88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1988 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1988  thiamine pyrophosphokinase  100 
 
 		 209 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1706  thiamine pyrophosphokinase  96.17 
 
 		 209 aa  398  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2483  thiamine pyrophosphokinase  43.78 
 
 		 216 aa  145  6e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1538  thiamine pyrophosphokinase  40.28 
 
 		 211 aa  137  7.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3202  thiamine pyrophosphokinase  38.79 
 
 		 213 aa  132  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1746  thiamine pyrophosphokinase  39.81 
 
 		 211 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000511676  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3907  thiamine pyrophosphokinase  38.03 
 
 		 213 aa  124  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000037625  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0577  thiamine pyrophosphokinase  36.02 
 
 		 212 aa  123  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3618  thiamine pyrophosphokinase  37.56 
 
 		 213 aa  121  6e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000017674  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3997  hypothetical protein  38.03 
 
 		 213 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000013843  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3873  thiamine pyrophosphokinase  38.03 
 
 		 213 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.54961e-30 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3600  thiamine pyrophosphokinase  38.03 
 
 		 213 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.86754e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3710  hypothetical protein  38.03 
 
 		 213 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000607891  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3901  hypothetical protein  37.09 
 
 		 213 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000344688  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3607  thiamine pyrophosphokinase  34.6 
 
 		 224 aa  117  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.945813 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3958  thiamine pyrophosphokinase  38.25 
 
 		 213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00188574  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3682  thiamine pyrophosphokinase  36.15 
 
 		 213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000180795  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1805  thiamine pyrophosphokinase  33.65 
 
 		 211 aa  112  3e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.219265  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1285  thiamine pyrophosphokinase  37.5 
 
 		 219 aa  112  6e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000567984  hitchhiker  0.0000616024 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0426  thiamine pyrophosphokinase  31.16 
 
 		 213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2511  thiamine pyrophosphokinase  34.72 
 
 		 213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000001941  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0627  thiamine pyrophosphokinase  34.78 
 
 		 219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0789  hypothetical protein  37.02 
 
 		 211 aa  108  8.000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3421  thiamine pyrophosphokinase  31.43 
 
 		 212 aa  107  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1070  thiamine pyrophosphokinase  34.74 
 
 		 215 aa  105  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09380  thiamine pyrophosphokinase  32.51 
 
 		 222 aa  103  2e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.39134 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1960  thiamine pyrophosphokinase  33.8 
 
 		 216 aa  101  7e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1166  thiamine pyrophosphokinase  35.75 
 
 		 216 aa  98.2  7e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000150801  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1262  thiamine pyrophosphokinase  34.76 
 
 		 219 aa  97.8  9e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.208483  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1795  thiamine pyrophosphokinase  30.62 
 
 		 216 aa  94.4  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000771119  normal  0.210862 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2676  thiamine pyrophosphokinase  32.7 
 
 		 217 aa  94  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1225  thiamine pyrophosphokinase  28.99 
 
 		 230 aa  93.6  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3933  thiamine pyrophosphokinase  32.7 
 
 		 221 aa  93.6  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1282  hypothetical protein  35.14 
 
 		 213 aa  92.4  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0360519  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1307  hypothetical protein  35.14 
 
 		 213 aa  92.4  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00543871  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1363  thiamine pyrophosphokinase  33.97 
 
 		 218 aa  89.7  3e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10040  thiamine pyrophosphokinase  31.41 
 
 		 215 aa  87.8  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0767  thiamine pyrophosphokinase  31.53 
 
 		 222 aa  87.4  2e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000566188  hitchhiker  0.0000000481128 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2104  thiamine pyrophosphokinase  29.81 
 
 		 219 aa  86.7  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1508  thiamine pyrophosphokinase  32.26 
 
 		 219 aa  85.5  5e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000147965  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1939  thiamine pyrophosphokinase  31.88 
 
 		 212 aa  85.1  7e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.611863  normal  0.701767 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0410  thiamine pyrophosphokinase  33.33 
 
 		 204 aa  82.4  0.000000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0949  thiamine pyrophosphokinase  32.69 
 
 		 203 aa  80.9  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000156762  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2014  thiamine pyrophosphokinase  33.78 
 
