More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2028 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1302  hypothetical protein  67.39 
 
 		 555 aa  783    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3657  beta-lactamase domain protein  57.92 
 
 		 554 aa  682    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000145039  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1678  beta-lactamase domain protein  60.69 
 
 		 553 aa  712    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3833  metallo-beta-lactamase family protein  54.33 
 
 		 556 aa  638    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000419922  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3648  metallo-beta-lactamase family protein  54.33 
 
 		 556 aa  638    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3538  metallo-beta-lactamase family protein  54.33 
 
 		 556 aa  638    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0178756  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1460  beta-lactamase domain protein  56.14 
 
 		 551 aa  655    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000017363  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0947  beta-lactamase domain protein  53.73 
 
 		 555 aa  640    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164083  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3556  metallo-beta-lactamase family protein  54.33 
 
 		 556 aa  638    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08700  beta-lactamase domain protein  58.62 
 
 		 558 aa  670    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000465654  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1938  beta-lactamase domain-containing protein  62.11 
 
 		 554 aa  724    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0941  beta-lactamase domain protein  53.15 
 
 		 560 aa  635    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0627  beta-lactamase domain protein  59.82 
 
 		 555 aa  724    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.223093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3933  metallo-beta-lactamase family protein  54.33 
 
 		 556 aa  638    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00612119  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4393  beta-lactamase domain-containing protein  54.89 
 
 		 558 aa  635    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0728616  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1069  hypothetical protein  60.9 
 
 		 555 aa  731    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000100194  normal  0.0563275 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3809  metallo-beta-lactamase family protein  54.33 
 
 		 556 aa  638    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2993599999999999e-37 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1772  beta-lactamase domain protein  62.52 
 
 		 555 aa  748    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0198506  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1816  beta-lactamase domain-containing protein  58.94 
 
 		 559 aa  699    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000137497  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1403  metallo-beta-lactamase family protein  54.15 
 
 		 556 aa  637    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0055609  hitchhiker  0.000000000000158477 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3845  metallo-beta-lactamase family protein  54.33 
 
 		 556 aa  638    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000592634  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0947  beta-lactamase domain-containing protein  59.85 
 
 		 554 aa  717    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2449  beta-lactamase domain-containing protein  53.96 
 
 		 583 aa  635    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0351233  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3163  beta-lactamase domain protein  61.38 
 
 		 554 aa  716    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2028  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  100 
 
 		 555 aa  1122    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1745  RNA-metabolizing metallo-beta-lactamase family protein  98.92 
 
 		 555 aa  1112    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1268  metallo-beta-lactamase family protein  58.88 
 
 		 553 aa  701    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000954754  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1460  beta-lactamase domain protein  55.92 
 
 		 566 aa  655    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1494  beta-lactamase domain-containing protein  68.6 
 
 		 560 aa  811    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000870726  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3567  beta-lactamase domain-containing protein  54.5 
 
 		 556 aa  635    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00558369  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3896  metallo-beta-lactamase family protein  54.33 
 
 		 556 aa  638    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0341705  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1781  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  52.96 
 
 		 557 aa  634    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0160352  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2294  beta-lactamase domain-containing protein  58.33 
 
 		 618 aa  682    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0366  hypothetical protein  54.74 
 
 		 558 aa  631  1e-180  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0664287  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1522  metallo-beta-lactamase family protein  52.42 
 
 		 557 aa  630  1e-179  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0439193  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1494  Zn-dependent hydrolase  52.42 
 
 		 557 aa  630  1e-179  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000794402  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1484  Zn-dependent hydrolase  52.6 
 
 		 557 aa  630  1e-179  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000568728  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2679  beta-lactamase domain-containing protein  52.09 
 
 		 555 aa  629  1e-179  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000157483  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1730  metallo-beta-lactamase family protein  52.42 
 
 		 557 aa  626  1e-178  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.744262  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4026  hypothetical protein  51.37 
 
 		 555 aa  625  1e-178  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0999117  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3887  hypothetical protein  51.37 
 
 		 555 aa  625  1e-178  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0624715  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3719  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  51.37 
 
 		 555 aa  625  1e-178  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.998295  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3735  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  51.37 
 
 		 555 aa  625  1e-178  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1827  beta-lactamase domain protein  52.82 
 
 		 555 aa  626  1e-178  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4190  hypothetical protein  51.37 
 
 		 555 aa  625  1e-178  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3992  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  51.37 
 
 		 555 aa  625  1e-178  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1707  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  52.24 
 
 		 557 aa  628  1e-178  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4057  beta-lactamase domain protein  53.08 
 
 		 558 aa  626  1e-178  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4097  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  51.37 
 
 		 555 aa  625  1e-178  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000534796  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1676  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  52.42 
 
 		 557 aa  627  1e-178  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0518689  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3971  beta-lactamase domain protein  52.9 
 
 		 558 aa  624  1e-177  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.313503  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1160  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  51.18 
 
 		 555 aa  623  1e-177  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.121903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3668  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  52.06 
 
 		 557 aa  624  1e-177  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000237244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3804  beta-lactamase domain-containing protein  51.18 
 
