117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2392 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2392  cell division topological specificity factor MinE  100 
 
 		 90 aa  177  4e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000829737  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2104  cell division topological specificity factor MinE  98.89 
 
 		 90 aa  175  2e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000684529  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2557  cell division topological specificity factor MinE  40.22 
 
 		 94 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000283914  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0094  cell division topological specificity factor MinE  39.08 
 
 		 94 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000217477  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2369  cell division topological specificity factor MinE  42.05 
 
 		 90 aa  70.1  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0155059  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21901  cell division topological specificity factor MinE  40.48 
 
 		 126 aa  68.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.892996 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3333  cell division topological specificity factor MinE  39.29 
 
 		 91 aa  67.8  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0369939  normal  0.713516 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0897  cell division topological specificity factor MinE  38.1 
 
 		 91 aa  67  0.00000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0560402  hitchhiker  0.00587681 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1460  cell division topological specificity factor MinE  38.46 
 
 		 89 aa  65.1  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.799074  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2128  cell division topological specificity factor MinE  36.78 
 
 		 91 aa  63.9  0.0000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000173264  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1204  cell division topological specificity factor MinE  34.07 
 
 		 94 aa  62.8  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1697  cell division topological specificity factor MinE  44.87 
 
 		 115 aa  62.4  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.743987  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04121  cell division topological specificity factor MinE  44.05 
 
 		 115 aa  62.4  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0552098  normal  0.388875 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0521  cell division topological specificity factor MinE  40.54 
 
 		 79 aa  62.4  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.617236  hitchhiker  0.000386475 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1307  cell division topological specificity factor MinE  43.42 
 
 		 100 aa  62  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000125469  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3384  cell division topological specificity factor MinE  36.59 
 
 		 95 aa  61.6  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.1316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1533  cell division topological specificity factor MinE  34.94 
 
 		 95 aa  60.8  0.000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.183546  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0543  cell division topological specificity factor MinE  35.23 
 
 		 98 aa  60.1  0.000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000190425  normal  0.758266 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0480  cell division topological specificity factor MinE  35.44 
 
 		 102 aa  59.3  0.00000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.689847  normal  0.84994 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2542  cell division topological specificity factor MinE  35.23 
 
 		 92 aa  60.1  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.958579  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0326  cell division topological specificity factor MinE  41.18 
 
 		 111 aa  59.3  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03461  cell division topological specificity factor MinE  41.18 
 
 		 111 aa  59.3  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03521  cell division topological specificity factor MinE  41.18 
 
 		 105 aa  58.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1258  cell division topological specificity factor MinE  36 
 
 		 121 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0812089  normal  0.744102 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1854  cell division topological specificity factor MinE  39.02 
 
 		 95 aa  58.2  0.00000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0713629  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03441  cell division topological specificity factor MinE  40 
 
 		 108 aa  57.8  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.61963  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03561  cell division topological specificity factor MinE  44.78 
 
 		 103 aa  57.8  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.217865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2769  cell division topological specificity factor MinE  33.73 
 
 		 96 aa  57  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.296613  normal  0.0661713 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3348  cell division topological specificity factor MinE  33.73 
 
 		 96 aa  57  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3479  cell division topological specificity factor MinE  37.33 
 
 		 97 aa  56.6  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0837361  normal  0.579917 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1282  cell division topological specificity factor MinE  33.73 
 
 		 92 aa  56.2  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0546704  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1994  cell division topological specificity factor MinE  37.33 
 
 		 100 aa  56.2  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.829432  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3018  cell division topological specificity factor MinE  40 
 
 		 97 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4345  cell division topological specificity factor MinE  29.63 
 
 		 91 aa  53.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000195585  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1635  septum site-determining protein  35.53 
 
 		 90 aa  52  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0732475  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1166  cell division topological specificity factor MinE  41.1 
 
 		 84 aa  51.2  0.000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000063438  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0345  septum site-determining protein  37.65 
 
 		 81 aa  50.4  0.000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0012  cell division topological specificity factor MinE  36.62 
 
 		 83 aa  50.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0291332 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0011  cell division topological specificity factor MinE  36.62 
 
 		 83 aa  50.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.982342  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3408  cell division topological specificity factor MinE  27.78 
 
 		 87 aa  48.9  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.350756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3506  cell division topological specificity factor MinE  36.23 
 
 		 86 aa  48.5  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0458207  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1732  cell division topological specificity factor MinE  39.39 
 
 		 84 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.656764  normal  0.252053 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3987  cell division topological specificity factor MinE  39.39 
 
 		 84 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.737747  normal  0.649102 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1324  cell division topological specificity factor MinE  39.39 
 
 		 84 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14180  cell division topological specificity factor MinE  33.33 
 
 		 79 aa  47.8  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.96332e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0277  cell division topological specificity factor MinE  34.25 
 
 		 85 aa  47.4  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.510649  normal  0.964016 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1553  cell division topological specificity factor MinE  30.77 
 
