More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2435 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2777  S-adenosylmethionine synthetase  75.96 
 
 
403 aa  635    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000102854  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2435  S-adenosylmethionine synthetase  100 
 
 
391 aa  803    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2145  S-adenosylmethionine synthetase  100 
 
 
391 aa  803    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2251  methionine adenosyltransferase  76.67 
 
 
397 aa  637    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000460807  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0686  S-adenosylmethionine synthetase  76.98 
 
 
396 aa  632  1e-180  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3437  S-adenosylmethionine synthetase  76.73 
 
 
399 aa  629  1e-179  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.109386  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0659  S-adenosylmethionine synthetase  75.7 
 
 
403 aa  630  1e-179  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2574  S-adenosylmethionine synthetase  75.52 
 
 
395 aa  622  1e-177  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0485425  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4660  S-adenosylmethionine synthetase  75.7 
 
 
399 aa  621  1e-177  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4500  S-adenosylmethionine synthetase  75.7 
 
 
399 aa  620  1e-177  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4517  S-adenosylmethionine synthetase  75.7 
 
 
399 aa  621  1e-177  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.536795  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0363  S-adenosylmethionine synthetase  75.7 
 
 
399 aa  620  1e-177  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000052915  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5017  S-adenosylmethionine synthetase  75.7 
 
 
399 aa  621  1e-177  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00446313  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0445  S-adenosylmethionine synthetase  73.91 
 
 
395 aa  622  1e-177  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000309499  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4904  S-adenosylmethionine synthetase  75.7 
 
 
399 aa  620  1e-177  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000363625  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0087  S-adenosylmethionine synthetase  74.62 
 
 
396 aa  621  1e-177  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000221578  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4886  S-adenosylmethionine synthetase  75.7 
 
 
399 aa  621  1e-177  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4594  S-adenosylmethionine synthetase  75.7 
 
 
399 aa  619  1e-176  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.791965  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4914  S-adenosylmethionine synthetase  75.45 
 
 
399 aa  619  1e-176  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.11754  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4877  S-adenosylmethionine synthetase  75.45 
 
 
399 aa  619  1e-176  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000842328  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3891  S-adenosylmethionine synthetase  73.59 
 
 
396 aa  617  1e-176  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00109689  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3874  methionine adenosyltransferase  70.48 
 
 
396 aa  599  1e-170  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000696498  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0894  S-adenosylmethionine synthetase  71.39 
 
 
395 aa  593  1e-168  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000969915  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2330  methionine adenosyltransferase  69.41 
 
 
396 aa  589  1e-167  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3096  methionine adenosyltransferase  71.47 
 
 
397 aa  587  1e-166  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09860  Methionine adenosyltransferase  71.32 
 
 
402 aa  581  1.0000000000000001e-165  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1841  S-adenosylmethionine synthetase  70.69 
 
 
398 aa  580  1e-164  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1071  S-adenosylmethionine synthetase  70.18 
 
 
393 aa  580  1e-164  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0298396  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1877  S-adenosylmethionine synthetase  70.69 
 
 
398 aa  580  1e-164  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0512  S-adenosylmethionine synthetase  68.73 
 
 
406 aa  576  1.0000000000000001e-163  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.128804  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0488  S-adenosylmethionine synthetase  68.48 
 
 
406 aa  575  1.0000000000000001e-163  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.227197  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1234  S-adenosylmethionine synthetase  69.23 
 
 
396 aa  577  1.0000000000000001e-163  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0170314  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3981  S-adenosylmethionine synthetase  70.05 
 
 
396 aa  576  1.0000000000000001e-163  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000348916  hitchhiker  0.00000146833 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2084  methionine adenosyltransferase  69.51 
 
 
395 aa  574  1.0000000000000001e-163  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.191002  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_453  S-adenosylmethionine synthetase  67.96 
 
 
406 aa  571  1.0000000000000001e-162  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00689475  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3565  S-adenosylmethionine synthetase  69.74 
 
 
403 aa  570  1e-161  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.814506  normal  0.982729 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0160  S-adenosylmethionine synthetase  66.58 
 
 
405 aa  558  1e-158  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.754463  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2353  S-adenosylmethionine synthetase  67.27 
 
 
405 aa  559  1e-158  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3549  S-adenosylmethionine synthetase  68.21 
 
 
403 aa  559  1e-158  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.642541  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0489  S-adenosylmethionine synthetase  66.84 
 
 
405 aa  558  1e-158  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1133  S-adenosylmethionine synthetase  65.73 
 
 
395 aa  557  1e-157  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000111198  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1171  S-adenosylmethionine synthetase  65.73 
 
 
395 aa  557  1e-157  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000972386  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1352  S-adenosylmethionine synthetase  68.12 
 
 
399 aa  553  1e-156  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1725  S-adenosylmethionine synthetase  66.15 
 
 
402 aa  554  1e-156  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.710096  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0660  S-adenosylmethionine synthetase  68.11 
 
 
402 aa  554  1e-156  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000409512  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1296  S-adenosylmethionine synthetase  66.75 
 
 
395 aa  545  1e-154  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0081249  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0456  S-adenosylmethionine synthetase  66.16 
 
 
402 aa  547  1e-154  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000025014  normal  0.132712 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1135  S-adenosylmethionine synthetase  65.55 
 
 
397 aa  547  1e-154  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0831  S-adenosylmethionine synthetase  65.05 
 
 
398 aa  543  1e-153  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0125  S-adenosylmethionine synthetase  65.22 
 
