351 aa  90.1  5e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5429  spore coat protein CotS  26.55 
 
 		 352 aa  88.2  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.917959  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2081  spore coat protein CotS  24.77 
 
 		 355 aa  87.8  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5431  spore coat protein CotS  25.91 
 
 		 372 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.472752  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2083  spore coat protein CotS  24.63 
 
 		 350 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.694942  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3824  CotS family spore coat protein  19.73 
 
 		 347 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1091  spore coat protein, CotS family  22.76 
 
 		 331 aa  75.5  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1639  spore coat protein, CotS family  20.79 
 
 		 364 aa  73.2  0.000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1130  spore coat protein, CotS family  22.37 
 
 		 333 aa  68.9  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2120  aminoglycoside phosphotransferase  19.59 
 
 		 314 aa  52.8  0.000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0542  hypothetical protein  38.1 
 
 		 322 aa  51.6  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4304  spore coat protein YsxE  22.22 
 
 		 341 aa  43.1  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0284  homoserine kinase  22.01 
 
 		 320 aa  42.7  0.009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.185844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1644  aminoglycoside phosphotransferase  29.07 
 
 		 331 aa  42.7  0.009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0305  aminoglycoside phosphotransferase  23.11 
 
 		 338 aa  42.4  0.01  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>