More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2308 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2308  ATP-dependent protease  100 
 
 		 761 aa  1503    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2023  ATP-dependent protease  94.09 
 
 		 761 aa  1402    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1517  peptidase S16, lon domain-containing protein  30.54 
 
 		 813 aa  371  1e-101  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.30513  normal  0.334171 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1543  peptidase S16, lon domain-containing protein  31.54 
 
 		 865 aa  365  2e-99  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1662  peptidase S16 lon domain-containing protein  31.97 
 
 		 788 aa  363  6e-99  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1773  peptidase S16, lon-like protein  31.75 
 
 		 814 aa  363  9e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0298  ATP-dependent protease, putative  30.54 
 
 		 799 aa  360  8e-98  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242114 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2309  peptidase S16 lon domain protein  31.2 
 
 		 817 aa  355  1e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1519  peptidase S16, lon-like protein  31.48 
 
 		 787 aa  352  1e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0802  peptidase S16, lon-like protein  30.99 
 
 		 801 aa  352  1e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0263  hypothetical protein  31.89 
 
 		 786 aa  352  1e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0823  peptidase S16 lon domain protein  28.9 
 
 		 813 aa  352  1e-95  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.112551  normal  0.517782 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03380  peptidase S16 lon domain protein  29.65 
 
 		 810 aa  352  2e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1297  peptidase S16, lon domain-containing protein  31.79 
 
 		 786 aa  350  7e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000625582  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0319  peptidase S16, lon domain-containing protein  32.89 
 
 		 783 aa  350  7e-95  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0177  peptidase S16 lon domain protein  30.78 
 
 		 818 aa  348  2e-94  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.16877  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0925  ATP-dependent protease  32.1 
 
 		 786 aa  348  3e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.819231  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2079  peptidase S16, lon domain-containing protein  29.51 
 
 		 802 aa  347  6e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001230  ATP-dependent protease La Type II  31.15 
 
 		 786 aa  346  7e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2123  peptidase S16 lon domain protein  32.07 
 
 		 809 aa  344  2.9999999999999997e-93  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00311978 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1359  peptidase S16, lon domain-containing protein  30.01 
 
 		 807 aa  344  4e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1929  ATP-dependent protease, putative  30.7 
 
 		 803 aa  342  1e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.355621  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05096  ATP-dependent protease  30.93 
 
 		 786 aa  342  2e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2347  peptidase S16, lon domain-containing protein  30.19 
 
 		 805 aa  338  2.9999999999999997e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1270  peptidase S16, lon domain-containing protein  31.12 
 
 		 805 aa  337  5.999999999999999e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2430  ATP-dependent protease, putative  29.82 
 
 		 798 aa  336  9e-91  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2088  peptidase S16 lon domain protein  30.73 
 
 		 803 aa  333  8e-90  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0840  putative Lon protease  29.88 
 
 		 777 aa  332  1e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1020  ATP-dependent protease  29.66 
 
 		 803 aa  332  1e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3103  peptidase S16, lon-like protein  30.19 
 
 		 810 aa  331  3e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3006  ATP-dependent protease-like protein  28.17 
 
 		 815 aa  330  6e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2719  peptidase S16, lon domain-containing protein  30.76 
 
 		 810 aa  327  3e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.220264  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2107  peptidase S16 lon domain-containing protein  30.42 
 
 		 806 aa  328  3e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.801534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1037  peptidase S16 lon domain protein  32.7 
 
 		 774 aa  328  3e-88  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.350098  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1717  peptidase S16, lon domain-containing protein  27.73 
 
 		 801 aa  327  4.0000000000000003e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1160  ATP-dependent protease, putative  30.55 
 
 		 805 aa  327  4.0000000000000003e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0787  ATP-dependent protease  28.98 
 
 		 861 aa  327  5e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.202315  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1159  ATP-dependent protease, putative  30.41 
 
 		 805 aa  327  5e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2793  ATP-dependent protease, putative  28.49 
 
 		 814 aa  326  8.000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281078  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3391  ATP-dependent protease, putative  30.73 
 
 		 806 aa  325  1e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1328  peptidase S16 lon domain-containing protein  30.04 
 
 		 805 aa  325  2e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.047879 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1920  peptidase S16 lon domain protein  30.65 
 
 		 808 aa  325  2e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1230  peptidase S16, lon domain-containing protein  30.27 
 
 		 805 aa  325  2e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.813888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0259  peptidase S16 lon domain protein  29.14 
 
 		 832 aa  325  3e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1294  peptidase S16, lon domain-containing protein  29.9 
 
 		 805 aa  323  5e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.506125  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0928  peptidase S16, lon domain-containing protein  31.34 
 
 		 794 aa  323  6e-87  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00182033  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3060  peptidase S16, lon domain protein  29.9 
 
 		 805 aa  323  7e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0329616  hitchhiker  0.000400818 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0981  peptidase S16 lon domain protein  28.77 
 
 		 831 aa  322  1.9999999999999998e-86  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000165888  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1250  peptidase S16, lon domain-containing protein  29.77 
 
 		 805 aa  321  3e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2463  peptidase S16 lon domain-containing protein  27.88 
 
