More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2215 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2215  GTP binding protein  100 
 
 		 597 aa  1197    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.192025  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1927  GTP binding protein  99.33 
 
 		 597 aa  1191    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2081  small GTP-binding protein  45.39 
 
 		 582 aa  432  1e-119  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00812611  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0178  GTP-binding proten HflX  42.03 
 
 		 596 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.22171  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1689  GTP1/OBG protein  45.15 
 
 		 419 aa  330  4e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1872  GTP-binding protein  44.94 
 
 		 419 aa  329  7e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000726379 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1674  GTP-binding protein  44.71 
 
 		 419 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.887073  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1441  small GTP-binding protein  48.47 
 
 		 413 aa  327  3e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1650  GTP-binding protein  44.71 
 
 		 419 aa  327  3e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101149  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1951  GTP-binding protein  44.71 
 
 		 419 aa  327  6e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.697887  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1835  GTP-binding protein  44.47 
 
 		 419 aa  326  7e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1693  GTP-binding protein  44.47 
 
 		 419 aa  326  9e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.78132  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1828  GTP-binding protein  44.47 
 
 		 419 aa  326  9e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.990495  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1434  GTP-binding protein HSR1-related  45.43 
 
 		 419 aa  325  1e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3508  GTP-binding protein  44.24 
 
 		 419 aa  325  1e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  40.9 
 
 		 441 aa  320  7e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3241  GTP-binding proten HflX  37.72 
 
 		 553 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.300166  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3981  GTP-binding proten HflX  44.66 
 
 		 487 aa  313  5.999999999999999e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0693971  normal  0.0467716 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1916  GTP-binding protein  45.62 
 
 		 401 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.328695  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1259  GTP-binding protein, HSR1-related  47.7 
 
 		 421 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027448  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0005  GTP-binding protein HSR1-related  37.37 
 
 		 565 aa  306  5.0000000000000004e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0820  small GTP-binding protein domain-containing protein  42.33 
 
 		 493 aa  304  3.0000000000000004e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2262  GTP-binding proten HflX  45.19 
 
 		 435 aa  304  3.0000000000000004e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2006  GTP-binding protein, HSR1-related  37.66 
 
 		 569 aa  303  6.000000000000001e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0534  GTP-binding proten HflX  46.23 
 
 		 420 aa  302  1e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000187355  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27610  GTP-binding proten HflX  42.99 
 
 		 482 aa  300  4e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2724  GTP-binding proten HflX  39.29 
 
 		 530 aa  299  1e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1110  GTP-binding protein, HSR1-related  44.18 
 
 		 422 aa  299  1e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000612987  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  44.31 
 
 		 442 aa  297  3e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11140  small GTP-binding protein  46.12 
 
 		 395 aa  297  5e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0275  GTP-binding proten HflX  37.15 
 
 		 564 aa  295  1e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1687  GTP-binding proten HflX  37.33 
 
 		 560 aa  294  3e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.176029  normal  0.381169 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0275  GTP-binding proten HflX  36.97 
 
 		 564 aa  293  6e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7080  GTP-binding proten HflX  42.66 
 
 		 502 aa  293  8e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.750227 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1051  GTP-binding proten HflX  40.47 
 
 		 509 aa  292  1e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.128813 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3097  GTP-binding proten HflX  41.57 
 
 		 461 aa  291  2e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000356343  normal  0.400149 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1231  small GTP-binding protein  43.6 
 
 		 503 aa  291  2e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.592117  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2747  GTP-binding proten HflX  43.48 
 
 		 419 aa  291  3e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000303435  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1612  GTP-binding proten HflX  40.37 
 
 		 436 aa  291  3e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000211402  unclonable  5.44053e-16 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2258  GTP-binding proten HflX  37.32 
 
 		 555 aa  290  5.0000000000000004e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.32021 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4208  GTP-binding protein, HSR1-related  35.92 
 
 		 574 aa  290  7e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.552873 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1906  GTP-binding proten HflX  35.02 
 
 		 583 aa  288  1e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0772  GTP-binding proten HflX  42.69 
 
 		 437 aa  286  5e-76  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.426006  normal  0.338027 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2283  GTP-binding proten HflX  34.05 
 
 		 549 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2926  GTP1/OBG protein  41.31 
 
 		 444 aa  284  3.0000000000000004e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0180067  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0811  GTP-binding proten HflX  42.03 
 
 		 509 aa  284  3.0000000000000004e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000455725  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10600  GTP-binding proten HflX  42.28 
 
 		 521 aa  284  4.0000000000000003e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.697427  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3611  GTP-binding proten HflX  44.26 
 
 		 414 aa  284  4.0000000000000003e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0108116  normal  0.379187 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0879  GTP-binding proten HflX  34.47 
 
 		 561 aa  283  5.000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2043  GTP-binding protein  40.18 
 
 		 547 aa  280  4e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000980367  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1212  GTP-binding protein HflX  46.27 
 
