More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2174 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2174  FolC bifunctional protein  100 
 
 
441 aa  884    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1885  FolC bifunctional protein  96.6 
 
 
441 aa  860    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3345  FolC bifunctional protein  42.82 
 
 
429 aa  351  1e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.63219  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1384  FolC bifunctional protein  42.56 
 
 
428 aa  351  1e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1447  FolC bifunctional protein  43.62 
 
 
424 aa  347  2e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2209  FolC bifunctional protein  42.89 
 
 
429 aa  342  5.999999999999999e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.791737  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0533  FolC bifunctional protein  39.17 
 
 
440 aa  329  6e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.861672 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1490  FolC bifunctional protein  42.89 
 
 
432 aa  329  7e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2552  FolC bifunctional protein  39.68 
 
 
431 aa  323  4e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0970266  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4360  FolC bifunctional protein  39.72 
 
 
459 aa  321  9.999999999999999e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07720  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  39.06 
 
 
427 aa  300  3e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.278263 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0295  FolC bifunctional protein  39.52 
 
 
426 aa  295  1e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4354  folylpolyglutamate synthase  38.3 
 
 
433 aa  293  4e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4190  folylpolyglutamate synthase  38.3 
 
 
433 aa  293  4e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4689  folylpolyglutamate synthase  38.3 
 
 
433 aa  293  4e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4201  folylpolyglutamate synthase  39.49 
 
 
433 aa  292  7e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4544  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  38.3 
 
 
433 aa  292  1e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0880  FolC bifunctional protein  36.45 
 
 
431 aa  290  3e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4548  folylpolyglutamate synthase  38.85 
 
 
433 aa  289  6e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4575  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  38.8 
 
 
433 aa  289  6e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.095656  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4302  FolC bifunctional protein  38.37 
 
 
433 aa  288  1e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2572  FolC bifunctional protein  37.3 
 
 
431 aa  288  2e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0659  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  37.64 
 
 
433 aa  287  2e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4590  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  39.08 
 
 
433 aa  286  5.999999999999999e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3173  FolC bifunctional protein  37.76 
 
 
433 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0325  FolC bifunctional protein  38.15 
 
 
438 aa  279  7e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2764  FolC bifunctional protein  40.33 
 
 
424 aa  278  1e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1472  FolC bifunctional protein  38.08 
 
 
425 aa  277  2e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0335611  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0758  FolC bifunctional protein  38.37 
 
 
443 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1671  FolC bifunctional protein  34.19 
 
 
431 aa  274  2.0000000000000002e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.239696  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4541  FolC bifunctional protein  33.86 
 
 
453 aa  274  2.0000000000000002e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.195738  normal  0.774158 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1278  folylpolyglutamate synthase  37.36 
 
 
427 aa  274  3e-72  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0510  FolC bifunctional protein  37.33 
 
 
437 aa  266  5e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0544  FolC bifunctional protein  38.61 
 
 
425 aa  266  5.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_15  folylpolyglutamate synthetase  36.79 
 
 
437 aa  266  8e-70  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0015  FolC bifunctional protein  37.18 
 
 
438 aa  265  1e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.124008  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4359  FolC bifunctional protein  35.65 
 
 
427 aa  264  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.601802  normal  0.624925 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0782  FolC bifunctional protein  37.47 
 
 
435 aa  264  2e-69  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0759  FolC bifunctional protein  37.47 
 
 
437 aa  264  3e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3683  folylpolyglutamate synthetase  39.47 
 
 
416 aa  263  4.999999999999999e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01530  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  33.33 
 
 
466 aa  262  8.999999999999999e-69  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0193239 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1549  FolC bifunctional protein  38.14 
 
 
422 aa  262  1e-68  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2475  folylpolyglutamate synthetase  34.19 
 
 
424 aa  262  1e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0738  folylpolyglutamate synthetase; dihydrofolate synthetase  33.8 
 
 
422 aa  260  3e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00754435  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1051  FolC bifunctional protein  37.15 
 
 
425 aa  259  8e-68  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1110  FolC bifunctional protein  34.79 
 
 
465 aa  259  1e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.94602 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0203  FolC bifunctional protein  38.98 
 
 
418 aa  258  2e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0053743 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0603  FolC bifunctional protein  33.1 
 
 
435 aa  258  2e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0207  FolC bifunctional protein  38.74 
 
 
418 aa  258  2e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1883  FolC bifunctional protein  38.31 
 
 
407 aa  258  2e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0016  folylpolyglutamate synthetase  35.38 
 
 
439 aa  257  3e-67  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2780  FolC bifunctional protein  34.62 
 
