More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2108 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2108  hypothetical protein  100 
 
 		 219 aa  439  9.999999999999999e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000109011  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1822  hypothetical protein  98.17 
 
 		 219 aa  433  1e-121  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000058196  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0596  alanine racemase domain protein  47.58 
 
 		 235 aa  215  4e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000505441  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2362  alanine racemase domain-containing protein  42.8 
 
 		 253 aa  196  2.0000000000000003e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000227174  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1892  alanine racemase domain-containing protein  50.51 
 
 		 202 aa  193  2e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000005505  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3449  alanine racemase domain-containing protein  42.92 
 
 		 219 aa  189  2e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2011  alanine racemase domain protein  44.95 
 
 		 220 aa  187  8e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1344  alanine racemase domain protein  48.06 
 
 		 233 aa  186  2e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000474178  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  42.17 
 
 		 230 aa  185  4e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1116  alanine racemase domain protein  46.53 
 
 		 219 aa  184  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0312206  normal  0.913907 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  41.3 
 
 		 230 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2544  hypothetical protein  44.61 
 
 		 231 aa  181  8.000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2126  hypothetical protein  44.59 
 
 		 224 aa  181  1e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4047  alanine racemase domain protein  41.23 
 
 		 233 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0138922  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2922  alanine racemase domain protein  46.61 
 
 		 229 aa  179  4e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000498305 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1189  alanine racemase domain-containing protein  45.54 
 
 		 235 aa  178  4.999999999999999e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000138535  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0792  hypothetical protein  43.81 
 
 		 234 aa  178  5.999999999999999e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000822407  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2661  hypothetical protein  44.29 
 
 		 220 aa  176  2e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09518  hypothetical protein  42.27 
 
 		 219 aa  174  9.999999999999999e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1272  alanine racemase domain protein  41.55 
 
 		 218 aa  174  9.999999999999999e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0896  hypothetical protein  40.87 
 
 		 231 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000533107 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0403  PLP dependent enzymes class III-like protein  40.09 
 
 		 228 aa  172  5e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0816  alanine racemase domain protein  47.62 
 
 		 230 aa  170  2e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000900984  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1082  alanine racemase domain protein  38.67 
 
 		 225 aa  170  2e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000765684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0858  hypothetical protein  38.26 
 
 		 236 aa  170  2e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0454343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1315  alanine racemase domain protein  42.15 
 
 		 233 aa  170  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000152977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0550  alanine racemase domain protein  40 
 
 		 219 aa  166  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0712  alanine racemase domain-containing protein  40.53 
 
 		 226 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1015  alanine racemase domain protein  37.95 
 
 		 247 aa  165  5.9999999999999996e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1062  hypothetical protein  42.99 
 
 		 216 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0153  alanine racemase domain-containing protein  43.69 
 
 		 235 aa  165  5.9999999999999996e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00359094  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1555  alanine racemase domain protein  46.08 
 
 		 224 aa  163  2.0000000000000002e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3685  alanine racemase domain-containing protein  38.77 
 
 		 237 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000728212  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1026  alanine racemase domain-containing protein  42.22 
 
 		 229 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1094  alanine racemase domain-containing protein  42.22 
 
 		 229 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.952967  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1449  alanine racemase domain protein  37.16 
 
 		 223 aa  160  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1179  alanine racemase domain-containing protein  40.64 
 
 		 227 aa  160  1e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0460  alanine racemase domain protein  41.26 
 
 		 228 aa  159  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2503  hypothetical protein  36.7 
 
 		 227 aa  159  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3256  alanine racemase domain-containing protein  38.77 
 
 		 228 aa  159  5e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.902673  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1414  alanine racemase domain-containing protein  40.29 
 
 		 234 aa  157  1e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000108104  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6290  alanine racemase domain protein  43.75 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.418922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4903  hypothetical protein  39.17 
 
 		 226 aa  157  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.116989  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4423  alanine racemase domain-containing protein  37.61 
 
 		 222 aa  156  3e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0000180777  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0953  hypothetical protein  43.22 
 
 		 225 aa  155  4e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000358691  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4019  alanine racemase domain protein  40 
 
 		 270 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.69419  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3839  alanine racemase domain protein  37.21 
 
 		 280 aa  154  9e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0545  alanine racemase domain-containing protein  36.64 
 
 		 242 aa  154  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1539  alanine racemase domain-containing protein  44.55 
 
 		 228 aa  154  1e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.237332  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1365  alanine racemase domain-containing protein  36.2 
 
 		 213 aa  153  2e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0384344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1694  alanine racemase domain protein  35.62 
 
