More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1966 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1966  30S ribosomal protein S16  100 
 
 		 81 aa  166  1e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.408162  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1684  30S ribosomal protein S16  100 
 
 		 81 aa  166  1e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000195322  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2496  30S ribosomal protein S16  77.5 
 
 		 90 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000037425  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1300  30S ribosomal protein S16  77.5 
 
 		 90 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000139404  unclonable  4.2704600000000004e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3886  30S ribosomal protein S16  76.25 
 
 		 90 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000793752  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3695  30S ribosomal protein S16  76.25 
 
 		 90 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000036513  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3585  30S ribosomal protein S16  76.25 
 
 		 90 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.24703e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3603  30S ribosomal protein S16  76.25 
 
 		 90 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000351748  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3892  30S ribosomal protein S16  76.25 
 
 		 90 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000076365  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3943  30S ribosomal protein S16  76.25 
 
 		 90 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000144012  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3982  30S ribosomal protein S16  76.25 
 
 		 90 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000152128  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3667  30S ribosomal protein S16  76.25 
 
 		 90 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000528742  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3858  30S ribosomal protein S16  76.25 
 
 		 90 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.93273e-63 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1712  30S ribosomal protein S16  75 
 
 		 86 aa  124  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000001616  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1485  SSU ribosomal protein S16P  71.25 
 
 		 139 aa  125  3e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000209071  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0769  30S ribosomal protein S16  72.5 
 
 		 81 aa  122  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000269081  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0710  30S ribosomal protein S16  73.75 
 
 		 81 aa  120  8e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000278806  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1197  30S ribosomal protein S16  71.25 
 
 		 88 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00460539  normal  0.0958126 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2055  ribosomal protein S16  76.25 
 
 		 89 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000864984  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1088  30S ribosomal protein S16  70 
 
 		 90 aa  118  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000001932  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0967  SSU ribosomal protein S16P  66.25 
 
 		 90 aa  117  6e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1416  ribosomal protein S16  70 
 
 		 82 aa  116  7.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000269941  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1979  30S ribosomal protein S16  68.75 
 
 		 90 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1497  30S ribosomal protein S16  67.5 
 
 		 88 aa  115  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.155145  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0968  30S ribosomal protein S16  66.25 
 
 		 81 aa  114  3e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000054377  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07300  ribosomal protein S16  65 
 
 		 88 aa  113  6.9999999999999995e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.83606e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3760  30S ribosomal protein S16  65 
 
 		 88 aa  113  7.999999999999999e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0113592  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1634  ribosomal protein S16  70.51 
 
 		 96 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1303  ribosomal protein S16  70.67 
 
 		 81 aa  112  1.0000000000000001e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0170665  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0786  30S ribosomal protein S16  61.25 
 
 		 90 aa  112  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  2.11078e-18  unclonable  1.2360400000000002e-28 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1352  ribosomal protein S16  65 
 
 		 91 aa  111  3e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000135994  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2408  30S ribosomal protein S16  65 
 
 		 81 aa  111  4.0000000000000004e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000382163  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0656  ribosomal protein S16  60 
 
 		 92 aa  107  8.000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0001625  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0798  SSU ribosomal protein S16P  60 
 
 		 96 aa  105  3e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000268891  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1154  30S ribosomal protein S16  57.5 
 
 		 91 aa  104  4e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000677791  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1369  SSU ribosomal protein S16P  58.75 
 
 		 82 aa  103  6e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000301445  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1663  30S ribosomal protein S16  56.25 
 
 		 90 aa  103  6e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000254638  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1297  30S ribosomal protein S16  57.5 
 
 		 91 aa  103  7e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000043058  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1322  30S ribosomal protein S16  57.5 
 
 		 91 aa  103  7e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000033965  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0804  30S ribosomal protein S16  60 
 
 		 91 aa  103  8e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.00000000000000525288  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1358  30S ribosomal protein S16  58.75 
 
 		 90 aa  103  8e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000511359  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1378  ribosomal protein S16  62.82 
 
 		 81 aa  102  2e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000172433  normal  0.497883 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1388  SSU ribosomal protein S16P  60 
 
 		 85 aa  100  6e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0159057  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1506  30S ribosomal protein S16  55 
 
 		 90 aa  100  7e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000148464  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1328  ribosomal protein S16  56.25 
 
 		 146 aa  98.2  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.519364 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2727  ribosomal protein S16  60.24 
 
 		 201 aa  98.6  3e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1824  30S ribosomal protein S16  58.02 
 
 		 134 aa  97.8  4e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1756  30S ribosomal protein S16  58.02 
 
 		 134 aa  97.8  4e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2672  ribosomal protein S16  60.26 
 
 		 89 aa  98.2  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00262741  hitchhiker  0.000000230838 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1463  30S ribosomal protein S16  57.32 
 
 		 122 aa  97.8  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.190646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2607  30S ribosomal protein S16  56.63 
 
 		 121 aa  97.4  6e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.152085  normal  0.0124083 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2450  30S ribosomal protein S16  57.5 
 