 
437 aa  257  3e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.38262  normal  0.709673 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1041  FolC bifunctional protein  34.08 
 
 
451 aa  256  4e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3099  FolC bifunctional protein  33.11 
 
 
438 aa  256  8e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1603  FolC bifunctional protein  36.02 
 
 
420 aa  255  9e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.119279  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3348  FolC bifunctional protein  34.66 
 
 
424 aa  254  3e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3277  FolC bifunctional protein  33.96 
 
 
424 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0325  dihydropteroate synthase  34.38 
 
 
878 aa  253  6e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.899871  normal  0.0161218 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4713  dihydropteroate synthase  34.19 
 
 
810 aa  252  1e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.464706  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0087  FolC bifunctional protein  31.11 
 
 
454 aa  250  3e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0279686 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0602  dihydropteroate synthase  32.66 
 
 
813 aa  248  1e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3284  dihydropteroate synthase  34.02 
 
 
847 aa  248  1e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1542  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase (folylpolyglutamate synthetase)  33.11 
 
 
429 aa  246  4e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0207441  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14370  Folylpolyglutamate synthase  36.44 
 
 
457 aa  246  4.9999999999999997e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137038  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1117  folylpolyglutamate synthase  33.8 
 
 
420 aa  245  9e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0897  FolC bifunctional protein  34.43 
 
 
424 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.54283e-31 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1504  folylpolyglutamate synthase / dihydrofolate synthase  34.86 
 
 
420 aa  245  9.999999999999999e-64  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000264137  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0351  FolC bifunctional protein  34.51 
 
 
414 aa  245  9.999999999999999e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.651098 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1456  FolC bifunctional protein  37.24 
 
 
438 aa  243  3.9999999999999997e-63  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0119  FolC bifunctional protein  32.89 
 
 
447 aa  243  3.9999999999999997e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.205687 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3147  FolC bifunctional protein  32.41 
 
 
817 aa  241  2e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0120997  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1754  FolC bifunctional protein  34.69 
 
 
423 aa  241  2e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.686494  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1720  FolC bifunctional protein  34.69 
 
 
423 aa  241  2e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1648  hypothetical protein  34.74 
 
 
416 aa  241  2e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0467  FolC bifunctional protein  34.13 
 
 
434 aa  240  4e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000374021  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2554  dihydropteroate synthase  32.57 
 
 
840 aa  240  4e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.324611  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1166  FolC bifunctional protein  33.26 
 
 
428 aa  238  1e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1830  FolC bifunctional protein  33.88 
 
 
432 aa  237  2e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0684286  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3070  FolC bifunctional protein  31.36 
 
 
428 aa  235  9e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2308  FolC bifunctional protein  33.48 
 
 
442 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.000000091683  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1568  FolC bifunctional protein  35.83 
 
 
432 aa  232  1e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06680  putative folylpolyglutamate synthase  34.33 
 
 
404 aa  228  1e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1227  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  33.93 
 
 
421 aa  228  1e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.113059  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1160  FolC bifunctional protein  30.25 
 
 
425 aa  228  1e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0059  FolC bifunctional protein  34.84 
 
 
421 aa  227  4e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.873383  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1048  FolC bifunctional protein  33.71 
 
 
433 aa  226  5.0000000000000005e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0971  FolC bifunctional protein  35.81 
 
 
463 aa  226  5.0000000000000005e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.764071  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0944  FolC bifunctional protein  33.66 
 
 
412 aa  225  1e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0423  FolC bifunctional protein  32.04 
 
 
436 aa  223  4e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.395258  normal  0.0242986 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0949  FolC bifunctional protein  32.74 
 
 
433 aa  223  4e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1510  FolC bifunctional protein  36.3 
 
 
413 aa  223  7e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1996  FolC bifunctional protein  32.88 
 
 
428 aa  222  9e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0734572  normal  0.0222652 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0426  FolC bifunctional protein  33.02 
 
 
422 aa  222  9.999999999999999e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.776712  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3871  FolC bifunctional protein  35.61 
 
 
444 aa  222  9.999999999999999e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000822129 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0455  folylpolyglutamate synthase  34.79 
 
 
393 aa  222  9.999999999999999e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0464  bifunctional protein FolC  33.7 
 
 
485 aa  221  1.9999999999999999e-56  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2510  FolC bifunctional protein  33.49 
 
 
403 aa  220  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000623947 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3492  FolC bifunctional protein  34.76 
 
 
444 aa  219  8.999999999999998e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.371874 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3525  FolC bifunctional protein  31.42 
 
 
440 aa  219  8.999999999999998e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2622  FolC bifunctional protein  35.45 
 
 
413 aa  218  1e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0132417  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>