237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2211 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2211  hypothetical protein  100 
 
 
217 aa  443  1e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1923  hypothetical protein  97.24 
 
 
217 aa  385  1e-106  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4991  hypothetical protein  42.92 
 
 
211 aa  167  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5363  conserved hypothetical protein TIGR00257  43.06 
 
 
211 aa  166  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5318  conserved hypothetical protein TIGR00257  42.45 
 
 
211 aa  167  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5305  hypothetical protein  43.06 
 
 
211 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5046  hypothetical protein  43.4 
 
 
211 aa  165  4e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4876  hypothetical protein  43.4 
 
 
211 aa  166  4e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4891  hypothetical protein  43.4 
 
 
211 aa  166  4e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5431  hypothetical protein  43.4 
 
 
211 aa  165  4e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5287  conserved hypothetical protein TIGR00257  43.4 
 
 
211 aa  166  4e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000948336 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3734  hypothetical protein  42.21 
 
 
212 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3045  protein of unknown function UPF0029  44.27 
 
 
211 aa  164  9e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0019281  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5641  hypothetical protein TIGR00257  41.98 
 
 
211 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.989891  hitchhiker  0.000000000000266179 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1191  hypothetical protein  44.21 
 
 
211 aa  161  7e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.952586  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3242  protein of unknown function UPF0029  42.71 
 
 
213 aa  161  9e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0134  protein of unknown function UPF0029  43.52 
 
 
207 aa  160  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000670968  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0180  protein of unknown function UPF0029  46.39 
 
 
216 aa  159  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.190284  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1444  hypothetical protein  45.96 
 
 
216 aa  159  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0813  protein of unknown function UPF0029  40.1 
 
 
206 aa  157  1e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0467204  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0415  hypothetical protein  44.97 
 
 
213 aa  156  2e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2757  hypothetical protein  40.31 
 
 
213 aa  155  3e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2078  hypothetical protein  48.13 
 
 
219 aa  155  4e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0361  hypothetical protein  43.48 
 
 
210 aa  153  2e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5502  protein of unknown function UPF0029  38.95 
 
 
209 aa  150  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0405  hypothetical protein  42.05 
 
 
208 aa  149  3e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0246  hypothetical protein  43.93 
 
 
211 aa  148  6e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0335  hypothetical protein  40.7 
 
 
214 aa  144  8.000000000000001e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0268  protein of unknown function UPF0029  40.82 
 
 
225 aa  144  1e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1335  hypothetical protein  38.25 
 
 
221 aa  142  5e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000275512  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0499  hypothetical protein  44.12 
 
 
218 aa  141  8e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000766856  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1076  protein of unknown function UPF0029  38.33 
 
 
192 aa  129  2.0000000000000002e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1318  hypothetical protein  36.79 
 
 
212 aa  129  2.0000000000000002e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0492765  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4048  hypothetical protein  33.82 
 
 
209 aa  129  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173399  decreased coverage  0.000882934 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3669  protein of unknown function UPF0029  38.89 
 
 
192 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253627  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0789  hypothetical protein  45.03 
 
 
213 aa  128  8.000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0502356  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0772  hypothetical protein  45.03 
 
 
213 aa  128  8.000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.540579  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0314  hypothetical protein  39.06 
 
 
205 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.55405 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0533  hypothetical protein  38.02 
 
 
205 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.00814053  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1211  protein of unknown function UPF0029  42.19 
 
 
212 aa  125  5e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00461  hypothetical protein  36.76 
 
 
207 aa  124  9e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0023  hypothetical protein  35.6 
 
 
198 aa  124  1e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.132491  normal  0.0840592 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2975  hypothetical protein  40.22 
 
 
204 aa  124  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00800  hypothetical protein  42.05 
 
 
219 aa  121  7e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.438932  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0030  hypothetical protein  34.04 
 
 
198 aa  120  9.999999999999999e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000164661  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1450  hypothetical protein  35.23 
 
 
198 aa  119  3e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1280  protein of unknown function UPF0029  36.46 
 
 
214 aa  119  3e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.313223  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001987  hypothetical protein  37.69 
 
 
207 aa  118  6e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03138  hypothetical protein  33.85 
 
 
206 aa  118  7.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2192  hypothetical protein  35.43 
 