 		 412 aa  280  6e-74  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0010  hypothetical protein  42.05 
 
 		 414 aa  280  7e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0010  hypothetical protein  42.05 
 
 		 414 aa  279  8e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3023  GTP-binding proten HflX  37.36 
 
 		 540 aa  279  8e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23070  GTP-binding proten HflX  41.94 
 
 		 515 aa  279  8e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0748737 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1140  GTP-binding proten HflX  43.57 
 
 		 501 aa  278  1e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.762868 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1174  GTP-binding protein HflX  42.41 
 
 		 431 aa  278  1e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.929711  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3269  GTP-binding proten HflX  42.56 
 
 		 485 aa  278  1e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000617793  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3905  GTP-binding proten HflX  42.99 
 
 		 512 aa  278  2e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.13556  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1355  GTP-binding protein HflX  40.84 
 
 		 435 aa  278  2e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00093  putative GTPase HflX  42.2 
 
 		 429 aa  277  3e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0970  GTP-binding proten HflX  41.02 
 
 		 433 aa  278  3e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3511  small GTP-binding protein domain-containing protein  42.13 
 
 		 486 aa  277  4e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.67992  normal  0.0915245 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1800  GTP-binding proten HflX  41.35 
 
 		 479 aa  276  6e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2759  putative GTPase HflX  43.52 
 
 		 429 aa  276  1.0000000000000001e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.563886  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0396  GTP-binding protein, HSR1-related  41.13 
 
 		 489 aa  275  1.0000000000000001e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10790  GTP-binding proten HflX  40.86 
 
 		 433 aa  276  1.0000000000000001e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000931239  unclonable  0.00000000274038 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1834  GTP-binding protein, HSR1-related  36.76 
 
 		 528 aa  275  2.0000000000000002e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0376  GTP-binding protein HflX  39.16 
 
 		 490 aa  275  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002260  GTP-binding protein HflX  41.95 
 
 		 429 aa  274  3e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0355  GTP - binding protein, phage lambda cII repressor  41.13 
 
 		 489 aa  274  3e-72  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3310  GTP-binding protein, HSR1-related  41.22 
 
 		 435 aa  274  3e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2436  GTP-binding proten HflX  42.89 
 
 		 493 aa  274  4.0000000000000004e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.292704  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1731  GTP-binding proten HflX  40.89 
 
 		 434 aa  273  5.000000000000001e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3979  GTP-binding protein, HSR1-related  40.98 
 
 		 432 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0203  GTP-binding protein, HSR1-related  37.72 
 
 		 608 aa  273  6e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2215  GTP-binding proten HflX  41.13 
 
 		 484 aa  273  9e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.166526  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0227  GTP-binding proten HflX  37.72 
 
 		 607 aa  272  1e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.160426  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0216  GTP-binding proten HflX  37.72 
 
 		 607 aa  272  1e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17490  GTP-binding proten HflX  40.82 
 
 		 517 aa  271  2e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.106124  normal  0.236778 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0559  GTP-binding protein, HSR1-related  41.42 
 
 		 435 aa  271  2e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00128459  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3709  GTP-binding proten HflX  41.67 
 
 		 435 aa  271  2e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.153718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3766  GTP-binding protein HSR1-related  41.42 
 
 		 435 aa  271  2e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000736905  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3892  GTP-binding proten HflX  41.67 
 
 		 435 aa  271  2e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.030857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1506  GTP-binding proten HflX  40.54 
 
 		 433 aa  271  2.9999999999999997e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00115562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1195  GTP-binding protein  46.48 
 
 		 412 aa  271  2.9999999999999997e-71  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00118595  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3539  small GTP-binding protein  40.49 
 
 		 431 aa  270  4e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0887499  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0905  small GTP-binding protein  36.62 
 
 		 546 aa  270  5e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2012  GTP-binding proten HflX  42.11 
 
 		 440 aa  270  5.9999999999999995e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1628  GTP-binding protein, HSR1-related  39.11 
 
 		 425 aa  270  7e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3183  small GTP-binding protein  36.13 
 
 		 532 aa  269  8.999999999999999e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1922  GTPase  46.04 
 
 		 375 aa  269  1e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.321489  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1466  small GTP-binding protein  42.58 
 
 		 522 aa  269  1e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00807526  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0410  GTP-binding protein HflX  45.74 
 
 		 420 aa  269  1e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1255  GTP-binding proten HflX  41.58 
 
 		 515 aa  268  2e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4759  putative GTPase HflX  40.63 
 
 		 426 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3024  GTP-binding protein HflX  41.03 
 
 		 435 aa  268  2e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000099061  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0326  GTP-binding protein HflX  39.86 
 
 		 428 aa  268  2.9999999999999995e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2263  GTP-binding family protein ; K03665 GTP-binding protein HflX  42.62 
 
 		 494 aa  267  2.9999999999999995e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0586252 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12738  GTP-binding protein hflX  42.53 
 
 		 495 aa  268  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.324868 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>