More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2180 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2180  DNA-binding response regulator  100 
 
 		 223 aa  444  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0299585  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1891  DNA-binding response regulator  99.55 
 
 		 223 aa  443  1e-123  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2250  two component transcriptional regulator  58.22 
 
 		 225 aa  270  1e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000295266  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3288  two component transcriptional regulator  57.59 
 
 		 225 aa  270  1e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0366247  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3612  DNA-binding response regulator  57.59 
 
 		 225 aa  270  2e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.20142e-22 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3620  DNA-binding response regulator  57.59 
 
 		 225 aa  270  2e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0597824  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3396  DNA-binding response regulator  57.59 
 
 		 225 aa  270  2e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000765328  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3358  transcriptional regulatory protein  57.59 
 
 		 225 aa  270  2e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000200566  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3308  transcriptional regulatory protein  57.59 
 
 		 225 aa  270  2e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000872353  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1606  DNA-binding response regulator  57.59 
 
 		 225 aa  269  2e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00543423  hitchhiker  0.0000000112462 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3661  DNA-binding response regulator  57.59 
 
 		 225 aa  270  2e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000222084  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3627  DNA-binding response regulator  57.59 
 
 		 225 aa  270  2e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456124  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3709  DNA-binding response regulator  57.59 
 
 		 225 aa  269  2e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000227696  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2855  two component transcriptional regulator  52.97 
 
 		 224 aa  246  2e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000952101  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2159  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.67 
 
 		 227 aa  241  6e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00177162  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2915  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.39 
 
 		 225 aa  236  2e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.892207  normal  0.300351 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2981  two component transcriptional regulator  51.57 
 
 		 229 aa  231  7.000000000000001e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000201285  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2911  two component transcriptional regulator  50.22 
 
 		 228 aa  230  1e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4952  DNA-binding response regulator  49.56 
 
 		 229 aa  223  1e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0827  two component transcriptional regulator  52.27 
 
 		 256 aa  223  2e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00211389  normal  0.244563 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4707  DNA-binding response regulator  50 
 
 		 229 aa  222  4e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4932  DNA-binding response regulator  50 
 
 		 229 aa  222  4e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5068  DNA-binding response regulator  50 
 
 		 229 aa  222  4e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4546  DNA-binding response regulator  49.56 
 
 		 229 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4937  DNA-binding response regulator  49.12 
 
 		 229 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  51.57 
 
 		 227 aa  219  1.9999999999999999e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4969  DNA-binding response regulator  49.12 
 
 		 229 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4564  DNA-binding response regulator  48.23 
 
 		 229 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.2 
 
 		 230 aa  219  3e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000466515  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4646  two component transcriptional regulator  47.35 
 
 		 229 aa  218  5e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.2 
 
 		 223 aa  218  6e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1728  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.56 
 
 		 233 aa  217  1e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0246  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.15 
 
 		 225 aa  215  5e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0272164  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1924  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.32 
 
 		 225 aa  214  5.9999999999999996e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1756  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.65 
 
 		 230 aa  214  8e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.769657  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1658  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 		 230 aa  214  9e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.515101  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.78 
 
 		 237 aa  213  9.999999999999999e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1752  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.18 
 
 		 228 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101966  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  48.23 
 
 		 228 aa  213  9.999999999999999e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1055  DNA-binding response regulator SrrA  46.15 
 
 		 241 aa  213  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.11 
 
 		 231 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1580  response regulator receiver  44.87 
 
 		 241 aa  212  3.9999999999999995e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1549  two component transcriptional regulator  44.87 
 
 		 241 aa  212  3.9999999999999995e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1903  two component transcriptional regulator  48 
 
 		 230 aa  211  5.999999999999999e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1215  two component transcriptional regulator  47.71 
 
 		 223 aa  211  1e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533573  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4198  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.21 
 
 		 226 aa  209  2e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1413  DNA-binding response regulator  46.79 
 
 		 223 aa  209  3e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1453  DNA-binding response regulator  46.79 
 
 		 223 aa  209  3e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1351  DNA-binding response regulator  46.64 
 
 		 223 aa  207  8e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.14 
 
 		 230 aa  207  8e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3993  DNA-binding response regulator  46.64 
 
