201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2333 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2333  alpha-glucosidase  100 
 
 
746 aa  1536    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0006  Alpha-glucosidase  43.22 
 
 
752 aa  592  1e-167  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19090  Alpha-glucosidase  41.4 
 
 
801 aa  553  1e-156  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00110521  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0171  Alpha-glucosidase  39.34 
 
 
777 aa  533  1e-150  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1729  alpha-glucosidase  36.86 
 
 
792 aa  523  1e-147  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1017  Alpha-glucosidase  39.77 
 
 
768 aa  508  9.999999999999999e-143  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0362727  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2868  Alpha-glucosidase  37.43 
 
 
779 aa  503  1e-141  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3309  Alpha-glucosidase  38.01 
 
 
821 aa  504  1e-141  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.154266 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3099  Alpha-glucosidase  38.92 
 
 
797 aa  502  1e-141  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.109594 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0650  Alpha-glucosidase  38.99 
 
 
776 aa  502  1e-141  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.379007  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2746  Alpha-glucosidase  35.94 
 
 
799 aa  490  1e-137  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.441472  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1683  Alpha-glucosidase  38.87 
 
 
779 aa  488  1e-136  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0803  a-glucosidase  39.15 
 
 
794 aa  484  1e-135  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00272657 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2099  Alpha-glucosidase  41.88 
 
 
803 aa  478  1e-133  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0521  Alpha-glucosidase  34.81 
 
 
779 aa  473  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0650  Alpha-glucosidase  36.5 
 
 
828 aa  475  1e-132  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.178818  normal  0.195512 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2545  Alpha-glucosidase  34.42 
 
 
785 aa  468  9.999999999999999e-131  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000167108  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4015  Alpha-glucosidase  35.58 
 
 
845 aa  464  1e-129  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1108  Alpha-glucosidase  35.82 
 
 
728 aa  421  1e-116  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.910405  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3837  Alpha-glucosidase  34.02 
 
 
828 aa  416  9.999999999999999e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.452643  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3324  Alpha-glucosidase  32.6 
 
 
825 aa  415  1e-114  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000336077 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2087  Alpha-glucosidase  37.35 
 
 
762 aa  413  1e-114  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.290545  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1692  Alpha-glucosidase  39.52 
 
 
743 aa  416  1e-114  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.90141  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_429  predicted protein  37.73 
 
 
815 aa  399  1e-109  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0318632  normal  0.136701 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1870  Alpha-glucosidase  34.27 
 
 
798 aa  389  1e-106  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.785633  normal  0.641991 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1611  Alpha-glucosidase  35.36 
 
 
702 aa  383  1e-105  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0369575  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2648  glycosy hydrolase family protein  32.48 
 
 
715 aa  376  1e-103  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0704  Alpha-glucosidase  36.53 
 
 
770 aa  373  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2334  alpha-glucosidase  32.33 
 
 
715 aa  374  1e-102  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4430  Alpha-glucosidase  31.94 
 
 
836 aa  373  1e-102  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121046  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1902  Alpha-glucosidase  33.11 
 
 
806 aa  359  9.999999999999999e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000358831 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0015  Alpha-glucosidase  34.58 
 
 
816 aa  357  3.9999999999999996e-97  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3785  Alpha-glucosidase  31.91 
 
 
692 aa  349  1e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.681439  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1570  Alpha-glucosidase  33.99 
 
 
715 aa  346  1e-93  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0793  Alpha-glucosidase  30.45 
 
 
700 aa  330  6e-89  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11054  alpha glucosidase II, alpha subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03500)  32.76 
 
 
952 aa  309  1.0000000000000001e-82  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.464256  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85073  glucosidase II  32.26 
 
 
911 aa  306  9.000000000000001e-82  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2781  glycoside hydrolase family protein  31.8 
 
 
799 aa  301  3e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.413294  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0911  Alpha-glucosidase  30.69 
 
 
661 aa  298  2e-79  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.22141  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1628  Alpha-glucosidase  30.62 
 
 
656 aa  292  2e-77  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.301391 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2338  Alpha-glucosidase  26.16 
 
 
839 aa  290  6e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.185932  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2044  Alpha-glucosidase  30.58 
 
 
685 aa  290  6e-77  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1013  glycoside hydrolase family 31  32.25 
 
 
803 aa  290  8e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.36394  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_50836  alpha subunit of glucosidase  30.68 
 
 
712 aa  289  1e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.312978  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1081  glucosidase protein  31.81 
 
 
803 aa  286  1.0000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00242883  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0948  glycoside hydrolase family 31  32.03 
 
 
803 aa  285  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0874171 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0917  Alpha-glucosidase  27.98 
 
 
683 aa  281  3e-74  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05150  alpha glucosidase, putative  31.13 
 
 
956 aa  277  5e-73  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.133027  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1794  Alpha-glucosidase  28.95 
 
