More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1945 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0694  DNA polymerase III PolC  49.15 
 
 		 1443 aa  1259    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0739447  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2470  DNA polymerase III PolC  50.8 
 
 		 1433 aa  1383    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07800  DNA polymerase III, alpha subunit  57.18 
 
 		 1397 aa  1444    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0831  DNA polymerase III PolC  49.92 
 
 		 1436 aa  1249    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0685824  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3859  DNA polymerase III, alpha subunit  44.77 
 
 		 970 aa  760    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1911  DNA polymerase III PolC  42.86 
 
 		 1468 aa  1154    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3669  DNA polymerase III PolC  50.51 
 
 		 1433 aa  1375    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1328  DNA polymerase III PolC  50.15 
 
 		 1433 aa  1369    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0462488  hitchhiker  0.0000648048 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3559  DNA polymerase III PolC  50.44 
 
 		 1433 aa  1373    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl288  DNA polymerase III alpha subunit  41.97 
 
 		 1493 aa  925    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3577  DNA polymerase III PolC  50.51 
 
 		 1433 aa  1375    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1650  DNA polymerase III PolC  57.78 
 
 		 1407 aa  1615    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00795258  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0360  DNA polymerase III PolC  48.5 
 
 		 1367 aa  1164    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1011  DNA polymerase III, alpha subunit  48.53 
 
 		 1447 aa  1359    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.939055  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3955  DNA polymerase III PolC  50.51 
 
 		 1433 aa  1375    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0154434  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1324  DNA polymerase III PolC  47.24 
 
 		 1438 aa  1256    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1806  DNA polymerase III, alpha subunit  59.1 
 
 		 1402 aa  1479    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0339  DNA polymerase III, alpha subunit  42.68 
 
 		 1479 aa  956    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1045  DNA polymerase III, alpha subunit  58.91 
 
 		 1214 aa  1062    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0186954  unclonable  0.0000000541415 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3916  DNA polymerase III PolC  54.79 
 
 		 1433 aa  1371    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.111889  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2619  DNA polymerase III, alpha subunit  53.27 
 
 		 1527 aa  1334    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.768829  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3640  DNA polymerase III PolC  54.62 
 
 		 1433 aa  1368    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf732  DNA polymerase III PolC  39.37 
 
 		 1438 aa  867    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1965  DNA polymerase III, alpha subunit  54.69 
 
 		 1426 aa  1495    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3865  DNA polymerase III PolC  50.51 
 
 		 1433 aa  1374    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00985865  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0452  DNA polymerase III PolC  57.64 
 
 		 1433 aa  1613    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.2678  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0342  DNA polymerase III PolC  48.5 
 
 		 1367 aa  1160    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1350  DNA polymerase III PolC  47.24 
 
 		 1438 aa  1256    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1945  DNA polymerase III PolC  100 
 
 		 1449 aa  2972    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1663  DNA polymerase III PolC  99.59 
 
 		 1449 aa  2962    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1483  DNA polymerase III PolC  46.25 
 
 		 1388 aa  1063    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1439  DNA polymerase III, alpha subunit  57.7 
 
 		 1210 aa  1036    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.476857  normal  0.05643 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0895  DNA-directed DNA polymerase  55.78 
 
 		 1212 aa  1021    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.210067  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3830  DNA polymerase III PolC  50.51 
 
 		 1433 aa  1375    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.80742e-56 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2429  DNA polymerase III PolC  47.62 
 
 		 1635 aa  1168    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0983  DNA polymerase III, alpha subunit ( type)  45.76 
 
 		 1437 aa  1094    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0809  DNA polymerase III, alpha subunit ( type)  44.57 
 
 		 1432 aa  1226    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164061 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0689  DNA polymerase III catalytic subunit, PolC type  42.63 
 
 		 1437 aa  1144    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0095  DNA polymerase III PolC  42.34 
 
 		 1464 aa  1170    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1039  DNA polymerase III PolC  44.49 
 
 		 1362 aa  1063    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.195059  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2090  DNA polymerase III, alpha subunit  50.52 
 
 		 1421 aa  1208    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.591044  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1721  DNA polymerase III PolC  47.98 
 
 		 1390 aa  1085    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.670328  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0598  DNA polymerase III, alpha subunit  45.95 
 
 		 1365 aa  1113    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1427  DNA polymerase III, alpha subunit  53.63 
 
 		 1440 aa  1382    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0420  DNA polymerase III PolC  37.96 
 
 		 1442 aa  836    Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1150  DNA polymerase III PolC  55.82 
 
 		 1435 aa  1405    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0319687  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2042  DNA polymerase III PolC  55.74 
 
 		 1444 aa  1405    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0996  DNA polymerase III PolC  55.64 
 
 		 1442 aa  1614    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0332  DNA polymerase III, alpha subunit  46.03 
 
 		 1465 aa  1073    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3856  DNA polymerase III, alpha subunit  60.93 
 
 		 483 aa  619  1e-175  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.307747  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1808  DNA-directed DNA polymerase  39.04 
 
 		 989 aa  611  1e-173  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0349481  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1391  DNA polymerase III, alpha subunit  24.78 
 
