More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1998 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1998  primosome assembly protein PriA  100 
 
 		 731 aa  1489    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1716  primosome assembly protein PriA  98.36 
 
 		 731 aa  1464    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1758  primosomal protein N'  45.37 
 
 		 732 aa  624  1e-177  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0566  replication restart DNA helicase PriA  39.85 
 
 		 815 aa  583  1.0000000000000001e-165  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00911754  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1061  primosome assembly protein PriA  50.55 
 
 		 804 aa  579  1e-164  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.964371  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09880  primosomal protein N'  43.47 
 
 		 745 aa  577  1.0000000000000001e-163  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2156  primosome assembly protein PriA  40.56 
 
 		 781 aa  578  1.0000000000000001e-163  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1951  primosome assembly protein PriA  46.09 
 
 		 801 aa  574  1.0000000000000001e-162  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3916  primosome assembly protein PriA  48.37 
 
 		 801 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000142044  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3719  primosome assembly protein PriA  48.37 
 
 		 801 aa  571  1e-161  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3609  primosome assembly protein PriA  48.2 
 
 		 801 aa  569  1e-161  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3627  primosome assembly protein PriA  48.2 
 
 		 801 aa  569  1e-161  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4006  primosome assembly protein PriA  48.37 
 
 		 801 aa  571  1e-161  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3882  primosome assembly protein PriA  48.2 
 
 		 801 aa  569  1e-161  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000345063 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3967  primosome assembly protein PriA  48.2 
 
 		 801 aa  570  1e-161  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.841786  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3911  primosome assembly protein PriA  48.2 
 
 		 801 aa  568  1e-160  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3691  primosome assembly protein PriA  48.03 
 
 		 801 aa  565  1e-160  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1276  primosome assembly protein PriA  48.2 
 
 		 801 aa  567  1e-160  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1594  primosomal protein N'  38.01 
 
 		 735 aa  565  1e-160  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2520  primosome assembly protein PriA  48.03 
 
 		 801 aa  564  1.0000000000000001e-159  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0370343  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1703  primosomal protein N'  40.46 
 
 		 732 aa  557  1e-157  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0760  primosomal protein N'  40.43 
 
 		 798 aa  553  1e-156  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000570984  hitchhiker  0.00000745488 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2315  primosomal protein N'  39.07 
 
 		 747 aa  551  1e-155  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.101119  hitchhiker  0.00122833 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0779  primosomal protein N'  47.38 
 
 		 802 aa  543  1e-153  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1296  primosomal protein N'  44.05 
 
 		 802 aa  542  1e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1271  primosomal protein N'  44.05 
 
 		 802 aa  542  1e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.58065  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1332  primosomal protein N'  38.79 
 
 		 749 aa  540  9.999999999999999e-153  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000143785  normal  0.287743 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1038  primosomal protein N'  40.99 
 
 		 724 aa  531  1e-149  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1173  replication restart DNA helicase PriA  46.31 
 
 		 809 aa  526  1e-148  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2493  primosomal protein N'  42.77 
 
 		 792 aa  522  1e-147  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0167  primosomal protein N'  38.62 
 
 		 752 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00132621 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3337  primosomal protein n  37.38 
 
 		 746 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1515  replication restart DNA helicase PriA  44.05 
 
 		 803 aa  517  1.0000000000000001e-145  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0185  primosomal protein N'  38.62 
 
 		 752 aa  509  1e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0959  primosomal protein N'  48.71 
 
 		 790 aa  512  1e-143  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3854  primosomal protein N'  36.97 
 
 		 775 aa  511  1e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0030151  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0128  primosomal protein n`  36.56 
 
 		 751 aa  500  1e-140  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0315  primosome assembly protein PriA  44.95 
 
 		 796 aa  501  1e-140  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.169363  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0786  replication restart DNA helicase PriA  36.31 
 
 		 803 aa  499  1e-140  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.823514  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1396  primosome assembly protein PriA  45.2 
 
 		 798 aa  501  1e-140  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2612  primosomal protein N'  39.02 
 
 		 744 aa  499  1e-140  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0856  primosomal protein N'  37.76 
 
 		 730 aa  498  1e-139  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.44655  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1527  primosomal protein N'  47.1 
 
 		 818 aa  494  9.999999999999999e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.590711  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2810  primosomal protein N'  36.08 
 
 		 758 aa  491  1e-137  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3121  primosome assembly protein PriA  40.12 
 
 		 825 aa  490  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0337  primosomal protein N'  41.87 
 
 		 815 aa  488  1e-136  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.566686  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0374  primosomal protein N'  37.02 
 
 		 754 aa  487  1e-136  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0607469  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_278  primosomal protein N, (replication factor Y) (superfamily II helicase)  41.93 
 
 		 815 aa  486  1e-136  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0311908  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0043  primosomal protein N'  35.61 
 
 		 738 aa  487  1e-136  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.401318 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1319  primosomal protein N'  41.88 
 
 		 805 aa  480  1e-134  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.342383  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08420  primosomal protein N'  33.42 
 
