More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1994 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_1994  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  100 
 
 
442 aa  894    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1712  sun protein  98.42 
 
 
442 aa  882    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.212482  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0571  sun protein  40.32 
 
 
455 aa  331  2e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0809795  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1752  sun protein  40.22 
 
 
444 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.731166  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1954  sun protein  37.84 
 
 
444 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1532  sun protein  38.29 
 
 
449 aa  314  1.9999999999999998e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0859  sun protein  37.36 
 
 
452 aa  311  1e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1301  sun protein  38.24 
 
 
435 aa  307  2.0000000000000002e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1276  sun protein  38.24 
 
 
435 aa  307  2.0000000000000002e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1707  sun protein  37.42 
 
 
453 aa  305  8.000000000000001e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1591  sun protein  36.22 
 
 
452 aa  305  2.0000000000000002e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0783  sun protein  36.88 
 
 
435 aa  302  9e-81  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2311  sun protein  35.79 
 
 
452 aa  297  3e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.362668  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1064  sun protein  37.25 
 
 
447 aa  296  4e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0193  sun protein  37.84 
 
 
448 aa  295  1e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000593735  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2517  sun protein  38.06 
 
 
444 aa  293  4e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000512112  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3964  sun protein  38.51 
 
 
444 aa  291  2e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0066  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase:Nop2p  35.94 
 
 
446 aa  291  2e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1279  sun protein  38.74 
 
 
444 aa  290  4e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.19762 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3688  sun protein  38.06 
 
 
444 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.66831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3624  sun protein  38.29 
 
 
444 aa  286  5e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0232202  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3907  sun protein  38.06 
 
 
444 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3716  sun protein  38.06 
 
 
444 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0992207  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3606  sun protein  38.06 
 
 
444 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3879  sun protein  38.06 
 
 
444 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.26957e-17 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4003  sun protein  38.06 
 
 
444 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3913  sun protein  38.06 
 
 
444 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0159883  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3373  Sun protein  34.39 
 
 
448 aa  281  2e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3528  sun protein  37.3 
 
 
448 aa  277  3e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3242  sun protein  33.48 
 
 
452 aa  276  5e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0117569  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1394  RNA-binding protein  37.53 
 
 
442 aa  276  7e-73  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3594  sun protein  37.3 
 
 
448 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1171  sun protein  34.38 
 
 
449 aa  273  4.0000000000000004e-72  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1042  Fmu (Sun) domain protein  38.44 
 
 
406 aa  272  7e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0900  sun protein  33.18 
 
 
457 aa  271  2e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0150  sun protein  34.08 
 
 
449 aa  265  1e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.958214  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0209  rRNA methyltransferase RsmB (sun protein), putative  34.9 
 
 
428 aa  265  2e-69  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0317  sun protein  35.29 
 
 
440 aa  261  1e-68  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0918  sun protein  32.81 
 
 
453 aa  261  2e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0241  Sun protein  32.52 
 
 
451 aa  261  2e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09930  sun protein  36.64 
 
 
440 aa  261  2e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3851  sun protein  33.7 
 
 
453 aa  260  3e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1337  sun protein  32.75 
 
 
462 aa  260  4e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0524507  normal  0.361587 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0652  sun protein  33.11 
 
 
451 aa  259  5.0000000000000005e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0762  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  35.81 
 
 
438 aa  259  5.0000000000000005e-68  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000298868 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3045  sun protein  32.07 
 
 
452 aa  259  7e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0672  sun protein  32.88 
 
 
451 aa  259  8e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0363723  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4428  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  33.71 
 
 
449 aa  258  1e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0744  sun protein  33.03 
 
 
443 aa  258  1e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.323768  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4706  sun protein  33.41 
 
 
446 aa  258  1e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2231  sun protein  34.31 
 
 
468 aa  258  2e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1437  sun protein  36.9 
 
 
430 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0962  sun protein  30.65 
 