 		 224 aa  153  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09220  conserved hypothetical protein TIGR00044  43.14 
 
 		 230 aa  153  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00199115  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1713  alanine racemase domain protein  35.62 
 
 		 224 aa  153  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0268832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2899  hypothetical protein  35.94 
 
 		 222 aa  152  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000414809  unclonable  0.000000149465 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1779  alanine racemase domain protein  38.6 
 
 		 229 aa  152  5e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.840113 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3657  alanine racemase domain-containing protein  36.04 
 
 		 235 aa  151  5.9999999999999996e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0664896  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2168  alanine racemase domain protein  33.33 
 
 		 244 aa  150  1e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1763  alanine racemase domain protein  38.1 
 
 		 231 aa  150  1e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.510381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0536  alanine racemase domain-containing protein  36.09 
 
 		 237 aa  150  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1232  alanine racemase domain protein  36.2 
 
 		 228 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0708926  normal  0.361735 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0775  alanine racemase domain protein  35.84 
 
 		 241 aa  150  2e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.2038  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1352  alanine racemase domain protein  36.24 
 
 		 223 aa  149  3e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1237  hypothetical protein  37.28 
 
 		 261 aa  149  4e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1238  alanine racemase domain protein  40.89 
 
 		 235 aa  148  5e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.878338  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1145  alanine racemase domain-containing protein  37.28 
 
 		 261 aa  148  6e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0758  hypothetical protein  35.65 
 
 		 220 aa  148  7e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.28716  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2739  alanine racemase domain protein  38.42 
 
 		 231 aa  148  7e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3709  alanine racemase domain-containing protein  37.07 
 
 		 283 aa  148  7e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.948517  normal  0.0157517 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0760  alanine racemase domain protein  37.18 
 
 		 241 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3718  hypothetical protein  40.1 
 
 		 227 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3628  alanine racemase domain-containing protein  34.07 
 
 		 234 aa  147  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0245801  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0498  alanine racemase domain-containing protein  36.95 
 
 		 235 aa  146  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.812973  normal  0.755781 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_664  alanine racemase domain protein  37.33 
 
 		 220 aa  145  4.0000000000000006e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0827888  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3641  hypothetical protein  38.42 
 
 		 226 aa  145  5e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0984  alanine racemase domain protein  38.83 
 
 		 271 aa  144  9e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1659  alanine racemase domain protein  38.26 
 
 		 229 aa  143  2e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1137  alanine racemase domain-containing protein  40.29 
 
 		 233 aa  144  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.218353  normal  0.343329 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1702  alanine racemase domain-containing protein  38.92 
 
 		 214 aa  143  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.348168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4204  hypothetical protein  37.23 
 
 		 231 aa  143  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810944  hitchhiker  0.00932277 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0778  hypothetical protein  39.9 
 
 		 227 aa  143  2e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.234851  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1193  hypothetical protein  37.91 
 
 		 238 aa  142  5e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03578  hypothetical protein  37.77 
 
 		 236 aa  141  6e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1487  hypothetical protein  35.07 
 
 		 240 aa  141  7e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.164906  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2383  alanine racemase domain protein  35.29 
 
 		 257 aa  141  9e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0085  alanine racemase domain protein  35.58 
 
 		 235 aa  141  9e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2315  hypothetical protein  39.9 
 
 		 275 aa  140  9.999999999999999e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000951598  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1536  hypothetical protein  33.33 
 
 		 229 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0543  membrane protein, related to K+ transport  38.46 
 
 		 255 aa  140  9.999999999999999e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.42956  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1062  alanine racemase domain protein  41.5 
 
 		 225 aa  140  9.999999999999999e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1034  alanine racemase domain protein  35.48 
 
 		 226 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000216914  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1215  hypothetical protein  38.96 
 
 		 231 aa  140  9.999999999999999e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.157009  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3912  alanine racemase domain protein  37.62 
 
 		 243 aa  140  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.459164  normal  0.0218623 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1350  hypothetical protein  38.05 
 
 		 229 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2477  hypothetical protein  35.65 
 
 		 235 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.58685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002457  hypothetical protein  39.91 
 
 		 233 aa  139  3e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4150  alanine racemase domain-containing protein  34.65 
 
 		 230 aa  139  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.766912 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2737  alanine racemase domain protein  36.84 
 
 		 259 aa  139  3e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0685  alanine racemase domain-containing protein  34.72 
 
 		 220 aa  139  3e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.268017  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2415  alanine racemase domain protein  34.45 
 
 		 237 aa  139  3e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4113  hypothetical protein  37.07 
 
 		 286 aa  139  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>