 		 786 aa  481  1e-134  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.181256  normal  0.746709 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0672  primosomal protein N'  39.87 
 
 		 835 aa  479  1e-134  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00593856 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1308  primosomal protein N'  33.5 
 
 		 780 aa  477  1e-133  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.368616 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0161  primosome assembly protein PriA  40.44 
 
 		 835 aa  478  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.139003 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0165  primosome assembly protein PriA  40.25 
 
 		 843 aa  475  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1197  primosome assembly protein PriA  39.97 
 
 		 849 aa  469  1.0000000000000001e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1374  primosomal protein N'  34.99 
 
 		 768 aa  471  1.0000000000000001e-131  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228362  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2915  primosome assembly protein PriA  39.1 
 
 		 914 aa  470  1.0000000000000001e-131  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.1983  normal  0.221114 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3986  primosomal protein N'  39.53 
 
 		 848 aa  468  9.999999999999999e-131  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0567  primosome assembly protein PriA  39.25 
 
 		 836 aa  466  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.973651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0869  primosomal protein N'  34.62 
 
 		 770 aa  466  9.999999999999999e-131  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.162124 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09880  primosomal protein N'  34.77 
 
 		 695 aa  465  1e-129  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.738581  hitchhiker  0.00505641 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2792  primosomal protein N'  35.62 
 
 		 745 aa  465  1e-129  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.240357 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0316  primosomal protein N'  42.4 
 
 		 815 aa  460  9.999999999999999e-129  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0460314  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0974  primosomal protein N'  47.06 
 
 		 661 aa  457  1e-127  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000534713  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2703  primosomal protein N'  40.73 
 
 		 866 aa  459  1e-127  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2052  primosomal protein N'  38.9 
 
 		 828 aa  455  1.0000000000000001e-126  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0651  primosome assembly protein PriA  37.88 
 
 		 806 aa  455  1.0000000000000001e-126  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1240  primosomal protein N'  39.93 
 
 		 868 aa  453  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1417  primosomal protein N'  38.23 
 
 		 810 aa  444  1e-123  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3737  replication restart DNA helicase PriA  34.14 
 
 		 738 aa  442  1e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228486 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4104  primosomal protein N'  41.06 
 
 		 829 aa  442  9.999999999999999e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.344877  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0896  replication restart DNA helicase PriA  44.02 
 
 		 821 aa  441  9.999999999999999e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0600783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1173  primosomal protein N'  38.34 
 
 		 715 aa  439  9.999999999999999e-123  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0770  primosomal protein N'  33.02 
 
 		 735 aa  440  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.654251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1233  primosomal protein N  39.66 
 
 		 802 aa  438  1e-121  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0109325  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0828  primosomal protein n  39.19 
 
 		 815 aa  434  1e-120  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000150971  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1542  primosomal protein N'  38.78 
 
 		 810 aa  436  1e-120  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.337717  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1169  primosomal protein N'  32.76 
 
 		 811 aa  433  1e-120  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.807249  normal  0.476891 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3774  replication restart DNA helicase PriA  38.62 
 
 		 813 aa  432  1e-120  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0372203  normal  0.148217 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0764  primosomal protein N'  32.18 
 
 		 732 aa  430  1e-119  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000407652  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0524  hypothetical protein  39.55 
 
 		 832 aa  426  1e-118  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.669922 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0948  primosomal protein n  40.58 
 
 		 810 aa  427  1e-118  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.434554  normal  0.866808 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1550  primosomal protein N'  41.84 
 
 		 824 aa  426  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.764668  normal  0.503728 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4062  primosomal protein N'  37.56 
 
 		 804 aa  429  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.172877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5549  primosomal protein N'  38.57 
 
 		 858 aa  427  1e-118  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.293579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0025  primosomal protein N'  33.93 
 
 		 679 aa  425  1e-117  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0159  primosome assembly protein PriA  34.53 
 
 		 753 aa  418  9.999999999999999e-116  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1430  primosomal protein N'  40.73 
 
 		 812 aa  417  9.999999999999999e-116  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1987  primosomal protein N' (replication factor Y)  32.97 
 
 		 774 aa  417  9.999999999999999e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3377  primosomal protein N'  39.82 
 
 		 831 aa  418  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2597  primosomal protein N'(replication factor Y)( helicase)  36.7 
 
 		 815 aa  415  1e-114  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.510107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1511  primosomal protein N'  39.35 
 
 		 812 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2490  primosomal protein N'  41.31 
 
 		 660 aa  405  1e-111  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3484  primosomal protein N'  42.97 
 
 		 815 aa  404  1e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6575  primosomal protein N'  40.24 
 
 		 815 aa  404  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4311  primosome assembly protein PriA  31.43 
 
 		 732 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4495  primosome assembly protein PriA  31.34 
 
 		 732 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4425  primosome assembly protein PriA  31.34 
 
 		 732 aa  396  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.981494  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3794  primosome assembly protein PriA  31.86 
 
 		 731 aa  398  1e-109  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>