42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2484 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_2194  spore coat protein, putative  96.49 
 
 		 342 aa  652    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00168617  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2484  putative spore coat protein  100 
 
 		 342 aa  678    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0028881  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2482  spore coat protein CotS  30.87 
 
 		 334 aa  138  1e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.915972  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0543  spore coat protein, CotS family  31.51 
 
 		 330 aa  136  5e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2192  spore coat protein CotS  30.54 
 
 		 333 aa  135  7.000000000000001e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00336173  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0017  spore coat protein, CotS family  27.62 
 
 		 327 aa  117  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2398  putative spore coat protein  25.97 
 
 		 329 aa  114  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2486  putative spore coat protein  24.69 
 
 		 335 aa  110  5e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000540962  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3824  CotS family spore coat protein  24.55 
 
 		 347 aa  109  6e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2196  spore coat protein, putative  24.38 
 
 		 335 aa  108  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0443073  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1090  spore coat protein, CotS family  24.05 
 
 		 331 aa  103  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.26177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1130  spore coat protein, CotS family  27.99 
 
 		 333 aa  103  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1083  putative homoserine kinase type II (protein kinase fold)-like protein  25 
 
 		 349 aa  90.1  5e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1091  spore coat protein, CotS family  22.65 
 
 		 331 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0541  spore coat protein, CotS family  23.61 
 
 		 337 aa  83.2  0.000000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1084  spore coat protein  25.19 
 
 		 345 aa  83.2  0.000000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5431  spore coat protein CotS  23.62 
 
 		 372 aa  82  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.472752  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2083  spore coat protein CotS  22.55 
 
 		 350 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.694942  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2081  spore coat protein CotS  24.23 
 
 		 355 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1978  hypothetical protein  24.31 
 
 		 359 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2267  putative spore coat protein  24.31 
 
 		 359 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5429  spore coat protein CotS  22.6 
 
 		 352 aa  65.1  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.917959  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1639  spore coat protein, CotS family  21.67 
 
 		 364 aa  56.2  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4577  spore coat protein YsxE  21.65 
 
 		 324 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3175  spore coat protein YsxE  20.52 
 
 		 342 aa  52.8  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1644  aminoglycoside phosphotransferase  22.97 
 
 		 331 aa  50.8  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4304  spore coat protein YsxE  21.5 
 
 		 341 aa  49.7  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4546  spore coat protein YsxE  20.2 
 
 		 341 aa  49.3  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4550  hypothetical protein  20.2 
 
 		 341 aa  49.3  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2828  hypothetical protein  26.62 
 
 		 309 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00879234  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0657  spore coat protein YsxE  20.29 
 
 		 341 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4203  spore coat protein  20.2 
 
 		 341 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0542  hypothetical protein  21.24 
 
 		 322 aa  47.8  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4192  spore coat protein  19.87 
 
 		 341 aa  47.8  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4691  hypothetical protein  20.14 
 
 		 341 aa  47.4  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4356  hypothetical protein  20.14 
 
 		 341 aa  47.4  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0043  homoserine kinase  22.74 
 
 		 326 aa  44.7  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.848383  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4595  spore coat protein YsxE  20.23 
 
 		 319 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3867  aminoglycoside phosphotransferase  41.3 
 
 		 264 aa  43.9  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.499671  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1727  homoserine kinase  20.15 
 
 		 316 aa  43.5  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33361  protein serine/threonine kinase activity  34.67 
 
 		 408 aa  42.7  0.009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.814262 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2603  aminoglycoside phosphotransferase  27 
 
 		 309 aa  42.7  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.337821  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>