 
198 aa  117  9.999999999999999e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3848  hypothetical protein  33.85 
 
 
290 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.128299  normal  0.727016 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl056  putative proline dipeptidase  40.78 
 
 
232 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1690  hypothetical protein  40.31 
 
 
213 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1598  hypothetical protein  38.02 
 
 
205 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00000000468439  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0111  protein of unknown function UPF0029  34.86 
 
 
216 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0084  protein of unknown function UPF0029  30 
 
 
212 aa  116  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0733  hypothetical protein  35.64 
 
 
212 aa  115  5e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000337539  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1632  protein of unknown function UPF0029  35.96 
 
 
201 aa  115  6e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2244  hypothetical protein  32.47 
 
 
194 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891523  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0035  hypothetical protein  37.21 
 
 
198 aa  114  7.999999999999999e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127558  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2969  hypothetical protein  32.32 
 
 
200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6009  protein of unknown function UPF0029  32.63 
 
 
239 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.69631 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2511  hypothetical protein  35.14 
 
 
203 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1690  hypothetical protein  38.1 
 
 
172 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.296344  normal  0.209957 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8747  predicted protein  34.81 
 
 
190 aa  113  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.336863  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0383  hypothetical protein  45.31 
 
 
208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.46169  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11160  conserved hypothetical protein TIGR00257  39.44 
 
 
233 aa  113  2.0000000000000002e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.9655  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1413  hypothetical protein  37.65 
 
 
205 aa  112  3e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.533633  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1310  hypothetical protein  36.7 
 
 
205 aa  113  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00619746  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2223  protein of unknown function UPF0029  38.65 
 
 
200 aa  113  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.238524  normal  0.0468847 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2729  hypothetical protein  39.09 
 
 
206 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0124  hypothetical protein  36.26 
 
 
206 aa  112  5e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000265032 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5111  hypothetical protein  31.12 
 
 
213 aa  112  6e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.335458  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1183  hypothetical protein  41.22 
 
 
200 aa  111  8.000000000000001e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.895174  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0249  uncharacterized protein, YigZ family  37.31 
 
 
222 aa  111  9e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0004  protein of unknown function UPF0029  31.19 
 
 
210 aa  111  9e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.528127 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2179  protein of unknown function UPF0029  34.44 
 
 
204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.509167  normal  0.553697 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06100  conserved hypothetical protein TIGR00257  30.3 
 
 
210 aa  111  1.0000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1725  protein of unknown function UPF0029  31.53 
 
 
204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1241  hypothetical protein  40.79 
 
 
197 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2225  protein of unknown function UPF0029  37.16 
 
 
195 aa  110  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0264  hypothetical protein  33.89 
 
 
204 aa  110  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00131939  normal  0.0250602 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1375  hypothetical protein  34.9 
 
 
197 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000270637  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1989  protein of unknown function UPF0029  35.42 
 
 
212 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.592737  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2891  hypothetical protein  32.43 
 
 
205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373114  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3931  hypothetical protein  33.89 
 
 
203 aa  109  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.457043  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0285  hypothetical protein  33.89 
 
 
203 aa  109  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000001725  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1914  hypothetical protein  33.89 
 
 
203 aa  109  3e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00064118  normal  0.0316098 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2997  protein of unknown function UPF0029  39.23 
 
 
211 aa  108  4.0000000000000004e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18640  hypothetical protein  45.93 
 
 
231 aa  108  5e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.685754  normal  0.475195 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1146  hypothetical protein  33.7 
 
 
204 aa  108  6e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3126  hypothetical protein  30.05 
 
 
209 aa  108  7.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0054  protein of unknown function UPF0029  35.09 
 
 
206 aa  108  7.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00609862 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3899  hypothetical protein  32.24 
 
 
204 aa  108  8.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00283954  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0876  protein of unknown function UPF0029  33.84 
 
 
203 aa  107  1e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.196068 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24840  hypothetical protein  31.18 
 
 
225 aa  107  1e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.070142  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12728  hypothetical protein  41.22 
 
 
203 aa  107  1e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1558  protein of unknown function UPF0029  32.49 
 
 
203 aa  107  1e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.17892  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2068  hypothetical protein  34.95 
 
 
232 aa  107  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0096752  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3325  hypothetical protein  32.6 
 
 
195 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0536454  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>