 		 87 aa  97.4  6e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000801266  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2982  30S ribosomal protein S16  60.98 
 
 		 122 aa  96.7  9e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.117081 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1419  ribosomal protein S16  59.76 
 
 		 141 aa  96.3  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.206604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1098  30S ribosomal protein S16  60 
 
 		 85 aa  96.3  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00129235  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1079  30S ribosomal protein S16  54.32 
 
 		 134 aa  95.5  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0578935  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2871  30S ribosomal protein S16  57.5 
 
 		 88 aa  95.9  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000408452  hitchhiker  0.000000516516 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0509  30S ribosomal protein S16  56.63 
 
 		 107 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1417  ribosomal protein S16  55 
 
 		 88 aa  95.5  2e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000010648  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0881  ribosomal protein S16  53.33 
 
 		 81 aa  95.1  3e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000838528  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11040  SSU ribosomal protein S16P  59.49 
 
 		 178 aa  95.1  3e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0237253  normal  0.066804 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3682  30S ribosomal protein S16  56.63 
 
 		 119 aa  94.7  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.442815  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1398  ribosomal protein S16  58.23 
 
 		 131 aa  95.1  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00441352 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3763  30S ribosomal protein S16  57.5 
 
 		 88 aa  94.4  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000744609  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0245  30S ribosomal protein S16  54.22 
 
 		 106 aa  94.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2888  30S ribosomal protein S16  56.63 
 
 		 119 aa  94.4  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3305  ribosomal protein S16  52.5 
 
 		 81 aa  94.4  4e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1229  30S ribosomal protein S16  53.85 
 
 		 95 aa  94.4  5e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000888168  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1226  30S ribosomal protein S16  53.85 
 
 		 95 aa  94.4  5e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000587393  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0547  30S ribosomal protein S16  55.13 
 
 		 108 aa  94.4  5e-19  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0749  30S ribosomal protein S16  54.32 
 
 		 130 aa  94.4  5e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0348  30S ribosomal protein S16  54.88 
 
 		 130 aa  94  7e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.409414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3339  30S ribosomal protein S16  54.32 
 
 		 134 aa  93.6  8e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.762714  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl542  30S ribosomal protein S16  55.13 
 
 		 89 aa  93.6  9e-19  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000264239  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2997  ribosomal protein S16  58.23 
 
 		 86 aa  93.6  9e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00000265446  normal  0.805241 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3039  ribosomal protein S16  58.23 
 
 		 86 aa  93.6  9e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000430382  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1167  ribosomal protein S16  58.23 
 
 		 142 aa  92.8  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1287  ribosomal protein S16  53.85 
 
 		 95 aa  92.8  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.889562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1666  ribosomal protein S16  55.13 
 
 		 93 aa  93.2  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00967781  hitchhiker  0.00350305 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10970  SSU ribosomal protein S16P  57.69 
 
 		 81 aa  93.2  1e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000033138  unclonable  0.00000000137998 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0352  30S ribosomal protein S16  54.22 
 
 		 110 aa  93.2  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.250559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1398  30S ribosomal protein S16  52.56 
 
 		 133 aa  93.2  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000212857  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3616  30S ribosomal protein S16  53.66 
 
 		 120 aa  92.8  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0072517 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0367  30S ribosomal protein S16  55.42 
 
 		 110 aa  92.8  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.444228 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1827  ribosomal protein S16  59.49 
 
 		 153 aa  92.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0861324 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2476  30S ribosomal protein S16  57.69 
 
 		 86 aa  92.4  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3352  30S ribosomal protein S16  58.97 
 
 		 120 aa  92.4  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.238376 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2224  30S ribosomal protein S16  55 
 
 		 86 aa  92.8  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.98252e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2855  30S ribosomal protein S16  57.69 
 
 		 86 aa  92.4  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.888184  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0985  ribosomal protein S16  62.03 
 
 		 136 aa  92.8  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  unclonable  0.0000000000245762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1524  30S ribosomal protein S16  53.85 
 
 		 135 aa  92.4  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000501914  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0568  30S ribosomal protein S16  52.56 
 
 		 82 aa  91.7  3e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000021123  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3431  30S ribosomal protein S16  56.25 
 
 		 88 aa  91.7  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000117102  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3097  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 124 aa  91.7  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.458494  normal  0.937059 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3493  30S ribosomal protein S16  56.25 
 
 		 88 aa  91.7  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.18951e-29 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0688  ribosomal protein S16  56.41 
 
 		 128 aa  91.7  3e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000224694  hitchhiker  0.000468142 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2278  ribosomal protein S16  53.85 
 
 		 83 aa  91.7  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00221023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3752  30S ribosomal protein S16  51.22 
 
 		 123 aa  91.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.411853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2896  SSU ribosomal protein S16P  56.41 
 
 		 152 aa  92  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2142  30S ribosomal protein S16  58.44 
 
 		 79 aa  91.7  3e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>