 		 555 aa  622  1e-177  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.199247  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4080  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  51.37 
 
 		 555 aa  624  1e-177  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0747948  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1171  beta-lactamase domain protein  53.27 
 
 		 555 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000121599  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1333  beta-lactamase domain-containing protein  52 
 
 		 557 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_380  metallo-beta-lactamase  52.54 
 
 		 551 aa  602  1.0000000000000001e-171  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0438  metallo-beta-lactamase family protein  52.36 
 
 		 551 aa  600  1e-170  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.386369  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3113  metallo-beta-lactamase family protein  53.28 
 
 		 533 aa  599  1e-170  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0415  beta-lactamase domain-containing protein  51.99 
 
 		 551 aa  598  1e-169  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.223724  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3415  beta-lactamase domain protein  50.09 
 
 		 593 aa  592  1e-168  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0676  metallo-beta-lactamase family protein  49.64 
 
 		 560 aa  585  1e-166  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1171  beta-lactamase domain-containing protein  49.64 
 
 		 565 aa  587  1e-166  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1149  beta-lactamase domain-containing protein  49.64 
 
 		 565 aa  587  1e-166  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2063  beta-lactamase domain protein  50.64 
 
 		 556 aa  586  1e-166  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0383  beta-lactamase domain-containing protein  51.46 
 
 		 569 aa  588  1e-166  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3518  beta-lactamase domain protein  50.18 
 
 		 552 aa  575  1.0000000000000001e-163  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000333928  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2198  metallo-beta-lactamase superfamily protein  47.82 
 
 		 555 aa  569  1e-161  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0875  beta-lactamase domain-containing protein  48.75 
 
 		 561 aa  571  1e-161  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0942136  normal  0.212553 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1597  beta-lactamase domain-containing protein  50.64 
 
 		 561 aa  571  1e-161  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0179  beta-lactamase domain protein  50.72 
 
 		 591 aa  568  1e-160  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4078  beta-lactamase domain-containing protein  48.39 
 
 		 561 aa  565  1.0000000000000001e-159  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35741  normal  0.385079 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1150  beta-lactamase domain protein  48.82 
 
 		 548 aa  561  1e-158  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0796  beta-lactamase domain protein  47.72 
 
 		 553 aa  558  1e-158  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2447  beta-lactamase domain protein  47.4 
 
 		 557 aa  556  1e-157  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1420  hypothetical protein  47.26 
 
 		 547 aa  552  1e-156  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.128957  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1749  mRNA degradation ribonuclease J1/J2enzyme  47.9 
 
 		 560 aa  554  1e-156  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.568373  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0324  mRNA degradation ribonuclease J1/J2enzyme  46.44 
 
 		 561 aa  551  1e-155  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1184  mRNA degradation ribonuclease J1/J2enzyme  47.94 
 
 		 559 aa  545  1e-154  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.238589  normal  0.189095 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0645  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  45.26 
 
 		 564 aa  539  9.999999999999999e-153  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000101529  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1761  metallo-beta-lactamase superfamily protein  48.26 
 
 		 559 aa  535  1e-151  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.662098  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2092  beta-lactamase-like  46.74 
 
 		 556 aa  538  1e-151  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.471204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1242  mRNA degradation ribonuclease J1/J2enzyme  46.4 
 
 		 573 aa  523  1e-147  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.752598  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1623  mRNA degradation ribonuclease J1/J2enzyme  46.53 
 
 		 560 aa  522  1e-147  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4416  beta-lactamase domain-containing protein  44.62 
 
 		 569 aa  524  1e-147  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4360  beta-lactamase domain protein  48.13 
 
 		 583 aa  516  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.263724  normal  0.359525 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0478  beta-lactamase domain protein  47.64 
 
 		 572 aa  514  1e-144  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3238  beta-lactamase domain protein  44.2 
 
 		 556 aa  509  1e-143  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.015572  normal  0.303561 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1625  beta-lactamase domain protein  47.49 
 
 		 590 aa  507  9.999999999999999e-143  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000210591  hitchhiker  0.00000143957 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1747  metallo-beta-lactamase family protein  44.1 
 
 		 677 aa  507  9.999999999999999e-143  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2585  beta-lactamase domain-containing protein  43.98 
 
 		 549 aa  508  9.999999999999999e-143  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0424665  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0755  beta-lactamase domain protein  44.73 
 
 		 602 aa  503  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1335  beta-lactamase domain-containing protein  42.16 
 
 		 574 aa  501  1e-140  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.547881  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1361  beta-lactamase domain-containing protein  42.16 
 
 		 574 aa  501  1e-140  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1811  metallo-beta-lactamase family protein  44.24 
 
 		 645 aa  501  1e-140  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1516  beta-lactamase domain-containing protein  43.81 
 
 		 618 aa  497  1e-139  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2928  beta-lactamase domain protein  44.93 
 
 		 588 aa  496  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3168  beta-lactamase domain protein  44.93 
 
 		 588 aa  496  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2917  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  45.06 
 
 		 591 aa  498  1e-139  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>