 
451 aa  253  4.0000000000000004e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.316292  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1322  sun protein  32.37 
 
 
451 aa  253  5.000000000000001e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1228  hypothetical protein  32.22 
 
 
456 aa  253  5.000000000000001e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.13972  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1513  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  32.74 
 
 
448 aa  249  8e-65  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2084  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  33.26 
 
 
424 aa  242  1e-62  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.616143  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2489  sun protein  32.26 
 
 
453 aa  241  2e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.968037  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3612  sun protein  33.33 
 
 
464 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0682  sun protein  28.92 
 
 
443 aa  239  6.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0449767  normal  0.911889 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl196  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  34.92 
 
 
425 aa  236  6e-61  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0292309  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0664  Fmu (Sun) domain protein  34.99 
 
 
430 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2201  Fmu (Sun) domain protein  33.11 
 
 
437 aa  222  9.999999999999999e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.256814  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0080  sun protein  33.56 
 
 
436 aa  218  2e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1758  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  30.68 
 
 
438 aa  216  5e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0818  sun protein  31.93 
 
 
447 aa  216  7e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.320678  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0728  sun protein  31.22 
 
 
449 aa  214  1.9999999999999998e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.738755 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04801  Sun protein (Fmu protein)  30.24 
 
 
448 aa  213  3.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.273951  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0448  NusB/RsmB/TIM44  30.43 
 
 
439 aa  213  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.455606  normal  0.168542 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1406  sun protein  31.86 
 
 
431 aa  211  3e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0437  16S rRNA methyltransferase B  31.4 
 
 
431 aa  210  4e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04501  Sun protein (Fmu protein)  31.58 
 
 
438 aa  209  9e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04811  Sun protein (Fmu protein)  31.84 
 
 
438 aa  207  2e-52  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1826  sun protein  29.65 
 
 
451 aa  207  3e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0425  sun protein  31.09 
 
 
438 aa  207  4e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0804  sun protein  28.79 
 
 
445 aa  206  6e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0103148 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1280  sun protein  30.73 
 
 
431 aa  206  9e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000185655  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3884  16S rRNA methyltransferase B  29.91 
 
 
429 aa  205  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.002095  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0314  16S rRNA methyltransferase B  29.91 
 
 
429 aa  205  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1119  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  30.18 
 
 
429 aa  204  2e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0613  16S rRNA methyltransferase B  29.91 
 
 
435 aa  204  2e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0175887  normal  0.0518778 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0022  sun protein  30.18 
 
 
427 aa  202  8e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04221  Sun protein (Fmu protein)  29.14 
 
 
432 aa  202  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2583  sun protein  27.49 
 
 
501 aa  202  9.999999999999999e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0446199  normal  0.0296322 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0029  sun protein  31.15 
 
 
426 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0019  Sun protein  30.82 
 
 
445 aa  201  9.999999999999999e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0029  sun protein  30.41 
 
 
428 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000239617 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0041  sun protein  32.35 
 
 
427 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.15586 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0030  sun protein  30.56 
 
 
428 aa  200  3e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0025  sun protein  30.41 
 
 
428 aa  201  3e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0018  sun protein  32.74 
 
 
440 aa  200  3.9999999999999996e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0191  sun protein  30.56 
 
 
436 aa  200  5e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0022  sun protein  31.08 
 
 
428 aa  200  5e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0354  16S rRNA methyltransferase B  31.29 
 
 
431 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.462133  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0030  sun protein  30.18 
 
 
428 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3771  16S rRNA methyltransferase B  30.41 
 
 
429 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.075284  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0027  sun protein  30.72 
 
 
429 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.930823  hitchhiker  0.0023625 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0029  sun protein  30.18 
 
 
428 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116562 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0033  sun protein  30.72 
 
 
429 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.709945  hitchhiker  0.00000640703 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1768  sun protein  30.07 
 
 
444 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>