 		 74 aa  46.6  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.326791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1693  cell division topological specificity factor MinE  34.85 
 
 		 84 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.357465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1735  cell division topological specificity factor MinE  34.29 
 
 		 86 aa  46.6  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.89096  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1557  cell division topological specificity factor MinE  31.11 
 
 		 87 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2112  cell division topological specificity factor MinE  35.71 
 
 		 86 aa  46.2  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000181978  normal  0.32779 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0503  cell division topological specificity factor MinE  32.39 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.92083  normal  0.0267759 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1627  cell division topological specificity factor MinE  34.72 
 
 		 88 aa  45.4  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000660845  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2186  cell division topological specificity factor MinE  32.86 
 
 		 86 aa  45.8  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000316075  hitchhiker  0.0000219314 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3423  cell division topological specificity factor MinE  33.71 
 
 		 87 aa  46.2  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00102224  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1282  cell division topological specificity factor MinE  37.88 
 
 		 84 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.120256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1365  cell division topological specificity factor MinE  31.08 
 
 		 88 aa  46.2  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0506  septum formation topological specificity factor MinE  32.14 
 
 		 96 aa  45.4  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3343  cell division topological specificity factor MinE  30.99 
 
 		 84 aa  45.1  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3373  cell division topological specificity factor MinE  34.29 
 
 		 113 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1702  cell division topological specificity factor MinE  32.86 
 
 		 94 aa  44.7  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.378486 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1690  cell division topological specificity factor MinE  34.85 
 
 		 89 aa  44.7  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1689  cell division topological specificity factor MinE  34.85 
 
 		 89 aa  44.7  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22010  cell division topological specificity factor MinE  33.33 
 
 		 84 aa  43.9  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.609699  hitchhiker  0.0000000000271778 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1880  cell division topological specificity factor MinE  33.33 
 
 		 84 aa  43.9  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1398  cell division topological specificity factor MinE  26.19 
 
 		 80 aa  44.3  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000955334  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2883  cell division topological specificity factor MinE  34.62 
 
 		 94 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0034  cell division topological specificity factor MinE  36.49 
 
 		 86 aa  43.9  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.748014  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2578  cell division topological specificity factor MinE  31.43 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0065  cell division topological specificity factor MinE  33.33 
 
 		 92 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3343  cell division topological specificity factor MinE  33.78 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0607141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1866  cell division topological specificity factor MinE  31.43 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000116087  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1763  cell division topological specificity factor MinE  31.43 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000138663  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1893  cell division topological specificity factor MinE  31.43 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000138456  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2521  cell division topological specificity factor MinE  32.86 
 
 		 86 aa  43.5  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000024687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1900  cell division topological specificity factor MinE  31.43 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000310514  normal  0.522204 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1352  cell division topological specificity factor MinE  29.76 
 
 		 79 aa  42.7  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2426  cell division topological specificity factor MinE  31.43 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000106409  normal  0.0850311 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0634  cell division topological specificity factor MinE  35.48 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0371939 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3366  cell division topological specificity factor MinE  33.33 
 
 		 84 aa  42  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2304  cell division topological specificity factor MinE  33.33 
 
 		 84 aa  42  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3423  cell division topological specificity factor MinE  31.94 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2175  cell division topological specificity factor MinE  31.43 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000703577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2252  cell division topological specificity factor MinE  31.43 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000226469  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6588  cell division topological specificity factor MinE  27.54 
 
 		 86 aa  42  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.898114  hitchhiker  0.00722875 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2384  cell division topological specificity factor MinE  31.43 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000014177  normal  0.288717 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28147  predicted protein  26.83 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.908244  decreased coverage  0.00612417 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1233  cell division topological specificity factor MinE  33.33 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.236843  normal  0.296312 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2446  cell division topological specificity factor MinE  30 
 
 		 86 aa  42.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000625931  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5652  cell division topological specificity factor MinE  30.3 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.375925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1996  cell division topological specificity factor MinE  29.35 
 
 		 94 aa  42  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0870829  normal  0.302162 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1934  cell division topological specificity factor MinE  34.72 
 
 		 85 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2414  cell division topological specificity factor MinE  31.94 
 
 		 84 aa  42  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0869  cell division topological specificity factor MinE  32.35 
 
 		 79 aa  42  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3874  cell division topological specificity factor MinE  33.33 
 
 		 84 aa  41.2  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0810055  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1611  cell division topological specificity factor MinE  33.33 
 
 		 84 aa  41.2  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0333182  normal  0.209596 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4342  cell division topological specificity factor MinE  30 
 
 		 87 aa  41.6  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.302634 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2111  cell division topological specificity factor MinE  31.94 
 
 		 84 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0702094  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1571  cell division topological specificity factor MinE  31.94 
 
 		 84 aa  41.2  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2633  cell division topological specificity factor MinE  31.94 
 
 		 84 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>