52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2058 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2058  hypothetical protein  100 
 
 
139 aa  282  1e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.836973  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1772  hypothetical protein  99.28 
 
 
139 aa  279  8e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1570  hypothetical protein  50.36 
 
 
148 aa  135  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  3.29369e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1744  sporulation protein YtfJ  48.91 
 
 
152 aa  134  3e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0691  hypothetical protein  48.61 
 
 
162 aa  134  4e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07200  Sporulation protein YtfJ  50.77 
 
 
128 aa  129  1e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.17088e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1414  hypothetical protein  51.59 
 
 
136 aa  127  4e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.173147  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1932  hypothetical protein  41.35 
 
 
141 aa  114  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2181  hypothetical protein  41.35 
 
 
141 aa  114  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0698521  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2195  hypothetical protein  41.35 
 
 
141 aa  114  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.384624  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2101  hypothetical protein  41.35 
 
 
141 aa  114  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1908  hypothetical protein  41.35 
 
 
141 aa  114  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1953  hypothetical protein  41.35 
 
 
141 aa  114  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1946  sporulation protein YtfJ  42.31 
 
 
141 aa  114  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2135  hypothetical protein  41.35 
 
 
141 aa  114  4e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2711  sporulation protein YtfJ  47.14 
 
 
142 aa  114  5e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2111  hypothetical protein  41.35 
 
 
141 aa  114  6e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1649  sporulation protein YtfJ  51.52 
 
 
154 aa  114  6e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.592174 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0796  sporulation protein YtfJ  50.94 
 
 
127 aa  113  1e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1297  sporulation protein YtfJ  54.62 
 
 
138 aa  110  7e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1358  hypothetical protein  47.48 
 
 
159 aa  110  8e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4749  hypothetical protein  49.23 
 
 
131 aa  108  2e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0486  hypothetical protein  49.23 
 
 
131 aa  108  2e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.239832 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1138  hypothetical protein  49.3 
 
 
146 aa  107  4e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1733  sporulation protein YtfJ  45.6 
 
 
134 aa  107  5e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4538  hypothetical protein  48.46 
 
 
131 aa  107  5e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.504702  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4471  sporulation protein YtfJ  48.46 
 
 
131 aa  107  5e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4891  hypothetical protein  48.46 
 
 
131 aa  107  5e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4758  hypothetical protein  48.46 
 
 
131 aa  107  5e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4374  hypothetical protein  48.46 
 
 
131 aa  107  5e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4384  hypothetical protein  48.46 
 
 
131 aa  107  5e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4776  hypothetical protein  48.46 
 
 
131 aa  107  7e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4775  hypothetical protein  48.46 
 
 
131 aa  107  7e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0728  sporulation protein YtfJ  46.67 
 
 
148 aa  106  9e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1550  hypothetical protein  40.94 
 
 
133 aa  105  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00888341  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1276  hypothetical protein  40.16 
 
 
155 aa  105  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3899  hypothetical protein  41.41 
 
 
155 aa  105  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3313  hypothetical protein  46.92 
 
 
131 aa  105  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1482  hypothetical protein  40.16 
 
 
155 aa  104  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1277  hypothetical protein  40.16 
 
 
155 aa  104  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  4.84756e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1117  sporulation protein YtfJ  39.84 
 
 
137 aa  104  5e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.065472  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1511  hypothetical protein  40.16 
 
 
195 aa  103  6e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1314  sporulation protein YtfJ  39.37 
 
 
135 aa  103  6e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  1.16543e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1444  hypothetical protein  39.37 
 
 
155 aa  103  7e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3422  sporulation protein YtfJ  49.24 
 
 
149 aa  102  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1199  hypothetical protein  48.78 
 
 
124 aa  97.1  8e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.247867  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3203  hypothetical protein  42.31 
 
 
141 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1587  hypothetical protein  44.74 
 
 
141 aa  92.8  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2092  sporulation protein YtfJ  50.36 
 
 
150 aa  89  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.547598 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1411  hypothetical protein  40.16 
 
 
135 aa  80.5  7e-15  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.875133  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1303  hypothetical protein  40.16 
 
 
155 aa  80.5  7e-15  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  2.10058e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2894  hypothetical protein  30.66 
 
 
137 aa  58.9  2e-08  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  4.20762e-09  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>