 
396 aa  541  1e-153  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00105717  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1756  S-adenosylmethionine synthetase  64.05 
 
 
395 aa  535  1e-151  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000785421  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2161  S-adenosylmethionine synthetase  64.97 
 
 
399 aa  536  1e-151  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1186  S-adenosylmethionine synthetase  65.05 
 
 
414 aa  534  1e-150  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1383  methionine adenosyltransferase  61.71 
 
 
401 aa  524  1e-148  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0533  S-adenosylmethionine synthetase  63.24 
 
 
393 aa  523  1e-147  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000146797  normal  0.123305 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2642  S-adenosylmethionine synthetase  64.03 
 
 
391 aa  520  1e-146  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15650  methionine adenosyltransferase  63.94 
 
 
400 aa  517  1.0000000000000001e-145  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.148398  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2348  S-adenosylmethionine synthetase  65.31 
 
 
403 aa  515  1.0000000000000001e-145  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.233249  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3661  S-adenosylmethionine synthetase  65.04 
 
 
393 aa  516  1.0000000000000001e-145  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.284553  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4159  S-adenosylmethionine synthetase  63.71 
 
 
397 aa  512  1e-144  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0297831  normal  0.258747 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27040  methionine adenosyltransferase  64.94 
 
 
399 aa  513  1e-144  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.593252  normal  0.387061 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0675  methionine adenosyltransferase  67.18 
 
 
401 aa  511  1e-144  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3161  S-adenosylmethionine synthetase  64.19 
 
 
396 aa  509  1e-143  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153387  hitchhiker  0.00000474907 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1065  S-adenosylmethionine synthetase  63.08 
 
 
397 aa  509  1e-143  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0413  S-adenosylmethionine synthetase  63.21 
 
 
390 aa  509  1e-143  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0737611  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3004  S-adenosylmethionine synthetase  63.08 
 
 
397 aa  510  1e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000578039  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3124  S-adenosylmethionine synthetase  63.01 
 
 
398 aa  510  1e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.110006  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3116  S-adenosylmethionine synthetase  63.4 
 
 
391 aa  510  1e-143  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2256  S-adenosylmethionine synthetase  63.68 
 
 
411 aa  509  1e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0616987  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3103  S-adenosylmethionine synthetase  64.27 
 
 
401 aa  509  1e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0169073  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1363  S-adenosylmethionine synthetase  63.1 
 
 
395 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.176558  normal  0.04012 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5235  S-adenosylmethionine synthetase  65.1 
 
 
400 aa  505  9.999999999999999e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3737  S-adenosylmethionine synthetase  63.89 
 
 
402 aa  507  9.999999999999999e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.193212 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4320  methionine adenosyltransferase  62.79 
 
 
387 aa  506  9.999999999999999e-143  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.238534  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2818  Methionine adenosyltransferase  62.31 
 
 
395 aa  501  1e-141  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.575493 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0929  S-adenosylmethionine synthetase  61.76 
 
 
383 aa  501  1e-141  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0871  S-adenosylmethionine synthetase  62.02 
 
 
383 aa  504  1e-141  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1864  S-adenosylmethionine synthetase  62.34 
 
 
399 aa  502  1e-141  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2575  S-adenosylmethionine synthetase  61.93 
 
 
407 aa  503  1e-141  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.136519  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5342  S-adenosylmethionine synthetase  62.76 
 
 
399 aa  501  1e-141  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.339579  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1716  S-adenosylmethionine synthetase  61.95 
 
 
398 aa  499  1e-140  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.123594  hitchhiker  0.00797673 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1692  S-adenosylmethionine synthetase  62.11 
 
 
397 aa  500  1e-140  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.753186  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1869  S-adenosylmethionine synthetase  61.27 
 
 
408 aa  498  1e-140  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1857  S-adenosylmethionine synthetase  62.09 
 
 
399 aa  499  1e-140  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.41268  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1470  S-adenosylmethionine synthetase  64.34 
 
 
412 aa  499  1e-140  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0274097  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3729  S-adenosylmethionine synthetase  63.08 
 
 
408 aa  498  1e-140  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.582078  normal  0.310239 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0501  S-adenosylmethionine synthetase  62.9 
 
 
420 aa  499  1e-140  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0177  S-adenosylmethionine synthetase  62.82 
 
 
389 aa  499  1e-140  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.225729  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11421  S-adenosylmethionine synthetase  63.32 
 
 
403 aa  499  1e-140  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0291702  normal  0.38734 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1290  S-adenosylmethionine synthetase  62.28 
 
 
417 aa  499  1e-140  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.134908  normal  0.0680854 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1993  S-adenosylmethionine synthetase  62.92 
 
 
411 aa  498  1e-140  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000306332 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0753  Non-specific protein-tyrosine kinase  61.5 
 
 
384 aa  496  1e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2004  S-adenosylmethionine synthetase  60.57 
 
 
382 aa  496  1e-139  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1999  S-adenosylmethionine synthetase  60.57 
 
 
382 aa  496  1e-139  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3284  S-adenosylmethionine synthetase  61.5 
 
 
384 aa  496  1e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02735  hypothetical protein  61.5 
 
 
384 aa  496  1e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0873  S-adenosylmethionine synthetase  62.02 
 
 
383 aa  494  1e-139  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3252  S-adenosylmethionine synthetase  60.72 
 
 
384 aa  495  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0015174  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3354  S-adenosylmethionine synthetase  61.24 
 
 
383 aa  497  1e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2670  S-adenosylmethionine synthetase  63.04 
 
 
402 aa  495  1e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.178907  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>