 		 1127 aa  186  2.0000000000000003e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1192  DNA polymerase III DnaE  24.52 
 
 		 1145 aa  178  8e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1265  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  23.66 
 
 		 1170 aa  172  5e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1464  DNA polymerase III, alpha subunit  23.5 
 
 		 1170 aa  167  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1264  DNA polymerase III DnaE  25.11 
 
 		 1181 aa  166  4.0000000000000004e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.756254  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2043  DNA polymerase III DnaE  24.84 
 
 		 1130 aa  165  5.0000000000000005e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16150  hypothetical protein  42.16 
 
 		 584 aa  164  9e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0650546  normal  0.732328 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1242  DNA polymerase III, alpha subunit  23.28 
 
 		 1170 aa  163  2e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1074  DNA polymerase III, alpha subunit  25.16 
 
 		 1180 aa  163  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3092  DNA polymerase III, alpha subunit  23.41 
 
 		 1156 aa  162  4e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00110918  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2196  DNA polymerase III, alpha subunit  23.79 
 
 		 1165 aa  162  6e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0036  DNA polymerase III, alpha subunit  24.67 
 
 		 1240 aa  161  7e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0650  hypothetical protein  22.77 
 
 		 1148 aa  159  4e-37  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.394104 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1169  DNA polymerase III, alpha subunit  23.1 
 
 		 1155 aa  158  6e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.34494e-16 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0675  DNA polymerase III, alpha subunit  24.21 
 
 		 1148 aa  157  1e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1233  DNA polymerase III, alpha subunit  23.5 
 
 		 1160 aa  155  4e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0212  DNA polymerase III, alpha subunit  24.46 
 
 		 1167 aa  155  7e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000022067  normal  0.693797 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1050  DNA polymerase III, alpha subunit  23.85 
 
 		 1075 aa  155  7e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.558692  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2507  DNA polymerase III, alpha subunit  24.2 
 
 		 1157 aa  153  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00161108  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0130  DNA polymerase III, alpha subunit  23.77 
 
 		 1173 aa  153  3e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.103911 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09341  DNA polymerase III subunit alpha  23.79 
 
 		 1172 aa  152  3e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.146562 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2499  DNA polymerase III, alpha subunit  24.75 
 
 		 1260 aa  152  4e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0265  DNA polymerase III subunit alpha  23.73 
 
 		 1172 aa  152  6e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.309989  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1265  DNA polymerase III, alpha subunit  25.48 
 
 		 1176 aa  151  9e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.166444  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1310  DNA polymerase III, alpha subunit  23.26 
 
 		 1510 aa  151  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3051  DNA polymerase III, epsilon subunit  40.31 
 
 		 595 aa  150  1.0000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0549  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  24.16 
 
 		 1134 aa  149  5e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2319  DNA polymerase III DnaE  23.16 
 
 		 1225 aa  147  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.511943  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0632  DNA polymerase III, alpha subunit  24.78 
 
 		 1165 aa  147  1e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1050  DNA polymerase III, alpha subunit  24.86 
 
 		 1153 aa  147  1e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000216104  hitchhiker  0.00986832 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3141  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.68 
 
 		 595 aa  146  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1378  hypothetical protein  40.41 
 
 		 578 aa  147  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3068  DNA polymerase III, epsilon subunit  40.98 
 
 		 605 aa  145  4e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0177257  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03930  DNA polymerase III, epsilon subunit  43.86 
 
 		 715 aa  143  1.9999999999999998e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1225  DNA polymerase III, alpha subunit  23.19 
 
 		 1164 aa  144  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.344496  normal  0.610841 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0434  DNA polymerase III, alpha subunit  23.35 
 
 		 1139 aa  143  3e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2723  DNA polymerase III, alpha subunit  23.09 
 
 		 1179 aa  143  3e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1242  DNA polymerase III, epsilon subunit  42.05 
 
 		 565 aa  143  3e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.629085  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0096  DNA polymerase III, alpha subunit  23.14 
 
 		 1151 aa  142  3.9999999999999997e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.810427  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1401  DNA polymerase III, alpha subunit  22.47 
 
 		 1155 aa  141  7.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.67909  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0809  DNA polymerase III DnaE  23.37 
 
 		 1145 aa  140  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000123157  decreased coverage  0.00151258 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2984  hypothetical protein  47.22 
 
 		 560 aa  140  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14220  hypothetical protein  40.22 
 
 		 551 aa  141  1e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.285162  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1300  DNA polymerase III subunit epsilon  39.61 
 
 		 574 aa  140  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03140  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  22.98 
 
 		 1122 aa  140  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.677635  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1715  DNA polymerase III, alpha subunit  23.17 
 
 		 1175 aa  140  2e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.49916  normal  0.677237 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0091  DNA polymerase III, alpha subunit  23.84 
 
 		 1279 aa  139  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00483462  normal  0.136645 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1215  DNA polymerase III, alpha subunit  22.96 
 
 		 1155 aa  138  6.0000000000000005e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000331804  hitchhiker  0.00000568126 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1612  DNA polymerase III, alpha subunit  23.5 
 
 		 1201 aa  138  7.000000000000001e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00506055  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>