 		 816 aa  321  3.9999999999999996e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.572002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1417  peptidase S16 lon domain protein  28.77 
 
 		 819 aa  320  6e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.185581  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1976  putative ATP-dependent protease La-relatedprotein  28.16 
 
 		 800 aa  318  2e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000551631  normal  0.8017 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0950  peptidase S16 lon domain-containing protein  31.08 
 
 		 794 aa  318  2e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0853  ATP-dependent protease, putative  28.25 
 
 		 844 aa  318  3e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.105216  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0720  peptidase S16, lon domain protein  28.87 
 
 		 819 aa  317  6e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.59212e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0708  peptidase S16, lon domain protein  29.01 
 
 		 819 aa  316  9e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3051  peptidase S16 lon domain protein  27.89 
 
 		 825 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0740  peptidase S16 lon domain-containing protein  28.18 
 
 		 843 aa  315  1.9999999999999998e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.493577 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1270  peptidase S16, lon domain-containing protein  28.42 
 
 		 806 aa  314  2.9999999999999996e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.347497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0831  ATP-dependent protease, putative  27.41 
 
 		 811 aa  312  1e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.726223  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2406  ATP-dependent protease, putative  29.97 
 
 		 791 aa  312  1e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2746  peptidase S16, lon-like  28.33 
 
 		 811 aa  311  2e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000135674  normal  0.815417 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2181  putative ATP-dependent protease La-relatedprotein  28.61 
 
 		 795 aa  310  5.9999999999999995e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2007  ATP-dependent protease, putative  29.52 
 
 		 829 aa  307  5.0000000000000004e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.303021  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3407  peptidase S16 lon domain protein  28.67 
 
 		 806 aa  306  7e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.025789  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3069  ATP-dependent protease, putative  29.13 
 
 		 813 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0590  ATP-dependent protease, putative  27.4 
 
 		 811 aa  305  3.0000000000000004e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0118699 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1447  ATP-dependent protease, putative  27.22 
 
 		 806 aa  303  8.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2449  peptidase S16 lon domain protein  27.07 
 
 		 809 aa  301  2e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.849825  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2180  putative ATP-dependent protease La-relatedprotein  27.45 
 
 		 807 aa  301  3e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2626  ATP-dependent protease, putative  28.65 
 
 		 803 aa  301  4e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000239913  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0312  peptidase S16 lon domain protein  28.45 
 
 		 873 aa  300  5e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.345035 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4505  ATP-dependent protease  28.01 
 
 		 812 aa  299  1e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.552319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01670  putative ATP-dependent protease  27.92 
 
 		 798 aa  299  2e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1567  peptidase S16, lon-like  28.18 
 
 		 795 aa  298  4e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.617903  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1200  ATP-dependent protease-like protein  27.85 
 
 		 829 aa  297  5e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000280038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1607  peptidase S16, lon domain-containing protein  27.98 
 
 		 815 aa  297  5e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0680  ATP-dependent protease, putative  26.34 
 
 		 812 aa  297  6e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0697551  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2600  ATP-dependent protease, putative  26.92 
 
 		 784 aa  297  6e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.863094  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0711  ATP-dependent protease-like protein  26.34 
 
 		 812 aa  297  6e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.807483  normal  0.0469717 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0712  peptidase S16 lon domain-containing protein  26.21 
 
 		 812 aa  296  9e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0968919  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40850  ATP-dependent protease  28.75 
 
 		 806 aa  295  3e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.887392  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60550  putative ATP-dependent protease  28.21 
 
 		 817 aa  294  4e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000190138  normal  0.722449 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5216  putative ATP-dependent protease  28.21 
 
 		 817 aa  294  5e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0128241  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1288  peptidase S16 lon domain protein  26.25 
 
 		 811 aa  293  1e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0020  ATP-dependent protease, putative  27.9 
 
 		 823 aa  292  1e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.140592  normal  0.225222 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2433  ATP-dependent protease, putative  27.96 
 
 		 821 aa  291  3e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1724  putative ATP-dependent protease LA  27.58 
 
 		 802 aa  290  6e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4869  ATP-dependent protease, putative  27.21 
 
 		 812 aa  289  2e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4259  ATP-dependent protease, putative  28.53 
 
 		 811 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4585  ATP-dependent protease, putative  28.07 
 
 		 811 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.560792  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0220  peptidase S16 lon domain-containing protein  31.36 
 
 		 790 aa  284  5.000000000000001e-75  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.229141  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2264  putative ATP-dependent protease  26.91 
 
 		 827 aa  284  5.000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.412132 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2798  peptidase S16 lon domain protein  28.37 
 
 		 811 aa  278  4e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00224654  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0676  putative ATP-dependent protease LA, putative  25.28 
 
 		 810 aa  269  2e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3315  putative ATP-dependent protease La, putative  27.56 
 
 		 806 aa  267  5e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0350  peptidase S16 lon domain-containing protein  28.27 
 
 		 722 aa  263  6.999999999999999e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0955  ATP-dependent protease, putative  24.93 
 
 		 797 aa  260  7e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.099615  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1056  peptidase S16, lon-like  27.31 
 
 		 975 aa  259  2e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1322  hypothetical protein  27.06 
 
 		 951 aa  256  1.0000000000000001e-66  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>