 
687 aa  274  4.0000000000000004e-72  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.761488  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1872  Alpha-glucosidase  27.97 
 
 
806 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00900175  normal  0.24419 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03521  conserved hypothetical protein  29.94 
 
 
795 aa  271  4e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03472  hypothetical protein  29.94 
 
 
795 aa  271  4e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1312  glucan 1,3-alpha-glucosidase  29.61 
 
 
787 aa  270  8.999999999999999e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3358  Alpha-glucosidase  30.31 
 
 
806 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.032039  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0623  alpha-xylosidase YicI  29.97 
 
 
764 aa  266  8e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2352  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  28.17 
 
 
788 aa  266  8.999999999999999e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03950  glycosyl hydrolase, family 31  26.33 
 
 
821 aa  266  1e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2416  alpha-glucosidase  26.4 
 
 
760 aa  266  1e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4208  glycoside hydrolase family protein  28 
 
 
806 aa  265  3e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0739255  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4158  glycoside hydrolase family protein  28 
 
 
806 aa  265  3e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00315991 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3127  glycoside hydrolase family protein  29.84 
 
 
813 aa  265  3e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0609  alpha-xylosidase YicI  29.78 
 
 
764 aa  265  3e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.283089  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4047  glycoside hydrolase family protein  30.42 
 
 
806 aa  263  6e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.175314 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3217  Alpha-glucosidase  29.37 
 
 
821 aa  262  1e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0977  Alpha-glucosidase  28.74 
 
 
791 aa  262  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0924  glycosy hydrolase family protein  28.74 
 
 
791 aa  262  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1612  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  29.05 
 
 
788 aa  261  3e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0320  alpha-xylosidase YicI  29.86 
 
 
775 aa  260  7e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0983  glycosy hydrolase family protein  25.76 
 
 
836 aa  260  7e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1643  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  28.01 
 
 
791 aa  259  1e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2626  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  28.66 
 
 
788 aa  258  2e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3360  glycosy hydrolase family protein  28.64 
 
 
789 aa  258  2e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3565  Alpha-glucosidase  30.1 
 
 
806 aa  257  5e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00443283  normal  0.722523 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3598  Alpha-glucosidase  28.25 
 
 
790 aa  255  3e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000274  normal  0.390231 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2887  alpha-xylosidase YicI  28.78 
 
 
779 aa  254  3e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3867  Alpha-glucosidase  28.99 
 
 
784 aa  253  1e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.191857 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1244  alpha-xylosidase YicI  30.59 
 
 
712 aa  250  6e-65  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.669712  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0387  Alpha-glucosidase  28.38 
 
 
806 aa  246  9e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.44264 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4927  glycoside hydrolase family 31  28.8 
 
 
777 aa  246  1.9999999999999999e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606594  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2986  alpha-xylosidase YicI  27.75 
 
 
749 aa  244  6e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391132  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0218  alpha-xylosidase YicI  29.37 
 
 
780 aa  243  7e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01510  alpha-xylosidase YicI  28.52 
 
 
681 aa  243  1e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10130  family 31 glycosyl hydrolase, alpha-glucosidase  28.14 
 
 
766 aa  241  2.9999999999999997e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0724432  normal  0.362992 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1323  alpha-xylosidase YicI  28.26 
 
 
760 aa  241  4e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2057  alpha-xylosidase YicI  27.05 
 
 
772 aa  240  9e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1288  Alpha-glucosidase  27.82 
 
 
765 aa  238  3e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07505  Alpha-xylosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AW25]  27.57 
 
 
780 aa  237  5.0000000000000005e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.763241  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0898  Alpha-glucosidase  26 
 
 
783 aa  235  2.0000000000000002e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.532752  normal  0.374184 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0490  glycoside hydrolase family 31  27.29 
 
 
757 aa  233  1e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0778  glycoside hydrolase family protein  30.61 
 
 
799 aa  233  1e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03670  glycoside hydrolase family 31  28.74 
 
 
1024 aa  233  1e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.510709  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1613  putative alpha-glucosidase  26.63 
 
 
765 aa  232  2e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0503092  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2455  alpha-xylosidase YicI  26.35 
 
 
770 aa  232  2e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.623882  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl317  alpha glucosidase/alpha-xylosidase  26.8 
 
 
752 aa  231  5e-59  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000639186  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1194  glycoside hydrolase family 31  27.88 
 
 
804 aa  230  6e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0413  alpha-xylosidase YicI  26.3 
 
 
763 aa  229  2e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09480  glycoside hydrolase family 31  30.34 
 
 
840 aa  229  2e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000232453  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4624  Alpha-glucosidase  26.98 
 
 
1025 aa  228  4e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2861  glycoside hydrolase family protein  28.68 
 
 
695 aa  228  5.0000000000000005e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0071  alpha-xylosidase YicI  26.53 
 
 
772 aa  226  2e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.290357  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>