 		 211 aa  80.9  0.00000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1756  hypothetical protein  31.89 
 
 		 218 aa  78.6  0.00000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.416332  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4124  thiamine pyrophosphokinase  30.33 
 
 		 207 aa  78.6  0.00000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.738174  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1694  thiamin pyrophosphokinase catalytic subunit  31.89 
 
 		 297 aa  77.8  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.391798  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1775  hypothetical protein  31.39 
 
 		 210 aa  76.3  0.0000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08960  thiamine pyrophosphokinase  32.6 
 
 		 228 aa  75.5  0.0000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000037051 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3841  thiamine pyrophosphokinase  29.06 
 
 		 231 aa  75.1  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000017039  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0791  thiamine pyrophosphokinase  35 
 
 		 220 aa  75.1  0.0000000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.410338  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0929  thiamine pyrophosphokinase  26.96 
 
 		 211 aa  71.6  0.000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.229858 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2073  thiamine pyrophosphokinase  30.48 
 
 		 226 aa  70.1  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.852638  hitchhiker  0.00000141899 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1143  thiamine pyrophosphokinase  28.65 
 
 		 218 aa  68.6  0.00000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0683  thiamine pyrophosphokinase  25.37 
 
 		 212 aa  68.2  0.00000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0036  thiamine pyrophosphokinase  30.59 
 
 		 203 aa  67.8  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000794456  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4260  thiamine pyrophosphokinase  29.28 
 
 		 219 aa  67.4  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1768  hypothetical protein  30.91 
 
 		 210 aa  67  0.0000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.712732  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4138  thiamine pyrophosphokinase  27.59 
 
 		 216 aa  66.2  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124794 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2799  thiamine pyrophosphokinase  27.1 
 
 		 220 aa  65.9  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1147  thiamine pyrophosphokinase  29.27 
 
 		 205 aa  64.7  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.514296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0128  thiamine pyrophosphokinase  23.41 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3105  thiamine pyrophosphokinase  26.34 
 
 		 220 aa  63.5  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3405  thiamine pyrophosphokinase  26.44 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.465121  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0480  hypothetical protein  28.32 
 
 		 230 aa  62.4  0.000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0879  thiamine pyrophosphokinase  25.6 
 
 		 234 aa  62.4  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4449  thiamine pyrophosphokinase  28.1 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.359554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0864  thiamine pyrophosphokinase  32.86 
 
 		 454 aa  60.8  0.00000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000134495  normal  0.492449 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3809  thiamine pyrophosphokinase  25.62 
 
 		 216 aa  61.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0039  thiamine pyrophosphokinase  27.87 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000099633  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0039  thiamine pyrophosphokinase  27.87 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2175  thiamine pyrophosphokinase  30.33 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.227177  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1966  thiamine pyrophosphokinase  27.15 
 
 		 223 aa  57  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.923392  normal  0.153951 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0906  thiamine pyrophosphokinase  26.76 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000103792  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0259  hypothetical protein  29.17 
 
 		 208 aa  54.7  0.0000009  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl224  hypothetical protein  27.13 
 
 		 207 aa  54.3  0.000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000280921  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3176  thiamine pyrophosphokinase  25.73 
 
 		 231 aa  54.7  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0363  hypothetical protein  24.04 
 
 		 232 aa  52.8  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2007  thiamine pyrophosphokinase  24.04 
 
 		 232 aa  52.4  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0983974  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1897  thiamin pyrophosphokinase catalytic subunit  26.64 
 
 		 225 aa  52  0.000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.327287 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0473  thiamine diphosphokinase  25 
 
 		 272 aa  49.7  0.00003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0230  thiamine pyrophosphokinase  27.55 
 
 		 241 aa  49.7  0.00004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1253  thiamine pyrophosphokinase  25 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0605  thiamine pyrophosphokinase  27.62 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.681659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1127  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  32.52 
 
 		 399 aa  43.9  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.919928 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1391  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  31.19 
 
 		 372 aa  43.9  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.645709  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2354  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  32.63 
 
 		 407 aa  41.6  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.412725  hitchhiker  0.00636665 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2010  thiamin pyrophosphokinase catalytic region  30.33 
 
 		 399 aa  41.2  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.272483  normal  0.113 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>