39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2126 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2126  TPR domain-containing protein  100 
 
 
365 aa  727    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000503657  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1840  TPR domain-containing protein  99.18 
 
 
365 aa  723    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00013398  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1333  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.79 
 
 
365 aa  62.8  0.000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2656  TPR repeat-containing protein  26.21 
 
 
568 aa  54.7  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000162187  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  25.76 
 
 
1266 aa  53.9  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1591  TPR repeat-containing protein  25.57 
 
 
412 aa  53.1  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1957  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.02 
 
 
375 aa  52.8  0.000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  31.25 
 
 
573 aa  51.2  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3645  TPR repeat-containing protein  31.36 
 
 
266 aa  50.1  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1641  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.77 
 
 
292 aa  49.7  0.00008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  31.15 
 
 
927 aa  48.9  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  28.67 
 
 
949 aa  47.8  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0511  TPR repeat-containing protein  29.52 
 
 
581 aa  47.4  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  28.32 
 
 
573 aa  47  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  31.71 
 
 
733 aa  46.2  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2098  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.21 
 
 
566 aa  46.2  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000120088  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  27.37 
 
 
725 aa  45.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0213  TPR domain-containing protein  29.36 
 
 
380 aa  45.4  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000856086  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0362  TPR repeat-containing protein  26.01 
 
 
804 aa  45.8  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.587657  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2954  TPR repeat-containing protein  35.59 
 
 
468 aa  45.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126198  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  24.14 
 
 
782 aa  44.3  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1229  hypothetical protein  36.63 
 
 
237 aa  44.3  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000200658  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  36.67 
 
 
594 aa  43.9  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25 
 
 
1034 aa  43.9  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2645  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.38 
 
 
572 aa  43.9  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000110346  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  31.03 
 
 
2145 aa  43.9  0.004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3199  TPR repeat-containing protein  31.73 
 
 
565 aa  43.9  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.714786  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2989  diguanylate cyclase  27.97 
 
 
628 aa  43.5  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.542118  normal  0.107456 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  32.32 
 
 
465 aa  43.5  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  27.23 
 
 
745 aa  43.5  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2471  TPR repeat-containing protein  23.86 
 
 
643 aa  43.5  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0354  TPR repeat-containing protein  34.78 
 
 
684 aa  43.1  0.007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.431996  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3694  TPR repeat-containing protein  30.17 
 
 
638 aa  43.1  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.663272  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2476  TPR domain-containing protein  28.87 
 
 
566 aa  43.1  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.834275  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  28.4 
 
 
356 aa  42.7  0.009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0402  TPR repeat-containing protein  29.63 
 
 
596 aa  42.7  0.01  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0047  TPR repeat-containing protein  27.8 
 
 
506 aa  42.7  0.01  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0614925  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1872  TPR repeat-containing protein  25.57 
 
 
594 aa  42.7  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0261679  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  23.81 
 
 
573 aa  42.7  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>