 		 223 aa  207  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1389  DNA-binding response regulator  46.33 
 
 		 223 aa  207  1e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1191  response regulator  46.33 
 
 		 223 aa  207  1e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1193  response regulator  46.33 
 
 		 223 aa  207  1e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3085  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.11 
 
 		 232 aa  207  1e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000315463  hitchhiker  0.000599707 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1213  DNA-binding response regulator  46.33 
 
 		 223 aa  206  2e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1312  DNA-binding response regulator  46.33 
 
 		 223 aa  206  2e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1399  two component transcriptional regulator  46.29 
 
 		 238 aa  206  2e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.129694  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2216  two component transcriptional regulator  46.15 
 
 		 224 aa  206  3e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2219  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.72 
 
 		 240 aa  205  4e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1601  DNA-binding response regulator ResD  45.41 
 
 		 250 aa  204  7e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.953648  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1637  DNA-binding response regulator ResD  45.41 
 
 		 250 aa  204  7e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0246031  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1569  DNA-binding response regulator ResD  45.41 
 
 		 250 aa  204  7e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45334e-32 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1386  DNA-binding response regulator ResD  45.41 
 
 		 238 aa  204  8e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1359  response regulator  45.41 
 
 		 238 aa  204  8e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0319788  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1200  two component transcriptional regulator  44.98 
 
 		 238 aa  204  8e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1358  response regulator  45.41 
 
 		 238 aa  204  8e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1497  DNA-binding response regulator ResD  45.41 
 
 		 238 aa  204  8e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.862661  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3814  DNA-binding response regulator ResD  45.41 
 
 		 238 aa  204  1e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.95849e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1531  DNA-binding response regulator ResD  45.41 
 
 		 238 aa  204  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1696  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.55 
 
 		 224 aa  202  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2566  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.19 
 
 		 229 aa  203  2e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000356007  hitchhiker  0.00345607 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.51 
 
 		 236 aa  202  3e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3179  DNA-binding response regulator VicR  45.09 
 
 		 226 aa  202  5e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0879082  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  49.35 
 
 		 239 aa  201  6e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2675  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.47 
 
 		 234 aa  201  6e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661044  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  49.35 
 
 		 239 aa  201  6e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1892  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.65 
 
 		 228 aa  201  8e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000392  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0444  DNA-binding response regulator  48.89 
 
 		 233 aa  201  8e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1021  two component transcriptional regulator  47.09 
 
 		 223 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2497  DNA-binding response regulator  48.87 
 
 		 228 aa  200  1.9999999999999998e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  46.49 
 
 		 232 aa  200  1.9999999999999998e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.3 
 
 		 230 aa  199  3e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0274  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.77 
 
 		 224 aa  199  3e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2811  DNA-binding response regulator  48.42 
 
 		 228 aa  199  3e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0302  DNA-binding response regulator  46.7 
 
 		 230 aa  198  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0294  DNA-binding response regulator  45.18 
 
 		 233 aa  198  5e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21640  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.75 
 
 		 226 aa  197  7e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176926  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3538  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.05 
 
 		 237 aa  197  7.999999999999999e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4699  DNA-binding response regulator PhoP  45.49 
 
 		 239 aa  197  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0539  DNA-binding response regulator PhoP  45.49 
 
 		 239 aa  197  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130788 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4720  DNA-binding response regulator PhoP  45.49 
 
 		 239 aa  197  9e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4704  DNA-binding response regulator PhoP  45.49 
 
 		 239 aa  197  9e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000673192 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4484  DNA-binding response regulator PhoP  45.49 
 
 		 239 aa  197  9e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4319  alkaline phosphatase synthesis response regulator  45.49 
 
 		 239 aa  197  9e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3409  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.81 
 
 		 236 aa  197  9e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4330  alkaline phosphatase synthesis response regulator  45.49 
 
 		 239 aa  197  9e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4833  DNA-binding response regulator PhoP  45.49 
 
 		 239 aa  197  9e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0982965  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4714  DNA-binding response regulator PhoP  45.49 
 
 		 239 aa  197  9e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0588  two component transcriptional regulator  45.74 
 
 		 227 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000451147  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>